Bombilactobacillus bombi: DS830_03645
Help
Entry
DS830_03645 CDS
T06522
Name
(GenBank) ribonuclease J
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
lbm
Bombilactobacillus bombi
Pathway
lbm03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lbm00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
DS830_03645
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
lbm03019
]
DS830_03645
Messenger RNA biogenesis [BR:
lbm03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
DS830_03645
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_C
RNase_J_b_CASP
Lactamase_B
Lactamase_B_2
RMMBL
Anti-Pycsar_Apyc1
Lactamase_B_6
DdrB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXX65629
UniProt:
A0A347SUC0
LinkDB
All DBs
Position
complement(705229..706947)
Genome browser
AA seq
572 aa
AA seq
DB search
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DLTYIEENIDKIVGIFLTHGHADAIGAVPYLVGDHDIPVFGSKLTIELTKINVGNDKHSR
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YKTDYQRLADIGKNKVVALLSDSANAESPYPAADERDIYTYIWETFEYQQGRIVVASVAS
NILRMQQIFDAAQKLNRKVVLTGQDASKIVRTVIKLGYLNVDDDLLVSAREAEKMPKDKI
LIIETGRMGEPIKILQKMATSRHHFYHIEPGDFVFIATTPSHAMETNVAKTRDLIFRAGA
EIKSLSDSGLYTSGHASKSDLQLMINLLHPQNVIPVQGEYRLLNAHSKIAAETGLDKNNI
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DRKKKKIVAPPKVTARGFVYLRENRQLLTESSEVVVKAVQNNLDNKEFDWTHLKQDIRED
LNHFLWNKTKRHPMILPVVMEVNQNRHRNSHK
NT seq
1719 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system