Legionella antarctica: TUM19329_09940
Help
Entry
TUM19329_09940 CDS
T07713
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lant
Legionella antarctica
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_At5g56370
LRR_SKP2
LRR_4
LRR_FBXL15
LRR_At1g61320_AtMIF1
LRR_FBXL18
LRR_14
AAA_5
AAA_16
AAA_14
NB-ARC
NACHT
nSTAND6
nSTAND3
TsaE
NTPase_1
LRR_8
DUF717
RsgA_GTPase
zf-CCCH_12
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCA94633
UniProt:
A0A6F8T349
LinkDB
All DBs
Position
1035691..1043544
Genome browser
AA seq
2617 aa
AA seq
DB search
MPITSNYTLQVESSERTYCSTANNGGVIDVGRMLQNKPFWRQPQGMTLEMNKTLIINDPA
IACWDHNQCIVAAERFNVLQQEGFKIYFYRKGAFSELNTSSLKSPKSIVDATPVTDLQIS
QLAAIKLRLSYDHLLVLNHEHLVALMQGTDDDWLNLNSFQHIDLRETNINTASLTTLLKT
FGDRIKSLNLSRCVNLKEGTLPGDIDLVSMEELIITDEFDNKCTIPALNQEYSPRENNLS
ADSIKHLLQSTRILKTLKLGRGFNRIRDIITDLEFPFLERIDLSSSNITSMSLNTLLAKT
TCIKELNLSDCMKLDDNQLFDHLNTGLLETLDLSGSNITCHSLGRLLAKATQLKILDLNS
CYGLDDEPLPNDFDLSALETLNLSRSNITSQSLGRLLAKVTKLTILDLRGCLHLEDNSLP
NHLNLASLEELDLNGTNITSQSLGRILSKATKLKILDLRDCEELYNNPLPEYLDLSSLET
LDLGGTNNISSQSLGRLLAKATKLKILDLSGSEVTIQSLGTIVAKTTKLTKLDLSSCNIL
VKNQLPVNVDLSALETLDLTRSSITSQSLGIILAKASQLKVLNLTNCYQLANNPLLHDLD
LFNLENLSLSHSNMTSQTLGRILAKTTQLKVLDLTNCNNLDDTSLPHNLDFSSLEELDLR
DSNIGCQSLGSILAQATKLRMLDLTRCPYLADNQIPDYLSFSSLEELDLSGSNLTSQSLG
RILANTKKLTKLNLSGCDNLANKQLPNDLDLPTLETLDLTRSSITSQSLGRILAKTTQLK
ILNLTNCYNLDDNQLANDLNLSSLETLNLSHSNITCQSLGRILAKATKLKVLNLTNCSNL
GDNQLPQDLNLSSLEELDLTESKINCQSLDRILVKTTKLTKLNLGDCNNLADIQLPKDLD
LLSLEMLNLSGSNITGLSLGRLMAKATKLKILDLRGCRNLDVNQITNDLNLYALKKLDLS
RSKITSLSLGRILARTTKLKILNLSDCSHLAETQLPNNLDLSNLESLSLSNITSQSLVRL
LTKTMNLKKLKLKNCHNIAPIQLPNEFDLPALKTLNLNHSNMTSQYLNRILANTTRLKKL
KLKNCYNLANIQLPNELDLSSLKELNLAGSSITSDPLYRILAKTTAKLTKLELKNRHNLD
ESDFTDNMDREPLGQITLEKSAISPDLLKKIKAKALHQITTDYPGELSSIPTSSDKSISN
VRSADDTKSLDADTQFNPNLQLHLTRIFYAKDEKNHPCPTEYRLEAFNKITVNDAQCGLN
NAFNLSNISLDVNIEARNITRSLEDLKSQLTEENQYYGIQKINLSTTWQFLASLDAEEIM
THYHLSHPDEVEIGYSTRDNMYCIRRSPDSSQTNNPITIGFILNIPQKRSQDSFPHGIQQ
KIGECSEFTAKPLKITQDHPTGADYLSALQEQKVGACRHRALIFKAWMDEHHPAFKTRII
NNDCHSYVETKHQEHWITCNLGGYPADLMIDEPKKPERIPKKYFQPDNVEEKFPLQTHLY
MQHLLSSPGIKKLIHVSSSQSLNGFRHHLQQQCKSTSRPCFYIHSPQDLICSAPYIKRDG
TTGLIKRGPGGPLHQFLMEHSKDGSNPVLIVNYDRFSATDIVRFNALLDKERLADGSPLP
EKATVIGLMNPNKPGAYHGADFRSRFAAIRTNKLPDGNLVIPPVTTEERNLTQDAYSINL
YGGADWEDRLLGHWVLQGNTLQFVEGALLAALKNKNSTIELKNAPWANEAFQCFWQGALL
FGSFQSQGRRYQLPKDFKLHKSEGYSFHNMNITINEDEDIPTDALALNRGTLAHFLSQYH
CDNARKTIQYGEGLLALNHNNTVSLYLSDSLSLSSWALFLDACQQHKVSINLTLAPGVTL
PKELAIDTKKRTAAAGLPWSSEHLPDTACVHSTDMDVTLATMSDESAIIIDVSEVLPANL
LMRLDGTFDDKTLTFSFNEQEGALLSAIKANKNVILKGRIQEDLRHALANFLLQRQHDPK
PKGRLIVICDQAHLFPMVSSFTHEVRLDEKEQLLLPHQFSRELIAKHSASELQAMTRHQK
LHPDEPGENAWQGLRTISLSVTPGEVDLNDAEQVAAEFDEQRLNKVAQVLMQSPFVFLAG
MTGVGKTTFIHEVWKKIHSRLYLGEASLLAWAKDTNSGIKTLFIDEANISSRQWSDFEGL
FHKPPRILIGNQVITLSEQHKVIFAGNPLSYGGDRQIPSLFARHGNSLIFDPMPPAYLYV
KLLKPILDNSELNSKELAQSILEAAQYLSALDRTTVLITPRELSMMALLTVSYCKQNPES
DSIEVARYYAYNLAKNYVPDHAKQAFQIRFKPQEALQRNAIEKPDKLLITTTNQPAFETL
CDLLNLRALRQMKSIQPEGGLGGLILEGEPGLGKTELVVKTLLAHGLEKGNINDQALDKQ
VFYVMPVSMALAEKEKMLLKAFHEGAPVVIDEINSAPMMERLLNDLLMGKDPNGNLANKP
GFMVIGTQNPPTMAGRTSTSTALEHRMLQITLTQYPKNEMIEILTYKGLPQNISQDMVEE
FLSLQQKSLQESSPTLCFRDLLQRAEQELLALSKLSQAVRTSNKLEINIDTKAEAMWDSS
CTLFRPMQYSSPRITDAFKLSSTIEEFYGTDSEVSSP
NT seq
7854 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgccaataacgagcaactacacacttcaagtcgaatcctcagaaagaacgtactgtagt
acagctaataatggtggcgttattgatgtggggcgtatgttgcagaataagcctttttgg
cgacaacctcagggtatgaccctggagatgaacaaaactctaataatcaatgatccagct
atagcttgctgggaccataatcagtgtatcgtagcagcagagcgatttaacgtattgcag
caagaaggatttaaaatttatttttatcgaaaaggtgccttctctgaacttaatacatct
tcattaaaatcccccaaatcaatagttgatgcaacacctgtaactgacctgcaaattagc
caacttgctgcaataaaacttcgcttaagctatgatcacttgttggtactcaatcacgaa
caccttgttgcattaatgcagggtactgatgatgactggttaaatttgaactcttttcag
catatagatcttcgagaaaccaatataaatacagcttcattaaccacattacttaaaacc
tttggggataggattaaatctctaaacctgtctcgttgtgtcaatcttaaagaaggcacg
cttcctggcgacattgatttagtgagcatggaagagttaattataactgatgaatttgat
aacaagtgcactatcccggctttaaatcaagaatacagcccaagagaaaacaatctgagt
gcagactctataaaacatctactccagtccacccgtatccttaaaacacttaaattaggt
cgaggctttaatcgtataagagatatcattactgatttagagttccccttcctggaaagg
atcgatttatcgagctcgaacatcacgagcatgtctttaaacacacttttggctaaaacg
acatgtattaaagagcttaatttaagtgattgcatgaaacttgacgataaccagttgttt
gatcacttgaacactggcttactggaaacgcttgatttaagcggctctaatatcacttgc
cattctttaggccggcttctggctaaggcgacacaacttaaaatacttgatttaaactcg
tgttacggccttgacgatgaaccactacccaacgacttcgacctgtccgctctggaaacc
cttaatttaagccgctctaacatcaccagccagtcattaggcaggctactggccaaggtg
acaaaacttaccatacttgatttaagaggatgcctacacctagaggataactcactacct
aatcacttgaaccttgcctcgctggaagagcttgatttaaacggtactaacatcactagc
cagtctttaggcaggattttgtccaaggcgacaaagcttaaaatacttgatttaagagat
tgtgaggagctttacaataacccactacctgaatatttagacctctcctcgctggaaacc
cttgatttaggcggcactaacaacatcagtagccaatctttaggcaggcttttagccaag
gcgacaaagcttaaaatacttgatttaagcggctctgaagttactatccaatctttaggc
acgattgttgccaagacaacaaaacttacaaaacttgatttgagttcttgtaatatcctt
gtcaaaaaccaactacccgttaacgttgacctgtcagccctggaaacgcttgatttgacc
cgatctagcattacgagccagtctttaggcataattcttgccaaggcgtcacaacttaaa
gtccttaatttaaccaattgttatcagcttgccaataacccactactccatgatttagac
ctgttcaacctggaaaatcttagtttaagccactctaacatgactagtcagacattaggc
aggattcttgccaagacgacacaacttaaggtactggatttaaccaattgtaataacctt
gacgatacctctctgccccataacttagacttctcctccctggaagagcttgatttaaga
gactcgaacattggttgccaatctttaggcagcatcttagcccaggcaaccaagcttaga
atgcttgatttaacacgatgtccatatcttgctgataaccaaatacctgattatttatcc
ttctcctcgctggaagagcttgatttaagtggatctaacctcactagccagtcgttaggc
agaattcttgccaatacaaaaaaacttacaaaacttaatttaagtggttgtgataatctt
gccaataaacaactacccaatgacttagacctgcccaccctggaaacgcttgatttaacc
cgctctagcatcacgagccagtctttaggcaggattcttgccaagacaacacagcttaaa
atccttaatttaaccaattgttataaccttgacgataaccaactagccaatgacttaaac
ctatcctccctggaaacgctgaatttaagtcactctaacatcacttgccagtctttaggc
agaatacttgccaaggcgacaaagcttaaagtccttaatttaaccaattgcagtaacctg
ggcgataaccaactacctcaagacttaaacctttcctcgctggaagagcttgatttaacc
gaatctaaaatcaattgccagtctttagacaggattcttgtcaagacaacaaagcttaca
aaacttaatttaggtgattgtaataaccttgccgatattcaactacccaaagatctagac
ctcctctccttggaaatgcttaatttaagcggttctaacatcacgggcctgtccttaggc
aggctaatggccaaggcgacaaagcttaaaatacttgatttaagaggatgccgaaacctt
gatgttaaccaaataaccaatgacttaaatctgtacgccttgaaaaagctcgatttaagc
cgttctaagatcacgagcctgtctctaggcaggattcttgccagaactacgaagcttaaa
atacttaatttaagtgattgctctcaccttgccgagactcaactacccaataatttagac
ctgtctaacttggaaagtctgagcctatctaacatcactagccagtctttagtaagactt
ctaaccaaaacaatgaaccttaaaaaacttaagttaaaaaattgtcataacattgcccct
attcaactacccaatgaatttgacctccccgcgctgaaaacgttaaatttaaaccattct
aatatgacgagccagtacttaaacaggattctagccaatacaaccaggcttaagaaactt
aagttaaaaaattgttataacctggccaatattcaactacccaatgaattagacctttcc
tcgctgaaagagcttaatttagccggctctagcatcacgagcgatcccttataccggatt
ctggccaagacaacagctaagcttacaaaacttgagttaaaaaaccgtcataaccttgat
gaatccgacttcacggataacatggatcgtgagcccctgggccaaattactcttgaaaag
agcgctatctcacctgatctgctaaaaaaaatcaaggccaaagcactgcatcaaatcacc
actgattatccaggagagctaagcagcatacccacctcaagtgataaaagtatcagtaac
gttcgaagtgctgacgacactaaaagtcttgatgcagatactcagtttaatcccaactta
cagctccacctgacacgaatcttttatgctaaggatgaaaaaaatcacccttgtccgacc
gagtaccgactcgaggcttttaataaaattacagtgaatgacgcccagtgtgggctcaat
aatgcatttaacttaagtaacattagtcttgatgtaaacattgaagcacgcaatattacg
cgaagcctcgaggacctaaaatcgcaactgactgaggagaatcaatactacggcattcag
aaaataaacctcagtaccacatggcaatttctggcttctctggatgccgaagagatcatg
acgcattatcacctgagccatcccgatgaggtggaaattggttattcaacgcgtgacaat
atgtattgtatacgcagatcgccggactcaagccagaccaataatccaattaccattggg
ttcattctcaatataccccaaaaaaggagtcaggattcatttcctcatggcattcaacaa
aagataggtgagtgcagcgagtttacagccaaacctttaaaaataacccaggatcatcca
acaggagcagactatctctcagccctgcaagagcaaaaggtcggagcttgccggcaccga
gccttgatatttaaagcatggatggatgagcatcaccccgcttttaaaacccgtattatt
aataatgactgccatagttatgtcgagaccaaacaccaggagcactggattacctgtaat
ttagggggctatccagcagacttgatgattgatgagcccaagaaacctgaacgcatccca
aagaagtattttcaaccagacaatgtagaggaaaaatttccacttcaaacacatctctac
atgcagcatctgttgtcttcaccaggtattaaaaaattaattcatgtgtccagttctcaa
agtcttaatggctttcgccatcatctgcaacagcaatgtaagagtacgtcaagaccatgc
ttctatatccattcgccacaagatttgatttgctccgcgccttatattaaacgagatgga
actacaggcctaatcaaaagaggcccgggcggtcctttgcatcaatttttaatggagcac
agcaaagacggcagtaaccctgtattaattgtgaactacgaccgctttagtgccactgac
atcgtgcgctttaacgccttgctggataaggagcgtttagcggatggcagtcctttaccc
gaaaaagcaacggtgattggtttaatgaaccccaataaacccggtgcctatcatggcgct
gattttcgctcacggtttgctgcgattcgtaccaataaattgcctgacgggaacctggtt
attccaccagttactacagaagaacgtaatttaacacaggatgcttacagtattaacctc
tatggtggtgctgattgggaagaccgtcttctagggcattgggtcttgcaggggaatacg
cttcaattcgttgaaggcgcattgcttgcagcgcttaaaaataaaaattcaactattgaa
ttaaaaaacgcgccttgggctaatgaggcatttcaatgcttttggcaaggggcattattg
tttggctcctttcaaagtcaagggagacgttatcagttgcccaaggattttaagctccac
aagagtgaaggctactcattccataacatgaacattacgattaatgaagacgaggatatt
cctaccgatgcccttgctttaaatcgcgggacgctggctcattttttaagccaatatcat
tgtgataatgcaagaaaaaccatccaatacggagaaggactccttgctctaaatcataac
aacacagtatctctttatttaagcgactccctgagcttaagttcctgggcgctcttttta
gatgcctgtcaacaacacaaggtttctattaatctaaccctagctccaggtgtgacgtta
cccaaagagcttgccatcgacactaaaaaaagaacagcagcagctgggctcccgtggtct
tctgaacacctgccggatacagcttgcgtacacagcaccgatatggacgtcactttagct
actatgagtgacgaatcagcgatcatcattgacgtgtccgaagtattgccagctaatctt
ttaatgaggcttgatgggacctttgatgataaaaccttaacctttagttttaatgagcaa
gaaggtgccttgttatccgctattaaggccaataaaaacgtcattttaaaaggacggatt
caggaagatttacgccatgctttagccaattttttattgcaacgacaacacgacccaaaa
ccaaagggtcgtttaatcgtgatatgcgaccaagctcatttatttcctatggtttcttca
tttacccatgaagtgcgccttgatgaaaaagagcaactgttactacctcatcagttctcc
agagagctgattgcaaagcactctgcttctgaacttcaggccatgacacgacatcaaaaa
ctgcatcctgatgaaccaggagaaaatgcgtggcagggattaagaacgatatccctctct
gtcactcctggagaagttgacctaaacgatgcagagcaagtagccgcagagttcgatgag
cagcgcctaaacaaagtggctcaggttttaatgcagtcccctttcgtatttcttgctgga
atgaccggagttgggaaaaccacgttcatccatgaagtatggaagaaaattcacagcagg
ctttatcttggagaagcaagtctactcgcttgggctaaagatacaaattcgggtattaaa
accctatttattgatgaagccaatatctcatctcggcaatggagtgattttgaggggttg
tttcataaaccgccaagaatattaattggcaaccaggtcataacccttagtgaacagcat
aaggtcattttcgcaggaaatccactgtcctacggtggcgatcgccaaatcccttccttg
tttgcacgccatggtaacagccttatttttgaccccatgccccctgcttatttgtatgta
aagctcctcaagcccattttagataactccgaattaaacagtaaagaactggcacaatct
attcttgaagctgctcagtacctcagcgctcttgataggacaacagtattaatcacccca
cgcgaattaagcatgatggctttactcaccgtaagctactgcaaacaaaatcctgaatcc
gattcaattgaagtggctcgatattatgcctataacttggctaaaaactacgttcctgat
cacgctaaacaggcttttcaaatccgattcaagccccaagaggcactgcagcgaaatgcg
attgaaaagcctgataagctccttatcaccaccaccaatcagcccgcttttgagaccctt
tgcgacttattgaatttaagagccttgcgtcaaatgaaaagcattcaaccagagggtggt
cttggcggtctcattcttgaaggcgagccgggtcttggcaaaacagaactcgtagttaaa
acattgctcgctcacggcctggaaaaaggcaatatcaatgaccaagcgctggataaacag
gttttttatgtaatgccggtaagcatggcattggctgaaaaggagaaaatgttattaaaa
gcctttcacgaaggtgcgcctgtagttattgatgaaattaatagcgctcctatgatggag
cgcttgctaaatgatttattaatgggaaaagatcccaatggtaatctcgccaataaacca
ggatttatggtgattggaacccaaaatcctcctaccatggctggccgcacatccaccagt
actgccctcgaacatcgaatgctacaaatcactctcacccaatatcccaaaaacgaaatg
attgaaatcctgacttacaagggtttacctcaaaatatcagtcaggatatggtagaggaa
tttctaagcctacagcaaaaatcactgcaggaatcatccccaaccctatgctttcgcgat
ttactacagcgagcggagcaagagctacttgctttatcaaaattaagccaagccgttagg
acctcaaataaacttgaaataaatattgatacaaaagcagaggctatgtgggatagcagc
tgtactctatttcggcctatgcaatatagctcacctcgcatcacagatgcttttaaacta
tccagtactattgaggagttttatggcaccgattcagaggtatcatcaccgtaa
DBGET
integrated database retrieval system