Lysinibacillus capsici: ICJ70_04825
Help
Entry
ICJ70_04825 CDS
T08448
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
lcap
Lysinibacillus capsici
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
C1q
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UNT56392
LinkDB
All DBs
Position
complement(945150..947504)
Genome browser
AA seq
784 aa
AA seq
DB search
MHFGNFIDRVCSKCHSFPCCCKTGPIPSCPIWPVKPTGPTGGITGPTGSTGVTGATGVTG
ATGSTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGVAGATGVTGAIGPTGSTGAIGVTGSTG
ETGPTGATGVTGATGVTGATGVAGSTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVAGSTG
ATGVTGATGVTGTTGATGVTGATGVTGATGVAGSTGAIGPTGATGVTGATGVAGSTGATG
VTGATGVAGATGVTGAIGPTGSTGAIGVTGSTGETGPTGATGVTGATGVTGATGVAGSTG
ATGVTGATGVTGATGATGATGVTGATGVTGATGVAGSTGAIGPTGATGVTGATGVAGSTG
AIGPTGATGATGATGVTGATGSTGETGATGVAGVAGATGATGATGVTGATGATGSTGATG
ATGATGATGVTGATGATGATGVTGSTGATGATGSTGVTGATGAIGSTGVTGATGATGVAG
ATGVTGSTGETGATGAIGSTGVTGATGATGVAGATGVTGSTGVTGATGSTGATGVTGSTG
VTGATGSTGATGVTGSTGVTGVTGSTGATGVTGSTGVTGVTGATGATGVTGSTGVTGVTG
ATGATGVTGSTGVTGVTGATGATGPAFTEGFSAFKNTLAVSGSTPITNWSVTSPYFTTPA
FNPTTGIFTVPTTGRYSFEATINYSTAAAISVTLGAGINPSFAIRQNATTNLISGLFPVL
NVNVALVLTLRAVLGNGTITLAGEVNLNAGDTIDLFYEANGLTISLTLGGANSGGIVWSC
HRIS
NT seq
2355 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcattttggaaattttattgatagagtttgcagtaagtgtcattcatttccttgttgt
tgtaaaactggtccaattccaagttgtccaatttggccagtgaaacctacaggaccgact
ggggggataactggacctactggtagtacaggtgtgactggcgctactggcgttaccggc
gctactggttctacgggcgctactggcgctactggcgctactggcgctactggcgctact
ggcgctactggcgctactggcgctactggcgctaccggcgttgctggggctactggcgtg
actggcgcaatcggacctactggctctacgggggctatcggcgttactggttctacgggt
gagactgggcctactggcgctactggtgttactggggctactggagtaactggggctacc
ggtgttgctggttctactggcgctactggtgttactggcgctactggtgttactggcgct
actggtgttactggggctactggtgttactggggctaccggtgttgctggttctactggc
gctactggtgttactggcgctactggtgttactggcactactggcgctactggtgttact
ggcgctactggagtaactggggctactggcgttgctggttctactggcgcaattggacct
acgggcgctactggagtaactggggctaccggtgttgctggttctacgggcgctactggt
gttactggcgctaccggcgttgctggggctactggcgtgactggcgcaatcggacctact
ggctctacgggggctatcggcgttactggttctacgggtgagactgggcctactggcgct
actggtgttactggggctactggagtaactggggctaccggtgttgctggttctactggc
gctactggtgttactggcgctactggtgtgactggcgctactggcgctactggcgctact
ggtgttactggggctactggagtaactggggctactggcgttgctggttctactggcgca
attggacctacgggcgctactggagtaactggggctaccggtgttgctggttctactggc
gcaattggacctacgggcgctactggcgctaccggcgctaccggcgttactggcgctact
ggttctacgggtgagaccggcgctactggtgttgctggtgttgctggggctactggcgct
actggcgctaccggcgttactggcgctactggcgctactggctctactggcgctactggc
gctactggcgctactggcgctactggcgttactggcgctactggcgctactggcgctacc
ggcgttactggctctactggcgctactggcgctactggctctacgggtgtaaccggggct
actggcgctatcggctctacgggtgtaaccggggctactggcgctactggcgttgctggg
gctaccggcgttactggctctacgggtgagaccggcgctactggcgctatcggctctacg
ggtgtaaccggggctactggcgctactggcgttgctggggctaccggcgttactggctct
actggggtaaccggcgctactggctctactggggctaccggcgttactggctctactggg
gtaaccggcgctactggctctactggggctaccggcgttactggctctactggggtaacc
ggcgttactggctctactggggctaccggcgttactggctctactggggtaaccggcgtt
actggggctactggggctaccggcgttactggctctactggggtaaccggcgttactggg
gctactggggctaccggcgttactggctctactggggtaaccggcgttactggggctact
ggcgctacggggcctgcgtttactgaaggattctctgcctttaaaaacacgttggctgtt
agtggatctactccaatcactaactggagtgttacttcaccatactttacaacacctgct
ttcaatccaacaactggtattttcactgtaccaactacaggtaggtattcctttgaagca
accattaactactccactgctgcggctattagcgttactttaggagcaggaataaaccct
tcatttgcaattagacaaaatgctactactaatttaattagtggcttgttccctgtacta
aatgtcaatgtggcacttgtattaactttacgcgcagttctgggaaatggcacaattact
ttagcaggagaagtgaatttaaatgctggagatacaatcgatttgttctatgaggccaat
ggattgactatttctcttacactaggcggcgctaactctggtggtattgtttggtcatgt
catcgaatttcttag
DBGET
integrated database retrieval system
