Latimeria chalumnae (coelacanth): 102361060
Help
Entry
102361060 CDS
T02913
Symbol
HNRNPM
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M
KO
K12887
heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M
Organism
lcm
Latimeria chalumnae (coelacanth)
Pathway
lcm03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcm00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
102361060 (HNRNPM)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
lcm03041
]
102361060 (HNRNPM)
Spliceosome [BR:
lcm03041
]
Common components
Common spliceosomal components
hnRNP proteins
102361060 (HNRNPM)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_3
RRM_MARF1
RBD_DEAH11
HnRNP_M_NLS
RRM_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102361060
NCBI-ProteinID:
XP_014340440
Ensembl:
ENSLACG00000016814
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
630 aa
AA seq
DB search
MASNSMENGDGNKSEVNGSLNSNEGRKEKSFKHVGRFEPYSNPARKYRVLITNVPFDVKW
QALKDLAKEKVGEVTYVELLMDAEGKSRGCATVEFRTEESMKKAADVLNRYDMNGRPLKV
KIDPDGEHARKIVMKTFGGPGGMGPNMGVAPGMINIPPNIMDNPNMVNLIQALQAGRLGS
TIFVANLDYKVGWKKLKEVFSMAGTVVRADVLEDKSGKSRGMGTVSFEQPVEAVQAISMF
NSQLLFDKPMHVKMDEKSMPRSDSFSQDRPQLPRGLGGIGMGLGPGGQPLGTNTMGRDMG
MGNMGSGRGGMGMDAMGYGGMNKMGVAGMESSYGGGMDGLSQFSSGLNRMTGGGMNMSGN
MGMGSSMDRMGLGMDRMSSGLDRMATGVGSGIDRMSQGMGTSLSLSMDRSGLDRMSTCLD
MLDRMSSNIDRMGTGMDRIGSGLERRSFEMDRIGSGMVSDIDRMGAMGMDRMGSGMDRMG
NIGMGLGGVERMGTGMGVGNVSASMVSGMGSAMGLAMGGGFDRSMDMDRTAFGGNYGTSM
AGGASAGLSRKGCQIFVRNLPFDFTWKKLKDEFNECGRVQYAEIKMENGKSKGCGVVRFE
SPQVAERACRLMNGIKLNGREIDVRLDRNA
NT seq
1893 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgagcaacagtatggaaaacggcgacggtaacaagagtgaagtcaatggaagtttg
aattcgaatgaggggaggaaagaaaaaagcttcaagcatgttggtcgttttgagccttat
agtaaccctgccagaaaatacagggttctcattaccaatgttccttttgacgtcaagtgg
caagctctaaaagacctggcaaaagaaaaagttggtgaggtaacgtacgtcgagctctta
atggacgcagaaggcaagtcaaggggatgcgccactgttgaatttagaactgaagaaagc
atgaaaaaggctgcagatgttctgaacagatacgatatgaacgggagacccctgaaagtc
aaaatagatcctgatggtgaacatgctagaaaaatagtgatgaaaacgtttggtggccct
ggtgggatggggcccaatatgggagtggctcctgggatgattaacattccacccaacatc
atggataatcccaacatggtgaatcttatccaggctctacaggccggcagacttgggagt
acaatctttgtggcgaatctggactataaagttggctggaagaagctgaaggaggttttc
agcatggccggtacggtggttcgagctgacgtcctggaggataaaagcgggaagagtcgg
gggatgggtactgtcagcttcgaacagcctgttgaagccgttcaggcaatctcaatgttt
aactcccagcttttatttgacaaacctatgcatgtgaaaatggatgagaaatcgatgcca
aggagcgattcattttcacaagatcggcctcagcttcctcgtggtcttggtgggatcggc
atggggttgggtcctggtggccagcctcttggcacaaacaccatgggcagagacatgggc
atgggaaatatgggctctggacgtggagggatgggtatggatgcaatgggatatggcggc
atgaacaaaatgggagttgcaggaatggagagctcttatggtggtggaatggatggtttg
tctcagttttcttcagggttgaacagaatgactggtggcggaatgaacatgagtggaaac
atggggatgggttctagcatggaccgaatgggcctgggaatggacagaatgagctctggc
ttagatcgcatggctacaggagtgggctctggcatcgaccgtatgagccaaggaatgggg
accagtctcagtttgagtatggaccggtctggactggatcgcatgagtacttgtttggat
atgctagaccgtatgagttccaatatagacagaatgggtacaggaatggaccgtattggt
tctggcttggagagaaggagttttgaaatggaccgcatcggttccggcatggtctcggac
atagatcgcatgggagccatgggaatggatcgcatgggctccggaatggatcgcatggga
aatattggaatgggccttggtggtgttgagcgaatggggactggaatgggtgttggcaat
gtgtcagccagcatggtatccggaatggggtccgccatgggcctggcaatgggaggtggt
tttgacagatcaatggatatggatcgtacagcttttgggggaaactatggaacatccatg
gcaggaggagcttcagctggactttccaggaaaggctgccagatatttgttagaaatctg
ccgttcgattttacatggaagaagctgaaagatgaatttaatgaatgtggccgtgtccag
tatgcagaaataaaaatggagaatggcaagtcaaaaggctgtggcgttgttcggttcgaa
tccccacaggtagcagagagagcctgcagactgatgaatggaataaaactcaacggaaga
gaaattgacgtccgactcgatcgaaatgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
