Lachnospiraceae bacterium KM106-2: lbkm_0442
Help
Entry
lbkm_0442 CDS
T08927
Name
(GenBank) N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
Organism
lbx
Lachnospiraceae bacterium KM106-2
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
fn3
Trypan_PARP
Lipoprotein_17
Pur_ac_phosph_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBF41762
UniProt:
A0A7U6QI33
LinkDB
All DBs
Position
470881..474285
Genome browser
AA seq
1134 aa
AA seq
DB search
MKREKRGCKRILLFAFSFLLLWGVGTKQAKAEMNSVTSLLIGGTAKDRVTNVGVALQQGE
VRYNQGGSADNYKWKVELVTGEDYPTATARITLNNCNIAEEFVYQGSTRMYGIWARGNIE
LVLIGENVIGNPSYDPESNDSRLAAGIYSENGMISVKGDGTLKLCGCENGMQTSGDGLIK
IDGADITVNCIGDSVSGFRSAGDIWIANNVCNITVKDLDGYSYNDFGIQAETTYYDDTKD
NVIHLENVQYNYHGSYDAEPLECDNFYISDSKLNLQTDGYESQSGKSAVYKSAAAKGFNI
TMQESYLYGTTINMKGGASIEADKLTMQKCTLRADTSLDSDDYSEIYLKVNELQAAHTTF
ADSCGDGLYCGNATFEDCEFTYPSGSSRIFGDDIVFKNCTGELGNGVSGKSMVFSGCDFL
IESAWGDSAIAVGNGGSGAIEIKNQSVLEIHGKYACISNYNEVDSSVTGDAEKKSVKIIQ
SKVKLYGARSNSFLVEHCGIYSKGKVMIDGSDLSMELSQEWDKKSAWVGAIYGIQGIKGV
EVSNSNIAMDLDILDEDDPSSVAGDKGIVSDGAVKVDRCTVNITSKADGTKGSVGLEGSR
INLSDTKFDLDLTQLRGQGIYSYVNLTLKDCTGKIYGGGEGLYNAGNVTIEGGNLHIKAN
SSTGWGICTEANLTPEYEPGDLTIGDGTRLQVEGNNAAIGILLRGGKQATVYDKLKVSEN
VYCSKQQESFYWISWDGNDRAAIIGYMDEDYLDFYGATFGGAATKLIYEPSITNCTYQMN
DTTFDYTGEPIYPKVTDVKRNGTSLIEGSDYMLHYENNIASGTGYVVLTSLTYDGNQLRI
PFTIKRDLVDIKGAEVALSGHSYEYTGSAITPAVTVTFDQQELKQGVDYTLTYSSNTTVG
TATITITGIGSYTGSKQITFEIVEVKPVQQPVQQPEQQPEQQPEQQPEQQPEQQPEQNIQ
QVEQRRNIVKLSFSKIGTLSYTGTAIKPRITIKDGTKKLKEGVDYSIQYTSNKQIGTATV
TIKGKGNYSGTKKLTFTITPKKTMLSSVKAGKKNSMIISWKKDKTVSGYEISYSMKKSFA
TQKKITVSGAKKTSKTIATVKKGKTYYVRVRSYKVVKGKKVFGAYSKVKTVKVK
NT seq
3405 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagagagaaaagagaggatgcaaaagaattctattgtttgctttttcattcttacta
ctatggggagtgggaacaaagcaggcaaaggcagaaatgaattccgtgacttctttatta
atcggaggaacggcaaaggatcgtgtcacaaatgttggagttgcgctacaacaaggagaa
gtccgatacaatcagggcggtagcgcagacaattataagtggaaagtggagctagtaacc
ggagaagactatcctaccgctactgcaaggatcactttgaataattgtaatattgcagag
gaattcgtctatcaagggtcaacaagaatgtatggcatctgggcaagaggaaatattgaa
cttgttttgatcggtgagaatgtaatcggaaatccatcctacgatccagaatccaacgat
agtcgtttggcagctggtatttattcagaaaatggtatgatctcagttaagggagatgga
acgctaaagctatgtggatgtgaaaatggaatgcagacaagtggagatggcttgatcaaa
atcgatggagctgatattacggttaactgcatcggagacagtgtatctggttttcgttca
gcaggagatatttggattgctaataacgtttgtaatataactgtgaaagacttagatggt
tactcctataatgatttcggaattcaagcagagacaacgtattatgatgataccaaagat
aatgtgatccatttagaaaatgtgcaatacaattatcacggaagttatgatgcagaaccg
ctagaatgtgataacttttacatctcggattccaagttgaatcttcagacggatggatac
gaaagccagagtggaaagtctgcagtgtataaaagcgcagcggcaaaaggattcaatatt
acgatgcaagagtcttatctatatggaactacgatcaacatgaaaggcggagctagtatc
gaagccgataaacttacgatgcaaaaatgtacgttaagagcagatacaagtttagactcg
gatgattatagtgaaatttatttgaaggtgaatgagttacaggcagctcacactactttt
gcggatagctgtggagatggcttatattgtggaaatgcaacttttgaggattgtgaattt
acttatccaagtggttcttctagaatcttcggagatgatattgtatttaaaaattgtact
ggagagctcggaaatggcgtaagtggaaagtcgatggtcttttcaggctgtgatttcctt
attgaatccgcttggggagattctgcaattgccgttggaaatggcggaagtggcgcaatt
gaaatcaaaaatcaatccgtgttagagatccatggtaagtatgcttgtatctccaattat
aacgaagtcgattctagtgttacaggtgacgcagaaaagaaaagcgtgaagatcatacag
tcaaaggtaaaactttatggtgcaagaagtaattcctttctggtagaacactgtgggatc
tacagcaaaggaaaagtcatgatagatggttctgatcttagcatggaattaagtcaggaa
tgggataagaaatctgcatgggttggagcaatctatggcattcaaggaatcaagggagta
gaagtaagtaattcaaacatagcaatggacctagatatcctagatgaagatgatccaagt
tctgttgccggagataaaggaatcgtatcagatggagcggtaaaagtagatcgttgtact
gtcaacataacaagtaaggcagatggtacgaaaggttccgttggtctggaaggaagcaga
attaatctaagtgataccaagtttgatctggatttaacgcagttaagaggacaaggaatt
tattcctatgttaatttaacacttaaagactgtaccggtaagatctacggtggaggggaa
ggactctataacgcaggaaatgttacgattgaaggtggtaatttacacatcaaagcgaac
tcatcgactggatggggaatctgtacggaggcgaatttaactccagaatacgaaccaggt
gatttaacaattggagatgggacgcgattgcaggtggaaggaaataatgctgcaattggt
atcctacttcgtggtgggaaacaagctacggtatatgataaattaaaggtatcagaaaat
gtatactgttcgaaacaacaagagagtttttattggatatcatgggatggaaatgatagg
gcagctatcattggatatatggatgaggattatctagacttttatggtgcaacctttggt
ggcgcagcgactaagttaatctatgaaccttcgatcacaaactgtacttatcagatgaat
gatacgacatttgattatacaggggagcctatttatccaaaagtaacagatgtaaagaga
aatggtacgagtctgatcgaaggatccgattatatgcttcattatgagaataatattgca
tcagggacaggatatgtggttttaacaagtttaacatatgatgggaatcaactgagaatt
ccttttacgattaaaagagatttggtggatattaaaggagcagaggtagcattatccggc
cattcttatgaatatactggaagcgccatcactccggcagttacagtgacctttgatcag
caggaactaaaacagggagttgattatacgcttacgtattcgtctaatacaacggtagga
actgcaacgattacgataaccggaataggatcatatacaggaagtaaacagatcacattt
gaaatagttgaagtaaagccagtacaacagccagtacaacagccagagcaacaaccagag
cagcaaccggaacaacagccggaacaacagccagagcaacaaccagagcagaatatccaa
caagtggaacagcgtagaaacatagttaaattaagtttttctaagataggaaccctaagc
tacacaggtactgctataaaacctaggattaccataaaggatggaacgaagaaactaaaa
gagggcgtggactattccattcagtatacttctaacaagcaaattggtacggctacagta
acaatcaaaggaaaaggaaattattcgggaacgaagaaattgacttttacgatcacgcca
aagaaaacaatgctctctagtgtaaaagcaggaaagaaaaattcgatgatcatatcttgg
aagaaagataaaacagtatctgggtatgagatttcctactcgatgaaaaaatcctttgca
acacagaagaagataaccgtatcaggagctaagaaaacgtctaaaacaattgctacagtg
aaaaaaggaaaaacttattatgttcgagttcgctcttataaggtagtgaaaggaaagaaa
gtctttggtgcttatagtaaggtgaaaacagtgaaagtgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
