Nicoliella spurrieriana: MOO44_03270
Help
Entry
MOO44_03270 CDS
T08428
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V subunit gamma
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
lbe
Nicoliella spurrieriana
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lbe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
lbe03400
]
MOO44_03270
Enzymes [BR:
lbe01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
MOO44_03270
DNA repair and recombination proteins [BR:
lbe03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
MOO44_03270
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
RecC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQS87195
UniProt:
A0A976X5S5
LinkDB
All DBs
Position
complement(360195..363788)
Genome browser
AA seq
1197 aa
AA seq
DB search
MALQFILGTADKNHAQTLTDLLQTMIHDRPNDRYFYLVPNHIKFESEVKTLERLNRHHDD
VYAQTNVQIFSLTRLAWFFLSHEPEYQIPRLSGAGVNMLLYQIINEQQEQLTVFRGESGQ
PGFINQIASQIAEMESGRVSPDDLADLYEVNHDALSPSLRDKLHDFTIIYREFEEATVGK
FIHQNDTLKLLCNYLMEADLSQMHFFISGFSQLSAQERELVMIMIQKAANVTIDLNLDRP
AVRERADEPDLFFQPAKLYHQLYQFANDHHVHVKFDLYAKQERVNNDLLALNNYWIQSSG
VDPIQKTKLFDDQSIQVVKADNYYAELTSVAIQIRQLVASGQYHYRDILVMTRHLDKYQN
IIQPIFKMQAIPYFNDVQKSMVDHPLVQLIDALFNIEPAFGARSYRYDDVMRLLKTELLL
PRDENGHLMDIKAFRDALALTENVVLKNGYEGSRWLQDDDWQYRWLNDADFESKSPSDEQ
VNRKINLIRHYVKDTFPPFFKRMRRAKDVPTAAKWLYQFLVEQGVVERLKQWRDTAVERG
DLSAGAQPEQVWQTFCSLLDDFVTVLGEHQTFKLADFLELLKAGFEGANYSQIPSTLDQV
AISESGIVQMQDYKVVFMIGATDDVMPDRITDDNLFNDSDRDDLTKYFGADQYLRDTSIS
QMANDSYLNYLAFLTGSERLIFSYCLANDSDSETGVQISPYVDRIKRHFQIQEYHYVDTP
NASHADIMPYVGTQRTTLRHLVQASYDHKYNHHDMADSWNFVYAELINASAESRALTEKL
LGGLDYHNTPTRLTNEIVTGLYGNTIETSISQLEQFYSNPYEYFLKYGLKLHERAVFELS
SASTGEFYHAALDMLVKRLQAEQIDLKSLDEQDVNQLVNEVANQLLNDPNNFQYAILHSS
SRMNYLKTQLIKTVERMALTMHWQSQSTPMRPRDTEISFGRVGKGPNLDPLTFDLSNQIV
IPGIQTLKVRGRIDRIDSMNTEDKRFLELIDYKSGNKSIDFGQVYDGTAMQLITYLDVIK
KNLDRFSQEQKAELAGALYFHVFNPKLTPKDLEKHDFKTAMMKKQKYSGVLVDDRELISL
IDDQIKTGGNSVIYPIGFNKGGEKLSHFSKVIEPDDLDLILQHTEQLIQNAGVRIFNGDV
QLAPVKDNNMTAMQYSPFKSIMQFDPLLSENNYRNVESLGMQEVIAKLREERKHGLH
NT seq
3594 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcactacaatttatcttaggaactgccgataagaatcacgctcagacgttgactgat
ttattacaaaccatgattcatgaccgccccaatgaccgttatttttatttagttcctaat
cacattaagtttgaatcagaagtgaaaacgttagagcggttgaatcgtcatcatgatgat
gtttacgctcagacgaatgtgcagattttttcgttgacccggttagcatggttcttttta
agtcatgagccggagtatcaaattcctaggttgagtggggcgggggttaacatgctgctc
taccaaattattaacgagcaacaagaacaactgaccgtttttcgtggtgaaagtggacag
cccgggtttatcaaccaaattgcgagtcagattgctgaaatggaatctggacgggtgagc
cccgatgaccttgccgacctatatgaagttaatcatgatgctctgagtcccagtttacgt
gataaattacatgattttacgattatttatcgtgaatttgaggaagctacggtcggaaaa
tttattcatcaaaatgacactttgaaactcctttgtaactacctaatggaagctgattta
tcacagatgcacttttttattagtggcttttcacagttgagcgcacaagagcgtgaatta
gtaatgatcatgatccaaaaagcagcgaatgtgaccatcgatttaaacctggatcgccca
gcagttcgtgagcgagcagatgaaccagatttattctttcaaccggccaagctttatcat
cagttgtatcaatttgcaaacgatcaccatgtccatgttaagtttgacttatacgctaag
caagaacgggtcaataatgatttattggcgttaaataactattggattcaatcaagtggt
gttgatccaattcaaaagactaagctattcgatgatcaatccattcaggtggttaaagct
gataactactatgctgaattaacatcagtggcaattcaaattcggcaattagtggccagt
gggcagtatcattaccgggatattttagtaatgacacggcatctagataaatatcaaaac
attattcagccaatttttaagatgcaggcgattccgtattttaacgatgtgcaaaagtcg
atggtcgaccatcccttggtccaactaatcgatgcgctatttaatattgagccagctttc
ggtgcacgttcgtatcgctatgacgatgtaatgcgcttgttaaaaacggaattattactt
ccgcgtgatgaaaatggccacttaatggacattaaagcatttcgggatgcacttgctttg
actgagaatgtggtgttaaagaatggctatgaaggatcgcggtggttgcaagatgacgac
tggcaatatcggtggttgaacgatgctgattttgaatcaaagtcgccttcggatgaacag
gttaaccgtaagatcaatttgattagacactatgtaaaggatacattcccaccgttcttt
aaacgcatgcgacgggccaaggatgtgccaactgctgcaaagtggctgtaccaattctta
gtggagcagggggtcgtagaacgcctaaagcaatggcgtgataccgccgttgaacgcggc
gatttatccgctggtgcacagcctgagcaggtctggcaaactttttgtagcttgttagac
gattttgtgaccgtcctaggtgaacaccaaacgtttaagttagctgactttttagagcta
ctgaaggctgggtttgaaggggctaattattcgcaaattccatcgacattggatcaggtt
gcaatttctgaaagtggaattgtccagatgcaggattataaggtcgtatttatgatcggg
gccactgatgacgtgatgccagatcgaattactgatgataatttatttaatgacagtgat
cgggatgatttaacgaagtactttggagctgatcaatatcttcgtgacactagcatcagc
caaatggcaaatgattcatacctgaactacctggcgtttttaactggtagtgagcggttg
attttttcatattgccttgcaaacgatagtgatagtgagaccggggtacaaatttcacca
tacgtggatcgaattaaacgccattttcagattcaagaatatcactatgttgataccccc
aatgctagccatgcggatattatgccgtatgttggaacgcaacgcacgacgcttcgccat
ttggtgcaggctagttatgatcataagtataaccatcatgatatggctgactcatggaac
tttgtgtatgctgaattgattaacgccagtgctgaaagtcgtgctttgactgagaagtta
ttgggcggattggactatcataataccccaacccggttaacgaatgaaatcgtcacggga
ttatatggcaatacgatcgagacctcgatttcacaactagaacagttttattccaacccg
tatgaatacttcttaaagtatggtttaaaattacatgaacgggcggtctttgaattatca
tccgcaagtaccggtgagttttaccacgccgcgttggacatgttggtcaagcgcctgcaa
gctgagcaaattgacttgaaatcattggacgaacaggatgtaaatcagctagtaaatgag
gtcgctaatcagttgttgaacgaccccaataattttcaatacgctatcttgcatagttct
tctcgaatgaactacttaaagacgcaattgattaaaaccgttgaacgaatggctttaaca
atgcactggcaaagccaatcaacgccaatgcgaccacgtgatactgaaatttcatttggt
cgggtcggcaaggggccgaatttagatcccctaacgttcgatctttctaatcaaattgtg
attccaggaattcaaaccctgaaggtgcgcggtcgaattgaccggattgattcgatgaat
actgaggataaacgcttcttagagttgattgactataaatcaggaaataaatcgattgac
ttcggccaggtttatgatggaaccgcgatgcaattgatcacctacctagatgtaattaaa
aagaatctggatcgatttagccaggagcaaaaagctgaacttgcgggagcgttgtacttc
cacgtctttaatccgaagctgacgcccaaggatcttgaaaagcatgatttcaaaaccgca
atgatgaagaaacaaaagtacagcggggtgttggttgatgaccgggaactgattagcttg
atcgatgatcaaattaagactggtgggaattcggtcatttatccaattggttttaacaag
ggtggtgaaaaattaagccatttcagtaaggtaattgaacccgatgatttggatttaatc
ttacaacacaccgaacaactgattcaaaatgcgggggtacgcatctttaatggtgacgtt
caactagctcccgttaaggataataatatgactgcgatgcagtactcaccgtttaagtcg
atcatgcagtttgatccgctactgagtgaaaataactaccgcaatgttgaatcacttgga
atgcaggaagtcattgcaaaattaagggaggaacgaaagcatggactacactaa
DBGET
integrated database retrieval system
