Lentisphaerae bacterium WC36: LJT99_09040
Help
Entry
LJT99_09040 CDS
T10936
Name
(GenBank) UvrD-helicase domain-containing protein
KO
K03582
exodeoxyribonuclease V beta subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
lbac Lentisphaerae bacterium WC36
Pathway
lbac03440
Homologous recombination
Brite
Enzymes [BR:
lbac01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
LJT99_09040
DNA repair and recombination proteins [BR:
lbac03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
LJT99_09040
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UDQ96645
LinkDB
All DBs
Position
complement(2098235..2102338)
Genome browser
AA seq
1367 aa
AA seq
DB search
MNNLKNSHQLINEFDFLSHDFCLGDKLLIEASAGTGKTFNIENIVLKLIIEGIKSSHHNN
KNSQQTSSKEVVISEVLIVTFTDLATAELCARIRENIQNALNFVLGIDDNYQHIKQNQEQ
LYCNSLEQFILNFIEFGYSYNKDLKQYNIERKNVLLNRLNHALYTFDEASICTIHSFCQK
MLKEFSVDSNQLFNSELVDSAEIIERIVYQFFRDNLYSQDSTLLNVVCDIKKLNYEYFSS
VAKTFDQHAIRDFSDNGDFDNLKKNIDIIQQSINNKIELLVKIFSEISTDFYHHCDFELH
DCYKKFAEDFPNNLATLRTNLSNNNLSGILCQLGYFSEKFIFKKLLKAKQKCWQPNMHAR
QFFDLCVSIPDEVDKLADYFIRYFANYFLEKYQDEINSRPIITYNELLQKLHNALENSQK
LVDNIRKKYTMALIDEFQDTDSIQYQIFAKIFDNPQNLLIMVGDPKQAIYGFRGADIFTY
LRVAKNLDEDQKTTLVKNFRTSQNLLNAINCLFEKELPFAIDNIDFVDATAGKVSDEVVI
DNENIMQQPLKIFQPADCVNFKFNKDNYRNFSCQVTAKKIAEILQKANQIDSISKLPLAH
INGRKIVPADIAVLVRNANEAEMISQRLLKYNIASVKQGNDNIFVGDEARELLKLLTAIL
NPQNSRAVMSALSLSYFNFDFSDIYQLNYDEKFAKIYEGIIEVLIYYRNIWQNFSFIKMI
NSLKNLHISSILGTQFDELITEKNSLLYKLEKNNLKMNLLNSENGNRKMTNFNHLVEILH
QEEKKHNLQPVALLNHLANFVRNPEANAEYELRLESDSQAVQILTMHKSKGLQFGIVFCP
FVWGDSSNNQQASKEKAIIYHDANNQQHISLTNNELSEAKNYYKFERLADELRLFYVAVT
RAKYGCYLVWADKQYNKTRAMSFNSPMDYLYYNFNKNRLHEFFNSPTLKNLQLCLESNNS
ATLIDEIDKKFKYQTDRREQWQDHQNIEFITVDEKDLSLDFKPSEQNDFFEKNKVDEYHF
IEFSGKIAKDFRVLSFSNLNSNLPHLTENVESGDVNDDDKLNNENDNIVDRNLRGINEEH
GVNDKLTPSILGDFPKGTFSGDCIHDLFEKLDFDYFKEQNIDNLKINSESHVGKFIHMLL
KKYGRLKYDVATQEESYQKELELRLLQLVKMFKNTVSSRMYILNNSLKKDNSIVLENLHS
EAMVCEMPFFFKTPKSFNAENLLSLSRKAFDVSDSTSNFEDQLENRKEQLRGFMNGKIDL
IFEHDDKFFIIDWKSSYLGDFNENYNIDAIKKDMFEKNYYLQAAIYTVALKAFLSNKIAN
FNFEKQFGGVLYLYVRGIDQQLNTGVWSMNPDTNVIEQIANLLGVNE
NT seq
4104 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatttaaaaaatagtcatcaattaattaatgaatttgattttttgagtcatgat
ttttgtttgggtgataaactcttaatcgaagcaagtgcgggaactggaaaaacatttaat
attgaaaatatcgtcttaaaactaattattgaaggtattaaaagtagtcatcataataac
aaaaatagtcaacaaacaagcagtaaggaagttgttattagtgaagttttaattgtaaca
tttactgatttggcaaccgcagagttgtgtgctaggattcgagaaaatattcaaaatgca
ttgaatttcgtactgggtattgatgacaattatcagcatattaaacaaaatcaagagcag
ttatattgtaattctttggagcagtttatcttaaattttattgaatttggttactcttat
aacaaagatttaaagcagtataatattgaaagaaaaaatgttttattaaatcgtttaaat
catgcgttgtatacgtttgatgaagcatcaatttgtactattcatagtttttgccaaaaa
atgttaaaggaattttcagttgatagtaatcagttatttaatagtgagttggttgatagt
gcagaaattattgaaagaattgtatatcagtttttccgtgataatttatattcccaagat
agcacattattaaatgttgtctgtgatataaaaaaattaaattatgaatattttagcagt
gtcgcaaaaactttcgaccagcacgcgattcgtgacttttctgataatggtgattttgat
aatctcaagaaaaatattgatattattcagcaatcgataaataataaaatagaattacta
gttaaaatttttagtgaaatttcaacagatttttatcatcattgcgattttgagttacat
gattgttacaaaaaatttgctgaggattttcctaataatttagcaactttgcgaaccaat
ttaagcaataataacctaagtggaattttatgccagttagggtattttagtgaaaaattt
atatttaaaaagttattgaaggcaaagcaaaaatgttggcaacccaatatgcacgcacgc
caattttttgatttgtgcgttagtattccagatgaagtagataaattagcagattatttt
atcaggtattttgcaaattattttttggaaaaatatcaggacgaaattaattctcgacca
ataattacttataatgaattgctacaaaagctacataacgcattagaaaatagtcaaaaa
ttagttgataatattcgtaaaaaatatacaatggcattgattgatgaatttcaggatact
gatagcatccaataccaaatttttgctaaaatttttgataatcctcaaaatttattaatt
atggttggagacccaaaacaggctatttatggctttaggggcgcagatatttttacatat
ttaagagttgctaaaaatttagatgaagatcaaaagacgactttagtcaaaaattttaga
acttcacaaaaccttttaaatgccataaattgtttatttgaaaaagagctgccgtttgct
attgataatatagattttgtcgatgctaccgcaggtaaagttagcgatgaagtggttatt
gacaatgaaaatattatgcaacaaccattgaaaatttttcagccagcagattgtgtgaat
tttaaattcaataaagacaattatagaaatttttcatgtcaggttactgcgaaaaaaatt
gcggaaattttgcagaaagcaaatcaaattgattcaatttctaagttacctttagcacat
attaacggtagaaaaattgtaccggcagatattgcagttttggtgcgaaacgccaatgaa
gcagaaatgattagtcaaaggttattgaaatataatattgctagtgtaaaacagggaaat
gacaatatttttgtaggtgatgaagcaagagaattattaaaattattaacagcaattttg
aatccacaaaatagtcgagcagtaatgagtgcattgtctttatcatattttaattttgat
tttagtgatatttatcaattaaactatgatgaaaaatttgctaaaatttatgaaggaatc
attgaagttttaatctattatcgaaatatttggcaaaatttttcatttataaaaatgatt
aattcattaaaaaatttacacattagttcaatcttaggaacacaatttgatgaattaatt
actgagaaaaattcgctgttgtataaattagaaaaaaataatttaaaaatgaatttacta
aacagcgaaaatggaaatcgcaaaatgacgaattttaaccatttagttgaaattttacat
caggaagaaaaaaagcataatctgcaacctgttgcgttattaaatcatttggcaaatttt
gtgcgcaatccagaagctaatgctgaatatgaactgcgtttagaaagtgattcacaagca
gtgcaaattctaacaatgcacaaaagtaaaggattacagtttggaatcgttttttgccca
tttgtttggggggattcctcaaataatcagcaagcaagtaaagaaaaggcaattatttat
catgatgcaaataatcagcaacatatttcattgactaataatgagttgtctgaagctaag
aattactataagttcgagcgtttagctgatgaattacgattgttttatgttgctgtgact
agagcaaaatatggctgttatttggtatgggcagataaacaatacaataaaacgagggca
atgtcatttaattctccaatggattatttgtattataattttaataaaaatagattacac
gaatttttcaatagtccaaccttgaaaaatttgcagttatgtttagaaagtaataatagc
gcaacattaattgatgaaattgataaaaagtttaaatatcaaactgaccggcgtgaacag
tggcaggaccatcaaaatatcgaatttattactgttgacgaaaaagatttaagtttggac
tttaaaccttcagaacagaatgacttttttgaaaagaataaagttgatgaatatcatttt
atagaatttagtggtaaaattgcgaaagatttcagagttttaagttttagtaatttaaac
agtaatttaccacatttaactgaaaacgttgaaagtggagatgtcaatgatgatgacaag
cttaataatgaaaacgataacattgtagatagaaatttaagaggaattaatgaagagcat
ggtgttaatgataaattgacgccatcaattttaggcgatttcccaaaagggacattttct
ggagattgtattcatgatttgtttgaaaaattagactttgattattttaaagagcaaaat
attgataatttaaaaattaatagtgaaagccatgtgggcaagtttattcatatgttgtta
aagaaatatgggcgcttgaagtatgatgttgctactcaagaagaaagttatcaaaaagag
ttggaattacggctgttacaattggtcaaaatgtttaaaaataccgttagtagtagaatg
tacatcttgaataatagcttaaaaaaagataattcaatagttttagaaaatttgcatagt
gaagcaatggtttgtgaaatgccatttttctttaaaactcctaaaagttttaatgctgaa
aatttgctgagtttaagtcgcaaagcgtttgatgtaagtgattcaactagtaattttgaa
gatcaattagaaaatcgtaaagaacaattgcgtggattcatgaatggaaaaattgatcta
atttttgagcatgatgataaattttttattattgactggaaaagtagctatttaggagat
tttaacgaaaattataatattgatgcaataaagaaagatatgtttgaaaaaaattattat
ttgcaagcagcaatttacacggttgctctcaaagcttttttaagcaataaaattgcaaac
tttaattttgaaaaacagtttggtggcgtgttatatttatatgtaagaggtattgatcaa
cagctaaatactggagtttggagtatgaatccagatacaaatgtaattgaacaaattgct
aatcttttgggtgtgaacgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
