Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly): 111675214
Help
Entry
111675214 CDS
T06013
Name
(RefSeq) tetratricopeptide repeat protein 37
KO
K12600
superkiller protein 3
Organism
lcq
Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly)
Pathway
lcq03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcq00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
111675214
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
lcq03019
]
111675214
Messenger RNA biogenesis [BR:
lcq03019
]
Eukaryotic type
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Ski complex
111675214
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_2
TPR_1
TPR_16
TPR_8
TPR_12
TPR_CcmH_CycH
TPR_14
TPR_19
ARM_TT21_C
ANAPC3
TPR_7
TPR_17
TPR_11
PPTA
Ago_MID_bact
TPR_Slam
SIS
DUF7017
Adeno_Penton_B
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111675214
NCBI-ProteinID:
XP_023291709
LinkDB
All DBs
Position
6:43377253..43382739
Genome browser
AA seq
1235 aa
AA seq
DB search
MSTKETKTLLKEVREAIKSEKYQDAIKKCEEVLKAEPNCYMGYLLMGAAYQDSDKQEAAK
YLRKAIEFCSPQPPTVALQGLSNCAPPEELPQIFEQLIELVPEKQLHYCEKLFSISTNSK
IAPDSFNVFKRIIAKTQDEEKKTILLTYLGRIWVQHDLPVETGEEQLYKSSLESILLDAS
LDVYLSAYKRFIKLLFKQNDLKLCLERACNLIDFYPEDIYAYEWICKIYCEQYNSTKNAC
LESLKNPIDFYASKLLELNSESSLGLLVKAIDLYNSQQFVAARELLYRIQIIQPNYEVAI
KLLAFTEMQLQSYGLAENLWYQLKDNDSKELAICLSYSDEKSKLNEAVKLLKTKEPSEEI
NQALARCYYKLEDTDNLQSLELDALSKAEFLLSPSEAIEFIKSSITDLETYSVLFLMGKC
YYEVQNYNNALMSILKATRLKPYSSECFYYLGRIYLATNDIVRSRKCFEKNVTLNPLNEK
AVENLSIIYQKLQEEDLNLSLLMSTLKYLKNSEKSKHIHYKLGLHYLNFQRCDEAIQSFR
TAIKHDVTCIIYWESLGDAYAERGSYNSAIRVFQKILEMQPDNLYAKLQIALTKTTIRMF
PEAIEDFDSLLKDNENYLPALKGAAEAHIGLANNLKLEYRFGRAKHHLQMAINMLQRCFL
NPENLNMVWLWRLVANVFVATAQMPESLANLDVSGKLANRDTDVVCLTRKDLLSLALRFY
TCALKIKQNTYMWYELALCSYYSADYMPEEAKMHLELATKACQIAIKEQTNRWHNWNLLG
VINMHSVMDNLPLAQHCFIQALNIERKSYTTWTNLGVLYLKLKEIKLANQAFQRAQQSSP
IYPNAWIGQAMIAEAIAEEVEAVDLFRHCQQFEYHAESSLGYAHWVCNILSNKEKCQLPH
YRYAIEIMYADTVALDAINWYNIIEENNSSASAYSFQGFLSERQQLYRPALRAYAKAAEN
AAPGTERDLMYTNLGYVYLKLNEPNEAINAFNKVTQASFKPIIGLALAYFKAGQHQESYS
VYSSVLKSVAGVEDDKAARILVAMASMVYAFQGEADTKTILYQCILLKDSPIQALYSACA
LGILHQDNQLSETILIELKKYEDSEQHAAHIAYLTAQYYKANQQPRKALTYLMTRVHIFP
QCAELRKVLASFLLDNYGHKRQYYNATSQIALSAITLVHGSKTKKSNCVEDSETLLIASK
SLQPVDKQRSLKLIQRAILLHPSNMNAWNALLSVH
NT seq
3708 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccactaaggaaacaaaaactttactaaaagaagttcgtgaggctataaagtccgaa
aaatatcaagatgctattaaaaaatgtgaagaagttttaaaagctgaacccaattgttat
atgggatatctgctgatgggtgctgcctatcaagattcagataaacaagaagcagcaaaa
tatttacgcaaagccattgaattttgttctccacaaccaccaactgttgcattacagggt
ctgtctaattgtgcacccccagaggagttgccgcaaattttcgaacaactgatagaattg
gtgcctgaaaaacaattgcattattgtgagaaactatttagcatatcgaccaatagcaaa
atagctccagattcgtttaatgtatttaaacgtattattgcaaaaactcaagatgaagaa
aagaaaaccattttattaacatatttaggacgtatttgggttcaacatgatctacctgta
gaaactggagaagagcaattgtataaatcttctttagaatctatattattggatgctagc
ttagacgtttatttgtccgcatataaacgttttatcaagttattgtttaaacaaaatgat
ttaaagttgtgtttggaacgtgcctgtaatttgattgatttctatccagaggatatatac
gcctacgaatggatttgcaaaatctattgtgaacaatacaattctacgaaaaacgcttgt
ttggagagtctaaaaaatcctattgatttttatgcctccaagttattggaattgaatagt
gaatcgagtttaggtttgttagtcaaagcaatcgatctttataattcacaacaatttgtg
gctgcaagagaacttttatatagaattcaaattattcaacccaattatgaggtggcaatt
aagttattggcttttactgaaatgcaattgcaatcatatggtttggctgaaaacttgtgg
tatcaacttaaggataatgatagcaaagaacttgctatatgtctttcatacagcgatgaa
aagtccaagttgaatgaagctgtaaaattactaaaaactaaagaaccatctgaggaaata
aatcaagctttagcaagatgctattacaaattggaagatactgacaatcttcagagttta
gaacttgatgcgttaagtaaagctgagtttttattgtcaccttcggaagctattgagttt
ataaaatcttcgataacagacttagagacctattccgttctatttttaatgggaaaatgc
tattatgaagtacaaaattataacaatgccttaatgtctattttaaaagctactcgctta
aagccctatagttcggaatgtttttattatttgggtagaatttatttggccacaaatgat
attgtacgttcaagaaaatgttttgaaaagaatgttacattaaatcctctaaatgaaaaa
gctgtggaaaatctctcaattatatatcaaaaattgcaggaagaggatttaaatttatca
ttgctgatgagcactttaaaatatctaaaaaattcggaaaaatcaaaacatattcattac
aagttgggtctacattatctaaattttcagaggtgtgatgaggcaatacaatcattccgc
actgccattaagcatgatgtaacctgcataatatattgggaatccttaggggatgcttat
gctgaaagaggttcctacaactcagctatacgtgtatttcaaaaaattcttgaaatgcag
ccggataacttatacgccaagctacaaatagccttaacgaagacaactatacgaatgttt
ccagaggccattgaagattttgatagtttacttaaagataatgaaaattatttgcccgct
ttgaagggtgcagccgaggcacatattggcttggcaaataatttaaagttggaatatcgt
tttggcagagctaaacatcatttacaaatggctatcaatatgctgcaaaggtgtttcttg
aaccctgaaaatttaaatatggtttggctgtggcgtttagtggccaatgtgtttgtggca
acggcccaaatgcccgaatctttggcaaatcttgatgttagtggtaaattggctaatcga
gataccgacgtagtctgcttgacacgcaaagatttattaagtttggcactaagattttat
acttgcgccttgaaaattaaacaaaatacttatatgtggtatgaattggctttgtgctct
tactattctgccgactatatgcctgaagaggcaaaaatgcatttagaattggctacgaaa
gcttgtcaaattgctattaaggaacaaacaaatagatggcataattggaatttattaggt
gttattaatatgcattcagttatggacaatttacctttggcccaacattgctttatacaa
gctttaaatattgagcgtaaatcctatacaacttggactaatttaggtgtgttatattta
aaactaaaggaaataaagctggccaatcaggcttttcaaagagcccaacagtcatcaccc
atttatcctaatgcttggataggtcaggccatgattgctgaagctatagcagaagaagta
gaagctgttgatttattccgtcattgtcaacaattcgagtatcatgctgaatcgtccctt
ggttatgcccactgggtttgtaatatcctatcaaataaggaaaagtgtcaattgcctcat
tatagatatgccattgagatcatgtatgccgatactgtggcattggatgccatcaattgg
tataatattatcgaagaaaataactcttcagcttcggcttactctttccaaggttttcta
agtgaacgtcagcaactttatagaccggctttaagggcatacgctaaggcagctgaaaac
gctgctcccggtactgaacgtgatcttatgtatacaaatttaggttatgtttatcttaaa
ctaaatgaacccaatgaagctataaatgcttttaataaggttacacaagcttcatttaag
cctattataggtttagctttggcctattttaaggctggtcaacatcaagaatcatattcg
gtttatagttctgtactaaaaagtgtggctggtgttgaggatgataaagcggcaagaatt
ttagtagccatggcttccatggtttatgcatttcaaggagaagctgataccaaaactatt
ttatatcagtgcatacttctcaaagactctcccatacaagccttgtattctgcctgtgct
ttgggtattctacatcaagacaatcaattgtctgagaccatattgatagagttgaaaaaa
tatgaagattctgaacagcatgctgctcatattgcctatttaacagcacaatattataaa
gcaaatcaacaacctcgcaaagcacttacctatctaatgacacgtgttcatatatttcca
caatgtgccgaattgcgtaaagtgttggccagttttctattggataattatggtcataag
cgtcaatattacaatgccaccagtcaaatagctttaagtgccataactttggtgcatggc
agtaaaacaaagaaaagcaattgtgttgaggattcggaaaccttattaattgccagcaaa
tcccttcagccagtggataaacaacgttctttaaaacttatacaacgagctattctcttg
catccttcgaatatgaatgcttggaatgctttattatctgttcattag
DBGET
integrated database retrieval system