KEGG   Lactobacillus sp. wkB8: LACWKB8_0953
Entry
LACWKB8_0953      CDS       T03355                                 
Name
(GenBank) DinG family ATP-dependent helicase YoaA
  KO
K03722  ATP-dependent DNA helicase DinG [EC:5.6.2.3]
Organism
law  Lactobacillus sp. wkB8
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:law00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:law03400]
    LACWKB8_0953
Enzymes [BR:law01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.3  DNA 5'-3' helicase
     LACWKB8_0953
DNA repair and recombination proteins [BR:law03400]
 Prokaryotic type
  Other factors with a suspected DNA repair function
   DNA helicases
    LACWKB8_0953
SSDB
Motif
Pfam: Helicase_C_2 RNase_T DEAD ResIII DEDDh_C Spectrin
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIS09224
LinkDB
Position
complement(982228..985014)
AA seq 928 aa
MKSFANTVFAVVDLETTGTQREDNNHIIQFGCAIIKNLKVVKTYSFLINPHREIPIAVQN
LTHIHDKDVAHQKDFSYYAPQIIKILKDTVFVAHNVNFDLPFLNYELVEHGYEPLTNRAI
DTVELAKIAFPTEPSYKLSDLTAQLQIEHLNPHKADSDAYGTAVLLIKIIRRLEKLPQAT
LNTLSSLAHGLIRDTSWIFTTIADDARKEKRPLPAKYQQVRQIILRKQKSVANNEQEHSA
TFPQSDQAKRKLFKKKINYRQPQVDLINQIEQFINISDQKALLVEAPNGTGKTFSYLFAY
SYQLYTSRKLVIATPTKVLQRQIINKEIPQLLNVTNLDLKAEEVKASNHYLDLDGFYQSL
YQDTPNKLTLVLQMRILVWLTETNTGDLDELQLTNYRAPLFAQIAHPGDARVGSSFAKVD
FWNLARQRQEQADILVTNHAFLANHYNDTIWGQNPYLVIDEAHRFVDNVISSRNDSFQFE
SLWGALTHLRNLLFYADDSVFNQYGNDVQFNFLLEKLDPQILDLIKVINHLQHLLCSKKK
KAVSQSVLANGNLLLSFKGTDLFPKNNQFLVKLAELQRKLENVRQQTNQILFKLYNETDS
SNIDRDAILSDISAQIDQLDYYITKSYQLSDLLRKRTYLDLEGFIVSLTNPQDPLSANLS
WLMLDATPELRKIYDRFDHILFVSATLTSENGFDFIVKQLGLTDLTPQEYVGTSTFKLAD
HLEVLSVNDLPDVNEPTFAKILIQILEHDLQTKNHVLVLMTNLELIKNVYSAIINSPHLR
DFEILAQGVSGSNNRIIKRFAIAKRAIILGADSFWEGIDFHECGVDLVIATKLPFESPDL
PEVKLRQKQLVDSGVDVFHSDTMPRAIIRFKQGMGRLIRGEQDRGQFLILDSRLWTKDYG
QVFLAAIPVKVKKINLNELEEKLDNYDK
NT seq 2787 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaagtcatttgccaatactgtttttgctgtagtagatttggaaactaccgggacacag
cgtgaagacaacaatcatattattcagtttggttgtgccataataaaaaatctaaaagtt
gtaaaaacgtattcttttttgattaatcctcaccgtgaaattcctatagctgttcaaaac
ttaacgcacatacatgataaagatgttgctcaccagaaggacttttcatattatgctcct
cagattattaagattctcaaagatacagtttttgtagctcataacgtcaactttgatttg
cctttcttaaattatgaattggtagagcatggctacgagcctcttactaaccgggcaatt
gatacggtggagctagctaaaatagctttcccaaccgaaccatcctataagttgagtgat
ttgactgctcaattacagattgaacatttaaatccgcacaaggctgattccgatgcttac
ggaactgctgtgctgctaataaaaattattcgccgcttggaaaaattaccgcaagcaact
cttaacacacttagttcattagcacatgggttaattcgtgatacgtcatggatttttacc
acgatcgctgatgacgctcgcaaagaaaagcgtcctttacctgccaaatatcagcaggta
cgtcaaataattttaagaaaacaaaaaagcgtagctaataatgagcaagagcattcagct
acttttcctcaaagtgatcaggcaaaaagaaagctttttaaaaagaaaataaattatagg
cagcctcaagttgatctgattaaccagattgagcaattcattaatatttctgaccaaaaa
gctttgctggttgaagcaccaaacggtaccggaaagacattttcatatttattcgcatat
tcttatcagctttataccagtagaaaattagtaattgccacgccgactaaagttttgcaa
agacaaattattaataaagagatacctcagttattaaatgtgacgaacttggatttaaaa
gcagaagaagttaaggccagcaatcattatcttgatctagatggtttttatcaaagttta
taccaagatacaccaaataaattaactctggttttgcagatgcgaattttggtttggtta
actgaaacgaatacgggtgatttggatgaattgcagttaacgaattatcgagcacccttg
tttgcacaaatagctcatccgggggatgctcgtgtcgggagcagttttgcgaaagtggac
ttttggaatctggcaagacaacgtcaagaacaagctgatattctagtaaccaatcacgca
tttttagctaaccattataatgacactatttggggacaaaatccctatttggtgattgac
gaagcacatcgctttgtagacaatgttattagttcgcgcaatgattcttttcaatttgaa
tccctatggggagccctaactcatttgcgtaatttgcttttctacgctgatgacagtgtg
tttaaccaatatggcaatgatgtccaatttaattttttactggaaaaattagatccccaa
atattagatttaattaaagtaatcaatcatttgcaacatttgttatgctctaaaaagaaa
aaagccgtcagccaaagtgttttggctaatggcaacttacttctcagctttaaaggcaca
gatttatttccgaaaaataatcaatttttagtaaaactagctgagttacagcgcaaatta
gaaaatgtcaggcagcaaactaaccagatcttatttaaactttataatgaaactgatagt
tctaatattgatcgggatgctattttgagtgatatttctgcccaaatagatcagttagac
tactacattactaaaagctatcaattatcagatttattgcggaaaagaacttatcttgat
ctcgaaggatttatagtttctttaaccaacccccaagatccattgagtgccaacttaagc
tggttaatgctcgatgctactccagaattacgtaaaatatatgatcgtttcgatcatatt
ctgtttgttagtgcaactctgactagtgaaaatgggtttgattttattgttaagcaactt
ggtttgacagacctgacaccacaagaatatgtcggcaccagcacctttaaactcgctgat
catctggaagttttatccgttaatgatttacctgatgtcaacgaaccgacttttgcaaaa
attttaattcaaattctagagcatgacttgcaaaccaaaaatcatgttttagttttaatg
actaatttggagttaataaagaatgtttacagtgcaatcattaactcaccgcacttacga
gattttgaaattttagctcaaggcgtctccggctcaaataaccgtattatcaaaagattt
gcaatagcaaaaagagctattatccttggagcagacagcttttgggaagggattgacttc
catgaatgtggtgttgatctcgtaatagcaactaaattgccgtttgaatcaccagattta
ccagaggttaaattgcgccaaaagcaacttgttgatagcggcgttgatgttttccattct
gatactatgccgcgagcaattattcgcttcaagcagggaatgggcagattaattcgcggt
gaacaggatagggggcagtttttaatcttagattcacggctatggactaaagattatggg
caagtctttttagctgctatccctgttaaagtcaaaaagataaatttaaacgaattggaa
gaaaagttagataactatgataaatga

DBGET integrated database retrieval system