Loigolactobacillus backii: AYR52_08655
Help
Entry
AYR52_08655 CDS
T04754
Name
(GenBank) 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase
Organism
lbt
Loigolactobacillus backii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF2229
BcrAD_BadFG
DEDD_Tnp_IS110
HGD-D
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ANK60312
LinkDB
All DBs
Position
complement(1844609..1848880)
Genome browser
AA seq
1423 aa
AA seq
DB search
MTKLRGGIDVGSTTVKLVIMNEQNETLFARYERHYSDVKTASKKIIDEAIKELGPTVPIS
FTITGSGGMGLANLLQLKFIQEVIACTKTVEELIPQTDVSIELGGEDAKITFFGASLEQR
MNGSCAGGTGAFIDQMATLLKTDANGLNIMARDYEMIYPIASRCGVFAKTDVQPLINDGA
KKADIAASIFQAVVNQTIAGLASGRKIRGKVAFLGGPLYFMDQLRARFIDTLNLAPEDVV
FPADPQLFVAKGAAFYAADQPEITLVTLADRLVNGDDSVMKPSRSLAPLFKNDDELQEFR
KRHAQAKVEERDLASYHGTAFLGIDAGSTTTKVALMSTDHKLLYTYYDSNDGDPLKKTEE
ILRDLYAKLPADVVIGKTAVTGYGEHLIKNALMVDIGEVETVAHYRAAHYFQPNVDFILD
IGGQDMKAMTVKNDALATIKLNEACSSGCGSFIETFATSLKYSVKNFAQAALLAQHPADL
GSRCTVFMNSKVKQVQKEGASIGDISAGLSMSVIKNALYKVIKLRRPEDLGENIVCQGGT
FYNEAVLRAFELISGRQVIRPNIAGLMGAYGAALIAEEAYQDGDQTTLLKPEQMDNLTSK
KEFMHCGLCENNCALTITIFNDGRRFVTGNRCERGEARGMKQRVPKSNGKINLVQEKYKL
LFSYRPLRKKLATRGIIGMPRVLNMYEDYPMWQTFFTKLGIRAELSPKGSKEQYEKGIET
IPSDTVCYPAKQVHGHIQALIDKGVKTIFYPGVVYEREENKDAQNHFNCPIVQSYPDVIK
NNVDEIREGKVNYLDPYLNLADHESTAKNLCEALSSFDVSLDEVKTALEAGYAELEHFKQ
QVRDRGEDTLRLLKQNGERGIVLAGRPYHLDPEVNHGISQIMTAEGFNVLTEDSIAHLGD
VKGLRVVNQWVYHSRLYAAARVAARDPQLELVQLNSFGCGLDAIDTDQVEDIMSQYNRLY
TVLKIDEGTNMGAVRIRLRSLKAAVKERNKRLIMPTKQFEDDKPITFTKDMQKEHYTLLM
PMMSPIHQNGLVDVALQASGYNVVNLPTDDHHAIDEGQKFVNNDACFPAIISIGQMLEAL
KSGKYDLDHTAVMMTQTGGGCRATNYIPLIRKALKDAGFAKIPVVSMSLGNQGVEETPGF
KLTLPLLKRVALGFLYGDLFERVVYKTRPYEQNPGQVDQMHADWLKLVKPSIVKGSFRQF
KKNVRQIVRDFDTVPLTDEIRPKVGLVGEILVKYSPIANNDLVHLLESEGAEAVVPDIVG
FMNYSLYNQIYKYKQFGFAKKSEVLAEMGLKLINWCEKPMQAALVASDRFTGIDAIETLA
NDASKVLSLGNQTGEGWFLTGEMISLLKEDVNNIICMQPFGCLPNHVVGKGVVKELRREY
PKANIAPIDYDPGVSIVNQLNRIRLMLATANKALDKEEEVKVH
NT seq
4272 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaaactacgtggtgggatcgacgttgggtcgacaactgtgaaacttgttattatg
aatgagcaaaatgagacgttatttgctcgttatgagcgccattattccgatgtgaaaaca
gcgagtaaaaaaattatcgatgaagcaattaaggaattagggccgactgtgccaatttca
tttacaatcacgggttctggtggtatgggcctcgcaaacttactacaacttaaatttatt
caagaagttattgcttgtaccaaaacggttgaggaattaattccgcaaacggatgtcagt
attgaacttggtggtgaggacgccaagattacgttctttggtgcttcacttgaacaacgg
atgaacggtagttgtgccggtgggactggtgcttttattgaccaaatggcaacactttta
aaaaccgatgcaaatggccttaatataatggctagggattacgaaatgatttatccgatt
gcttcgcgttgtggtgtctttgcaaaaacggatgttcagccgctgattaatgatggtgct
aaaaaggcggatatcgctgcgagtatctttcaggcagtggtcaaccaaacaatcgccggg
ttggcctctggtcgtaaaattcgcggtaaggtggcctttcttggtggcccactgtatttt
atggatcaactgcgcgcccgttttattgatactttgaatttagcaccagaagatgttgtc
tttccagctgatccacaattatttgtggctaaaggtgccgcattttatgctgctgaccaa
ccagaaataacgttagtcactttggccgatcggttagttaacggcgatgatagtgttatg
aaaccttcccgctccttagcgccattatttaaaaatgatgatgagttgcaggaatttcgc
aagcgccacgcccaggctaaggttgaagaacgtgatctagctagttatcacggcacggcc
tttttaggaattgatgcgggatcaaccacaactaaagtggctttgatgagtaccgatcac
aagctactatatacttattatgacagcaatgatggcgatccgctaaagaaaacggaagaa
attttgagggacttatacgctaaattacctgctgatgtggttattggtaaaacggccgtt
actggttacggtgaacatttaatcaaaaacgccttaatggttgatattggtgaagttgaa
acggtagcccattaccgagcggctcattatttccaaccaaacgtcgattttatcctcgat
attggcggtcaagatatgaaagcaatgaccgttaaaaacgatgctttagcgacaattaaa
ttgaacgaggcctgttcttctgggtgtggttctttcattgaaacgtttgcgacctcacta
aagtattcagttaagaattttgcgcaggcggctttgcttgcacagcatcccgctgatctt
ggttcccgctgtactgtctttatgaactctaaggtcaaacaagttcaaaaagagggtgcc
tcaattggtgacatttctgccggcttatcaatgtcggtaattaaaaatgccctttataag
gttattaaattacggcggcctgaagatttaggcgagaatattgtttgtcaaggtgggact
ttttataatgaggccgttttacgggcctttgaacttatttctgggcgccaagtaatccgg
cctaacattgcgggtttaatgggcgcttatggggcggcgttgatcgccgaagaggcgtac
caagatggggaccaaacaaccttactaaagcctgaacagatggataacttaacctctaaa
aaagaatttatgcactgtggcctttgtgaaaacaactgtgccttaacgatcactattttt
aatgatgggcgccgctttgtcaccggtaatcggtgtgaacgtggtgaggcacggggcatg
aagcaacgagtgccgaagagtaacggtaaaattaatcttgttcaagaaaagtataaatta
ctatttagttaccggccactacgtaaaaaattagctacccggggtattattggaatgcca
cgcgttctaaatatgtacgaagactatcctatgtggcaaacttttttcactaagttaggc
attcgcgctgaattatcaccaaagggcagcaaagaacaatacgaaaaagggattgaaaca
attcctagcgacacagtttgttatccggccaaacaagttcatggccatattcaggcttta
attgacaagggcgttaagacaatcttctatcccggagttgtttatgaacgcgaagaaaat
aaagatgcacaaaaccattttaactgtccaattgttcagtcgtaccccgatgttatcaaa
aataatgttgacgagattcgtgagggtaaagtgaactaccttgatccttatttaaacttg
gccgatcacgaatcaacggcgaaaaacctttgtgaggcacttagtagttttgacgttagc
ttagatgaagtcaaaacggccttagaagcgggctatgctgaattagaacactttaaacag
caggttcgcgatcgcggtgaagataccttacgtttattaaaacaaaatggtgaacggggg
attgttttagctggccgaccttatcaccttgatcctgaagtcaatcatggtatttcgcag
attatgactgcggaaggctttaacgtgttgacggaagactcaattgcgcatcttggcgac
gttaaaggtctacgagttgtcaatcagtgggtttatcattcccgtctttacgctgcggct
cgagtagcggcgcgtgatccacagctggaactagttcagttaaattcgtttggttgtggc
ctagacgccattgatacggaccaggttgaagatattatgagccagtacaatcgactttac
accgttttgaaaattgatgagggtaccaatatgggtgcagttcgaattcggttacgttcg
ttaaaggccgcggttaaggaacgaaataaacgtttgattatgccaacgaaacaattcgaa
gatgacaaaccaattacctttaccaaagatatgcaaaaagaacactatactttactgatg
ccaatgatgtccccaattcatcaaaatgggttggttgatgttgctttacaagcgtctggt
tataacgtggttaatttgccaactgatgaccaccacgcaattgatgaagggcagaagttt
gttaataacgatgcttgtttcccagcaattatttcaattggccagatgttagaggcattg
aagagtggcaaatatgatctggatcatactgccgtgatgatgacacaaacaggtggtggc
tgccgagcaaccaactatattccactaatccgtaaggccttgaaggacgctggcttcgca
aagattccagttgtttcaatgtcattaggtaatcaaggcgttgaagaaacacctggcttc
aagttaaccttaccgttactcaaacgagtagcattaggtttcttgtatggtgatttattc
gagcgtgtggtttataagactcgcccttatgaacagaatccagggcaagttgaccaaatg
catgcggattggttaaagcttgttaaaccaagtatcgttaagggcagcttccggcaattc
aaaaagaacgttcgccaaattgttcgcgacttcgatactgttccgttaactgatgaaatc
cgaccaaaagttggtttagtcggtgaaattttagttaaatattcgccaatcgctaataat
gatcttgttcatttattagaaagtgaaggtgctgaagccgttgttcctgatattgtcggt
ttcatgaattactcgctctataatcaaatctataagtataaacagtttggttttgctaaa
aagtcagaggttctggcggagatgggcctgaaactgattaattggtgtgagaagccaatg
caggcggccttagttgcttccgatcgttttactgggattgatgcaattgaaacgttagca
aatgatgccagcaaggtactttcattaggaaatcaaactggagaaggttggttcttaact
ggtgaaatgattagtctgttgaaagaagacgtcaataatatcatttgcatgcagccattt
ggttgtttgcccaatcacgtggttggtaaaggtgtggtcaaagaattacgccgggaatat
ccgaaggcaaacatcgctccaattgactacgatcctggtgtttcaattgttaaccaactt
aatcgaattcggctgatgttggctacggctaataaagctttggataaggaagaagaagtt
aaggttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system