Leptopilina boulardi: 127290789
Help
Entry
127290789 CDS
T08910
Name
(RefSeq) nuclear pore complex protein Nup154 isoform X1
KO
K14312
nuclear pore complex protein Nup155
Organism
lbd
Leptopilina boulardi
Pathway
lbd03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lbd00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
127290789
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
lbd03019
]
127290789
Messenger RNA biogenesis [BR:
lbd03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
127290789
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nucleoporin_C
Nucleoporin_N
WD40_WDHD1_1st
Beta-prop_WDR36-Utp21_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
127290789
NCBI-ProteinID:
XP_051175537
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1303 aa
AA seq
DB search
MTLTEMEPLKIHLDSLEMAGKMVDKHINADSNFPSLINLMRYTVQGGPTVSGLDVYDYPN
LNGSNLLNVNHMKIHSKIPLPSEVMEHFGHMQCHCMMGLFTDISKAWLTIDSDIYVWSYE
NESDVAYFDGLNETIISVGLVKPKPGIFQSYVKYLLILTTTVEITVLGVTLSETSSQGEI
QLVPEPIFTVTTDGVAITTIANTNSGRIFLGGRNGSLYEIYYQAESSWFGKRCKKINHSE
GPLSFLVPSFVSIALSEEEAIVQISVDDTRHILYTLGDKGSITVWDIDNGGASKITSMTQ
TTLVQNSVHAVKTLDSNNFRPLVSISAITESESQHLNLVAVAATGTRFYFSCSSVSNPSS
RPQGLQLIHVRLPPGYAANAPVIRPRKVQMSHYRKGTLILTCGGDSETVWCLTNDVFPFT
SYLAETQSILPLDSPVWSMAEILGEPAIKIETFNGLQGDPPLLVRQHMEPPRKFIFLTAQ
GAIILMQERPVDILRQLLLKQRGPDSEAVRAYFQSQSPEQACATCLILATLESSQNVQLS
EWATRAFFLYGGQRISNAPNMEIHSGFSNLNAGDLRTSTPRMQGLESRSPIFRSQQMGIS
TDLSLQQFSGKHGGLYLYVGRLLRPFWNLRCIKQETVNSKCQILSTVSSNQVGWVLGHLQ
ALRSFLNKNTYISKQFRDNSTRNMTNGFEMSQFNEPIVEERNSLDALKIFITHACEILGL
WKILCENQLQNIVNCLSKEQINQFSTATFRDLILIGHEISSLLIIHLIDSYLGDNASVDA
VSAKLREICPNLYRSEDAICSKANEIILKAKNCTNNEEKETYLQSALKLCKEVAPRLNLA
AVCQQFVACQFYSGVLELCLCCSERIDPNNAALHYYKNNEPIEDYEGNAAYSKRLEIYKE
FTAMLDHLYNQSISNPLTPTIPSKPGPPIRNTLATNVPAKDVLHDIIDEALHSSCETLHA
SIYLWMIEKGLHGELIALAAPSLEAYLIRVGAPELLWQYYERNKNHAGAAKILDSLASKP
GTGVPLTQRVEYLARAVICMRSDRAGYAPYLGVFLRELEDKVEIARIQQQILETIVNQEN
ILDADTVRDARMRLNSSLLDITQLYEDYAEPLQLWECKLSIIHCSGHQDSMLIQGIWTNI
IDNELRNATSPSSEDKLVILLTKIKQLGQDYFGSPHCFPIDFLLKELEIRACRLKVSNDH
IIKGLLQLGIPIEDLLDYYDKMIGGNNRTWLNEGNEFHLIESTMNLVNYFISNSTVTNNF
NRMKIITKCQDVISKCLTTLFSKPNGGQLIEKLRSIQSVLNRL
NT seq
3912 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactctcacagaaatggagccactgaaaattcaccttgactccttggagatggcaggg
aaaatggtagacaaacacattaatgcagacagtaattttccatcgttaattaatcttatg
agatatactgtacaaggtggtccaacagttagcggtttagatgtatatgattatccaaat
ttaaatggttctaatttattaaatgtaaatcatatgaaaattcacagtaaaattccattg
ccctcagaagttatggagcattttggacatatgcaatgtcactgcatgatgggacttttt
acagatatttcgaaagcttggctgacaattgacagtgacatttatgtttggtcctatgaa
aatgaatctgatgtggcgtactttgatggattgaatgagacaattattagtgttggctta
gtgaaaccaaaaccaggaatatttcaaagttacgtgaaatatttgctaattttaacaact
actgttgaaataactgttcttggtgttactttatccgaaacgagctcacaaggagaaata
cagttagttccagaaccaatttttacggttaccactgatggagtcgctattacgactatt
gcaaatacaaatagtggtagaatttttcttggcgggagaaatggatccctttatgaaata
tattaccaagcggaaagtagttggtttggaaaacgttgtaaaaagataaatcattcagaa
ggtccattatcgtttttggtaccttcattcgtttcaattgcattaagtgaagaagaagcg
atagttcaaatatcagtagatgacacgaggcatattttatatactcttggtgataaagga
agtataactgtttgggatattgataatggaggagcatctaaaataacatcgatgacacaa
acaacacttgtacaaaattcagttcatgctgttaaaacccttgatagtaacaattttcgg
cctttggttagtatatcggctattacagaatcagagtcgcaacatttgaatttagttgca
gttgcagcaacaggaacaagattttattttagctgcagttcagtttcaaatcccagcagt
agaccacagggtcttcaattaattcatgttagattaccacctggttatgccgctaatgct
cctgttattagaccaagaaaagttcaaatgtcccattatagaaaaggaactttaatacta
acctgtggcggtgattctgaaactgtatggtgtttaacaaatgatgtttttcccttcacg
agttatcttgccgaaacacaaagtattcttccattggatagtccagtttggtcgatggca
gaaattctcggtgaacctgcaataaaaatagaaacgtttaatggattacaaggagatcca
ccccttttagtgaggcaacatatggaaccacctaggaaatttattttcctaactgcacaa
ggagcaataatattaatgcaagagcgaccagtcgatattcttcggcagcttctattaaaa
caacgaggtccagattcagaagcagtgagagcttattttcaatcacaatcaccagaacaa
gcatgcgctacttgtttgattttagctacccttgaaagttctcaaaatgttcaattatcc
gaatgggcaacaagagcatttttcttatatggaggacaaagaatttctaatgcaccaaat
atggagatacacagtggattttcaaatttaaatgcaggagatcttcgaacatcaacgcca
agaatgcaaggtttagaatcacgatcgcctatctttagatcacaacaaatgggtatttca
acagatttgtcattacaacaattttctggaaaacatggaggcttgtatctttatgttggt
agattattgaggccattttggaatttaagatgcatcaaacaagaaactgttaatagtaaa
tgccagatacttagtacagtgtcatcgaatcaagttggatgggttttgggacatttacaa
gctctaagatcatttttaaataaaaacacctacatttctaaacagtttagagataattca
actcgaaatatgacaaatggctttgaaatgagtcaattcaatgaaccaattgttgaggaa
agaaattcattggatgcattgaaaattttcattactcatgcttgtgaaattttgggactt
tggaaaattctctgcgaaaatcaattacaaaatattgttaattgtctctcaaaggaacaa
attaatcagttttcaacggcaacatttagagatttgattttaattggtcatgaaatatca
tctttgcttattatccacttgattgacagttatttaggtgacaatgcttcagttgatgct
gttagtgcaaaattacgcgaaatctgtccaaatttgtatagaagcgaggacgctatttgt
tcaaaggctaatgaaattattctaaaagcaaaaaattgtacaaataatgaggaaaaggaa
acgtacttgcagtctgctcttaagctgtgtaaagaagttgctccaagattaaatttagca
gctgtttgtcaacaatttgtagcttgtcaattttattccggtgttttggaactttgtctt
tgttgttcagagagaattgatcctaataatgctgcattgcattattataaaaataatgag
ccaatcgaagattatgaaggcaatgctgcttattcgaaacgattagaaatttacaaagaa
ttcactgcaatgttagatcatctttataatcaaagtatttctaatcctctgacaccaaca
attccaagtaaaccaggtccacctattcgaaatacattagctaccaatgtaccagcaaaa
gatgtgttacacgatattatcgatgaggcattgcattcatcgtgtgaaactttacatgca
tcaatttatttgtggatgattgaaaaaggacttcatggagaattaattgcacttgctgca
ccttctttggaagcatatctcataagagttggagcaccagaattattatggcaatattat
gaacgaaataaaaatcacgcgggagctgctaaaatcttagattcactagcttcgaaacca
ggaactggcgttcctttaactcaacgtgttgaatatttagcacgtgctgtaatttgtatg
cgaagtgatagagcaggatatgctccttatcttggagtttttctccgtgaacttgaagat
aaagtagaaatagcaagaatacagcaacagatattagaaacaattgtaaatcaggaaaat
attcttgatgctgacactgtacgagatgcaaggatgagactaaattcttccttattagat
attacacaattatatgaagattatgcagaaccacttcaactttgggaatgtaaattgtca
ataattcattgttcaggacatcaggattcaatgttaattcaaggaatttggaccaacata
attgataatgaattaagaaatgctacatctccatcatcggaagacaaattagtaattctc
ttgactaaaattaaacaacttgggcaggattattttggaagtccacattgtttcccaata
gactttttattaaaagaattggaaattcgagcctgtcgattgaaagtttctaatgatcat
ataattaaaggacttttacaattaggaatcccaattgaagatcttttagactactatgat
aaaatgattggaggaaacaatcgtacgtggctaaacgaaggcaatgaattccatttaatt
gaatcaacaatgaatctagttaactatttcatatccaattcaactgtaactaataacttt
aacagaatgaaaataataacaaagtgtcaagatgtaatttccaaatgtttgacgacactc
tttagtaaaccaaatggaggacaattaattgaaaaattacgatcaatacaaagtgtgctt
aatcgtttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system