Lacinutrix sp. 5H-3-7-4: Lacal_1996
Help
Entry
Lacal_1996 CDS
T01533
Name
(GenBank) ABC-type transporter, periplasmic subunit
KO
K02035
peptide/nickel transport system substrate-binding protein
Organism
lan
Lacinutrix sp. 5H-3-7-4
Pathway
lan02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lan00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
Lacal_1996
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lan02000
]
Lacal_1996
Transporters [BR:
lan02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Peptide and nickel transporters
Peptides/nickel transporter
Lacal_1996
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH01842
UniProt:
F6GFB8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2242862..2244490)
Genome browser
AA seq
542 aa
AA seq
DB search
MIKLKNKQYSSLINYLPIACLLFLFFSCSNKKNTIDDTLVFRYNEHKNIGSLDPAFAKDN
ADIWAVNQLFDGLVQMDDNLNAQPSIAKRWSISNDALTYSFSLRDDVYFHKHKLFGKDST
RTVTARDFEYSLFRNCDEKLASPGSWVVNNIWDIKAVKKDSLVIILKSTDPSFLGKLSMK
YCAVVPQEIVKHYGTAFRANPIGTGPFKFKRWEENIKLVFRKNNNYFEYDENGVQLPYLE
AIAITFLPDKQSEFLQFIQGNLDFLNSLDASYQDDILTSSGILRKKYSNNINMLRGPYLN
TEYLAFYLDSNIPEVQSQLIRQAINYGFDRKKMMTYLRNGIGIPANGGFIPKGLPGYNAN
IGFKYNPEKAKLLINEYKKESNNKTPEITITTTGNYLNFCEYIQRELQKTGLIVNVDVVP
ASTLKSAKANGKLDFFRASWVADYPDAQNYLSLYYSGNFAPNGPNYTHFKNSTFDKWYAQ
SFLETNTRKRELLYTKMDSLIMSKTPVVPLYYDEAIRFTKKEVKGLTSNPINLLKLKYVS
KL
NT seq
1629 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaattgaaaaacaagcaatattctagtttaattaactatttaccaatagcttgc
cttttatttttgtttttttcatgttctaacaaaaaaaatacgattgatgatacccttgtt
tttagatacaacgagcataaaaacattggttctttagatcctgcttttgcaaaagacaat
gcagatatttgggctgtaaatcaactttttgatggtttagtacaaatggacgataattta
aatgcacaaccaagtattgcaaaacgctggagtattagtaacgatgcacttacctactcg
ttttcattgcgtgatgatgtttattttcataaacacaaattgtttggaaaagattctaca
cgtacagtgactgcaagagattttgagtatagtttatttagaaattgtgacgaaaagcta
gcttctcctggtagttgggttgtaaataacatatgggatattaaagcagtaaaaaaagac
tctttagttattattttaaaatcaacagatccttcctttttaggtaaactatctatgaaa
tattgcgctgttgtaccacaagaaattgttaaacattatggcactgcctttagagcaaac
ccaattggaactggtccttttaaatttaaacgttgggaagaaaatattaaattggttttt
agaaaaaacaacaattattttgaatatgatgaaaatggtgtacaattaccatatctcgag
gctattgctattacctttttaccagataaacagagtgaatttttacaatttatacaaggc
aatttagattttttaaactcgcttgatgcttcttatcaagatgatattttaacaagtagc
ggtatactaagaaagaagtattcaaataatataaatatgcttcgcggcccttatttaaac
acagagtatttggcattttatttagattctaatatcccagaagtacaatcgcaacttata
agacaagcgattaattatgggtttgacagaaaaaaaatgatgacttatttgcgaaacggt
ataggtatacctgcaaatggtggttttataccaaaaggtttacctgggtataatgccaat
attggttttaaatacaatcctgaaaaagcaaaactattaattaatgaatacaaaaaggag
agtaataataaaactccagagataactattacaactactggtaattatttaaatttttgt
gaatacatacaacgcgaattacaaaaaactggacttatagttaatgtagatgttgtacct
gcttctactttaaaaagtgctaaagctaacggtaagttagatttttttagagcaagttgg
gttgcagattatcctgatgctcaaaattatttatcgctttattatagtggcaattttgct
ccaaatggtccaaattacacacattttaaaaacagtacttttgataagtggtatgcacaa
tcttttttagaaactaatactagaaaaagagagttattatatactaaaatggatagttta
ataatgagtaaaacacctgttgtacctctatattatgatgaggccataaggtttacaaaa
aaagaagtaaaaggcttaacaagtaacccaataaatttacttaaacttaaatacgttagt
aaactttaa
DBGET
integrated database retrieval system
