Leptopilina boulardi: 127281925
Help
Entry
127281925 CDS
T08910
Name
(RefSeq) DNA polymerase subunit gamma-1, mitochondrial isoform X1
KO
K02332
DNA polymerase gamma 1 [EC:
2.7.7.7
]
Organism
lbd
Leptopilina boulardi
Pathway
lbd03410
Base excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lbd00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03410 Base excision repair
127281925
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
lbd03032
]
127281925
03029 Mitochondrial biogenesis [BR:
lbd03029
]
127281925
Enzymes [BR:
lbd01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
127281925
DNA replication proteins [BR:
lbd03032
]
Eukaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
DNA polymerase gamma complex (mitochondrial)
127281925
Mitochondrial biogenesis [BR:
lbd03029
]
Mitochondrial DNA transcription, translation, and replication factors
Mitochondrial DNA replication factors
Mitochondrial DNA polymerase
127281925
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DNApol_Exo
DNA_pol_A
DNA_pol_A_exo1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
127281925
NCBI-ProteinID:
XP_051161872
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1320 aa
AA seq
DB search
MSLTFRRMSVQYKSTRFLSELAGDEKKKFGKRIIVKKNKSDENNDLTSKLTKTEFKFMRK
DIKSSPYDVPPKLTSIRRSKPKYKGYYTKTNQLTAENYIFSRNSEEKADFVYGIRKNKFS
KNYHTNSLCANFMLKESKNFEKSLINKTSTKKNDNLINLPSKKYRYLNNSKFKIIKVKNP
INNENITIKATNEISKNKETIEQVSDNNYLKIDENRENEINLQMLPSALFKTIFPEENES
IVSSEKLDSIKKELLTFGLNVDNQIRLPNVDLELPSLEGKNIEEHFYNIANSQIKPYMKV
VNELVKKIPPVPEQWIFQEGWTRYTESGSEKVDYPLEEGLIFDVEVCMSEGPLPTLATAV
SKNAWYGWISKSLVENSSLVVKDRFLSNEFLIPLESTSDDYGTKLNNFQKRGKIIIGHNV
SYDRARIKEQYWLNSTGTRFIDTMSMHICVSGINSFQRALLKADKEDLEENLRNHSSLNN
LGDVHQLYCGEKINKKARDLFVDGTLLQIRENFNDMMKYCANDVKATFNIFQKLLPMFQE
RFPHPVSFAGMLELGCAYLPVNSNWQRYIEESELTFEDFSHESKAILSNRAAEVCQLMHD
EKYKKDLWMWDQDWSTQDIKIKSILTKQQRDEMIKDKAKRAIEKENLKNEEEEIDPLEEK
FAYLNDTKYYLPAKMPHMPGYPNWYRKLCDKKNNEDWLPGAQNISTSMKVVPKILNLTWE
NYPLHYIREHGWGFLVPYNNDLAIETKIPLKELLKQCPLPIESKTEIEIDYTMMTLDKEV
QSDLSKTEFWRDKKKKNPENNFYKGSGIWCNIDIDNCCWFFKLPHKDGTSKNVGNPLAKD
FLNKFSDNVLAGLDVSASSVLKIARMLSYWRNNRDRILSQLVIWFDEKSLSSALKRDKRK
MRYGAILPQVIVSGTLTRRAVEPTWMTASNAHAERIGSELRSMIQAPPGYNIVGADVDSQ
ELWIASIIGDAYHAKIHGATPFGWMTLIGNKADGTDMHSVTAKAIGISRDHAKIINYARI
YGAGQRFAERLLKQFNPTMTEAEAGAKSKKMFAMTKGRKIFRLKKEFISKELVDKEYSSG
LMFKIAKIYGRTASEMFEKGQWIGGSESAMFNRLEEIAGNLTPVTPFLNSRLSRALEGQE
IDDDKYLPTKVNWVVQSGAVDFLHLMLVSMRWLMKDNARFCLSFHDEIRYLVANKYKYNA
ALAMHITNLLTRSFCSSRLGLKDLPMSVAFFTSVEVDTVLRKEASSDCKTPSNPHGLQAG
YEISPGESLDVWKAIEKSSGSIGSWHNKNKINSIDTNLKNKEEANDDQISQCLNQPNVSM
NT seq
3963 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtttaacatttagacgtatgtctgtgcaatataaaagtacacgttttttaagtgaa
ttagctggtgatgaaaaaaagaagtttggtaaacgtataattgttaaaaaaaataaaagt
gatgaaaacaatgatctaacctcaaaattaacaaaaacggaatttaaatttatgagaaaa
gatattaaatcatcgccttatgatgtccctcctaaacttacatcaattcgaagatctaaa
ccaaaatacaaaggatattatacaaaaacaaatcaacttactgctgaaaattatattttt
agtcgaaattcagaagaaaaagccgattttgtatatggaatacgaaagaataaattctcc
aaaaattatcacacaaattcattatgtgccaattttatgttaaaggagagtaaaaatttt
gaaaaatctctaataaataaaacatcaacaaagaaaaatgataatttaattaatttacca
agtaaaaaatatcgctatcttaataattcaaaatttaaaataattaaagttaaaaatcct
ataaacaatgagaatataacaattaaggcaacaaatgaaatttcaaaaaataaagaaaca
attgaacaagtcagtgataataattatttaaaaatagatgaaaatcgagaaaatgaaatt
aatttacaaatgcttccttcagctttgtttaaaacaatttttcccgaagaaaatgagtct
attgtttcatcagagaaattagattcaattaaaaaagaattactaacttttggattaaat
gttgataatcaaattcgcttaccaaatgtggatttagaattacctagtctcgaaggaaag
aatattgaggagcatttttataatattgccaattcacaaattaaaccctacatgaaagtt
gtaaatgaacttgttaaaaaaatacctccagttcctgaacaatggatttttcaagaagga
tggacaagatacacggaatcaggatcggaaaaagtggattacccattggaagagggttta
atttttgatgttgaagtttgtatgagtgagggaccacttcctacattagcaacagcagtt
agtaaaaatgcatggtacggttggatatcaaaatctctcgtcgaaaattctagtcttgtt
gtgaaagatcgttttctttcaaatgaatttctaattcctctagaaagtacatctgatgat
tatggaacaaaattaaataattttcaaaaacgtggtaaaataataattggtcataatgta
tcgtatgatcgtgcacgaattaaagaacaatattggttaaattcaactggaacacgattt
atcgacacaatgtcaatgcatatatgcgtcagcggaataaacagttttcaacgagcatta
ttgaaggctgataaagaggaccttgaggaaaacttgcgcaatcattcatcgttgaacaat
ttgggtgacgttcatcaactctattgtggcgagaaaatcaataaaaaggcacgcgactta
tttgtcgatggtactttattacaaattcgtgaaaatttcaatgatatgatgaaatattgt
gccaatgatgttaaagcgacatttaatatttttcaaaaattattaccaatgtttcaggaa
cgttttccacatccagttagttttgccggtatgttggaacttggttgtgcttatttacca
gtgaattcaaattggcaacgttatattgaagaatcagaattgacatttgaggattttagt
catgaatcaaaggctattttatcgaatcgtgcggctgaggtttgtcaacttatgcacgat
gagaaatataaaaaagatttatggatgtgggatcaggattggagtactcaggatattaaa
attaaatcgatattgacgaaacaacaacgcgatgaaatgattaaagataaagcaaaaagg
gcaattgaaaaagaaaatttaaaaaatgaagaagaagaaattgatccacttgaagagaaa
ttcgcttatttgaacgatacgaaatattatctacctgcaaaaatgcctcacatgcccggc
tatccaaattggtatcgaaaattatgtgacaaaaagaacaacgaagattggttaccaggt
gctcagaatattagcacttctatgaaagttgtgcctaaaattttgaatctcacatgggaa
aattatcccctacattatatacgtgaacatggttggggatttctcgtgccttataataat
gatctagctatagaaacaaaaattcctttaaaagaactattgaaacaatgtccactacca
attgaatcaaaaacagaaattgaaattgattacacaatgatgacactcgataaggaggta
caaagtgatttatcaaaaacagaattttggcgcgataaaaagaagaaaaatcccgaaaat
aatttctataaaggcagtggaatttggtgtaatattgacattgataattgttgttggttc
tttaaattaccacacaaagatggaacatcaaaaaacgttggcaatccattggctaaagat
tttttaaataaattctccgacaatgtactcgctggtcttgatgttagtgcatcgtcagtt
ttaaaaatagcaagaatgctctcctattggcgaaataatcgtgatcgaattttatctcaa
ttggtaatttggttcgatgaaaagagtctatcgagtgcattgaaacgtgataaaagaaaa
atgcgttacggtgcaattcttccacaagttattgtttcgggaacacttacacgtcgagca
gtggaaccaacatggatgacggcatcaaatgctcatgccgaaagaattggatctgaatta
cgttcaatgattcaagcaccaccgggatataatattgttggtgccgatgttgatagtcaa
gaattgtggattgcatcaataattggtgatgcttatcatgcaaaaattcacggagcaaca
ccatttggatggatgacattgattggtaataaagccgatggaacggatatgcatagtgtt
acagcaaaggcaattggtatatcgagagatcatgcaaaaataattaattacgcacgtatt
tatggtgctggtcaaagatttgccgagagattattgaagcaatttaatccaacaatgacg
gaagctgaagcgggggcaaaatcaaaaaaaatgttcgccatgacaaaggggagaaaaatt
tttagacttaaaaaagaatttatcagcaaagaattggttgataaggaatatagttcgggt
ttaatgtttaaaattgcgaaaatttatggtcgaacggcaagtgaaatgtttgaaaaagga
caatggatcggtggttctgaatcggcaatgttcaatagacttgaagaaattgctggtaat
ttaacgccggttacaccgtttttgaattcaagattaagtcgtgccttggagggacaggaa
attgatgacgataaatatttaccaacaaaagtcaattgggttgttcaaagtggtgctgtt
gattttttacatttaatgttggtttcaatgcgatggctaatgaaagataatgcaagattt
tgtctatcatttcatgatgaaattcgttatttagtcgcgaataaatataaatataatgct
gcacttgcaatgcatattacaaatttattgacacgttcattttgttcgtcgcgacttggt
ttaaaagatttgccaatgtcagtggcttttttcacatcggttgaagttgacactgtattg
agaaaagaagcgagtagtgattgtaaaacaccatcaaatccacatggtcttcaggctggt
tatgaaatatcacctggcgaaagtttagatgtatggaaagctattgaaaaatcttctgga
tcaattggctcatggcataataaaaataaaatcaattctattgatacaaatttgaaaaat
aaagaagaggcgaatgatgatcaaatttcacaatgtctaaatcaaccaaacgtaagcatg
taa
DBGET
integrated database retrieval system
