Leptopilina boulardi: 127289902
Help
Entry
127289902 CDS
T08910
Name
(RefSeq) laminin subunit beta-1
KO
K05636
laminin, beta 1
Organism
lbd
Leptopilina boulardi
Pathway
lbd04512
ECM-receptor interaction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lbd00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
127289902
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_EGF
Laminin_N
LAMININ_IV_B
F5_F8_type_C
XRCC1_N
NAS
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
127289902
NCBI-ProteinID:
XP_051174114
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1780 aa
AA seq
DB search
MVGVRNYFLIGNLIFLFTIFGPGLGEPQYGQPKPPIRGIKPKRIHPCEQSSCYPATGNLL
IGRTDKLKASSTCGSNGPERYCIVSHLKDRKKCFFCDASSQKKQHSIENIVSGVPHRTWW
QAENGVENVTVTFDLEAEFHFTHIIIRFQTFRPAAMLIERSYDSGKTWQVYRYFAHNCEQ
FFPGIPTHAPQKLTDVICETRYSHVAPSQNGDLIFRVLPSNLLISNPYSKEVQNLLKITN
LRINFTKLHTLGDDLLDNRAEIREKYYYAINDMVIRGSCSCYGHASRCLPLPGVANEENM
VHGRCECTHNTKGLNCELCEDFYNDLPWKPAVGKQTNACRECNCNNHTTSCHFDQAVYER
SGKLSGGVCDNCLHNTRGQNCEQCSLYYYHDESKHISDPYACQPCECDPRGSLDEGICDS
RTDILSGEESGKCHCKINVQGRNCNECKNGFWNFDEKNPEGCQACTCHILGTVNNEGCDV
FTGECTCKRHVTGRDCNQCLPEYYGLSDDADGCKPCDCDPGGALENSCDVVTGQCRCRPH
VTGRTCNQPEQSYYTGYLDLLTYEGELARGTDNCQVVIREPYRDGRNNTWTGIGFMKALE
GSTLNFTIDDIYRSMWYDIIVRYEPVQAGTWEDVQIVIERNEPVDPNGPCAEWKPDDDRL
WTQLPANARSAVAIPSVCLEAGKQYSILLTLRKFNGPADTPSASILVDSIVLRPKIDFIP
IFTDPGVGELRRHEYDGYRCSEYFNNVGYNHDAPEKCNKYYNSIGYYVYDGAHLCECNPT
GSHSAFCDNYGGNCHCKQNVVGRRCDRCAPGTYGFGPQGCISCDCDGVGALDNFCDVETG
RCKCRPNTYSRTCGQCEPGFWNFPHCQRCECNGHADSCDSQTGACLNCRDSTTGHNCDRC
IATFYGDPRIGVDIPCRACPCPGTLDSGHSYADSCSLDPVTHDVICECREGYSGPRCDSC
AENYFGNPEVAGGSCTSCDCSNNTDLYRPGNCDPHTGRCLQCLYHTSGPNCQICQPDYFG
NALLKDCQQCKCDVLGTDRSAGSCDHRTGQCPCLPHVMGQLCDSCEENHWRIASGQGCDP
CECDAIGSISDRCNPFDGTCECRPGFGGRRCNECQANHWGNPNVECYPCECDQIGSASQQ
CNRETGACVCHKGIGGHKCDQCDRSYIGFAPNCSPCGECFDNWDMILEGLKNKTNYVIGE
ASRIQKVGTTGVYSQEFDDMMSSIEQVKTLIGNASVRSQDLDELNKLADDLSKSISDSSV
TLEKADDLLNNVKQRVNLNDVALKNLKNRTNNLHEKAVNLKENATSLQEANVQGALNVTR
MMAEQSRQAEKMANDTTSILDDAERYKKHTESLIAKNSDAVAEAHERNKDALQKLDEKIN
SFGQLMPALNLNMCGQNVSECSSVCGGAGCGTCGGLACDAGALTKANQALDVAKKQSARI
KSHRDEAEQLLRNMIEVKNDATSARSNAQDAFNFASDARHRSDELMKNITDLSDKISSLL
DQTENNDHPTPSQVRTLAQQVLEKNIPLKPEEITELADKIKHIVSSLTNPDKILEETRYD
LERATILAARAEHAKNAALEKQNLASKVSDLLNEAKEAQDLAESAITKANEDITLSEKDL
TEIIEVTRDAKKKADNTSKSVDSLEERLKKLQTHVGKNEFIVKQEISHEGARVAEDAKIV
ENKTNQLGRQYKEASDLLNDRVDKSKENIQRAKRLLQQASELTADTSAKFKDLDGMESVY
KDNERILSGLMADVDALTEEMTRQLESIELKSQEYRQCST
NT seq
5343 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttggagttcgaaactactttttaataggaaatcttattttcctcttcactattttt
ggcccaggtctcggggagccacaatatggacaaccaaagccaccaataagaggcattaaa
ccaaagagaattcatccctgcgaacagagttcctgttatcctgcgacaggtaatttatta
attggaaggacagataaattaaaagcatcgtcgacatgtggttcaaatggaccagagaga
tattgtattgtctcacatttgaaggatagaaaaaaatgctttttctgcgatgcatcatca
caaaagaaacaacacagtattgaaaatatcgttagtggagtaccacatagaacatggtgg
caagcagaaaatggagtggaaaatgtaacagtcacatttgatttggaagcagaatttcat
tttacacatataattattcgctttcaaacatttcgaccagctgcaatgttaattgaaaga
tcttatgattctggtaaaacatggcaggtttatcgatattttgcacacaattgcgaacaa
tttttccccggtataccaacacatgcaccacaaaaattaacagatgtcatatgtgaaacg
agatattcacacgttgcaccatcacaaaatggagatcttatttttagagttctgccatca
aatttattgatcagcaatccctattcaaaggaagtgcaaaatcttctaaagataacaaat
ttgagaataaatttcacaaaactacatacacttggcgatgatcttttagataatcgtgcg
gaaattcgtgaaaaatattattatgcaatcaacgatatggtaataagaggatcatgctca
tgctatggtcatgcatcgagatgtctaccattgcctggagtggctaatgaagagaatatg
gtacatggaagatgtgaatgtacacacaatacaaaaggattaaattgtgaattatgcgaa
gatttttataatgatttaccatggaagccagcagttggaaaacaaacaaatgcatgtcgt
gaatgtaattgtaataatcacacaacatcatgtcattttgatcaagcagtttatgaaaga
tcgggaaaattatcaggtggtgtttgtgataattgtctacacaatacgagaggacaaaat
tgcgagcaatgctcactttattattatcacgatgagagtaaacatatttctgatccttat
gcttgtcaaccctgcgaatgcgatcctcgtggatcattggacgagggaatttgtgattca
cgaactgatattctcagcggtgaagaatcaggcaaatgtcattgtaaaatcaatgttcaa
ggacgtaattgtaacgagtgtaaaaatggcttttggaattttgacgagaaaaatcccgaa
ggatgtcaagcatgtacttgccatattcttggaactgtcaacaatgagggttgtgatgtt
ttcactggtgaatgtacttgcaaacgacacgtgacaggacgtgattgtaatcaatgttta
cccgagtattatggtctatcggatgatgctgatggttgtaaaccatgtgattgtgatccc
ggtggtgcattggagaattcctgtgatgttgtcactggacaatgtcgttgtcgaccacac
gtcactggacgaacgtgcaatcaacccgaacaaagttattacacgggttatcttgatctt
ttgacctatgagggagagctggcaagaggaactgacaattgccaagtagtgatcagagag
ccgtacagagatggaaggaacaacacatggacgggaattggattcatgaaagccctggag
ggatcgacgttgaatttcactattgatgatatatatagatcaatgtggtatgatattata
gtgagatatgagccagtgcaagctggtacgtgggaagatgtgcaaattgtcattgaacgg
aacgaaccagttgatcctaatggtccctgtgctgaatggaagccagatgatgatcgtttg
tggacccaattgccagcaaacgctagaagtgctgttgcaattccttcagtttgtttggaa
gctggaaaacaatactctattctgttgaccttgaggaaattcaatggtcccgctgataca
ccatcggcttcgattcttgttgattcaattgtactgaggccaaagatagattttattcca
atcttcactgatccaggtgtgggagaactgcgacgccatgaatatgatggttacagatgt
agcgagtacttcaacaacgttggttataatcatgatgcaccagaaaagtgtaacaagtac
tacaacagcatcggttactacgtttatgatggtgctcatttatgtgaatgtaatccaact
ggatcgcacagtgccttttgtgacaattacggtgggaattgtcactgtaaacaaaatgtt
gttggcagacgttgtgatcgttgtgctccaggaacatatggatttggtccacaaggatgt
atttcatgtgattgtgatggtgttggtgctttggataatttttgcgatgttgaaactggt
cgttgtaaatgtcgaccaaacacatattcacgaacttgtgggcagtgtgaacctggattt
tggaatttcccccattgtcaacgatgtgaatgcaatggacacgccgacagttgtgattca
caaacgggagcttgtttaaattgtcgagattcaacaactggccacaattgtgatcgatgc
attgccactttctatggtgatccaagaattggagttgatattccatgtcgagcttgtccc
tgtccaggaactttggattctggtcactcgtatgcagacagttgttctcttgatccagtg
actcatgatgtgatttgtgaatgtcgtgaaggttattcgggaccaagatgtgatagttgt
gctgagaattattttggcaatccagaagtggcaggtggaagttgcacgtcctgtgactgt
agtaataataccgatttgtataggccgggaaattgtgatcctcatacaggacgttgtcta
cagtgtctctatcatacgtctggaccaaattgtcaaatttgccaaccagattactttggc
aatgctctgctgaaggattgtcagcaatgcaaatgtgatgttcttggtactgatcgatca
gctggatcttgtgatcatcgaactggacagtgtccctgtttgccacatgtgatgggtcaa
ctttgtgattcctgcgaagaaaatcattggagaatagccagtggacaaggttgtgatcct
tgtgagtgtgatgccattggaagtatatccgacagatgcaatccctttgatggaacatgt
gagtgtcgtcccggctttggtggcagaagatgcaacgaatgtcaagcgaatcactggggc
aatccaaatgtggaatgttatccctgcgagtgtgatcaaataggatcagcgagccagcaa
tgtaatcgtgagactggtgcctgtgtttgtcacaaaggtattggtggtcacaaatgtgat
caatgtgatcgtagttacattggttttgcaccaaattgcagtccctgtggcgaatgtttc
gacaattgggacatgatcctcgagggtttgaagaataaaacaaattacgttattggtgaa
gcgtcaagaatacaaaaagtcggaaccactggtgtttatagtcaggaattcgatgatatg
atgtcttccattgaacaggtgaaaacactcattggaaatgcatcagtgagaagtcaagat
ctcgatgaacttaataaattggcagatgatttaagtaaaagtatttccgattcttcggtg
actttagagaaagctgatgatctgttgaataatgttaagcaaagggttaatttgaatgat
gttgcactaaagaatttgaagaatcgaacaaataatcttcatgagaaagctgtgaatttg
aaggagaatgctacatctctgcaggaggcaaatgttcagggtgctttgaatgtcacacga
atgatggctgaacaatctagacaggctgaaaaaatggccaatgatacaacgagtattttg
gatgacgccgaacgatataaaaaacatacggaatcattaattgctaaaaatagcgatgct
gtggctgaagcacatgaaagaaataaggatgcacttcaaaaattagatgagaagatcaat
tcctttgggcagctgatgcctgctttaaatttgaatatgtgtggacaaaatgtttctgaa
tgtagcagcgtgtgcggaggagctggatgtggtacatgtggaggtcttgcttgtgatgct
ggagctcttaccaaagcaaatcaagcattggatgtcgctaaaaaacaatcggccaggatc
aagagtcacagggatgaagctgagcaactgcttcgaaacatgattgaagtgaagaatgac
gcaacctctgcaagatcaaatgcccaagatgcctttaattttgcatcagatgctcgccat
cgttccgacgagctaatgaagaacataactgatctatcggataaaattagcagcctactg
gatcaaacggagaataatgatcatccaacgccatcgcaggtacgaactctcgctcaacaa
gtactcgagaaaaatattcctttgaaacccgaggaaatcacagaactagctgataaaatc
aaacacattgtcagttcacttacaaatcctgataaaattctcgaagagacacgatatgat
ttggaacgagcaacgatattagcagctcgtgccgaacatgccaaaaatgctgcactcgaa
aaacaaaatctcgcaagtaaagttagtgatctattaaatgaagccaaggaagctcaagat
ctcgctgaatcagccattacaaaagccaatgaagatattacgctatccgaaaaagattta
actgaaatcattgaggtaactagggatgcaaaaaagaaagctgacaatacatcaaaatca
gttgacagtctagaggagagattgaaaaaattacaaactcacgttggtaaaaatgaattt
atcgtgaaacaagaaatttcacacgagggagcaagagttgcagaggatgctaaaattgtt
gagaataaaactaatcaacttggtagacaatacaaagaagcgagtgatctattgaatgat
agagttgacaagagcaaggagaatattcaaagagccaagagacttttgcaacaagcttct
gagctcacagccgatacatcggcgaaatttaaagatcttgatggaatggaaagtgtctac
aaggataatgagagaattttaagtggtcttatggcagacgttgatgcacttactgaagag
atgacacgtcaacttgaaagcattgaattaaaatctcaagaataccgacaatgttcaact
tag
DBGET
integrated database retrieval system