Legionella cherrii: NCTC11976_01623
Help
Entry
NCTC11976_01623 CDS
T06506
Name
(GenBank) DNA/RNA helicase SNF2
Organism
lcj
Legionella cherrii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
HDA2-3
SWIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEB36268
LinkDB
All DBs
Position
1:1815426..1818701
Genome browser
AA seq
1091 aa
AA seq
DB search
MLNEALSKMPEVFEAKILLRGQEYFEKGHVLNIRFSDGLLKGRVKGSSSQIYDVHMDLKA
WPKKLAHCTCTFQYNCKHAAACLFALRDREKESLLSLPANKLDKKLDSWLKNLRAQEAAV
VKTTEVTHHLVYLLELRLDGHEHRVAIKLALAKLLKRGGYGKMITFNSLSDSKKQHFVGD
DNDLVALLLFKCGVSGWFDTLIIRNSELLERTIATGRAFFIQNQHEPIHLGESIQGTCEW
VLSHNGSQNLLLMHEGNALDPMLLDDSWYFNYAESKIGRLITSYPIKQLGYLLQAPPIPM
GQAKLLADKMAKTCPEFPVPRVFEQREIRNVMPIPVLILDAVSEFDEESSWLYDTEEELH
VLFIARIIFDYAGLMIAGSDESETVVSQQDGVLIEYVRHKDFEKSKWDEVQEILGLRVPR
AWEHEQWEKIKQADFVLENIHVVADLEFLHSQLIPELESRGWRVERISSLYQEVISADEV
EWYSDLSESTTDFFSYQLGILVEGKPVSIVPLVADLIQRYRGNDLDNLPDSQLVKLPLQD
GRALQLEMGRIKPLVRLLLQFGIRHIDENQQVQINKYQIILMREAELAIAATKTRWQGAE
TLREQIRKLSQLTLIPEIQLPTGLQTQLRDYQRHGLNWLQFLRVSHFSGILADDMGLGKT
VQTLAHLQYEKEQGRIKTASLIVAPTSLVGNWHAEAKRFTPNLNVLIYHGSERHQDNFDD
YDIVVSTYGLIHRDKDKFITYPFYYLILDEAQFIKNARTKTTQIIQQVHATHRLCLTGTP
LENHLGELWSLFHFLMPGLLGDAKQFRLWFRTPIEKYADLTRRDILIKRVQPFILRRTKN
QVVRELPPKTEMTRTIEIIGPQRDLYEAIRMSMEKKVRDAIAKQGLGKSHILLLDALLKL
RQVCCDPRLLSLSEASIAHGTSAKLEALMELLDNLVGEGRRVLVFSQFTSMLQLIEEELR
ARNYDYLKLTGQTVHRQAMVEKFQEGKTPVFLISLKAGGTGLNLTRADTVIHYDPWWNPA
VEDQATDRSHRIGQENPVFVYKLITLGTVEEAILGMQEKKRQLVEGVLSADPAKAMTLSE
EDIEHLFMPLS
NT seq
3276 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaatgaagcactctcaaaaatgccagaagtctttgaggccaaaatattattgcgt
ggccaagagtattttgaaaaggggcatgtgctcaacattcgttttagtgatggtctactc
aaagggcgggtgaaaggcagttcaagtcagatttatgatgtacatatggacttgaaggct
tggccaaaaaaattggcgcattgtacttgcacttttcaatataactgcaagcatgctgct
gcgtgtttgtttgccctacgggatcgagaaaaggaaagcttactctctttgcctgccaat
aaattagataaaaagctcgatagttggttgaagaatttacgtgctcaagaagcagcagta
gtgaaaacgactgaagtcacccatcatttagtctatctcctagaactaaggcttgatggg
catgaacaccgggtcgcgattaagttggctttagccaagttattaaagcgcggtggttat
ggaaaaatgatcacttttaatagcctttctgattctaaaaaacagcattttgttggtgat
gataatgatctggtcgcgctgctgttgtttaaatgcggtgtttcaggctggtttgataca
ttaatcatacgcaatagcgaattgttagaacgaaccattgcaactggcagggcttttttt
atacaaaatcagcatgagccaattcacctaggtgagtccatccaaggtacctgtgaatgg
gtgttatctcataatggcagtcagaacttattgttaatgcatgaagggaatgcgcttgac
cctatgctgttggatgatagttggtattttaattacgcagaaagcaaaatcggacgttta
atcacctcatatccaataaagcaactgggttatttattgcaagcacctccaatcccaatg
ggacaggctaaattattagcagataaaatggctaaaacatgtcctgaatttccggtgccc
cgagtttttgaacaacgagaaattcgcaacgtaatgccaatacctgtactcattctggat
gccgtgagtgaatttgacgaagaatcttcttggctttatgacaccgaagaagaactgcat
gttttgtttattgcgcgtattatttttgattatgcggggttaatgattgcaggctctgat
gaaagtgaaacggtcgtttctcagcaagatggggttttaattgaatatgtgcggcataaa
gattttgaaaaatccaaatgggatgaagtacaggaaatcctggggttaagagtacctcgg
gcatgggaacatgaacaatgggaaaaaataaaacaagccgattttgttttggaaaatatt
catgtcgtcgcagatttagaatttcttcatagtcaattaatacccgagttagaaagtcga
gggtggcgagttgagcgtattagttcgttatatcaagaagtgattagtgctgacgaagta
gaatggtattcggatctctcagagagtacgacggattttttctcatatcaattagggatt
ttggttgagggtaaaccggtcagtatcgttcctttggtagcagatttaattcagcgttat
cgaggtaacgacttggataatctgcctgattcacaattagtcaaattgcccttgcaggat
ggacgtgctttgcagttagaaatgggacgaattaaaccattagttcgattgttgctgcaa
tttggcatacgtcatattgatgaaaatcaacaggtgcaaatcaacaaatatcaaattatt
ttgatgcgcgaagcagaattggcaattgcggcaaccaaaacgcgttggcaaggcgctgaa
acgttaagagaacaaataagaaagctttcgcaattaacccttattcctgaaatacaactg
ccaactggcttacaaactcagttgagggattatcaacgtcatggtttaaattggctgcaa
tttttaagagtatctcattttagtggtattctggctgatgatatgggattaggtaaaaca
gtacagactttagctcatttgcaatatgaaaaagaacaaggacgtattaaaacagcaagt
ttaatcgttgcaccaaccagccttgtaggaaattggcacgccgaagcaaaacggtttacc
cctaacttaaacgttttaatttatcatggttctgagcgccatcaggataattttgatgac
tatgacatcgttgtttctacttatggattaattcaccgtgataaggataagtttattact
tatcctttttattatttgattttggatgaagcgcaattcattaaaaatgcgcgcactaag
acgacgcaaatcattcagcaagtacatgcaacgcatcgtttatgtctgacaggtacgcct
ttggaaaatcacttaggtgagttgtggtctttatttcatttcttgatgcctgggttatta
ggcgatgcaaaacaattccgactatggtttagaactcccatcgaaaaatacgcagatttg
acccgaagggacatcttaattaaaagagtgcagccttttatattaagaaggacaaaaaat
caggtggttcgtgaattaccacccaaaacagaaatgacacgaaccatagaaattattggt
ccacaacgtgatctgtacgaagcgattcgcatgagtatggagaaaaaggttcgggatgca
attgcaaagcagggattgggtaaaagtcatatacttcttctggacgcgctactgaagcta
cggcaagtgtgttgcgatcccaggcttttgtccttgtctgaagcctcgattgcccatggg
acctctgcaaagctcgaggcgttgatggagttattggataatttggtgggcgagggtagg
cgggttttggttttttcacaatttacttccatgttgcaattaattgaagaggagctgcgt
gcgagaaattatgattatttaaagcttaccgggcaaacagtccatcgacaagcaatggta
gaaaaattccaggaaggaaaaactccagtttttcttattagtttgaaagcgggaggcacc
ggacttaacttaacacgtgctgatacagtaattcattatgatccctggtggaatcccgcc
gttgaagatcaagcaaccgatcggagtcatcgaataggtcaggaaaaccctgtttttgtc
tataagcttattaccttgggtacggtagaggaagctattttagggatgcaagagaaaaaa
agacaattagttgaaggcgttttatcggctgatcctgccaaagcgatgaccttgagtgaa
gaagatatagaacacctatttatgccattgagttaa
DBGET
integrated database retrieval system