Larimichthys crocea (large yellow croaker): 104931608
Help
Entry
104931608 CDS
T04659
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(X) chain isoform X1
KO
K19479
collagen type X alpha
Organism
lco
Larimichthys crocea (large yellow croaker)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
C1q
BclA_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104931608
NCBI-ProteinID:
XP_010744956
LinkDB
All DBs
Position
XXIV:complement(6860162..6876114)
Genome browser
AA seq
661 aa
AA seq
DB search
MPVGSCKMDVRVACILLLVVASAAAHGKGYVVKKLVKAAPQYQPYSVKSQVVAVAGEPGP
PGEPGPEGPAGPPGERGEDATGEPGPQGPPGPPGAPGRSIAGKPGSPGGPGKPGSDGAPG
EKGDTGATGAQGPRGAPGAHGSPGPAGLSATGKPGPSGLPGAMGPRGEPGLKGHPGIPGL
PGPKGDKGIGVQGPQGETGPEGPMGPTGEPGAAGVGKPGRTGAPGEPGKSGSPGRDGATG
PMGPMGPKGHTGAPGVGVAGKPGENGAPGLPGPVGPKGHQGPGGAPGAPGVPGYGKPGAN
GEKGERGATGATGATGAKGEQGPTGYTGATGATGPTGPAGPQGARGFQGEPGAVGAKGDT
GEAGPQGPKGNKGDQGAQGFAGKQGYPGAAGPPGPRGATGATGDKGHVGLPGTPGAPGIP
GPAGPKGHTGRPGEPGAAGSDGASGPRGPAGPQGPAGTPGLKGHPGLPGAPGPAGLAAKG
HTGPQGPAGQPGEPGADGEAGPAGPPGPPGPPGEVVFEKGMGMSEVMVKSPMSAFTASLA
TPYPAAGTPIKFDQIVYNAENHYDPESGIFTCQIPGVYYFAYSIHVNGAHALVALYKNGQ
PVMFTYDEYNKGFLDQMSGSAVLLLDEQDTVYVQIPDDEANGVFAAENVHCSFSGFLIAS
T
NT seq
1986 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccggttggatcttgtaagatggacgtacgagtagcatgcatcctcctcctcgtggtg
gcctcggctgctgcccatggaaaggggtacgtggtgaagaaactggtgaaggctgcccct
cagtatcagccctactctgtgaagagccaggtggtggcagtggcaggtgagcctggtcct
ccaggtgagcccggccctgagggacctgctggccctcctggtgagcgaggtgaggatgcc
acaggtgagcccggcccccaaggacctcctggacctcctggagctcctggacgctccatt
gctggcaagcctggttccccaggtggacctggcaaacctggcagtgatggcgcacctggt
gagaagggagacaccggagccactggcgctcagggaccaaggggagcccctggagctcat
ggaagccctggacccgccggcctctctgctactggcaagcctggaccttcaggtcttcct
ggagcaatgggacctagaggagagcctggtctgaagggacatccaggtattcctggtctg
ccaggtcctaagggtgataaaggtattggtgttcagggacctcagggtgagacaggacca
gagggacctatgggccctactggagaaccaggtgcagctggagttggaaagccaggaaga
acaggtgctcccggtgagccaggaaagtcaggtagcccaggtagggatggtgccacaggt
ccaatgggaccaatgggacctaagggtcacactggtgccccaggtgtaggtgttgcaggt
aaaccaggtgagaatggtgccccaggtctgcctggcccagttggccctaaaggccaccag
ggacctggtggagctcctggtgcccctggagttcccggatatggaaagccaggtgcaaat
ggtgagaagggagagaggggagctacaggtgccacaggtgccacaggtgcaaagggtgag
cagggtccaacaggttatactggtgctactggtgcaactggccccactggtcctgctgga
cctcagggtgcaagaggtttccaaggtgagcctggcgctgttggtgctaaaggtgacaca
ggtgaagctggacctcagggacctaagggaaacaagggagatcagggagcacagggattc
gcaggcaagcagggttacccaggcgcagctggtcctcctggacccagaggagccactgga
gctactggtgataagggtcatgtaggtctcccaggtacaccaggtgccccaggtatccca
ggccctgctggacccaaaggtcacactggccgtccaggtgagccaggtgctgctggttct
gatggtgcttcaggtcctagaggacccgctggtccccagggtcccgctggtactcctggc
cttaagggtcacccaggtctgcctggtgctcccggtcctgctggtttggctgccaagggt
cacaccggacctcagggtcctgctggtcaacccggtgagcctggtgctgatggagaagct
ggcccagctggccctcctggtccccctggtcctcccggtgaggttgtgttcgagaagggt
atgggaatgagtgaggttatggtcaagtcccccatgtctgctttcacagcatctctggcc
accccctaccctgctgctggcacccccattaagtttgaccagattgtgtacaatgctgag
aatcactatgaccccgagagcggcattttcacttgccagattcctggagtctactatttc
gcctacagcatccatgttaatggcgctcatgccctggttgctctgtacaagaacggccag
cctgttatgttcacctatgatgagtacaacaagggcttcctggaccagatgtccggtagt
gctgtcctcttgctcgatgagcaggacacagtctacgtccagatccccgatgatgaggcc
aatggtgtctttgctgccgagaatgtccactgctctttctctgggttccttattgcttca
acgtga
DBGET
integrated database retrieval system
