Lentisphaerae bacterium WC36: LJT99_04615
Help
Entry
LJT99_04615 CDS
T10936
Name
(GenBank) DUF4982 domain-containing protein
KO
K01190
beta-galactosidase [EC:
3.2.1.23
]
Organism
lbac Lentisphaerae bacterium WC36
Pathway
lbac00052
Galactose metabolism
lbac00511
Other glycan degradation
lbac00600
Sphingolipid metabolism
lbac01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lbac00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00052 Galactose metabolism
LJT99_04615
09103 Lipid metabolism
00600 Sphingolipid metabolism
LJT99_04615
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00511 Other glycan degradation
LJT99_04615
Enzymes [BR:
lbac01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.23 beta-galactosidase
LJT99_04615
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro2_C5
Glyco_hydro_2_C
DUF4982
F5_F8_type_C
F5_F8_type_C_2
Glyco_hydro_2
Glyco_hydro_2_N
BetaGal_gal-bd
Glyco_hydro_2_N2
Invasin_D3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UDQ98822
LinkDB
All DBs
Position
1067195..1070212
Genome browser
AA seq
1005 aa
AA seq
DB search
MTKKTNRGKVAVASLLGMLAGIGMIASACIDMDTKDCSKKTARSKESFNENWKFARFGPS
PIAGGDYIDEPGVVRKESNFFKTWASSTEASQKTEYAVDGDKDSRWCANGAKNNQWVKID
LGKKMDISKAKIAFEFADKSYAYKLEVSNDGQSWALANSGNAKDPQFDLNKAARFVRLTL
TDANKSRWASVREIELFDKNGNLIKPEKKKEKKVVCKISPSEIKFDDSNWRKLNVPHDWG
IEGPFRQDLPGNTGKLPWKGIGWYRKDFKVPACDANKKVFIDFDGAMSNSKVYINGNYAG
GWAYGYTAFRIDATKFIKFGETNKIAVRLDTVNWDSRWYPGAGIYRNTWIVMTDKVHLDH
WGVQVLTPKITKNCGEVKVVATVDNESDSAAKVQVKTEIYPIDKNDVKGGKVAESCSKTM
KIAAQSGQATLTTNLKVVNPKLWDIIAPNRYVVTTKVFKNGKLVDVKDTKFGFRILEFTK
RDGFKLNGRRVEINGVCQHHDLGPLGAAFNVRAAERQIEILKEMGVNAIRTSHNPAATEF
YELCDKMGVLVQAETFDCWDRGKRKLDYGKDFNKWWKRDIEALVKRARNHPSVFMWCIGN
EILGLWSRDKAKLGRQISDQVKKFDITRPTTIGSNYGEAYKKGFAQAVDVFGFNYNIWQY
GKFNKYCKKPNEMYMGTETSSCISSRGEYFFPVTRNNKANFQMSSYDVSHPGWGCTPDTE
FKELDKHRDCMGEFVWTGFDYIGEPTPYNNDATNLLNFTDPKQKAAMAAEMKKLGKLQVP
SRSSYFGIVDLVGFKKDRFYIYQARWRPNLPMAHILPHWTWPERVGKVTPIHVYTSGDEA
ELFLNGKSLGRKKRGKYDYRLKWDDVKYVPGVVKVVAYKNGKKWATDTVKTSTPAVKINL
TADQKVIKADGYDLSFVTCDVLNAENGVVPRSSNLVKFSVEGAGEIIATGNGDATNHTVF
SSKKRKAFNGKVMVIIRSKKGVKGAIKLTAQSEGLKGATITLEAK
NT seq
3018 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaaaaaaacaaacagaggaaaagttgcagtggcatctttattagggatgcttgct
ggaattggaatgattgctagtgcctgtattgacatggacactaaagattgttctaaaaag
actgctcgttcgaaagaatcgtttaatgaaaattggaagtttgctcgttttggtccatca
ccaatcgctggaggggattacattgatgaacctggcgtagttagaaaagagagcaatttc
ttcaaaacgtgggcttcttcaactgaagcgagtcaaaaaactgagtacgctgttgatggt
gataaagattcacgctggtgcgctaatggtgctaaaaataatcaatgggtaaaaattgat
ttaggcaaaaaaatggacatcagcaaagcgaaaattgcttttgaatttgctgacaaaagt
tatgcttacaaattagaagtttcaaatgatggtcaaagttgggcactggcaaacagcgga
aacgctaaggatcctcaattcgacttaaacaaggctgcacgttttgtacgtttgacttta
acagatgccaataaaagtagatgggcttcagttcgcgaaattgaactttttgacaaaaat
ggcaacttaatcaaacctgaaaagaaaaaagagaaaaaagttgtttgtaaaattagccct
tctgaaattaaatttgatgattcaaattggcgtaaattaaacgttccacatgattggggt
attgaaggtccttttagacaggatttaccaggaaatactggaaaattaccttggaaaggc
attggttggtatcgtaaagattttaaagttcctgcatgtgacgcgaacaaaaaagtattc
atcgattttgatggcgcaatgtcaaacagcaaagtttacatcaacggaaattacgctggt
ggttgggcatatggttacactgcgttccgcattgatgcgactaaatttatcaaatttggc
gaaactaataaaattgcggttcgtttagatactgttaattgggattcacgttggtatcca
ggtgctggtatttaccgaaatacgtggattgtaatgactgataaagtacatttggatcac
tggggagtacaggtgttaacaccaaaaattacgaaaaattgtggtgaagtaaaagttgta
gcaactgttgataatgaatcagacagcgcggcaaaagttcaagtaaaaacagaaatttac
ccaattgataaaaatgatgttaaagggggaaaagttgcagaaagttgttcaaaaacaatg
aaaattgcggctcaaagtggtcaggcaactttaacaacaaatttaaaggttgttaatcct
aaattatgggatattattgcgccaaatcgttatgttgtaacgactaaagtatttaaaaat
ggtaaattagttgatgttaaagatactaaatttggttttagaattttagaattcacaaaa
cgagatggttttaaattaaacggtcgtcgtgttgaaattaatggcgtatgtcagcatcat
gatttaggacctttaggagcggcatttaacgtgcgcgctgctgaacgtcaaatcgaaata
cttaaagaaatgggtgtgaatgctattcgtacatcacataacccagctgcaacagaattt
tatgaattatgtgacaaaatgggtgttttagttcaagcagaaacgtttgattgttgggat
cgtggtaaacgtaaacttgattatggtaaagattttaataaatggtggaaacgtgatatt
gaggcattagttaaacgtgcgcgcaatcatccatcagtttttatgtggtgtattggtaat
gagattttaggtttatggtcacgagataaggctaaattaggtcgtcaaatttctgaccag
gtgaaaaaatttgatattacacgtcctacgacaattggctccaactatggagaagcctat
aaaaaaggttttgctcaagctgttgatgtatttgggtttaattataatatttggcaatat
gggaaatttaataaatactgtaagaaaccaaatgaaatgtatatgggaacagaaacttca
tcatgtatttctagtcgtggtgaatattttttcccagtgacacgcaataataaagctaat
tttcaaatgagtagttatgatgtttcgcatccaggttggggttgtactccagacactgaa
tttaaagaattagataaacaccgtgactgcatgggtgaatttgtgtggacgggttttgac
tacattggtgaacctactccatataataatgatgcaacaaatttactaaattttacagat
ccaaaacagaaagcggcaatggctgcagaaatgaaaaaattaggtaaattacaggttcca
tcacgcagcagctattttggaattgttgacttagttggcttcaaaaaagatcgtttctat
atctatcaagctcgttggagaccaaatttaccaatggcacatattttaccacattggaca
tggccagaacgtgttggcaaagttacgccgattcatgtttatacgtcaggggatgaggct
gagttattccttaatggtaaaagtttagggcgtaaaaaacgtggcaaatatgattatcgt
ttgaaatgggatgatgtaaaatatgttcctggcgtagtgaaagttgtcgcatataaaaat
ggtaaaaaatgggcaacagacacggtaaaaacttcgactccagcagtaaaaattaattta
acggcagatcaaaaagttattaaagctgatggctatgatttatcatttgtaacttgtgat
gtgttaaatgctgaaaatggcgttgtgccacgcagcagtaatttagttaagttttcagta
gaaggcgcaggtgaaattattgcgacaggcaacggtgacgcaacaaatcatacagttttc
agttctaaaaagcgtaaagcttttaacggaaaagtgatggtgattattagaagtaaaaaa
ggagtaaaaggagcaattaagctaacagcacaaagtgaaggcttaaaaggagcaacaatt
actctagaagcaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
