Larimichthys crocea (large yellow croaker): 104927966
Help
Entry
104927966 CDS
T04659
Name
(RefSeq) calsequestrin-1
KO
K23468
calsequestrin 1
Organism
lco
Larimichthys crocea (large yellow croaker)
Pathway
lco04020
Calcium signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lco00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04020 Calcium signaling pathway
104927966
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Calsequestrin
Thioredoxin_6
MazE_antitoxin
TXNDC16_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104927966
NCBI-ProteinID:
XP_010740467
LinkDB
All DBs
Position
X:14239572..14248204
Genome browser
AA seq
492 aa
AA seq
DB search
MKWTWVLVVVLLSFGGLSLGKESLDFPEYDGKDRVHDLNGKNYKSVMKKYDVMVVYYHDH
PGSSRVAQKQFEIEEMALELAAQVLDEFEDEDIGVGLIDAKHDKAVAKKLGLDESDSIFI
FTDDEVIEYDGELAADTLVDFIYDVIEDPVEIIDNNRELKGFENIEEDIKLVGYFKSHKS
EHFEAFADAAEEFHPHIKFFATFSAKVAKALDMKLNEVDFYEPFMDDPVVIPGKPYSEDE
LVKFIEANDRPTLRKLQPHNMYEIWDDDVGGEHIIAFAEEADPDGFEFLEILKQVAEDNT
DNPDLSIVWIDPDDFPLLLPHWEKTFDIDLSHPQIGVVDADDADSVWMDMDDGEDLPSVD
ELEDWIEDALSGEVDPDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDNDDDDDDDDDDD
DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DDDDDDDDDDDY
NT seq
1479 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtggacctgggtacttgtggtggtcttgctgtcctttggggggctatcactgggc
aaggaaagcttggacttcccagagtatgatggaaaggaccgtgtccatgacctcaacggc
aagaactataagtctgtgatgaagaagtacgatgttatggtggtgtactaccatgaccat
cccggatccagccgcgtcgcccagaaacagtttgagattgaggagatggcccttgagctt
gcagcccaggtcctggatgagtttgaggatgaggatattggagttggtctcattgatgca
aagcacgacaaagccgttgcaaagaaattaggccttgatgagtctgacagcatcttcatc
ttcacagacgatgaagtcatagaatatgatggcgagctcgcagcagacactcttgtggat
ttcatctatgatgttattgaggacccagtggaaattattgacaataatagggaactgaaa
ggcttcgaaaacattgaagaggacatcaaattggtgggctactttaagagtcacaagtca
gaacattttgaggcttttgccgatgctgctgaagagttccaccctcacatcaagttcttt
gctacattcagtgccaaggttgccaaggctctggacatgaagctcaatgaggtggacttc
tatgaacccttcatggacgatccagttgtcatccctggaaaaccttactcagaggatgag
ctggtgaaattcattgaagctaatgacagaccaaccctgaggaagctgcaaccacacaac
atgtatgagatctgggatgatgatgttggtggtgaacatatcattgcttttgcagaggag
gctgacccagacggttttgagttccttgagatcctgaaacaagttgcagaggataacact
gacaaccctgacctcagcattgtctggattgaccctgacgacttccccctgcttctgcca
cactgggagaagaccttcgatatcgacctgtcccacccacagattggtgttgtcgatgct
gatgacgctgacagtgtgtggatggacatggatgatggcgaagatttgccatcagtagac
gagctggaggactggattgaggatgctctgtcaggagaagttgatcctgatgatgatgat
gatgatgatgatgatgatgatgatgacgatgacgatgatgatgatgacgacgatgatgat
gacgacgatgatgacgacgacgacaatgatgatgatgacgatgatgacgacgatgatgac
gatgacgatgacgatgatgatgacgatgatgatgacgatgacgatgatgatgatgacgac
gatgacgacgatgatgatgatgatgacgacgatgatgacgatgacgacgatgatgacgat
gatgatgacgacgacgacgatgatgacgacgatgatgacgacgatgatgacgacgatgat
gatgatgatgacgatgacgatgatgatgacgattattaa
DBGET
integrated database retrieval system