Leptotrichia buccalis: Lebu_0887
Help
Entry
Lebu_0887 CDS
T00975
Name
(GenBank) Autotransporter beta-domain protein
Organism
lba
Leptotrichia buccalis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Paramyxo_P
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACV38794
UniProt:
C7N9G3
LinkDB
All DBs
Position
971413..979908
Genome browser
AA seq
2831 aa
AA seq
DB search
MTNNLRKISQDLRAFAKRTKNFKYTESALIAFLMSGMLFTANNLFAALSEEESSIESQKR
VISTSIKDMKKNFKKVKAENNKSIRSKNLELIQLMEQGDHVVKSPWNSWQYGENYFYNDW
HGTYKGRGDKEKKYPYEGVFERGDRYERAVNPLSDKYEEMPLGSRKNAASSSQRMGLVSD
SYGLVGVKPLLEPTVGFNVSVAIRPKQVLKGAITIADKTPATPAQPETIIFNAPNISVTA
PAAPQVEPAQVTISSLTVTPPTLPSITLPTPLSFTPASPTVNVSIPTPNSLPTLNFTATG
NGDESYMLGGGPGTWTYTKGASYYAPSDRAAVALMGQVSMSSGTVSYTDSGITINGNLTG
SGSMGGSWSFSGTHSVTGFTGHALIKNTGDYTSNIDNTTITFNRSGGANYDAWLFHTDAH
NSSVVSAFVLGSGTTINTTGNKSVVYTSQFHNGNLNAEFTNNGTIDMGGTENIVWVALNE
NARSRHKDNIFRNGGTIKLNSSKNTFAYIDMPTTIGAIGGSWGGKGVPAGGSAGGTNAGN
SNGWEIISTGTLDIGGTQNTGIFINDSWKYWKAKIELAAGDKTKISGTKNIGTYFKGWAD
VSTSKLNMQMPGDENVGIYLEYAGTATDDEFKFTSASTLDSEGKKNVLIYNKASKANFGT
NVNLKVNGKENVGIVNESAQDLVTAAKIETTKSSGEESIGIYSKGTGATTNTGNITMKAK
KVKGIVADNSGTINNNGGTIAVEGDEVAGAIAMGNGTVNISTASPSNATTITVKGKSGLG
LYAESGGTINAGDVAITSSGGAVNVYSNGGDIHLSKNNKKTTVNVGADSLGFMRTGSKKI
IFDGATELNVATGGSGFYITTSPVPTTVSYPVNIATELTTGYSGLNNLTANMSADSNLVV
ASYAQANLSNLDLSGYGMTINGTGHKEFLLYRSKLTLDSPKTYNDYKKIALSSSSIINDT
AIQTDNDGVKLMAQENDGGTNKWVTLENKKTIELGGKNSVAMYASDGTIKNHSGATITMK
KEGSAAIFGKNTGKGDTEIINDGDIQIGEKSVGLFAEDYTEKNLENAGKIAIVGDSGIGM
YYKAGTLTQDVTMENKSGAEISGTELGGATPATSVKRVGMYSEANSNSNKLTAKNSGDIK
ILGDGANSISDANIGMYTNATAAGTNPLENAGTIELGKYGIGMYGWELDTSGDITVGDGG
VAIYSQGGDVNMVASGTKKIKVGKDARGVLIVGDGQTVTATNYEYEIGDGSYGFVNRNSG
STGNTFTISGGKATLGNKGKFIYSSDKNGNIINSTDMEMLSTATDGENYGIYATGTVTNS
GKIEFTKGKGNVGIYSTEDGNIINSGNIELGESDAANKKYSIGIIAKPGKVTNSGTIKIG
DSANSIDGKDGIGLFADSENGKNGEIINTGAITTEGDSTIGAYANASSKISLGAGGDITV
KGDKTTGYYIDQGTGSSIDSGVSIDVTGDNANGVFVNKGGLTYEGDTTVTGDGAYGFVAG
KNSTVTANGGSVTVSGASGSSKATTGTDGRGTAGVVALAGANLTGGKMNVDADVTDEGSV
GIYSAGNLQIDKADIKAYNGAVNFFADNGGTISVGNNGGSSTVVTGTGTDKGSLLFYTPG
GKVLINGPMTATIEGGTKATTRGTAFYYTGGGTLGNIASYTALTPGNVATWARTNYGDGT
TSTLGNLTLNMQADSRLFLTQKVNMNLSNTSVSNLFSGLASTEKPTVGGSNDYRRFMLYQ
SHLNVDQAVNLDNPSDDYNLLEISNSSITNNSTITGTQDGQIGIAQENSDLATPKSTVTL
INKGTIDLSGKNSAAIYGKNAIVVNDTAGIIKIAKSSTGLYGLRNTEIYNKGNISVGNKS
TGMFYSDVFTDPVTSAVTIYDTETGLQNVGTITLDDEEGVGMTYEPGNITVAPVFENAGT
ITSTKDKNVGMYAKVAKNNISYDTVNSKVITFGDSASLADPNVAMYTNATGTGTNPLINN
GDITIGKNAVGIYGFEEVNNKNITVGDGSVAMYSKGGTVDLNSGTIKVGKNEAVGVYTVG
SGQQITNTGTAFDIEDTSFGFVNVGTGNTIESNISDVTLKNDSVYAYSNDNTGVIRNNTN
LTAVGTSGNNYGIYAAGTIENSANIDFNTGIGNVGVYSVNNGLARNSGTISVGASDPINK
VFSVAMAAGYIGDSSTPATTGNIENNGTINVNGKYSIGMYGVGEGTTVTNNHDIILNANS
TIGIYVEEGAKAINNGIIKTGTSGLSGVTGVVLSKNSTLENNNTIDIDSRSGVGVYLKGG
TIINRGTINVAGKGAVEEYDMTKNATSKPMGDVIIDAPAGSPTAKIIVAGKGEVQPTLVT
TTAENPITVSASSIGLYVDTSSKNYTRSIDNLGALTSEADLIIGVEAAENTSSKYIQIND
RNILDTYNRTIVYGGVSKWNVYSGALTWMATPTLDPDTGEITNLYMAKASYTNWATNSKV
TPTKVTDTYNFADGLEQRYGIKALGTRENQIYQKLNSIGNNEEILLYQAFDEMMGHQYGN
LQQRINATGNLLDKEFNHLRKDWRKPSKQNSKIKVFGMRDEYNSDTAGVINYTSNAYGVA
YVHENDTVKLGNSSGWYAGAVTNRFRFKDIGNSRENQTILKAGIFKTMSPSGDYNGSLRW
TVSGDMFAGINDMKRRYLVVDEIFQAKSDYYSYGAAIKNELGYDIRLSQRTHLRPYGALK
MEYGRFNNIKEDRGEMRLEVKGNDYFSVKPEVGMEFRYVQPLAVRTNLSVGLTAAYENEL
GKVGENNNKARVRYTSADWFGIRGEKDDRKGSGKFDLNIGVDNTRFGVTANIGYDTKGKN
TRGGIGFRAVY
NT seq
8496 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaataatcttaggaaaatatcgcaggatttacgtgcgtttgcaaaaagaacaaaa
aatttcaagtatacagaatcggcattaattgcatttttaatgtcaggaatgctttttact
gcaaataatttgtttgcggcgctatcagaagaagaatccagcatagaaagtcagaaacgt
gtaatttctacatctataaaggatatgaagaaaaattttaaaaaagttaaggctgaaaat
aataaatcaataagaagtaaaaatttagaactgatccaattaatggaacagggagatcat
gttgtaaaatcgccttggaacagctggcaatatggggaaaattatttctacaatgactgg
catggaacttataagggcagaggggataaagagaaaaaatatccttatgaaggagttttt
gaaagaggagacagatatgagagagctgtaaatccattaagtgacaaatatgaagaaatg
ccacttggatcaagaaaaaacgctgcttcaagctcacaaagaatgggacttgtttcagac
tcatacggacttgtgggagtaaaacctcttttagagccaacagtaggatttaacgtaagt
gtggcgataagaccgaaacaagtgctgaaaggggcaataacaattgcggataaaacacct
gcaacacctgcacagccagaaacaataatttttaacgcgcctaatataagcgtaacagcg
ccagcagcgccacaagtggaacctgcacaagttacaataagctcgttgacagtaacacct
ccgacgctgcctagtattacgttgccaacgccactttcgtttacaccggcttcaccaaca
gtaaatgtaagtattccaactccaaattctttgccaacgctaaattttacagcaacaggt
aatggagatgaatcatatatgttaggtggaggtcctgggacatggacttatacaaaaggg
gcttcatattatgctccaagtgacagggcggcagttgcacttatgggtcaggtaagtatg
agttcgggaacagttagctacacggattcaggtattactataaatggaaatttgactgga
tcaggttcaatgggtggaagctggagttttagtggaactcatagcgtaacaggatttact
ggacatgcgcttataaaaaatactggagattatacttcaaatatagacaatacaactata
acctttaacagatcgggaggtgctaattatgatgcatggctatttcacacggatgcccat
aatagcagcgtagtatctgcatttgtcctaggaagtggaacaacaattaatacaacgggt
aataaatctgttgtatatacttctcaatttcataatggaaatttaaatgctgaatttaca
aataatggaactattgatatgggaggtactgagaatattgtatgggtagcattgaatgaa
aatgcaagaagcagacataaagacaatattttcagaaatggcggaacaataaagctgaac
agttctaaaaatacgtttgcatatatagatatgccgactactataggagctattggtgga
agctggggtggaaaaggagttccagcaggtggttctgcaggtggaactaatgcaggtaat
agtaacggttgggaaataataagtacaggaacgttagatataggcgggactcagaataca
ggaatatttataaatgacagctggaaatactggaaggctaagattgagcttgctgctgga
gataaaactaaaatttcgggaactaaaaatataggaacatattttaaaggctgggcagat
gtctctacttcaaaacttaatatgcaaatgcctggagatgaaaatgtgggaatatacctt
gaatacgcaggtacagcaacagatgatgagtttaagttcacaagcgcttcaacattagat
tcagaaggcaagaaaaatgttttgatatacaataaggccagtaaggctaattttggaaca
aatgttaatttaaaagttaatggaaaagaaaatgttgggattgttaatgaatctgcacaa
gatttagtaactgccgcaaaaattgaaaccacaaaaagctctggggaagaatcaattgga
atatactcaaaagggacaggtgcaactactaatactggaaatataactatgaaggctaaa
aaagtaaaaggtattgtagctgataactcaggaactattaacaataatggtggaactatt
gctgtggaaggagatgaggttgcaggtgcaattgcgatggggaatggaactgtaaatatt
tcgacagcttcaccaagcaatgcaacaacgattacagtaaaaggaaaatcaggactcgga
ctttatgcagaaagcggcggtacaattaatgcaggtgatgtagcaattacaagttctgga
ggtgccgtaaatgtttattctaatggtggggatattcatttaagcaaaaacaataaaaag
actacagtaaatgtaggagctgattcacttggatttatgagaacgggaagtaaaaagata
atatttgatggtgctacagaacttaatgttgccacaggcggatcaggattttatataaca
acatctccagttccaacgacagtttcgtatcctgtaaacattgctacagaacttactact
ggatattcgggactgaataacttgactgcaaatatgagtgcagactcgaacttggtagtt
gcttcgtatgcacaagctaatttatctaatttggatctttcgggatatggtatgactata
aatggtactgggcataaagaatttttgttgtacagaagtaaattgactcttgattctcca
aagacttataatgattacaaaaaaatagcattatccagttcatcaattattaatgataca
gctatacagacagataatgatggtgtaaaacttatggcacaagaaaatgatggcggtact
aataagtgggtaactctggaaaataagaaaactattgaactaggcggaaaaaattcggtt
gcgatgtatgcaagtgatggtactataaaaaatcattcgggtgcaactatcacaatgaaa
aaagaaggatctgccgcaatctttggaaagaatacaggaaaaggtgatacagagattata
aatgatggagatatccagattggagaaaaatctgtaggactttttgctgaagattatact
gaaaagaatcttgaaaatgcaggtaaaattgctattgttggagacagcggaatcggaatg
tactacaaggcaggaactttgacgcaagatgtaacaatggaaaataaatctggagcggag
attagtggaactgaattaggtggagcaactccagcgacatctgtaaaaagagttggaatg
tattcagaagctaatagtaacagtaacaaactaacagctaaaaactcaggagatataaaa
attcttggagatggagcaaattccataagtgatgctaatataggaatgtatacgaatgca
actgcagcaggaacgaatccattggaaaatgcaggaacgattgaacttggaaaatatgga
atcggaatgtatggatgggagctggataccagcggagatattacagtcggagatggtgga
gttgccatttattcacaaggcggagatgtcaatatggttgcgtctggaactaaaaagata
aaagttgggaaagatgcaagaggagttcttattgtaggagatggtcagactgttacagcc
actaactatgaatatgaaattggagatgggtcttacggatttgttaatagaaattcggga
tcaacaggaaatacatttacaataagtggtggaaaggctacattaggaaacaaaggtaaa
tttatttactcaagtgataaaaacggaaatatcataaactcaacagatatggaaatgcta
agtactgcaactgatggagaaaactacggtatttatgctacaggaactgtaactaacagc
gggaaaatagaatttactaaaggtaaagggaatgtaggtatttattctacagaagatgga
aacataataaacagtggaaatattgaactgggagaatctgacgctgcaaacaaaaaatac
agtataggaattatagcaaaacctggaaaagttacaaacagcggaactatcaagattgga
gattcagctaattcaattgacggaaaagacggaattgggctgtttgcagacagtgaaaac
gggaaaaatggagaaatcataaatacaggagcgataactactgaaggagattcaacaatt
ggtgcttatgcaaatgcaagttcaaaaattagtcttggtgcaggtggagatattactgta
aagggagataagactactggatactatatcgatcaaggtacaggaagcagcattgattca
ggtgtaagcatagatgtaacaggagataatgctaatggtgtatttgtaaataaaggtgga
ctgacatacgaaggggatacgactgtaacaggtgatggagcttacggatttgttgcaggt
aaaaattctactgtaactgctaatggcggaagcgttaccgtgtcaggcgcttcgggatct
tcaaaagctacaactggaactgatggaagaggaactgcaggagttgttgcattggcaggg
gcaaatctgactggtggaaaaatgaatgtagatgccgatgttacagatgaaggttctgta
ggaatatattcagctggaaatcttcaaattgacaaggctgatataaaagcatacaatgga
gcagtaaacttctttgctgataatggaggaactatctctgttggaaataatggtggctca
agcacagttgtaacaggaactggtactgacaagggatcacttctgttctatactcctgga
ggaaaagtacttataaacgggcctatgaccgctactattgaaggtggaactaaagctact
acccgtggtactgcattctactatactggtggagggacattaggaaatatcgcttcttat
acggcattgacacctgggaacgttgcaacttgggcaagaactaactatggagacggtaca
acaagtacgcttggcaacttgacattaaatatgcaggctgattcaagactgttcctgact
caaaaagttaatatgaatttgtcaaatacgtcagtttcaaatttgtttagcggtcttgcc
tcaacagaaaagccgacagtaggaggaagcaacgattatagaagatttatgctttatcaa
agtcatttgaatgtagatcaggcagtaaatctggataatccaagcgatgactacaatctg
cttgaaatctcaaactcaagcataactaacaatagcacgataacaggaactcaagatggg
caaattggtattgcgcaggaaaactcagatctggctacaccaaaatctacagtaacactt
ataaataaaggaactatagatttgtctggtaaaaactcagctgcaatttatgggaaaaat
gccattgttgtaaatgatactgcaggtatcataaagatagcaaaaagctcgacagggcta
tatggattgagaaatacagagatttataacaaaggaaatatctcggtaggaaataaatcg
acaggaatgttctattcagacgtatttacagatccagtaacaagtgccgtaacaatatac
gatacagaaacagggcttcaaaatgtaggtacaataactcttgatgacgaagaaggagtt
ggaatgacatacgaacctggaaatataactgttgcgccagtatttgaaaatgcggggaca
attacaagtacaaaagataagaatgtcggaatgtatgcaaaagtcgcaaaaaataatatt
tcatacgacacagtaaacagcaaagtaatcacatttggagattctgcttcgcttgctgac
cctaatgtggcaatgtatacaaatgcaactggaactggtacaaatccgcttataaataat
ggagatataacaattggaaaaaatgccgttggaatatatggatttgaagaagtgaacaat
aaaaacataactgtaggcgatggatctgtcgcaatgtactctaaaggaggaactgttgac
ttaaattcagggacaattaaggttggaaaaaatgaagctgttggagtgtatacagttggg
agcggacagcagattacgaatacaggaacagcatttgacatagaggatacttcgttcgga
tttgtaaatgttggaacagggaatacaattgaaagcaatatttcagatgtgacactgaag
aatgattcagtttatgcatattcaaatgataatactggagtaattagaaataatacaaat
ttgacagcagtaggtacgagtggaaataattatggtatttatgctgctgggacaattgaa
aatagtgcgaacattgattttaatacaggaattggaaacgttggagtttattctgtaaat
aatggacttgctagaaatagtggtacaatatctgttggagcctctgatccaattaacaag
gtattcagtgttgcaatggccgctggatatataggagattcaagtacgcctgcaactact
ggaaatattgagaacaacggaacgatcaatgtaaatggaaaatacagtattggaatgtat
ggtgttggagaaggaacaactgttacaaataatcatgatattattttgaatgccaatagt
acaataggtatttacgttgaagaaggtgcaaaggctataaataatggaataataaaaact
ggaacaagtggtttgtcaggagttactggagttgtactaagtaagaattcaacgcttgaa
aacaacaatacaatagatattgattcaagatcaggagttggagtatatctaaaaggtgga
acgataataaacagaggtactataaatgttgctggaaaaggtgcagtggaagaatatgat
atgactaaaaatgccacatcaaaacctatgggtgatgtaataattgacgcacctgcagga
tcaccaacagctaaaattatagtagctggaaaaggtgaagttcaacctacattagtcaca
actacagcagaaaacccaataacagtatcagcttcaagtataggactttatgttgatact
tcaagcaaaaattacacacggtcaattgacaacttgggagcattgacaagtgaagctgat
ttaataataggagtagaagcggcagaaaatacatcaagcaaatatattcaaataaatgac
agaaatattttggatacatacaatagaacaattgtttatggtggagtttcaaaatggaat
gtctattcaggagcattaacttggatggctacaccgactcttgatcctgatacaggagaa
atcacaaatctctatatggctaaggcttcgtatacaaactgggctacaaatagtaaggta
actccaacaaaagttacagatacgtataattttgctgatggattggaacaaagatacggt
ataaaagctctgggaacaagagaaaaccaaatctatcaaaaattaaattcaatcggaaac
aatgaggaaatactattatatcaagcatttgatgaaatgatgggacatcagtatggaaat
ctgcaacaaagaattaatgcaacaggaaaccttctggacaaggaattcaatcatcttaga
aaagactggagaaagccatctaaacagaacagcaaaataaaagtatttggcatgagagat
gagtataattcagatactgcaggagttatcaattatacaagtaatgcttatggagtggca
tatgttcacgaaaacgataccgttaaacttggaaattctagtggatggtatgcaggagct
gtaacaaacagatttaggttcaaagatattggaaattcaagagaaaatcagacaatatta
aaagccggaatatttaagacaatgtcgccttccggagattataacggttcattgagatgg
acagtttcaggagatatgtttgctgggattaatgatatgaaacgtagatatctagttgtc
gatgagatatttcaggccaaatcggattattattcttatggtgctgcgataaagaatgaa
cttggatatgatataagattgagccagagaacacatttacgtccttatggagcattaaag
atggaatacggaagatttaacaacataaaagaagacagaggggaaatgcgtctagaagta
aaaggaaacgactacttttcagttaaacctgaagttggaatggaattcagatatgttcag
ccattggcagtaagaacaaatttatcggtaggattgacagcagcttatgaaaatgaatta
ggaaaagttggagaaaataacaacaaggcaagagtgagatatacaagtgccgactggttt
ggaataagaggtgaaaaggatgacagaaaaggaagcggtaagtttgacttgaatattgga
gttgataatacaagatttggagtaactgctaatattggatatgatacgaaagggaaaaat
actcgaggtggaataggtttcagagctgtttattaa
DBGET
integrated database retrieval system
