Latimeria chalumnae (coelacanth): 102359526 Help Entry 102359526         CDS       T02913                                  Symbol COL2A1 Name (RefSeq) collagen type II alpha 1 chain   KO K19719   collagen type II alpha Organism lcm  Latimeria chalumnae (coelacanth) Pathway lcm04510   Focal adhesion lcm04512   ECM-receptor interaction lcm04518   Integrin signaling Brite KEGG Orthology (KO) [BR:lcm00001]  09130 Environmental Information Processing   09133 Signaling molecules and interaction    04512 ECM-receptor interaction     102359526 (COL2A1)    04518 Integrin signaling     102359526 (COL2A1)  09140 Cellular Processes   09144 Cellular community - eukaryotes    04510 Focal adhesion     102359526 (COL2A1)  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:lcm00536]     102359526 (COL2A1) Glycosaminoglycan binding proteins [BR:lcm00536]  Heparan sulfate / Heparin   Extracellular matrix molecules    102359526 (COL2A1) SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Collagen COLFI VWC VWC2L_2nd Motif Other DBs NCBI-GeneID:  102359526 NCBI-ProteinID:  XP_005986342 Ensembl:  ENSLACG00000019101 UniProt:  H3BIL6 LinkDB All DBs Position Un AA seq 1488 aa AA seqDB search MFSFVDSRTLVLLAATQVILLAVVKCQDEDIQDEGSCIQDGQIYSDKDVWKPEPCRICVC DTGTILCDEIICEETKDCPNPEIPFGECCPICPTERTPASGRQPGAKGQKGEPGDIKDVI GPKGPQGPQGPPGEQGPRGDRGDKGEKGTPGPRGRDGEPGTPGNPGPPGPPGPPGLGGNF AAQMAGGFDEKAGGAQMGVMQGPMGPMGPRGPPGPPGAPGPQGFQGNGGEPGEPGASGPM GPRGPPGPSGKPGDDGEAGKPGKPGERGPPGPQGARGFPGTPGLPGIKGHRGYPGLDGTK GEAGAAGAKGEAGAPGENGAPGPMGPRGLPGERGRPGPPGSAGARGNDGLPGPAGPPGPV GPSGAPGFPGAPGAKGEAGPTGARGPEGPQGPRGESGTPGSPGPSGASGNPGTDGIPGAK GSTGAPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPLGPKGQQGDPGLPGFKGEHGPKGEPGPVGPQ GAPGPAGEEGKRGARGEPGAAGPHGPPGERGAPGNRGFPGQDGLAGPKGAPGERGVPGVS GPKGATGDPGRPGEPGLPGARGLTGRPGDAGPQGKVGATGAPGEDGRPGPPGPQGARGQP GVMGFPGPKGANGEAGKAGEKGLPGAPGLRGLPGKDGETGAVGPPGPSGPAGERGEQGPP GPPGFQGLPGPPGPPGEGGKPGDQGVPGEAGATGQTGPRGERGFPGERGSPGPQGLQGPR GLPGTPGTDGPKGATGPAGPNGAQGPPGLQGMPGERGAAGIPGPKGDRGDVGEKGPEGAP GKDGARGLTGPIGPPGPAGPNGEKGETGPSGPPGAAGARGAPGDRGETGPPGPAGFAGPP GADGQPGSKGEQGETGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVSGPKGARGAQGPPGATGFP GAAGRVGPPGPNGNPGPPGPAGPAGKDGPKGLRGDAGPQGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEP GEDGPAGPDGPPGPQGLAGQRGIVGLPGQRGERGFPGLPGPSGEPGKQGAPGSAGDRGPP GPVGPPGLTGPAGEPGREGNPGSDGPPGRDGAPGIKGDRGETGPVGQPGAPGAPGAPGPV GPTGKQGDRGESGPQGPMGPTGPAGARGMPGPQGPRGDKGEAGEPGERGQKGHRGFTGLQ GLPGPPGPSGDQGASGPAGPSGPRGPPGPVGPSGKDGANGLPGPIGPPGPRGRTGETGPA GPPGQPGPPGPPGPPGPGIDMSAFAGLAQPEKAPDPLRYMRADQASSSLRQHDAEVDATL KSLNNQIESIRSPEGSKKNPARTCRDLKLCHPNWRSGDYWIDPNQGCTLDAIKVFCNMET GETCVYPNPASIPRKNWWTSKTKDKKHIWFGETMNGGFHFSYGDDSLAPNTANIQMTFLR LLSSEASQNMTYHCKNSIAYMDETSGNLKKAILLQGSNDVEIRAEGNSRFTYNVLEDGCA KHIGKWGKTVLEYRSQKTSRLPIVDIAPMDIGGANQEFGVDIGPVCFL NT seq 4467 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgttcagctttgtggactcaaggactctagtgctgcttgcagccactcaagtcattcta ttagcagttgtcaaatgtcaggatgaggatatccaggatgaagggagctgcatccaggat gggcagatatatagtgataaagatgtgtggaaacctgaaccctgtcgaatatgtgtatgt gacactggaactatactctgcgacgagataatctgtgaagaaactaaagactgccccaac cccgagatccccttcggagagtgctgccccatctgccccactgagcgaacccccgccagc ggacggcaacccggtgctaagggacagaaaggggaaccaggggatattaaagatgttata ggaccaaaaggaccccagggcccacagggaccaccaggagagcaggggccaaggggcgat cgtggtgataaaggtgaaaaaggtactcccggccctcgtggtagagatggtgaacccggc acccctggtaaccctggaccccccggaccccctggcccacctggccttggcggaaacttt gctgctcagatggcgggaggatttgatgagaaagcaggcggtgctcagatgggtgtgatg caaggaccgatgggcccaatgggaccccgaggacctccaggccccccaggtgctcctggc cctcaaggtttccaaggaaacggtggtgaacccggtgaacctggtgcttctggtccaatg ggccctcgtggtcccccaggcccatctggcaaacctggtgatgatggtgaagctggcaaa cctggcaaacctggtgagcgtggtcctcctggccctcagggcgctcgtggcttcccagga actccaggtcttccaggcattaagggtcacaggggttatcctggtctagatggaacaaag ggagaagctggagctgctggtgctaaaggtgaagctggagctcctggtgagaatggtgct cctggcccaatgggccctcgtggtctgcctggtgagaggggacgtcctggaccacctggt tctgctggagctcgtggtaatgatgggcttcctggtcccgccggccctcctgggcctgtt gggccttcaggtgctcccggcttccctggtgctccaggtgctaagggtgaagctggtccc actggtgcccgtggtcctgaggggccccagggcccaaggggtgaatctggaactcctggc tctcctggaccttctggcgcttctggtaaccctggtactgacggcattcctggtgccaaa ggatccactggtgctcctggtattgctggagctccagggttccctggccctcgtggccct ccaggacctcagggtgccacaggcccacttggtccgaaaggtcagcagggtgaccccggt cttccaggtttcaagggagaacatggtcctaagggagagcctggtcctgttggtccccaa ggtgctcctggtcctgctggtgaagaagggaagagaggcgcgcgcggtgaacctggcgct gctggcccacatggtcctcctggcgagagaggtgctcctggtaaccgtggtttcccaggt caggacggccttgcaggtcctaagggagctcctggtgaacgtggtgtccccggtgtttct ggtcccaaaggagccactggtgatcctggccgtcctggcgaacccggcctccctggtgct aggggtctgactggtcgccctggcgatgctggtcctcaaggcaaagttggcgctactggt gctcctggtgaagatggtcgccccggtccccctggccctcagggtgctcgcggacagcct ggtgtcatgggtttccctggtcccaaaggtgccaacggcgaagctggcaaagctggtgag aagggactgccaggcgctcctggtctaagaggtctacctggtaaggatggagaaactgga gctgtaggcccccctggtccttctggccccgctggtgagagaggagaacaaggtccccca gggccacctggcttccaaggtctcccagggcctccaggtcccccaggtgaaggaggtaaa ccaggtgaccagggtgttcccggagaagctggagctacaggtcaaactggtccaagaggt gagcgtggtttcccaggtgaacgtggctctccaggtccccagggtcttcagggccctcgt ggtctccctggcactcccggaactgatggtcctaagggagctactggtccagctggtccc aatggtgcccaaggtcctccaggtctgcagggtatgcctggtgagagaggagctgctggt attcctggacccaagggagacagaggtgatgttggtgagaaaggccctgaaggagctcct ggtaaagatggtgccagaggtttgactggtccaatcggtcctcctggcccagctggtcct aatggtgagaagggtgaaactggtccatctggtcctcctggtgctgctggggctcgaggt gctcctggtgatcgtggtgaaactggtcctcccgggcctgctggttttgctggtcctcct ggtgctgatggacaacccggttcaaagggcgagcagggcgagactggtcagaagggagat gctggtgccccaggtcctcagggtccatctggtgctcctggcccacagggtcccactggt gtttctggtcctaaaggtgcccgtggcgctcagggtccacctggtgccactggcttccct ggtgctgctggaagagtcggcccgcctggtccaaatggtaacccaggcccacctggcccc gctggccctgcagggaaagatggtcctaaaggtctccgtggtgatgctggtcctcaaggt cgtgctggagatcctggtctgcagggtcccgctggtgctccgggtgagaagggtgagcct ggcgaagatggtcctgctggccccgatggtcccccaggtccccagggtctggctggacag cgtggtattgttggtcttccgggtcagcggggtgagagaggtttccctggtttacctggt ccatctggtgaacctggcaaacaaggagctcccggaagtgctggagatcgtggtccccct ggccctgttggcccacctggtctgactggacctgctggtgaacctggacgtgaaggcaac cctggatctgatggtcctcctggccgtgatggtgctcctggcattaagggtgaccgtggt gagactggtcctgttggtcagcctggcgctcccggtgctcctggtgctcctggtccagtt ggtccaaccggcaaacaaggagacaggggtgaatctggtcctcaaggtccaatgggtcct actggtcctgcaggtgcccgtggtatgcctggccctcaaggtccccgtggtgacaaggga gaagctggtgagcctggagagagaggtcagaaaggtcatagagggttcactggtctacag ggtctgcctggcccacctggtccctctggtgatcagggagcctctggtcctgctggtcca tctggtccaagaggtcctcccggcccagttggtccatctggtaaagacggtgccaatggc ttgcctggtcctattggacccccaggtcctcgtggccgtactggtgaaactggtcctgct ggtcctcctggacagcctggccctcctggtccccctggtccccctggtcctggtatcgat atgtctgccttcgccggtctcgctcagcctgagaaagcccccgatcctctgcgttacatg cgcgctgaccaggcctcctcctccctccgccagcatgatgccgaggttgatgctactctg aaatcactcaacaaccagatcgagagcattcgcagtcctgaaggttccaagaagaatccg gcccgtacctgccgtgacctgaaactctgccatcccaactggaggagtggtgactactgg atcgatcctaaccaaggctgcacactggatgccatcaaagtcttctgtaatatggagact ggagagacctgcgtctaccccaacccagccagcatcccaaggaagaactggtggacaagc aagaccaaggacaagaagcacatctggttcggcgagactatgaacggtggattccacttc agctatggtgatgacagcttggcacccaacacagccaacatccagatgactttcttacgc cttctctctagtgaggcctcccagaacatgacctaccactgcaagaacagcatcgcttac atggatgagacctctggcaacctgaagaaggccattttactccagggatccaacgatgtg gagatcagagccgagggcaacagccgattcacatacaacgtcttggaggatggctgcgcg aaacacattggcaagtggggtaagacagtgctagaatacagatctcagaagacatctcgc ctccccattgttgacattgcacctatggatatcggaggagccaatcaggaatttggtgtt gacatcggcccagtctgcttcttgtaa

DBGET integrated database retrieval system