Lupinus angustifolius (narrow-leaved blue lupine): 109360644
Help
Entry
109360644 CDS
T04664
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
lang
Lupinus angustifolius (narrow-leaved blue lupine)
Pathway
lang03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lang00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
109360644
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
lang03019
]
109360644
Messenger RNA biogenesis [BR:
lang03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
109360644
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109360644
NCBI-ProteinID:
XP_019461225
UniProt:
A0A4P1R5D9
LinkDB
All DBs
Position
LG11:complement(18341797..18345358)
Genome browser
AA seq
470 aa
AA seq
DB search
MDSDEGKLFIGGISWETTEDKLKEHFTNYGDVLNASVMRDKNTGKPRGFAFVVFSDPAIL
DRVLQDKHVIDGRTVDAKRALSREDQQISGNSRAGNPNSALHSGNGGNMKTKKIFVGGLP
PTLSEENFRQYFESYGNVTDVVVMYDQSTGRPRGFGFISFDTEDAVERVLHKTFHDLNGK
QVEVKRALPKDANPGSGGRMMGGSSGGGGYQGYGASGGNQNAYDGRVDSSRYMQSQSNAG
GFPPYASSGYSAPGYGYGPANNGMGYGAYGSYGAAAAGYGGPAGATYGNPNVPNAAYAGG
PPGGPRSSWPAQAPSGYGSVGYGNTAPWGAQSGGGGGPGSAAAGQSPSGAAGYGSQGHGY
GGYGGYDGSDSSYGNPGVYGAVGGRTGSASNTNASGPDGSELQGSGGSGSYVGTGYGDSN
GNSGYGNAAWRSEHSQASGNYGTHGNGSHGGQVGYGGGYGGAQSRQSQQQ
NT seq
1413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatgaaggaaagcttttcatcggtggaatttcatgggaaactactgaagac
aagctcaaagagcatttcaccaattacggcgacgttttgaatgcttctgttatgcgtgat
aagaacactggaaaacctagaggatttgctttcgttgttttttcagatcctgctattcta
gatagggttcttcaggataaacatgttattgatggaagaacggttgatgccaagagggcc
ctctcgagagaggatcaacaaatttctggcaattctagagctggaaatccaaattctgct
ttgcattctggaaatggtggaaatatgaagaccaaaaagatatttgttggagggttgcct
cccaccctgtctgaagaaaatttccgtcagtactttgagtcgtatggcaatgtgactgat
gtcgtagtcatgtacgaccagagtactggacgcccacgaggatttgggtttatttctttt
gatactgaggatgctgttgaaagggttttgcacaagacatttcatgacttaaatggtaag
caagtagaggtaaagcgtgcacttcccaaggatgccaatcctggttcaggtggtcgaatg
atgggtggtagttctggaggcggtggctatcaggggtatggagcatctggtggcaaccaa
aatgcgtacgatggccgtgtggattctagtaggtatatgcaatctcaaagtaatgctggt
ggattcccaccttatgcttcttctggctatagcgcccctgggtatgggtatggtcctgct
aataatggcatgggttatggtgcatatggaagttatggtgctgctgctgctgggtatggt
ggacccgctggtgcgacatatgggaatccaaatgtccctaatgctgcctatgctggtggt
cccccaggtggcccaaggagttcatggcctgctcaggctccctctggttatgggtctgtg
ggctatgggaacactgctccttggggtgctcaaagtggaggcggcggcggtcctggttcg
gctgctgctggtcaatcccctagtggagctgctggatatgggagtcaaggacatggatat
ggagggtatggtgggtatgatggaagtgatagttcttatgggaaccctggtgtatatggt
gctgttggagggcgtactgggagtgcatccaatactaatgctagtggtcctgatggaagt
gaactacaaggtagtggtggcagtggaagctacgtgggcactggctatggggattcaaat
ggaaattcaggttatggaaatgcagcttggagatctgaacattctcaagcctctggaaat
tatgggactcatggaaatggctcacatggtgggcaagttggttatggtggtggctatggt
ggtgctcagtctcgccaatcccaacagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
