Loigolactobacillus backii: AYR52_10270
Help
Entry
AYR52_10270 CDS
T04754
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
lbt
Loigolactobacillus backii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lbt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
lbt03032
]
AYR52_10270
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
lbt03400
]
AYR52_10270
Enzymes [BR:
lbt01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
AYR52_10270
DNA replication proteins [BR:
lbt03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
AYR52_10270
DNA repair and recombination proteins [BR:
lbt03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
AYR52_10270
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ANK60601
LinkDB
All DBs
Position
complement(2201421..2203895)
Genome browser
AA seq
824 aa
AA seq
DB search
MADEPQNSRIKDVNLSTTMRTSFLDYAMSVIVARALPDVRDGLKPVQRRILYGMSELGVT
PDKPYKKSARIVGDVMGKFHPHGDSSIYEGMVRMAQDFSYRYMLVDGHGNFGSVDGDGAA
AMRYTEAKMSKIATEMLRDINKDTIDYQDNYDGTEKEPTVLPARFPNLLVNGSTGIAVGM
ATNIPPHNLSEVISALHILMDNPEATTADLMEAVPGPDFPTGGLVMGKSGIRRAYETGKG
TIMLRARTEIQEQKNGKERIIVTELPYMVNKARLVEKIAELARDKRIDGITDLNDESDRE
GMRVVIDIRRDVSASVVLNNLYKLTMMQTSFGFNMLAIVNGTPRTLSLKEILQYYLKHQE
EVIQRRTAFDLRKAEARAHILAGLRIALDHIDEIIRIIRSSKTGEVAKNILMERYELDDK
QTQAILDMRLVRLTGLERDKVESEYADLMVKIADYKDILAKPERINQIIYQELLEIQTKF
GDKRRTELLVGEVLSLEDEDLIEEEDVVITLTHNGYIKRLPASEFKIQNRGGRGIQGMGI
HDDDFIEHLVFTSTHDMLLFFTNTGKVYQAKGYEIPEYGRTAKGIPVINLLGIDSGESIQ
TVVNVASDAEDNYLMFTTLKGVAKRTPVAEFQNIRSNGLKAITLKENDELINVSLTDGKQ
NIIIGTHLGYAVSFAETAVRSMGRSATGVRGIRLREGDYVVGSDLLTADSEVLVISENGY
GKRTSAKQYPIKGRGGKGIKTVNVTDKNGPLAGLTTVNGNEDVMLITNTGVVIRFHVSDV
SQTGRATLGVRLIRVDDKAKVATMAKVEPEVADTEATTEDPTTD
NT seq
2475 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagacgaaccacaaaatagccggataaaagacgtcaatttatcgacaacaatgcgt
acctcgttcttggactacgcgatgagtgttatcgttgcacgggcattaccggacgttcgt
gatggtctaaaaccagtccaacgtcgtattttatacggtatgagcgaattaggagtaaca
ccggacaagccatataagaaatcggccagaattgttggggatgttatgggtaaattccat
ccccatggtgattcatcaatttatgaaggcatggtacgaatggcgcaagacttcagttat
cgctacatgttagttgatggacatggtaactttggctccgtcgacggtgatggcgccgct
gcaatgcggtataccgaagctaaaatgagtaaaattgcaacggaaatgttgcgcgatatt
aacaaagatacaattgattaccaagataactatgatggtactgaaaaagaacctactgta
ctaccggcacgctttcctaacctactagttaatggttcaacggggattgccgttgggatg
gcaacaaatattccaccacataatttgagtgaggttattagtgcactgcatattttaatg
gataatccagaagcaactacagccgatttaatggaggcagttcctggtcctgattttcca
actggtggtttagtcatgggcaaatcaggtattcgccgtgcttatgaaactggtaaggga
accattatgctccgtgcacgaactgagattcaggaacaaaaaaacggtaaggaacgcatt
attgttactgaacttccgtacatggttaataaggccagattagttgaaaaaattgctgaa
ttggcacgtgataaacgaattgatggaattacagatctaaacgatgaatccgatcgtgaa
ggtatgcgtgttgttattgatatacgccgtgacgtatcagcttcagttgttttgaacaac
ttatataaattaacgatgatgcaaacttctttcggctttaacatgttagccattgttaac
ggcacaccgcgcacgttgagtttaaaagaaattttgcagtattacttaaaacatcaagaa
gaagttattcaacggcggacggcttttgatttacgcaaggccgaagctcgtgcgcacatc
ttggctggtttacgaattgcgctagatcatattgatgagattattcgaattattcgtagt
tctaaaactggtgaagttgccaaaaatattttaatggaacgctatgaattagacgataag
caaacacaggctattttagacatgcgtttggttcgtttaactggtttggaacgcgataaa
gttgagtctgaatatgctgatttaatggtcaaaattgccgactataaggatattttggct
aaaccggaacggatcaaccagattatttatcaagaattgttagaaattcaaactaaattt
ggtgataagcggcggactgagttgttagttggcgaagttctaagtcttgaagatgaggat
ttaatcgaagaagaagacgttgtgattactttgacgcacaatggctatatcaagcgctta
cctgcttctgaatttaagatccagaatcgtggtggccgtggtattcaaggtatgggcatt
cacgatgatgatttcatcgaacacctagtctttacctcaacgcatgatatgctattattc
ttcacgaatacgggtaaagtttaccaggcaaagggctacgaaatacccgaatatggacga
actgccaagggaattccggtaattaatctgcttggaattgattctggcgaaagtattcaa
acagtagttaatgtagcttcagatgctgaagataactatttgatgttcactacgctgaag
ggagttgctaagcggacacctgttgcggagttccaaaatattcgtagtaatggcttaaag
gcaattaccttaaaagaaaatgatgagctaattaacgttagtttgacagatggtaagcag
aatattattatcggaacgcacttaggttatgcggttagctttgctgaaacggccgttcgt
tcaatgggtcgttctgcaaccggtgttcgtggtattcgcctacgtgagggtgactatgtt
gttggttcagatttattaactgctgacagtgaagttcttgttatctctgaaaatggttac
ggtaaacgtactagtgccaagcagtacccaattaagggccgtggcggtaaggggattaag
acggttaacgtgaccgataaaaacggtccattagctggtttaacaactgtcaatggtaat
gaggatgtcatgctgattactaatacaggtgttgttattcgtttccacgttagcgacgtt
tcacaaactggtcgggcaaccttaggtgttcgtctaattcgagttgacgacaaggctaag
gtcgcaacaatggccaaagttgaaccagaagtggcggatactgaagcaaccactgaagat
ccaacgactgattaa
DBGET
integrated database retrieval system