Lates calcarifer (barramundi perch): 108896120
Help
Entry
108896120 CDS
T04895
Name
(RefSeq) matrilin-2 isoform X2
KO
K19467
matrilin
Organism
lcf
Lates calcarifer (barramundi perch)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
lcf04990
]
108896120
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
lcf04990
]
Von Willebrand domain-containing proteins
VWA domain-containing proteins
108896120
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
FXa_inhibition
cEGF
EGF_CA
VWA
EGF
hEGF
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
VWA_2
EGF_3
VWA_CoxE
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108896120
NCBI-ProteinID:
XP_018550645
LinkDB
All DBs
Position
LG19:4152826..4169788
Genome browser
AA seq
903 aa
AA seq
DB search
MLHHLHPGSLLRTQVALLSSIRASTASRSNCRNRPIDLVFIIDSSRSVRPAEFEKAKEFL
QDMVDSLEIGSDATRVGLVNYASTVQIEFLLKTYSAKSALRQALARVEPLASGTMTGMAI
KTAMEKAFTAEAGARTSSMNIAKVAIIVTDGRPQDKVEDVAAAARASGIEIYAVGVDRAD
MTSLRLMASHPHDDHVFYVETYGVIEKLTSKFRETLCGKDDDNGSAEIPVNGGIDDYGKG
LDGRQDGYGINNENDEKGNNGLDACAQGHNCQHICVNNGNSYNCKCRLGYVLNPDKKTCS
LSDACTQGHDCQHICVSNGDSYTCKCRVGYVLNADEKTCSRSDLCTLGHDCQHICVNSDD
SYICKCRVGYVLNADQKTCSHLDACVQGHGCQHICVTNGNSYLCMCEEGYMLNADEKTCS
RSPTCPQGHDCQHICINTDDSYICKCHLGYVLNADGKTCSRSDPCAHGHDCQHICENNGD
SYICKCRVGYVLNADEKTCSRSPTCPQGHDCQHICINTDDSYICKCHLGYVLNADGKTCS
RSDPCAHGHDCQHICENNEDTYICKCRLGYVLNADQKTCSRSPTCAQGHDCQHICVTSGD
SYLCKCREGYVLNADLKTCSRSDACAQGHDCQHICVSSDNSYICRCREGYVLNVDQKTCS
RLDTCDQGHDCQHICVKNRDSYLCKCHEGYVLNTDQKTCSRSDPCAHGHDCQHICINRDN
SYICKCHVGYVLNPDKKTCSRSDTCARGHDCQHICVSTDDSYICKCRIGYVLNADGKTCS
RSDPCAQGHDCQHICVNSDDSYICRCRVGYVLNADQKTCSRPGLDACAQGHDCQHICVNN
RNSYICKCRVGYVLNMDRKTCSRSDACAQGHNCQHICINNGDSYNCKCRVGYVLNADQKT
CFT
NT seq
2712 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctacaccatttgcaccctggcagcctgctaaggacacaggtggctctcctgtcatcc
atcagagcgagcacagcatcaagatccaactgcagaaatcgtcctatagacctggtcttc
atcatagacagctcccgcagtgttcgtcctgctgagtttgagaaggccaaggagttcctg
caagacatggtggatagcctggagatcgggtccgacgccacacgagtaggcctcgtcaat
tatgccagcacagtgcagatcgagtttctactgaagacgtattctgccaagtccgccctg
aggcaggcactggcccgtgttgagcccctcgcctcaggcaccatgacgggcatggccatt
aagacagctatggagaaagcattcactgctgaggcaggggcccggactagttccatgaac
atcgcaaaagtggccatcatagtgacggacgggaggccccaggacaaggtggaggatgtg
gcggcagcagctcgtgcatctgggattgagatctacgcggttggagtagacagagctgat
atgacgtccctccgcctcatggccagccacccacacgatgaccatgtcttctatgtggag
acctatggtgttatagagaagctcacttccaaatttagggaaaccttgtgcggtaaggat
gatgataacgggagtgcggaaattccagtaaatggtggaattgatgattatggaaaaggc
ctagatggcaggcaagacggttatggaataaataatgaaaatgacgaaaaaggaaacaat
ggtctggatgcatgtgctcagggacacaattgccagcacatttgtgtcaacaatggcaac
tcatacaactgcaagtgtcgcttgggctacgtcttgaacccggacaagaaaacatgctca
ctttcagatgcatgtacccagggacatgactgccaacatatttgtgtcagcaacggtgac
tcatacacctgcaagtgtcgagtgggatatgtgttgaatgcagacgagaaaacatgctca
cgttctgatctatgtacccttggacatgactgccagcatatatgtgttaacagtgatgac
tcgtacatctgcaagtgtcgagtgggatatgtgttgaatgctgaccagaaaacatgctca
catttggatgcatgtgtccagggtcatggctgccagcatatttgtgtcacaaatggcaat
tcttacctctgtatgtgtgaggagggatatatgttgaatgcagacgagaaaacatgctca
cgttcacctacatgtccccagggccatgactgtcagcatatttgtataaacactgatgat
tcttacatctgcaaatgtcatttgggatatgtattgaatgctgatgggaaaacatgctca
cgttctgatccatgtgctcatggacatgattgtcagcacatttgtgaaaacaatggggac
tcttatatctgcaaatgccgagtgggatatgtgttaaatgcagacgagaaaacatgctca
cgttcacctacatgtccccagggccatgactgtcagcatatttgtataaacacagatgat
tcttacatctgcaaatgtcatttgggatatgtattgaatgctgatgggaaaacatgctca
cgttctgatccatgtgcccatggacatgattgtcagcacatttgtgaaaacaatgaggac
acttatatctgcaagtgtcgactgggatatgtgttaaatgcagaccaaaaaacatgctca
cgttcacctacatgtgcccagggacatgactgtcagcatatttgtgtcacaagtggtgat
tcctacctttgcaagtgtcgtgagggatatgtgttgaatgcagacctgaaaacatgctca
cgttcagatgcatgtgcccagggacatgactgccagcacatttgtgtcagcagtgacaac
tcatatatctgcagatgtcgagagggatatgtgttgaatgtagatcagaaaacatgctca
cgtttggatacgtgtgaccaaggacatgactgccagcacatttgtgtcaaaaatcgtgat
tcttatctttgcaaatgtcatgagggatatgtgctaaatacagaccagaaaacatgttca
cgttctgatccatgtgcccatggacatgattgtcagcacatatgtataaacagagataac
tcatacatctgcaagtgtcatgtgggatatgtgttgaacccagataagaaaacatgctca
cgttcagatacatgtgcccgtggacatgactgccaacatatttgtgtcagcactgatgac
tcatacatctgcaagtgtcgaattggatatgtgttgaatgctgatgggaaaacatgctca
cgttcagatccatgtgcccagggacatgactgccaacatatttgtgtcaacagtgatgac
tcgtatatctgcagatgtcgagtgggatatgtattgaatgcagaccagaaaacatgctca
cgtccaggtttggatgcatgtgcccagggacatgactgtcagcacatatgtgtcaacaac
agaaactcatacatctgcaaatgtcgagtgggatatgtcctgaacatggataggaaaaca
tgctcacgctcggatgcatgtgctcagggacataactgccagcatatatgtatcaacaac
ggggattcttacaactgcaagtgtcgagtgggatatgtgttgaatgcagaccagaaaaca
tgcttcacgtaa
DBGET
integrated database retrieval system