Leadbetterella byssophila: Lbys_2803
Help
Entry
Lbys_2803 CDS
T01350
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor plug
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
lby
Leadbetterella byssophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lby00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lby02000
]
Lbys_2803
Transporters [BR:
lby02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Lbys_2803
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
MetallophosN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADQ18465
UniProt:
E4RRD2
LinkDB
All DBs
Position
3144550..3147852
Genome browser
AA seq
1100 aa
AA seq
DB search
MVRKLLMLISLFVSIGMNAMAQTVSGRVSSAADGSDAPGVSVTVKGSTTATITDASGEYQ
ISASPNSTLVFSAVGFITQEVPVNGRTVVNVSLAEDNTLLDEVVVTALGVARQQKSLGYA
TTTIKSADLIKVGNTNLASSLYGKAPGVRIATGPGGATSASNITIRGINSITGRNQPLII
LDGVPIRSEEVSNNNYWDDQRQRGNGLNDINPEDIENLTILKGASAAALYGSEAVNGVVL
ITTKRAQQGKRGLNLDFNANYSVDQVAYLPRFQTVRGAGGPTILVNAGQDELGFIKYADG
SRGLPETGVNFGALFDGQPIRSWDGQMRPYSAQPDGYKNLFQDAHNSNINVALSQANDFA
SFRFSLTRQDNEGVSLNAKNERNIANLNTSLNLSKAWKADITINYINQLTKNRPYSTDRM
INNFTGMLGTFDNGLWYREKYQTSLGYRFVQGASGQSLTPNENIIYNGFRGDIADYMWRV
YRHQSLEKSDRVLASLTNTFQILKDLNLRARVSTDFTGFNAEEKKATERPLAFGSSGEFV
TQNNKYNILYGDLLLTYTKRFNDDFSMSIMGGYTATKSQNTFLSAGTNGGLSTENKFDLT
SSVNDRLNVSLKRTNRLIDAVLGTVNFDYKGFAFIEGTIRRDRTSTMNPNNNSFVYPSVN
ASFVFSEALDMPSFVNYGKLRASWGIVGNYPDPYVANVAYDQRTLGSTQYTFIPVAMGND
GIRPERKHEFEIGLETRLADKVHLDVAYYNSQIVDQILPLTLPSSSGGTSVLTNIGTLRN
KGIEVGINTNLITAKDYSLNLGINYAWNKNVVEKLTNDATELLHADYDGQAAQLKSVVGS
AMGDLFVPPVAEAPDGQKIVRADGLYQLDATKWKKVGNTQPKGVGGISLDATYKNFFVNV
MTDFRIGGYVMPTGINWMHSRGMTEESLKFMDKESGGLSYYIDASGKGVQTTANAGPNGE
KVFHDGMLMEGVIQVVEDGVTKYLPNTNVISQALYYQRTYNWGGPQYGAARYELFIEEAT
YWKMRELSVGYNLPSKVASKLGASKINVSVYGRNLFFIYRKLKDLDPEVLTAGSRWSQTI
NNAGTNPATRGFGIMLRSTF
NT seq
3303 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtcagaaaattacttatgcttatcagcctttttgtctcgataggcatgaacgctatg
gcgcaaaccgtctctggtagagtgagttctgctgcagacggatctgatgctcccggagta
agtgtcacggtaaagggcagtaccactgctaccatcactgatgcctccggagaatatcaa
atatctgcgtcaccgaatagcactcttgtcttctctgctgttggctttatcactcaggaa
gtaccagttaacggtagaacagtggtaaatgtgagcttagcagaagataacaccttgcta
gatgaagttgtggttactgccttaggtgtggcaaggcaacaaaaatcccttggttacgcc
acaacaactattaaatctgccgaccttattaaagtaggaaacactaacttagcttcatcc
ctttatggtaaagctcctggtgtacgtatcgccacaggtccaggtggagctaccagtgca
tctaacattaccattcgtgggatcaactctatcaccggaagaaaccagcctctgattata
ttagatggtgtgcctatccgtagtgaagaagtttcaaacaacaattactgggatgatcaa
cgtcaacgcggtaatggcttaaatgacattaaccctgaagatattgaaaaccttactatc
ttaaaaggagcatcggctgctgccctgtacgggtcagaagcggtgaatggtgtggtttta
atcactactaaaagagcacaacaagggaaaagagggttaaatcttgattttaatgccaat
tactccgttgatcaagttgcctatcttcctaggttccaaaccgttagaggtgcaggtggg
cctacgattttggtgaatgcaggacaggatgaattaggttttatcaagtatgctgatggc
agcagaggccttccggagacgggagtgaactttggcgccttatttgatggacagcccatt
cgttcgtgggatggtcaaatgagaccttattctgcgcaaccggatggatataaaaaccta
tttcaagatgctcataattcaaatataaatgtggctttgtcgcaagctaacgacttcgca
tctttccgtttctccttaacccgtcaggataatgaaggggtaagtttgaatgctaaaaac
gaaaggaacatagccaacttaaatacttctttgaatctatctaaggcgtggaaggcagat
atcaccatcaactacattaatcagttgactaaaaaccgtccttactctacagaccgcatg
ataaataacttcaccggtatgttaggtacctttgataatggtctttggtacagagaaaaa
tatcaaaccagtctgggatatagatttgttcaaggtgcttccggtcaaagtttgacaccg
aatgaaaacattatttacaatggattcagaggagatatcgctgattatatgtggagagtg
tacagacaccagtcgctcgaaaaaagtgatagggttctggccagtttaaccaatactttc
cagatcttgaaggatttaaatttaagagcgagggtctcaactgacttcactggatttaat
gcagaagagaagaaagctacggaaagacctctggcttttggctcctctggggaatttgta
actcagaataacaagtacaatattctttacggcgatttgctattaacctataccaagaga
tttaatgatgatttctccatgagcatcatgggaggatacacggcaactaaatctcagaat
accttcctttccgccggaactaatggaggtttgagtacagagaataaatttgacttgaca
tcttcagtgaatgatcgccttaatgtttctcttaaacgtactaaccgactcattgatgct
gtgttaggaacagtgaattttgactacaaaggttttgcatttatcgagggaaccatcagg
agagaccgcacctctaccatgaatccgaataataactcctttgtttacccttcagtaaac
gccagctttgttttctctgaagctttggatatgccaagctttgtgaactatggtaagctt
agagcttcctggggtattgtaggtaattatccggatccatacgtagctaatgtagcctat
gatcaaagaacactaggctctactcagtatacctttattcctgtagctatgggtaatgac
ggtattcgtcctgaacgtaaacatgagtttgagattggtttggaaacaagactagcagat
aaagtacatctggatgtagcttattataactcgcagatcgtagaccaaatcctaccattg
actttgcctagttcttcaggtggtacttcagtattgacaaacattggtaccttaagaaac
aaaggtattgaggtaggaattaatacaaacctaattactgccaaagattatagcttgaat
cttggtattaactatgcttggaacaagaacgtggtggagaagttaactaatgacgctact
gaattgcttcatgccgattatgatggacaagcagcccagttaaaatctgtggttggctct
gctatgggtgacctgtttgtgccgccggtagccgaagctccggacggacaaaaaatagtg
agagcggatggcttataccaattagacgctacaaaatggaagaaagtgggtaatactcag
cctaaaggtgtgggtggtataagtttagatgcaacttataagaatttctttgtgaatgta
atgactgacttcagaataggaggatacgttatgcctacagggatcaactggatgcattcg
cgcggtatgacagaagaaagtttgaaattcatggacaaagaaagtggtggtctttcctat
tatatagatgccagtggcaaaggggtacagactactgcaaatgccggtcctaacggggaa
aaggtgttccatgacggaatgctcatggaaggtgtgatccaagtagtagaagatggagta
accaaatatctacctaacactaacgtgatttcgcaggcattgtattatcagagaacctac
aactggggtggacctcagtacggtgctgccagatatgaattgtttattgaggaagctact
tactggaaaatgagagagctatcagtaggttacaatttgccatctaaggtagcatctaaa
ttgggtgcatctaaaatcaatgtttctgtttacggacgtaacctcttctttatctataga
aagttgaaagacttagatcctgaggtacttactgccggttccagatggagtcagaccatc
aataacgcaggtactaacccggctacgagaggatttggtataatgttaagatcgaccttt
taa
DBGET
integrated database retrieval system