Longicatena caecimuris: L3BBH23_06420
Help
Entry
L3BBH23_06420 CDS
T07231
Name
(GenBank) helicase
Organism
lcg
Longicatena caecimuris
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
ERCC3_RAD25_C
SWI2_SNF2
TIMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCT44197
LinkDB
All DBs
Position
complement(672972..676199)
Genome browser
AA seq
1075 aa
AA seq
DB search
MEFTIAQIRDFAGDEQTFEKGEKLMKEKAIKSLDIDDFSSPEIIMVNANVVDKKVYREVN
MSIDKDDFIVRAHLCGCEEHAQKMTCAHCVAVLLRLMEDSKRKNAEKEQMENKVVDKHAI
QIMNIYEEQIVYSSLAMNLKTAIHLEPVLEIRKKNILALTLKIGNEKQYIVKDIALFLDD
IAHNVKKAYGKELEFMHNYYSFDETSQKLIDFMRHHEHDVLYFLNHPTLEKAPQSRNMCM
TPDALDEFYELYTDQDVMHRMKEKTLINMRFLAINPPFSLQIHKDAQQIFHISLNEGDYR
LFKGRNHLYVLMNHILYRCDKDFTKACEPMLSGCLEHHNTLTVSDGLMSAFYNNVILNVK
KYLPLHGEDISMYAPLPLECKVYIDMPKQNVISARLLYCYGDDMYNAFSDTSLSASRNFN
DEIAVRLIFTKYMTRIDAMEGLAYIEHSQDAIYEFLNKGFEELSQTCEMFASEKFRKLQI
RDSVNISMGVRIESDLLEIDFDTFDFPVEELQEVLKAYRLNKKYYRMRNGSFVNIEDSAL
QELSFILDGMHVSEKELESGKIKVPKYRSLYIDKSLKDAEMIKVERDATFKDIIRSIRNV
KDSDFKVPHSLKNILRNYQKDGFRWLKTMANYGFGGILADDMGIGKTLQVITLLEEEKLH
DPQAISLVVCPSSLILNWQSEIAKFSDALTSILITGNMEERKALIYKAKDYDVVITSYDY
LKRDIEHYENFHFTYQIIDEAQYIKNHNTKNAVSVKQIQAAHRFALTGTPIENSLAELWS
IFDFLMPGYLYTYPYFKKQYEIPIVKENDPITLKELKRMVEPFILRRVKKDVLKELPEKV
EHTMMIELDEETRKLYMANVSLIREDLHKSFKQKGFENSKIMVLSMLTRLRQLCCDPRLL
YENYQGVGNKINACMEFIENCRASGKKVLLFSQFTSLLSLIEKELKQREIDYYLLKGSTP
KVQRQQYVNAFNVDATPVFLISLKAGGTGLNLTSAEVVIHFDPWWNVSAQNQATDRAYRI
GQHNNVQVVKLIAKDTIEEKIMHLQELKQDLSDSIIHLNDGLITSMSKDEIMDLF
NT seq
3228 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatttacaatagctcagatacgtgactttgcaggcgatgagcaaacatttgaaaag
ggagaaaaattgatgaaggaaaaagccatcaaatcgttggatatcgatgacttttcaagt
cctgagatcattatggtcaatgctaatgtcgtagataaaaaagtatatcgggaagtgaat
atgtcaatcgataaggatgacttcatcgtaagagctcatttgtgtggctgtgaagagcat
gcccaaaaaatgacctgtgcacattgtgtcgctgttttgctgcgcctaatggaagacagt
aaacgcaaaaacgcggaaaaggaacagatggaaaataaagtagtcgataaacatgccatt
cagatcatgaatatctacgaagaacaaatcgtctattcttcattggccatgaacttaaaa
acagccattcatttggaacccgtattagaaatacgtaaaaaaaacattcttgcgttaacc
ttaaaaatcggcaatgaaaaacaatatatcgtcaaagacatcgcattatttctggatgat
attgcccataatgtaaaaaaagcctatggtaaggaactggaattcatgcataattattat
agctttgatgaaacgagtcaaaagctgattgatttcatgcgtcatcatgaacatgatgtt
ttgtattttttaaatcatcctaccttagaaaaagccccgcaatcccgtaatatgtgcatg
acgccggatgctttagatgaattttatgaattatataccgatcaggatgtcatgcatcgc
atgaaagaaaaaacattgatcaacatgcgctttcttgctatcaatccccctttttcttta
cagatacacaaagatgcccagcagatttttcatatttctctgaatgaaggagactatcgt
ctgtttaaaggacgaaaccatctatatgttcttatgaatcatatcctttatcgttgtgat
aaagattttacaaaagcctgtgagccaatgctcagcggatgcttagaacatcataatacc
ttaaccgtgtcagatggcttgatgagtgccttctataataatgttattttaaatgtcaaa
aaatatctgcctctgcatggtgaagatatttctatgtatgcgccattaccattagaatgt
aaggtgtatatcgatatgccgaaacaaaatgtcatatctgcacgtttgctgtattgttat
ggagatgatatgtataatgcgttcagtgatacttccttatctgccagtcgcaacttcaat
gatgaaattgccgtacgtctgatttttaccaaatatatgacacggattgacgctatggaa
ggacttgcctatattgaacattcacaagatgccatatatgaatttttaaataaaggcttt
gaagaattatcacagacctgtgaaatgtttgccagtgagaaattccgcaaactgcagata
cgtgatagtgtgaatatctccatgggtgtacgtattgaaagtgatttgctagaaattgat
tttgatacctttgattttcctgtcgaagagttgcaagaggtattaaaagcataccgtttg
aataaaaaatactatcgtatgcgcaacggttcttttgtcaatattgaagatagtgctttg
caagagttgtcttttattttagatggcatgcatgtaagtgaaaaagagctcgaaagtggt
aaaatcaaggttcccaaatatcgttctttatacatcgataaaagcctaaaagatgctgag
atgatcaaggttgagcgcgatgcgacttttaaagatatcatccgtagtatacgcaatgtt
aaggactctgattttaaggttcctcacagtctgaaaaacattttgcgaaattatcaaaaa
gatggtttccgctggctaaaaacgatggccaattatggttttggaggaattttagctgat
gatatgggcattggtaagaccttgcaagtaattactttattggaagaggaaaagctccat
gatccacaggctatctctcttgttgtctgtccaagttcactgattttgaactggcaaagt
gaaatcgcgaaattttctgatgccttaacgagcattttgattaccgggaatatggaggaa
cgaaaagccttaatctacaaagcgaaagattatgatgtcgtgatcacctcttatgattat
ctcaaacgtgatattgaacactatgaaaatttccactttacttatcaaatcattgatgaa
gctcagtatatcaaaaaccataatacgaagaatgccgtatctgtcaaacagattcaggca
gcccatcgatttgccttaaccggaacaccaattgaaaattcattagcggaattatggagc
atttttgatttcttaatgccaggttatctatatacttacccttacttcaaaaagcaatat
gagattcctatcgtgaaagaaaatgatcctataaccttaaaggaattaaagcgaatggta
gaaccgttcatcttgcgccgtgtaaagaaagatgtcttaaaagaacttcctgaaaaagtc
gaacatacgatgatgatcgaattagatgaagaaacccgaaaattatatatggcaaatgta
tctttgatacgagaagatttgcataaaagctttaaacaaaaaggctttgaaaatagtaag
atcatggtgctgagtatgttgaccagattgcgccaattgtgctgtgatccccgcttgctg
tatgaaaattaccagggggtaggcaataaaattaacgcgtgcatggaatttatcgaaaac
tgtcgtgcatcgggtaaaaaagtcttattattctcacagtttacctcactgttatcgttg
attgaaaaagagctaaagcaacgcgaaattgattactatctattaaaaggcagcacccca
aaagtacagcgtcagcaatatgtaaatgcctttaatgttgatgctacaccggtttttttg
atatctttaaaagccggaggaaccgggttgaatcttaccagtgccgaagttgtcattcac
tttgatccatggtggaatgtatctgcccaaaatcaagctaccgatcgagcctatcgcatc
ggacagcacaacaatgtacaggtcgttaaactaattgccaaagatacaatcgaagaaaaa
atcatgcatttacaagaattaaaacaagatttaagtgatagtatcattcacttgaatgac
ggtttgattactagcatgagcaaagatgaaattatggatttgttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
