Latimeria chalumnae (coelacanth): 102351274
Help
Entry
102351274 CDS
T02913
Symbol
NF1
Name
(RefSeq) neurofibromin 1
KO
K08052
neurofibromin 1
Organism
lcm
Latimeria chalumnae (coelacanth)
Pathway
lcm04010
MAPK signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcm00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04010 MAPK signaling pathway
102351274 (NF1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PH_NF1
RasGAP
CRAL_TRIO_2
CRAL_TRIO
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102351274
NCBI-ProteinID:
XP_005987610
Ensembl:
ENSLACG00000017003
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
2737 aa
AA seq
DB search
MAAHKPVEWVQAVINRFDEQLPIKAGQQNTHTKVSTEHNKECLINISKYKFSLVISGLTN
ILKNVNNMRIFGETAEKNLYLSQLIILDTLEKCLAGQPKDSLRLDETMLVKQLLPEICHF
IHTYREGNQHAAELRNSASGVLFSLSCNNFNAVFSRISTRTEESCSVIENLTKKTVFKFR
ALKKVAQLGVINSLEKAFWNWVENYPGEFTMLYQRPQSDMADCAEKLFDSVDSFAESTKR
KAAVWPLQIILLILCPEIIQDISKDVVEESKVNKKSFLDNLKKALAGHSGSRQLTESAAI
ACVKLCKASTYINWEDNSIIFLFVQSMVVDLKNLLFNPSKLFSRGAGCQNADVDLMIDCF
VSCFRINPHNNQHFKICLAPSSPSTFHYVLVNSLHRIITNSALDWWPKIDAVYCYSGELR
IMFAETLNKVIQCCSAHAPVRMTPSLTFKEKMTSLKFKEKPTDVETRSYKCLLLSIVKLI
HADPKLMLYNPGKPGHEIQSSTADLIRGLVHLVPQPNMTEIAQEAMEALLVLHQPENIEL
WNPDAPIETFWDISSQVLSYICKKLIAHQLLNSTEILKWLREILICRNKFLLKNKESATL
GSSIQICRQAQTQLEVALYMFLWSPDTEAVLVVMSCFRHLCEEADIRCGVDEVSVHNILP
NYNTFIEFASVSSMMSTGRAALQKRVMALLRRIEHPTAGNTEAWEDTHTKWEHATKLILN
YPKAKLEDGPVTESLHKTIVKRRMSHVSGGGSIDLSDTDSLQEWINMTGFLCALGGVCLQ
HRSNPGLATYSPPMGQVNERKGSMISMVSTEGNAEIPVSKFLDRLLSLMVCNHEKVGLQI
RTNIKDLVGLELSPALYPMLFNKLKNSISRFFDSQGQVLLNDTNTQFVEQTIAIMKNLLD
NHTEGSSEHLGQASIETMMLNLVRYVRVLGNLVHAIQIKTKLCQLVEVMMQRRDDLSFCQ
EMKFRNKMVEYLTDWVMGTSNQAADDDVKCLTRDLDQASMEAVVSLLAGLPLQPEEGDGV
ELMEAKSQLFLKYFTLFMNLLNDCSEVEDENAQTGGRKRGMSRRLASLRHCTVLAMSNLL
NANVDSGLMHSIGLGYHKDLQTRATFMEVLTKILQQGTEFDTLAETVLADRFERLVELVT
MMGDQGELPIAMALANVVPCSQWDELARVLVTLFDSRHLLYQLLWNMFSKEVELADSMQT
LFRGNSLASKIMTFCFKVYGATYLQKLLEPLLRTVITAPDWQHVSFEVDPTRLETTETLE
DNQQNLLQMTERFFHAIINSSSEFPPQLRSVCHCLYQATCHSLLNKATVKEKKENKKAVV
SQRFPQNSIGAVGSAMFLRFINPAIVSPYEAGILDKKPPPRIERGLKLMSKILQSIANHV
LFTKEEHMRPFNDFVKNNFDAARRFFLDIASDCPASDTVNHSLSFISDGNVLALHRLLWN
NQEKIGQYLSSNRDHKAVGRRPFDKMATLLAYLGPPEHKPVADTHWSSLNLTSSKFEEFM
TRHQVHEKEEFKALKTLNIFYQAGTSKAGNPVFYYIARRFKTGQINGDLLIYHVLLTLKP
YYAKPYEIVVDLTHAGPSNRFKTDFLSKWFVVFPGFAYDNVTAVYIYNCNSWVREYTKYH
ERLLTGLKGSKKLIFIDSPGKLAEHIEPDHQKLPAATLALEEDLKVFNNALKLAHKDTKV
SIKVGSTAVQVTSAERTRVLGQSVFLNDIYYASEIEEICLVDENQFTLTIANQGTPLTFM
HQECEAIVQSIIHIRTRWELSQPDSIPQHTKIRPKDVPGTLLNIALLNLGSSDPSLRSAA
YNLLCALTCTFNLKIEGQLLETSGLCIPANNTLFIVSISKTLAANEPHLTLEFLEECISG
FSKSSIELKHLCLEYMTPWLLNLVRFCKHNDDAKRQRVTAILDKLITMTINEKQMYPSIQ
AKIWGSLGQITDLLDVVLDSFIKTSATGGLGSIKAEVMADTAVALASGNVKLVSSKVIGR
MCKIIDKTCLSPTPTLEQHLMWDDIAILARYMLMLSFNNSLDVATHLPYLFHVVTLLVAT
GPLSLRASTHGLVINIIHSLCTCSQLNFSEETKQVLRLSLTEFSLPKFYLLFGISKVKSA
AVIAFRSSYRDRSFSPGSYERETFALTSLETVTEALLEIMEACMRDIPTCKWLDQWTELA
QKFAFQYNPSLQPRALVVFGCISKRAAHGQIKQIIRILSKGLESCLKGPDNYNSQVLIEA
TVIALTKLQPLLNKDSLMHKALFWVAIAVLQLDEVNLYSAGTALLEQNLHTLDSLRVFND
KSPEEVFMETRRPLEWHCKQMDHFVGLNFKSNFNFALVGHLMKGYRHPSPTTVARTVRIL
HTLLTLVNKHRNCDKFEVNIQSVAYLAGKKIFCCFIYRFIFVFRTLRENQPWASPKASDR
HLAANYPTVGQISPRTRKSMSLDMGQPSQANTKKLLGTRKSFDHLISDTKAPKRQEIESG
ITTPPKMRRVAENDYEMETQRIASSQQHPHLRKVSVSESNALLDEEVLTDPKIQALLLTV
LATLVKYTTDEFDQRILYEYLAEASVVFPKVFPVVHNLLDSKINTLLSLCQDSNLLNPIH
GIVQNVVYHEESPPQYQPSYLQSFGFNGLWRFAGPFSKQTQIPDYAELIVKFLDALIDNY
LPGIDEEASEESLRTPTSPYPPPVQSQLSITANLNLSNSMTSLATSQHSPGIDKENVELS
PTTGHTNSGRTRHGSASQVQKQRSAGSFKRHSIKKIV
NT seq
8214 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggctcacaaaccggtggaatgggtccaggccgttattaaccgattcgacgagcag
cttccaattaaagctggacagcagaacacccacaccaaagtcagcacagaacacaacaag
gaatgcctcattaatatctccaagtataagttttctcttgttataagtggcctcactaac
atcttaaaaaatgtgaacaacatgagaatatttggagaaactgcagagaagaatttatac
ctgtcacaactcattatattagatacactggaaaaatgccttgcaggacaacccaaggac
agtctccgtttggatgagacgatgctggtgaaacagttgctgcctgagatctgccatttt
attcacacctaccgggaaggaaatcaacatgcagctgagctccgcaactctgcctctggg
gttcttttctccctcagctgcaataatttcaatgctgtctttagccgcatttccaccagg
acagaagaaagttgctctgtaattgagaacttgactaagaagacggtatttaaatttaga
gctctgaaaaaagtagctcagctgggagttataaacagtctcgaaaaggcattttggaac
tgggtggagaactatccaggagagttcacaatgttgtatcagcggcctcagagtgatatg
gcagattgtgcagagaaattgtttgactcagtggacagttttgcagaaagcacaaagcgc
aaggcagcagtgtggcccctccagattattctacttatcctttgccctgaaataattcaa
gatatttccaaggatgttgtagaagaaagcaaagtgaacaagaaatcgtttctagacaac
ttgaaaaaagccctggccggccatagtgggagtagacagttgactgaaagtgctgccatt
gcctgtgttaaactctgcaaagcatctacctacatcaactgggaggacaactccatcatc
ttcctctttgtccagtctatggtggttgacctaaagaaccttcttttcaatcctagcaag
cttttctctagaggtgcaggctgccaaaatgcagatgtggatctcatgatagactgtttt
gtttcctgttttcgcatcaaccctcataacaaccagcactttaagatttgtttggcaccc
agctccccatctactttccattatgtgttggtgaactcactccacagaataatcacaaat
tctgcattggactggtggcctaagattgatgcagtatactgttactcaggagaacttcgc
attatgtttgctgaaacgttgaataaagtgatacagtgttgtagtgcccatgctcctgta
cgtatgacgccgagtcttacttttaaagaaaaaatgacaagccttaaatttaaagaaaag
cccacggatgtggagacaagaagttataagtgtttactgctatcaattgtgaaattaatt
catgcggacccaaaacttatgttgtataatccaggaaagccagggcatgagatacaaagc
agtactgctgacttaattagaggactggtgcatcttgttccacagcccaacatgacagaa
atagcacaggaagccatggaggctttgttagttcttcatcaaccagaaaacatagagttg
tggaatccagatgcaccaattgaaacattctgggatataagctctcaagttctctcttac
atttgcaagaaattaattgctcatcagctgctgaacagcactgagattctcaaatggttg
cgagagattctgatctgtaggaacaaatttcttctaaagaataaggaaagtgccacacta
ggcagcagtatccaaatctgtcgccaagcccagacacagttagaggtggctctgtatatg
ttcctgtggagtccagatactgaagcagtccttgttgtcatgtcttgtttccgccatctt
tgcgaggaagctgacattagatgtggtgtagacgaggtgtctgtccataacatcctacca
aattacaatacattcattgagtttgcatctgtcagtagcatgatgtcaacaggcagagca
gctctgcagaaaagagtaatggcattgttaaggagaatagaacatcctactgcaggaaat
actgaggcatgggaagacacacatacaaagtgggaacatgctacaaaattaattcttaac
tacccaaaagcaaaattggaagatgggccggtgacagaatctcttcataaaacaattgtt
aagcgacgaatgtcacatgtaagtgggggtggctctatagatctgtctgacacagactct
ctgcaggaatggatcaatatgacggggttcctgtgtgccttgggaggagtctgtctacag
catcgcagcaacccgggactggcaacgtatagcccacccatgggccaagtgaacgaacgc
aaaggttctatgatctccatggtttccacggaaggaaatgcagagatccctgttagcaag
ttcctagatcgattgctttctctaatggtgtgcaatcatgagaaagtgggccttcagata
cgaactaatattaaagatctggtgggtttggaactgagtcctgcactttacccaatgctc
ttcaataaattgaaaaatagcatcagtaggttttttgactcgcaaggacaggttttattg
aatgacacaaacacgcagtttgtggagcaaacaattgctattatgaaaaacttgcttgat
aatcacactgaaggtagttcagagcatctgggacaagctagcattgaaacaatgatgctc
aacctagttaggtatgtgcgagtgctgggaaatttggttcatgcgatccagattaaaacc
aaactctgccagctagtagaagtaatgatgcagagacgagatgatctctcattttgccaa
gagatgaaatttaggaataagatggtagaatatcttacagactgggttatgggaacgtcc
aatcaagccgcagatgatgatgtcaagtgtttgacgagagacttggatcaagccagtatg
gaggcggtggtgtccctgcttgctggactacctctgcagccggaggagggagatggtgtg
gaactgatggaggccaagtcccagctcttccttaaatactttactttatttatgaacctc
ctgaacgactgcagtgaggttgaagatgaaaatgcacagactggcgggcgaaagagaggg
atgtctcgacggttagcttcacttcggcactgcactgttcttgctatgtctaatttgctt
aatgcaaacgttgacagtggcttaatgcattcaataggtttgggttaccacaaagatttg
cagacacgtgctacatttatggaagtcctgactaaaattctacaacaaggtactgagttt
gacacattagcagaaactgtgctggctgaccgatttgagaggctagtggagctggtcacg
atgatgggtgaccagggagagctgcctattgccatggctcttgcgaatgtggtgccatgt
tcacagtgggacgaactggctcgtgtgctggtgacattgtttgactcgaggcacctcctt
tatcagctgctttggaacatgttctccaaggaagtggaattggctgattccatgcagaca
cttttcagggggaatagccttgccagtaaaataatgactttctgttttaaggtttatggt
gctacatacctacagaagctgctggaacctttgttgagaacagtaattacagcccctgac
tggcagcatgttagttttgaagttgatcctacaaggttggaaactactgaaaccctagaa
gacaaccagcagaatctcttgcagatgacagagagatttttccatgcaattattaattca
tcatctgaatttccaccacaattacgcagtgtctgtcactgcttgtatcaggcaacttgc
cattctctactgaataaagctacagtaaaagaaaaaaaggaaaacaaaaaagcagttgtg
agccagcggtttcctcagaacagcattggcgcggtggggagtgccatgttcttaagattc
attaatcctgcaatagtttctccctatgaggcaggaattttggacaagaagccaccacct
agaattgaacgtgggctgaaattgatgtcaaagatccttcaaagtattgccaatcacgtg
ctgtttacaaaggaggaacacatgcgtccctttaatgattttgttaaaaacaactttgat
gcagccagaagattcttcctagatattgcatctgactgcccagccagtgacacagttaat
cacagtttgtctttcatcagtgatggaaatgtacttgctttacatcggttactatggaac
aaccaggaaaagattggacaatatctctcaagcaacagggatcataaggctgtaggaaga
agaccatttgacaagatggctactctgcttgcttacttggggcctcctgagcataagcct
gtggcagacacacactggtcaagtcttaatcttactagctccaagtttgaggagtttatg
actagacaccaggtgcatgaaaaagaagagttcaaggcactaaagacattgaacatattc
tatcaggcagggacgtcaaaagctggaaatccagtgttttactacattgccaggaggttc
aaaacaggtcagataaatggtgatctgttgatataccatgtgttactgactcttaagcca
tactatgctaagccatatgagattgtggtggacctcactcacgctgggcccagtaatcgg
tttaaaacggattttctctccaagtggtttgttgtgtttcctggttttgcgtacgacaac
gtgaccgctgtgtacatctacaactgtaattcctgggtcagagaatacaccaagtaccac
gagagactgctcactggactgaagggcagcaaaaaattgatttttatagattccccagga
aagctggcagaacacattgaacctgaccatcagaagctgcccgctgctactttagctctg
gaggaggatctcaaagtttttaataatgctctcaagttggctcataaagacaccaaggtc
tcaattaaggttggttcaacagctgttcaagtgacttcagcagagcgtacgagagtcctc
ggacaatcagtgtttctaaatgacatttattacgcctctgagattgaagagatttgcctt
gttgatgaaaatcagtttacgctgaccatcgccaaccagggcacaccattgacattcatg
caccaggaatgtgaggccattgtccagtccatcatccacatacggacacggtgggaactg
tcacaaccagattctattccacagcacactaaaattcgccccaaggatgtcccgggaacg
ctactcaatattgcattgctgaacctggggagttcagacccaagcttacgatctgctgca
tataatctcttgtgtgctttaacctgtacattcaatctgaagattgaaggccagttgctg
gagacgtcgggtctgtgtattcctgccaacaacacccttttcattgtttccattagtaaa
acgctggctgctaatgagccacacctaaccctggaatttttggaggagtgtatttctggt
tttagcaaatctagtattgaattaaagcatctctgcttggagtatatgacaccctggttg
ttaaatctagtccgtttctgtaagcacaatgacgacgcaaaacgtcagagggtaactgct
attttggacaaactcattacaatgaccattaatgagaaacagatgtatccatccattcaa
gcaaaaatttggggcagccttgggcagataacagatctgctggatgtggttctggacagt
tttataaagacaagtgctacgggtggattgggctccataaaagctgaagttatggctgat
acagctgtagctttggcttctggcaacgtgaagctggtttctagcaaggtaattggaaga
atgtgtaaaataattgacaagacttgcttgtcgccaacccctacattggagcagcacctg
atgtgggacgatatcgccatccttgcccgttacatgctgatgttatcctttaacaactct
ctcgatgtagcaacgcacctcccctacctcttccatgtggtcactttacttgttgccact
ggccctttgtcccttagagcttccactcatggcctggtcattaacattattcactccctc
tgcacctgttcacagctaaacttcagtgaagaaaccaaacaagtgttgcgactcagttta
acagagttctcattgccaaagttctacctgctatttggaatcagtaaagtgaaatcagct
gctgtcatagcattccgatccagctaccgggatcgttctttttcacctggctcgtatgag
agggaaacttttgcactcacatctctggagacagttacggaggctttgctggagataatg
gaggcttgtatgagggatatcccaacatgcaagtggctagaccagtggacagaattagca
caaaagtttgcattccagtacaacccgtctctgcagcccagagctcttgttgtctttggt
tgtattagcaagagagcggcccacggacagatcaaacaaatcattcgaatccttagcaag
ggactagagagctgcttaaaaggtcctgataattacaacagccaagttttaatagaggcc
actgtcatagcgctgaccaaactacaaccactgctcaacaaggactccctcatgcacaaa
gccctcttttgggtggctatcgcagtgctgcagttggatgaagttaacctgtattctgcg
gggacagcactcctggaacagaacttgcataccttagacagtcttcgggtctttaatgac
aagagcccagaggaagtgtttatggaaaccaggagaccattggaatggcactgcaaacag
atggatcattttgtcggcctcaatttcaagtccaactttaactttgcactagtgggacac
ctcatgaaaggttacagacatccttcccctacaactgtagctaggacagtaagaattttg
catacactactaacattggttaacaagcataggaactgtgacaaatttgaggtgaatatc
cagagtgtggcttatcttgcaggtaagaaaatattctgttgctttatatatcgctttatc
tttgtctttaggaccctgagggaaaaccaaccatgggcttctccaaaggcttcagacaga
catcttgcagcaaactacccaacagtgggacaaattagccccagaacccggaaatctatg
agcctggatatggggcagccttcacaagccaacactaagaagctactaggaacaaggaaa
agctttgaccatttaatatcggacactaaagcccccaagcgacaagagattgaatctggg
atcaccacacctcctaaaatgagaagggtagcggagaatgactatgaaatggagacacaa
agaatagcatcttctcagcagcatcctcacctacggaaggtctctgtctctgagtctaat
gcacttttggatgaggaggttctgacagatcccaaaatccaagctctactgctgactgtc
ttggccacattagtgaaatacactacagatgagtttgatcagcgaattctttatgaatat
ttagctgaggctagtgttgtcttccccaaagtctttccagttgtgcacaatttattggac
tcaaagattaacacccttctgtcactgtgccaagactcaaatctcttgaatccaatccat
ggaattgtgcagaatgtagtctaccatgaagaatcaccaccacagtaccagccttcgtat
ttacagagtttcggttttaatggactgtggaggtttgctggaccattttcaaagcaaact
caaatcccagactacgcagagcttatagtgaagtttcttgatgccttgattgacaactat
ctgccagggattgacgaggaggccagcgaagaaagtctgcggacgccaacctccccttac
ccacctccagtccagagccaactgagtattactgcaaaccttaacctctcaaattccatg
acctctcttgcaacttcccagcattccccaggaattgacaaggaaaacgtggagctctca
ccaaccacgggacatacaaacagtgggcgaacacgccatggttctgcaagtcaagtgcag
aaacagaggagtgctggaagctttaagcgccacagcattaagaagattgtgtaa
DBGET
integrated database retrieval system