Lacinutrix sp. 5H-3-7-4: Lacal_1400
Help
Entry
Lacal_1400 CDS
T01533
Name
(GenBank) PKD domain containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
lan
Lacinutrix sp. 5H-3-7-4
Pathway
lan02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lan00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
Lacal_1400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
PKD_4
PKD
CUB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH01248
UniProt:
F6GIV5
LinkDB
All DBs
Position
1594795..1602201
Genome browser
AA seq
2468 aa
AA seq
DB search
MRNFTLIIFLLFISIPVFAQDILMQNGTFNQCSGTLYDSGGPSANYSSDENFVLTICPDG
PDQFIQLDFTTFGTQGGSDILTIYDGDDTTAPVIGSFDGGGVTSDPGTIMASITSATGCL
TLEFVSNATGNTIGWAADIDCFTDCQTITPSIDSTNPAVNGTGVVQVLVGTTVDFTGSAV
FSEDGTGATYNWNFGDGSPFGTGEMVSNQFDTIGTYTTTLTVTDTNPLGCSETATVTVQV
LGPYIDVDQTTYTVPQLVEDVLINSPCATVSNINWSTGTNFGDVNGIGYFSALPGAFGFD
AGIVLNSGDAMEAEGPESGIQSSGGGAWPGDADLEAEINTDLDNTPGDDLPAGNSRNASF
IEFDFVPLADTITFNFLFASDEYGAFQCSFSDAFAFLLTDLSTNTTTNLALVPGTTDVVS
VFTVRDNAFAGGCSSENPTYFDSYHGAGGEPAANAPIDYLGYTVPMAAIANVTPNNNYRI
KLVVADARDTSYNSAVFLEAGSFSLGGDLGDDITINAGTAECQGTPVVLDTQLPTATHTW
YLDGVVIPGETNSTLNATQDGEYTVDITFSATCMASDSIIIEFIPGPTIQAVNTITECDD
GSGAVVFDLTENDAPAFGAQDQTANSLSYHNSNADAMNGVNPIGDPVNYNGTDGEIIYIR
IEDNTGTCADIDMFTLEYLTVALNDAPDIVVCDDLSNDGQEEFDLTNQDAAVLGAQAASD
FIVTYHSSIADADTGANPLTSPYTSSGEIIYVRIESVASSVCYISSQNDAEGFTITINPI
AEAAQPSNLELCDDSSNDGVEIFDLTTEEAVILNGQDPANYTVSYYEQPGDVATSTNAIA
TPGAYPNMSSPQTIYVRVDDNSNPACFGETSFTITVNPEDDSTFTMQPTCDGATVDTVAT
PGGTYVLNPDPADGSVIDATTGTITDGLSGASYTVDYTTNGTCPSTSSFTVTVDITNDAS
FTMNATCDGGIVTSEATPGGTYAFNPIPTDAASIDPVTGTVTGATSATVYMVEYSLGGAC
PSSTIETLTVLTTDDASVTYTPTCDGGVVDSEATPGGSYAFNTVPTDGAILDTTTGAITG
GTPGASYTVDYTTNGSCPATSTTTVTANPLPTVVTPTPLEVCDDATPDGITAIDLTLKNQ
EISGGNPAYTVSYYFTPLDAINATNPLAIPYTNQTPNMQTVYVRVEDANTGCFDTTSLEL
VVEQAPVAFTPAALEYCDPDSDGFGEFMLSDTEAEITAGAPGLTVTYHETMADAMNNVNA
LSSPYNNIVANMQTIYVRVESSTIATDCASFVELVLIVNPTPQITDPTALEVCDDDADGF
ATFNLPSKDAEILNLLDTDPTNDLDPTQYTVTYYITPGDAMAGTNPIATPNAYVNTSNPQ
IVHVRVEDTANDCFTNTTLELIVNPLPVLVQPDPLALCDVNNPGDEVEAFTLEDANAQIL
NGQTGITLTYFDTQAGADTNDAAAQIFSPYTNTVNPQTVYVRAENDNTGCVSTITLDLRV
NPLPSPVAMPAAIEECDDDNDGFASFDLDAQSAIITNGEPDITISYYETQDDAMNMVNPL
VSPYNNIVANMQTIYVLAENDNTGCFTIVEMPLIVQPAPVVPLDIEDYIICDDDDDGFNQ
FDFDAVITPQIFTAGQTVADFTLTYHTTQANADSGNNPIINTSNYTNNSNPQTIYIRLES
NTNGCVTTGEFIIRVEFPPVLDPNYDNELAQCDDLDANYMEANDGFTSFDLTVEDSEIVN
GNNSWVVTYYETMADAQGDVNAIADPTNYTNTMNGPQTLYVRVTDNDTGCFSFTTVTLRV
LPNPSPTPDPEDLIVCDDTNAGDLIEVFDLTQNEIAIINGELNVTASYYTSQDDAITGNN
AIADPTMHTNEDPNNPGTGITPQTIYVRLTNGDDNTGLNGTGCYSLVSFDVIVNPLPTVT
PVDDYIICELFNDGMADFDLDGTMTAAILNGQDPSIFTVSYHETQAEADAAINGLNSPYT
NITNPQTIYVNITNTITGCDVATLNFNIEVQEAAQANPDGVAIVYEQCDDNMEFDGDPSN
DTVQFNLETQNPFVLDGQDANNYTVSYYENQADADAGTNPLPFLYENTSNPQVIIVRVDN
DTMIVTPISLDLSSLTTGLDVDSDGNIDTIDTNGDGVFDIVDINGDGIAEGFDSDADGII
DYIDLDGDGNGDLVDLNNDGVVDNGQDSSICYETAEVTLQVNPLPAFDLDDSYLLCINTN
GTEVVNSPLVDTGLDASLYSFEWSYEGNVMAGETGPSIMPTEGGNYSVIVTDTSTSANTM
CMSSDSTVVDVSEPPVISYELLTAAFADQHDVQVTASGSTATSIAVYEFSLNGGAWQLGT
ANADGSYSHTFTNIPAGGIVVTARDVNGCGEVSEEIMVLDYPVYFTPNGDGYNETWNIYS
ISNYPDAKIYIFDRFGKLLKQISPLGDGWNGTYNGNPMPTSDYWFTVEYTDTATNTKKHF
RAHFTLKR
NT seq
7407 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggaactttacgctaatcatctttttattatttatttccattccagtatttgcacaa
gatatattgatgcaaaacgggacgtttaaccaatgttcagggactttatatgactcaggt
gggccatcagcaaattattcaagtgatgaaaattttgtacttacaatatgtccagatgga
ccagaccagtttatacaattagactttactacttttggaacacaaggaggaagtgatatt
cttacaatttatgatggtgatgatactactgctccagtaattggatcttttgatggtggt
ggagttacaagtgatccaggaacaattatggcatccattacaagtgcaactgggtgttta
actttagaatttgtaagtaatgctactggaaatactattggttgggcagcagatattgat
tgttttacagattgtcaaactataacaccttcaatagattctacaaatccagcagtaaat
ggaacaggagtagttcaagtgttagttggtactactgtagactttacaggaagtgctgtg
ttttctgaagacggcacaggagcaacttataattggaattttggagatggttcgcctttt
ggaaccggagaaatggtctctaatcaatttgatactattggtacatacactacaacacta
acagttacagacacaaatcctttaggatgctctgaaacagcaacagtaactgttcaggtt
ttaggaccttatattgatgtagaccaaacaacatatacagtgcctcaattagtagaagat
gttttaattaacagtccttgtgcaacggtatccaatattaactggagtacaggaactaat
tttggagacgtaaatggtataggctattttagtgcacttccaggagcatttggttttgat
gcaggaatagttttaaattctggagacgctatggaggccgaaggaccagagtctggaata
caaagtagtggtggcggtgcttggccaggagatgctgatttagaggccgaaattaatacc
gatttagataatactccaggtgacgatttacctgctggaaattcaagaaatgcttcgttt
atagaatttgattttgtaccattagccgatactattacattcaatttcttatttgcatca
gatgagtatggagcgtttcaatgttctttctcagatgcatttgcatttttacttacagat
ttatctacaaatacaacaactaatttagcattagttcctggaacaacagatgttgtatct
gtttttactgttcgagataatgcttttgcaggaggatgttcttcagaaaacccaacatat
tttgattcttatcatggcgctggtggagaacctgcagcaaatgctccaatagattattta
gggtatacagtaccaatggcggcaattgctaatgtaacacctaataataattatagaata
aaacttgtagttgcagatgctagagatacatcatataattcagcagtatttttagaagct
ggttcttttagtttaggaggtgatttaggagacgatattactataaatgctggtacagca
gagtgccaaggtacaccagtagttttagacactcaattacctactgcaactcatacttgg
tatttagatggtgttgtaattcctggagaaacaaattcaacccttaatgctactcaagat
ggagaatatactgtagatattactttttctgctacatgtatggcgtcagattctattatt
atagaatttattcctggcccaacaatacaagcagttaatactattacagagtgtgatgat
ggtagtggagctgttgtttttgatcttacagaaaacgatgcacctgcttttggagctcaa
gatcaaacagcaaatagcttgtcttaccataattctaatgcagatgccatgaatggagta
aatcctattggagatcctgtaaattataatggtaccgatggagaaataatttatataaga
attgaagataatacaggaacatgtgcagatatagacatgtttactttagaatatttaaca
gtagctttaaatgatgctccagacattgtggtttgtgatgatctttctaatgatggtcaa
gaagagttcgatttaacaaaccaagatgcagcagttcttggagctcaagcagcctcagat
tttattgtaacctatcattcatctatagcagatgcagatacaggagcaaatcctttaaca
agtccatacacaagttctggtgaaattatatatgttagaattgaaagtgtagcgagtagt
gtttgttatatttcttctcaaaatgatgctgaaggatttacaattactattaatcctatt
gctgaagctgcacagccttcaaacctagaactatgcgacgattcttcaaacgatggcgta
gaaatattcgatttaacaaccgaggaagcagttattttaaacggtcaagatccggcaaat
tacacggtaagttattacgagcaaccaggtgatgtagcaacaagtaccaatgcaatagca
acaccaggagcttacccaaatatgtcaagcccacaaaccatatatgttcgtgtagacgat
aactctaatccagcatgttttggcgaaacaagttttacaataacggttaatccagaagac
gattcgacctttaccatgcaaccaacctgtgatggagctactgtagatacagtagccaca
ccaggcggcacctatgtattaaatccagatcctgcagatggctcagtaatagatgcaaca
acaggaacaataaccgacggattatcaggcgcgagttacactgtagattatacaacaaat
ggcacctgtccatcaacaagttcatttacagtaacagtagatataaccaatgatgcttca
tttactatgaatgctacctgtgatggtggaatagtaacaagcgaagccacaccaggcggt
acctatgcatttaatccaataccaacagatgctgctagtatagacccagtaacaggaaca
gtaacaggagccacatctgccactgtttatatggtagaatatagcttaggaggcgcttgt
ccgtcatcaacaatagaaacgctaaccgttttaactaccgatgatgctagtgtaacctac
acaccaacctgtgatggtggcgttgtagattcagaagccacaccaggcggaagctatgca
tttaatactgtgccaacagatggtgcgattttagataccactacaggcgctataaccgga
ggcacaccaggagcaagttacaccgtagattatacaacaaatggtagctgtccagcaaca
agtacaacaactgtaacagccaacccactaccaacagtagtaacaccaacacctttagaa
gtatgtgatgatgcgacaccagatggaataacagcaatagatttaacattaaaaaatcaa
gagatatcaggcggaaatccagcctatacagtaagctattattttacaccattagacgca
ataaatgcgaccaatccattagccataccttataccaaccaaacaccaaatatgcaaacg
gtatatgttcgagtagaagatgcaaacacgggatgttttgatacaacgagtttagaatta
gtagttgagcaagcaccagtagcctttacaccagcagctttagaatactgtgatccagac
agtgatgggtttggagagtttatgctatcagataccgaagcagaaatcacagcaggcgca
ccaggactaacagtcacttaccatgaaacgatggccgatgctatgaataatgttaatgcc
ttatcaagtccttacaataacattgtagcaaacatgcaaacaatttatgtacgagtagaa
agctctaccatagcaacagactgtgcgagttttgtagaacttgtattaatagtcaaccca
acaccacaaataaccgatccaacagcgttagaagtttgtgatgatgatgccgatggtttt
gctacatttaatttaccaagtaaagatgccgagattctaaatttattagataccgatcca
acaaacgatttagatccaacgcaatacacagtaacatattatataacaccaggcgatgct
atggcaggtacaaacccaatagcaacaccaaacgcttatgttaatactagtaacccgcaa
atagtacatgtacgagtagaagacacagctaatgattgttttacaaacacgacattagag
cttatagttaacccattaccagtacttgtgcaaccagatcctttagccttgtgtgatgtt
aataatccaggagatgaagtagaagccttcactttagaagatgcaaatgcacaaatacta
aacggtcaaacgggtataacactaacatactttgatacacaagcaggagccgatactaat
gatgcagccgcacaaatattcagtccatataccaatacggtaaacccacaaacagtatat
gtacgagcagaaaatgataacacaggctgtgtaagcacgatcacattagaccttcgtgtc
aatccattaccatcaccagttgcaatgccagcagctattgaagaatgtgatgatgataat
gatggttttgcaagtttcgatttagacgcccaaagtgctataatcaccaatggagagcca
gatatcactattagttactatgagacgcaagatgatgctatgaatatggtaaacccatta
gtgagtccatacaataatattgtagccaatatgcaaaccatttatgttttagcagaaaat
gataacacaggctgttttacaatagtcgaaatgccattaattgtacaaccagcaccagta
gtaccattagatatcgaggactatattatttgtgatgacgatgatgatggattcaatcaa
tttgattttgatgcagtaattacaccacaaatctttacagcaggacaaacagtggcagat
ttcacactaacgtatcacacaacacaagctaatgccgattcaggaaacaacccaattatt
aataccagtaactatacaaataactctaacccacaaaccatttacattcgattagagagt
aatactaatggatgtgttactacaggagaatttataatacgtgtagagtttccaccagta
ttagatccaaactacgataatgagttagcacaatgtgatgatttagacgctaactatatg
gaagccaatgacggtttcacttcttttgatttaacagtagaagattcagaaatagtaaat
ggcaacaacagttgggttgtaacctattatgaaacaatggcagatgctcaaggcgatgta
aatgcaatagcagacccaaccaactataccaataccatgaatggtccacaaacactttat
gtacgtgtgaccgataacgatacagggtgtttttcatttacaacagtgacattacgagta
cttccaaacccatcaccaacaccagatccagaagatttgatagtgtgtgatgataccaac
gcaggtgatttaatagaagttttcgatttaacacaaaatgaaatagcaattattaatgga
gaattaaatgtaacggcaagttactacaccagtcaagacgatgccattacaggaaacaat
gcaatagcagacccaacaatgcatactaatgaagatccaaacaatccaggaacaggtata
acaccacaaaccatttatgtacgtctaaccaatggcgatgataacacaggattaaacggt
acaggatgttacagtttagtaagttttgatgttattgtaaacccattaccaacagtaaca
ccagtagacgattatattatttgtgagctgtttaatgatggtatggccgattttgattta
gacggcacgatgacagcagcaatattaaacggtcaagacccgtcaatattcactgtaagt
tatcatgaaacacaggcagaagcagatgcagccatcaatggattaaacagtccgtatacc
aatattaccaatccacaaaccatatatgtaaacatcaccaatactattacaggctgtgat
gtagcgacactaaactttaatatagaagtacaagaagcagcacaagccaatccagatgga
gtagcaatagtatatgagcaatgtgatgacaatatggagtttgatggcgacccaagtaac
gatacagtacagtttaatttagaaacacaaaacccatttgttttagatggacaagacgct
aataactacactgtaagttactatgaaaatcaagcagatgcagatgcaggtacaaaccca
ttaccatttttatacgaaaacactagtaatccacaagtaattattgttcgtgtagataat
gataccatgatagtaacaccaataagtttagacctaagcagtttaacaacaggattagat
gttgatagtgatggaaatatagatacaatagataccaatggcgatggcgtgttcgatata
gtagatatcaatggcgatggcatagcagaaggatttgatagtgatgccgatggtattata
gattatatagatttagatggcgatggcaatggtgatttagtagacctaaataacgatggc
gttgtagataatggtcaagacagttcaatatgttatgaaaccgctgaagttactctacaa
gtcaacccgttaccagcctttgatttagacgatagttacctactatgtatcaatactaat
ggtacagaagtagtaaactcaccactagtagatacaggtttagatgcttcattatatagt
tttgaatggagctatgaaggcaatgttatggcaggagaaacaggaccatcaatcatgcca
accgaaggcggaaactatagtgtaatagtaacagatacctctacaagtgcaaatacaatg
tgtatgagtagtgatagtacagtagtagatgtaagcgaaccaccagtaattagttacgag
ctattaacagcagcctttgcagaccaacacgatgtgcaagtaacagcaagtggaagcaca
gcaacttcaatagccgtgtatgaatttagtttaaacggtggtgcttggcaattaggaaca
gcaaatgcagatggaagttacagtcacacctttaccaacataccagcaggcggtatagtt
gtaaccgcaagagatgttaatggttgtggagaagtaagtgaagaaatcatggtactagac
tacccagtttactttacaccaaatggcgatggttataacgaaacatggaatatatatagc
atctcaaattacccagatgctaagatttacatctttgatcgttttggaaaactattaaaa
caaataagtccattaggcgatggttggaacggaacttacaatggtaacccaatgccaaca
agtgactactggtttacagtagaatatacagacacagcaacaaatactaaaaagcacttt
agagcacactttacattaaagcgttaa
DBGET
integrated database retrieval system