Lacinutrix sp. 5H-3-7-4: Lacal_2734
Help
Entry
Lacal_2734 CDS
T01533
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
lan
Lacinutrix sp. 5H-3-7-4
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lan00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lan02000
]
Lacal_2734
Transporters [BR:
lan02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Lacal_2734
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Plug
PEGA
EMC7_beta-sandw
DUF4397
SdrD_B
SpaA
Y_Y_Y
fn3_3
Shr-like_HID
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH02573
LinkDB
All DBs
Position
complement(3040921..3043299)
Genome browser
AA seq
792 aa
AA seq
DB search
MLKNISFIVLFAIQFSFSQSKISGTVTNNLNENIPFASVMLEGTNKGVSANENGYFEFTN
LTEGTYTIKVSSVGYKTQTNTIQLNNNESLTVTFKLQSDGDLEAVEVFGNRFKHPDKIEA
LTRLPLAPYEQIQSISIISDKLIEQQGNLTISDATKNVPGVYTFATYGNKRESMSSRGFR
GIPILKNGVRVHSDFRGVGVLTDMQGVDNIQVLKGAASITQGVATDLGSPGGIINLVTKT
PKYAFGGNVSLRGGSYGQARTTFDVYGPLTKTENTAFRINGALERADSYRSGIDSDRFYI
NPSFEWKADDKTTFTFEMDYFEDSRTPDLGTVNLGENNQNLIYDLPYDQFLGFEDDKSLT
TNTTFSLRIDRTLSDKLSLKVAFYKSNLELDDKGASLGGVVSDALGNAIYNQRSRGYSVA
TREDNNSVIQFDLIGDDLKTGSISHTFQVGFDYRTNEYNTTSQRVTTVDTIDVFTSNNRI
LPSDIELSAQTTAGAQSKALGFVAQDVVTFNKYLKAFIGLRYSKTRTITETETTESDAFN
PLGGIIISPFKNINVFASYTNSSYPRTGTRLDINGEELGNERYDQFETGIKTNWLNSRLR
FNFTYFKINNKDINLPVYDENWVETGYYAKGGNDERKGIEVELSGRVLENLEVITGYSYI
DAQYKEHTSYVYGSAPLNTPKHTFNAYANYSFKQKLEGLSLGAGVYYTGERPINDWSAGA
VTHEGIVPNQEPFNVDAYTQVNAQAAYRFNRHFNFRVLVNNVFNNIGYNAYRTSYINQTD
PRNFAGVLTYRF
NT seq
2379 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaaaacataagctttatagtattatttgctatacaattttcgttttcacaatct
aaaataagtggaacggtaacaaacaatttaaatgaaaatataccttttgcatcggtaatg
ttagaaggcactaataaaggtgtttctgcaaatgaaaacgggtattttgaattcactaat
ttaactgaaggtacttatactataaaagtatcttctgttgggtataaaacacaaacaaac
acaattcaattaaacaataacgaaagtttaaccgtaacatttaaacttcaaagtgatggc
gatttagaagcggttgaagtgtttggaaatcgttttaaacatccagataaaattgaagcc
ttaacacgtttaccgttggcgccatatgagcaaattcaaagtatttctataatttcagat
aaattaatagaacaacaaggtaatttaacaatatcagacgctacaaaaaatgttcctggt
gtttatacttttgctacatatggtaacaaaagagaaagtatgtcgtctcgaggatttaga
ggaatccctatattaaaaaatggagtacgagtacattcagattttagaggtgttggtgtt
ttaacagatatgcaaggtgtagataatattcaagttttaaaaggagctgcatctattacc
caaggcgttgctacagatttaggaagtcctggaggaattataaatcttgttacaaaaaca
cctaaatatgcttttggtggaaatgtgtccttacgtggtggtagctatggtcaagcaaga
acaacttttgatgtttatggacctttaacaaaaaccgaaaacacagcctttagaattaac
ggtgctttagaacgcgcagatagctatagaagcggaatagattctgaccgtttttatatt
aatccttcatttgaatggaaagcagatgataaaacaacatttacttttgaaatggactat
tttgaggatagtagaacgccagacttaggtacagttaatcttggtgaaaataatcaaaac
ttaatttatgatttaccttatgatcaatttttaggatttgaagatgataaatcattaacc
acaaacacaacattctctttaagaatagatagaactttaagcgataaattaagtcttaaa
gtagctttttacaaatctaatttagagttagatgataaaggtgcaagcttaggtggtgtt
gtaagcgacgcgttaggaaatgcaatttacaatcaaaggtctagaggttattctgtagct
acaagagaagataataatagtgtaatacagtttgatttaattggagacgacttaaaaaca
ggaagcatttctcatactttccaggttggtttcgattatcgtacaaatgagtacaataca
acctcacaacgtgttactacagtagatactatagatgtatttacaagcaacaatagaatt
ttaccaagtgatatagagctttctgcgcaaactacagctggagctcaatcaaaagcctta
ggttttgttgcacaggatgttgtaacttttaataaatatttaaaagcttttataggttta
cgttatagcaaaactagaacaattacagaaacagaaacgaccgagagtgatgcttttaac
ccattaggaggaattataatttctccatttaaaaacataaatgtatttgcttcttacacc
aatagctcttatccaagaacaggaacacgtttagatattaatggagaagaattgggtaac
gaacgttacgaccaatttgaaacaggtattaaaaccaattggttaaacagtaggttacgt
tttaatttcacctattttaaaattaataataaagatattaaccttcctgtttatgatgaa
aattgggtagaaacaggatattatgctaaaggtggaaacgatgaacgtaaaggtattgaa
gtagagcttagtggtcgtgttttagaaaaccttgaagttataacaggatattcttatata
gacgcacagtacaaagagcatacatcttatgtctatggatctgcaccattaaatacacca
aaacatacttttaatgcgtatgctaattacagttttaaacaaaagctagaaggcttatca
ctaggagctggtgtatactatactggcgaaagaccaattaacgactggagtgcaggagca
gtaacacatgaaggtattgtaccaaatcaagaaccatttaatgtagatgcttatacacaa
gttaatgcgcaagctgcatataggtttaatagacactttaattttagagtacttgttaat
aatgtgtttaataatataggttataacgcatatagaacaagctatattaaccaaacagac
ccaagaaattttgcaggagtattaacctacagattttaa
DBGET
integrated database retrieval system