Lactobacillus amylovorus GRL1118: LAB52_04520
Help
Entry
LAB52_04520 CDS
T01954
Name
(GenBank) mucus binding protein
Organism
lay
Lactobacillus amylovorus GRL1118
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Muc_B2
MucBP_2
YSIRK_signal
Gram_pos_anchor
DUF7167
PepSY_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEA31867
LinkDB
All DBs
Position
889834..894291
Genome browser
AA seq
1485 aa
AA seq
DB search
MVSKNNRIKRLEEVAGRQSHFGIRKLTVGAASVLLGITLLFGANAKVAKAAGTEGASAAN
SVNNEKRGSTDDPAEGRTPNVNNEQKPAADPSKATDEATAYKNLKSAIEQARNTKGLTVS
GPYDSKPGDNARIPDELDKSKVGVIYDNEKLSAEDMQKQADEIQKKIKNYVENRNEFIQG
LKKQGIYKDGDVDPTTLAQHLILQSEPQAKSEYKIQDNNGNWTTKENDVVTVTRDPHAPF
VNAPNAPFVNPAYAVQLKNNNQVTGPIIQITYTNLEHSEYDGKPLGKIVETFSDVHATDI
NDQKAAFYISTNPTNGWLYTHCDGVTVTIQLYDNQAQPIKIDSSAYVSVSSLNSNGLTAT
PKGEISDIKGRTETAQLLSKGSAMSIPESSVQVFPGNKVFSPSDNEDLLYNKTHNKDQIN
YWGKFFAPREADWNKLSPDQQEDEIQKVGNYVIKNYSDWDNTGSKKIFGSALYKVEENPI
VIRSYVIRNSSNTIPGYWFTYSTTVPQTSFDANNTISYHFATAHSVTDAPKTVDGSQTVE
YIDGKTKQRISEKDYPDKIQRVTFTGANGTVTDKSGNKYNVKRDTVTNKIVKVNSQTGEI
TDLTDKDNVIYNWTWNTNGKYGNASQVTADNVDVPKINGYIASIDTEIVSTEKNTTQPGK
IVPIKDKNGKETGKYVVPGNSISVDNPTTVVKVIYNQLGHIIPVDTANEEIPGTTSEQYK
NAAVDPTKFKDPIPQSSYKNKADPRDPYKKLDKQSDENIETIDQTGTITPKDPTKDIRIV
YDAEQHAYLFIVDQDNNNQSIVGAKKDDKAIPTQFDSQGYANNPIKFNGKDASVKDLESI
GYVYVKTDSTIGKFDKDMTKDQQFTIYMKHAHVGQTEVKPATQTIKYIYKDKDKNGKEVV
VAAPANARTINVSSNKDTFNRTVIKDKVTGKTLSSTPWTGTHTFKKVDTPRVDGYHADKK
QAGGKTATPDHPDVNDTVVYTPNGHIIPVYPDPTDPTKPGQTIPNVDHPQYPTDPTDPTK
VKPDTPIPKITGWHIAKNPDPGKTPGTVTPKDPTKDTLVIFAKDQYAQIIYRNVNDPNNI
ITLDKSPEVTGTAGDPITFGDKDNPTNKITGYEDKGYVLVNDEFDSGKPIFDSNNGIQIF
NIDFKHGTTPVTPDKPQKPGDPINPNDPDGPKWPKGTTADDLTRKATQTITYKYSDGSKP
DTTKVENQDKAFTKTVTVDNVTGKIIKQTDWTPAGYKFNPVDTPRVDGYHADKKQAGGKP
ATPDHPDVNDTVVYTPNGHIIPVDPDGNPIPGIPEEPYATDPNDPTKVVPDENVPKDPNG
KYTPDKDTVTPEDPSQDTPVVYNLIPNVPGPSVGPSDNTPTPITPTPGKTTEEKKPEETK
PDETKPDENKDDKDVDEPDDDEDVVPTPRHHKKHNGGESSTTRPRPTGYTPAPKGSGYLD
ANGKVHYKLPQTGESDSEEMVAVLGGAAAVIGLIGLAGAKKRRHE
NT seq
4458 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtatctaagaataaccgtattaaaagattggaagaggtcgctggacgtcaatcacac
ttcggaattagaaaattgactgttggggccgcttcagtgttgttaggtataactctgctt
tttggagcaaatgccaaggttgctaaagctgctggaactgagggtgctagtgcagctaac
agtgttaataatgagaaaaggggctcaactgatgatcctgctgagggtcgtactccaaat
gttaataatgaacaaaagcctgcggctgatccttctaaagctacagatgaagcaacggca
tataaaaatttaaaatcagcgattgagcaggctagaaatactaaaggcttaactgtaagt
ggcccttatgattctaagcctggtgataatgcacgtattcccgatgagcttgataaatct
aaagtaggagttatttatgacaatgaaaaactaagtgcagaagatatgcaaaaacaagcc
gatgaaattcagaaaaaaataaaaaactatgttgaaaacagaaatgaatttattcaaggc
ttaaaaaaacagggtatttataaagatggagatgtagatcctaccactttagctcaacac
ttaattttacaaagtgagccgcaagcaaagtctgagtacaagattcaagataataatggt
aattggactactaaagaaaatgatgttgtaactgtaacaagggatcctcatgctcctttt
gtgaatgctcctaatgctccttttgtgaatcctgcttatgctgtgcaattgaagaacaat
aatcaggttactgggccaattattcaaattacgtatactaatcttgaacattctgaatat
gatggtaaaccgttgggcaagatagtagagactttctctgacgtacatgctacagatatc
aatgatcaaaaagcagctttttatatatctactaatccaacaaatggatggttgtataca
cattgtgatggtgtaactgttactattcagttgtatgataatcaagcacaaccaataaag
atagattcatctgcttatgtaagtgtgtcgtcattgaattctaatgggttaactgctact
ccaaaaggtgaaatttcagatattaagggaagaacagaaaccgctcaattattatctaag
ggtagtgcaatgtcaatccctgaaagctcagttcaagtttttccaggtaacaaggtattc
tcaccaagtgataatgaggacttgctttacaataaaactcataataaggatcaaattaat
tattggggtaaattctttgcaccaagagaagccgattggaataaattgtctccagatcaa
caagaagatgaaattcaaaaagttggtaactatgttattaaaaattatagtgactgggat
aatacaggatcaaaaaaaatttttggttctgcattatataaagtagaagagaatcctata
gttattagaagttacgttattagaaatagctctaatacaatccctggttattggtttact
tattctactaccgttcctcaaacttcattcgatgcaaataatactataagttatcatttt
gcaacagctcatagtgttacagatgcacctaaaacagtagatggtagtcaaactgttgag
tatattgatggtaaaactaagcaaagaataagtgaaaaagattatccagataaaattcaa
agagttacttttacaggtgccaatggaacagttacagataaaagtggtaataaatataat
gttaaaagagatacggtaactaataagatagtaaaggttaatagtcaaactggtgaaatt
actgatcttactgataaagacaatgttatatacaattggacatggaacacaaatggtaag
tatggaaatgcttcacaagttactgcagacaatgtagatgtaccaaaaatcaatggttat
attgcttcaattgatactgaaattgtgtcaacagagaagaatactacgcaaccaggtaaa
attgttcctataaaagataaaaatggtaaagaaacaggtaagtatgtagttccgggtaat
tcgatttcagttgataatcctactactgtagttaaagtaatttataatcaactcggacat
attattccagtagatactgcaaatgaggaaatcccaggtactacgtctgaacaatataaa
aatgctgctgtcgatccaactaaattcaaggatccaattcctcaatcaagctataaaaat
aaggcagatcctagagatccttacaagaaactagataaacaatcagatgaaaatattgaa
actattgatcagacaggcactattacaccaaaggatccaactaaagatatccgtattgtt
tatgatgcagaacagcatgcctatttatttattgttgatcaagataataataaccaatca
attgttggtgcgaaaaaagatgataaggcaattcctacgcaatttgactcgcagggctat
gctaataatccaattaaatttaatggtaaagatgcatcagtaaaagatcttgaaagtatt
ggttatgtttatgtgaaaactgattcaacaatcggtaagtttgataaagacatgaccaaa
gatcagcaatttaccatttacatgaagcatgcacatgtcggacaaactgaagttaaacca
gcaactcagaccattaaatatatatataaagataaagataagaatggtaaagaagttgtt
gttgctgcaccagctaatgctcgaacaataaatgtttcttcaaataaagatacatttaac
agaactgtaattaaagataaagtaactggtaaaactttaagtagtactccttggacaggt
acacatacatttaaaaaagttgatactccacgagttgatggctaccatgctgataaaaaa
caagctggtggcaagactgctactccagatcatccagatgttaatgatactgttgtttac
acgccaaatggtcacatcatcccagtttacccagatccaacagatccaactaagcctggt
caaacgattccaaatgtggatcatccacaatacccaacagatccaacagatccaaccaag
gtaaaaccagatacaccaatacctaagattacaggttggcatatcgccaagaacccagat
ccaggtaaaactccaggtactgtaactccaaaggatccaactaaagatacactagtaatc
ttcgctaaagatcaatacgcacaaattatctatcgcaatgttaatgatcctaataatatc
attacattagataagtcacctgaagttacaggtacagctggtgatccaattacctttggt
gataaagataatccaactaataagattaccggttatgaagataaaggttatgttcttgta
aatgatgaattcgattcgggaaagcctatttttgatagtaataatggtattcaaatcttc
aacattgattttaagcatggcactactccagtaacgccagataagccacaaaagccgggc
gatccaattaatccaaatgatccagatggacctaaatggccaaaaggcacaaccgctgat
gacttaactagaaaggctacgcaaaccattacttataaatatagcgatggcagtaagcca
gatactactaaggttgaaaatcaagacaaagccttcactaagactgtaacggttgataat
gtcactggtaaaattatcaaacaaactgattggactccagctggttacaagtttaatcca
gttgacactccacgagttgatggctatcatgcagataagaaacaagccggtggcaagcct
gctactccagatcatccagatgttaatgatactgttgtttacacgccaaatggtcacatc
atcccagttgatccagacggcaatccaattccaggcattcctgaagagccatacgccact
gatccaaatgatccaaccaaggtagttccagacgagaatgtaccaaaggatccaaatggc
aagtatactcctgataaggatacggtaaccccagaggatccatcccaggatacgccagtt
gtttataatctaattccaaacgttccaggtccatccgttggtccatctgacaatactcca
acacctataactcctactccgggcaagacaactgaagagaagaagccagaggaaactaag
cctgacgaaaccaagccagatgagaacaaggacgacaaggatgttgatgagccggatgac
gatgaagacgttgttccaacaccacgtcaccacaagaagcacaatggcggcgaaagcagc
acaactcgtccacgtccaacaggctacactccagcaccaaaaggcagcggctacttagat
gcaaacggtaaagtacactacaagcttccacaaacaggtgaaagcgatagtgaagaaatg
gtagcagttcttggcggagcagccgcagtcattggcttaatcggtttagctggtgcgaag
aaacgtcgtcatgaatag
DBGET
integrated database retrieval system
