Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly): 111678713
Help
Entry
111678713 CDS
T06013
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(IV) chain
KO
K06237
collagen type IV alpha
Organism
lcq
Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly)
Pathway
lcq04512
ECM-receptor interaction
lcq04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcq00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
111678713
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
111678713
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
lcq04147
]
111678713
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lcq00536
]
111678713
Exosome [BR:
lcq04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of other cancer cells
111678713
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lcq00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
111678713
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
C4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111678713
NCBI-ProteinID:
XP_046802837
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(8862199..8891945)
Genome browser
AA seq
1825 aa
AA seq
DB search
MLPLPRGLLGLSGLNAPKRHGLLLPTVVVILLTFALFGNIADAKQPDQKCNGVVCDCKGL
KGRPGDIGVPGFQGYEGPAGEFGPMGPPGRPGEWGDPGEYGGPGEKGHRGDPGLAGLPGA
PGPRGRQGEDGPQGPRGIDGCDGKTGQQGAPGVPGRHGGRGEVGKPGPPGPTGDAGEGGI
NSKGTKGSRGDRGTDGYDGQQGYQGMKGYKGDTGFPGLEGAKGESGPKGYKGEMAEPADL
QLQEQGQQGDKGEPADAEEGEWNPTPVIKGEKGEKGIRGDSGIRGPQGEIGELGRQGLPG
IRGDTGEAGERGKPGKPGDPGFPGAKGVKGAPGYNGRDGEDGLPGQIGDDGYNGIPGVQG
PPGPPGIYDPNLDISLPGPIGPQGDIGEPGLPGLSGIPGRPGRQGPRGPTGPPGDAGLDG
LPGRRGASIKGDDGDFGLMGPPGPMGPPGKPGPIGRAGEPGNPGKNVLGPKGFAGQPGIP
GLDGYRGDRGEMGLPGEKGLPGLGVDKVGPAGPDGMPGPRGQPGVDGIPGYRGMPGDKGM
RGDDCGICPAGPKGIPGIRGDAGYPGAHGARGLSGITGERGFKGLPGRPGLVGFKGIRGT
DGIPGESGQAGLPGRPGQILKTGSRRAPETGDIGDNGERGMQGETGDRGARGIDGLRGFK
GETGLRGEYGDAGYAGRDGAPGRHGKDGRPGRDFTTPKIYLIGDPGYDGRKGEMGEPGDV
GPKGEKGEPKPGEIYENKGQHGDKGYPGEPGPPGPKGEAGTKGAEGPRGDIGFPGESIPG
PPGFKGWPGIIGDIGLHGSPGLPGRNGAPGIDGLSGSKGVRGDPGPNVLAGEIGPDGLPG
PAGITGDIGFNGFPGPSGKPGVKGVKGAKGDNGPFGLQGLPGTKGMRGDTLMGRPGMAGA
PGRDGRVAPHGRKGQKGETGYPGPDGVQGAKGNIGYTGRRGPVGDKGFAGVPGLLGMQGI
VGIPGVQGDRGDLGEDGRHGDMGPRGAIGNMGPKGQSGDIGGFGRPGFDGVPGRKGQLGD
KGFMGPVGPKGFASRSGIKGEAGDMGYTGPRGYDGLPGEKGIQGLPGDEAYGNDGLPGRK
GETGAPGIPGLDGLPGLKGERGDLGVMGFTGEVGDRGDDGVPGYPGRHGAPGPKGAVGVI
GPMGAKGEVGERGEIGFAGYDGPRGDRGETGMPGPFGPQGEQGDEGMPGRPGVLLVAYAE
VGQKGEPGFRGEMGPMGEPGIDGAPGYPGRKGEYGDIGLAGVPGVDGYAGAKGERGDKGY
PGAPGITPDFAEPGDEGDTGYDGLSGRPGRVGPKGAPGDMGEYGMDGEMGEMGISIMGIK
GVTGDIGYPGPMGRNGLHGMAGLKGMMGETGPRGMRGDAGMVIHGLRGDKGDTGPQGAPG
FDGRKGERGMPGTPGRTGPVGPRGPRGPVGDPGWNGGDGLDGLRGVKGEPGVTFPFNMAR
KGDRGEHGLDGFKGAMGDMGVEGEMGFQGARGLKGYQGDQGLMGLAGADGPKGERGMIGA
PGLTGLQGIRGPKGYTGEPAPPPPRAKSRGFIFTRHSQSVYVPKCPANTQKLWEGYSLAG
NIGNSRTVGQDLGRAGSCLMRFSMMPYMICDINNVCNYGQTNDDSLWLGTAEPMNVAMTP
LQPSEIQKYISRCVVCETSTRVIAMHSQSMSIPECPGGWEEMWTGYSYYMTTTDNTGGFG
QNLVSPGSCLEEFRAQPVIECHGQGRCNYYDPVFSFWLAVIEEQEMWSMPRQQTLKKDQT
SKISRCTVCRRRNDSYITRQATLDSSAREFRRGRERVVPAPQAAPAPPPSLRRTSTYNSR
RPAPGNYGYGRVNRYRYPRSDTTAP
NT seq
5478 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgccattacccagaggccttttgggtctctcgggtttgaatgcccctaagaggcat
ggtctactgttgccaacagtagttgtaattcttttaacatttgccctttttggaaatatt
gctgatgctaagcaacccgatcaaaagtgtaatggtgttgtgtgcgactgtaaaggtttg
aagggccgaccaggtgatattggtgtgcccggttttcaaggttatgaaggtcccgctggt
gaatttggtccaatgggtccacccggtcgtcctggcgaatggggtgatcctggtgagtac
ggtggtccaggtgaaaaaggtcatcgtggcgatcccggtttagctggattacctggagct
cctggtcctcgtggtcgtcaaggtgaagacggtccacaaggtcctcgtggtattgatggt
tgtgatggtaagactggtcagcaaggtgctcccggtgttcccggtagacatggtggtcgc
ggtgaagttggtaaacctggtcctccaggtcccactggtgacgccggtgaaggtggtatt
aactccaagggaaccaagggtagtcgtggtgatcgtggtactgacggttacgatggtcaa
caaggttatcaaggcatgaagggttataagggtgataccggtttccctggtttagaaggc
gcaaagggtgaatctggtcccaaaggttacaagggtgaaatggctgaaccagccgattta
caattgcaagaacaaggtcaacaaggtgataagggtgaaccagctgatgccgaagagggt
gaatggaatccaacacctgttatcaagggtgaaaaaggtgaaaaaggtatacgtggagat
tccggtattcgcggtcctcagggtgaaattggtgaacttggtcgtcaaggtctgcccggt
attcgaggtgatactggtgaagctggtgaacgtggtaaacccggtaaacctggtgatccc
ggctttcctggtgctaaaggtgttaaaggtgctcctggctacaacggtagagatggtgaa
gatggacttcctggtcaaattggtgatgatggctacaacggtatccccggtgtacaaggt
cctcctggtccacccggtatctacgatcccaatttagatatttcattgcccggtcctatt
ggtccccaaggtgatattggtgaacctggtttgcccggtttgtcaggtatacccggtcgt
cctggtcgtcaaggtccacgtggtccaactggacctcctggtgatgctggtttggatggt
ctacctggtcgtcgtggtgccagcataaagggtgacgatggtgattttggtttaatgggc
ccccctggtcctatgggacctcctggaaaacccggtccaattggccgtgctggtgaacct
ggtaatcccggtaaaaatgtacttggtcccaaaggttttgctggccaacctggcattccc
ggtctcgatggctatcgcggtgaccgtggtgaaatgggtctgcctggtgagaaaggttta
ccaggtttaggtgttgacaaagttggtcctgccggtccagatggtatgcccggtcctcgc
ggtcaacctggcgttgacggtattcctggttatcgtggtatgcccggtgacaaaggtatg
cgtggtgatgactgtggaatttgccctgctggtccaaaaggtattcctggtattcgtggt
gatgctggttatcctggtgctcatggagctagaggtctttcgggtattacgggagaacgt
ggtttcaagggtttgcctggtcgtcctggtctagttggtttcaaaggtattcgtggtacc
gatggtattcccggtgaatctggtcaggctggtctgcccggtagacctggtcaaatttta
aaaactggtagcagacgtgcaccggaaactggcgatattggtgataacggcgaacgtggt
atgcaaggagaaacaggtgaccgtggtgctagaggtattgatggacttcgtggctttaag
ggtgaaactggtttgcgtggtgaatatggtgacgctggttatgctggtagagatggtgct
cctggtagacacggtaaagatggaagacctggtcgtgattttactacacctaaaatttat
cttattggtgatcccggttacgatggacgcaaaggtgaaatgggtgagcctggtgatgtt
ggtcctaaaggtgaaaagggtgaacctaagcctggagaaatttatgagaataaaggtcaa
catggtgataaaggttatccaggtgaacctggtccacccggtccaaagggagaagctggt
actaagggtgctgaaggccctcgcggtgatattggttttcctggagaatcaattcctggt
cctcctggtttcaagggttggcctggtattattggtgatatcggtttacatggctctcct
ggtttaccaggtcgcaatggtgctcctggtattgatggactcagcggtagtaaaggtgtt
cgtggtgatcccggtccgaacgttttggccggtgaaatcggtcctgacggtcttcctggt
ccagctggtatcaccggtgatattggttttaatggattccccggtccatctggcaaacct
ggtgttaaaggcgttaaaggtgctaagggtgacaatggtccattcggtctacaaggtctg
cccggtaccaagggtatgcgtggtgatactttaatgggcagacctggcatggctggtgca
cccggtcgcgacggtcgtgttgctcctcatggccgcaagggtcaaaagggtgaaactggc
taccccggtcctgatggtgtccaaggtgccaaaggtaatattggttatactggtcgtcgt
ggtcctgttggtgacaaaggtttcgctggtgttcctggtcttttgggtatgcaaggtatt
gttggcattcctggcgtacaaggtgatcgtggtgatcttggtgaagatggtcgtcatggc
gatatgggtccaagaggtgctatcggtaacatgggtcctaaaggtcaaagtggtgatatt
ggtggtttcggtcgtcctggctttgacggtgtgcctggccgtaaaggtcaacttggtgat
aaaggtttcatgggtcccgttggtcccaaaggttttgcatcccgcagcggtattaagggt
gaggctggagatatgggatatacaggtcctcgtggttatgatggtttacctggtgaaaag
ggtattcaaggtcttcctggagatgaagcttacggaaacgacggtttaccaggaagaaaa
ggtgaaactggcgcacctggtattcccggccttgatggtctccctggtcttaaaggtgag
cgtggtgaccttggtgtaatgggtttcactggtgaagtaggtgatcgtggtgatgatggc
gtccctggatatccaggcagacatggtgctccaggtcctaaaggtgctgttggtgtaatc
ggtccaatgggtgcgaagggagaagtaggtgaaagaggcgagattggttttgctggttat
gatggacctcgtggtgatcgtggtgagactggtatgcctggtccatttggaccccaagga
gaacagggtgatgaaggtatgcctggtcgtcccggtgtgttgttggttgcttatgccgaa
gtaggccaaaagggtgaacctggctttagaggcgaaatgggtccaatgggtgaaccaggt
attgacggagccccaggttaccctggtcgcaagggtgaatatggtgatatcggcttagct
ggtgtccctggcgttgatggttacgccggagctaagggtgaacgtggtgataagggttat
cccggtgccccaggtataacacctgactttgctgaacctggtgatgaaggtgatactggt
tacgatggtctttctggacgtcctggtcgcgtaggacccaaaggtgctcctggtgatatg
ggcgaatatggtatggacggagaaatgggtgaaatgggcattagcattatgggtattaag
ggtgtcactggtgatattggttatcctggcccaatgggacgtaacggtttacacggtatg
gctggtttgaagggtatgatgggtgagacaggtcccagaggtatgcgtggtgatgctggt
atggttatacacggtttgcgtggtgacaaaggtgatactggaccccaaggtgcaccaggt
tttgatggtcgcaaaggtgaacgcggtatgcccggtaccccaggccgcactggacccgtc
ggtcctcgtggtcctcgcggccctgtcggtgatcctggttggaacggaggagatggttta
gatggtctcagaggtgttaagggtgaaccaggcgtaacattccccttcaatatggctcgt
aaaggcgatcgtggtgagcatggtttggatggtttcaagggtgcaatgggtgatatgggc
gttgaaggtgaaatgggtttccaaggtgctcgcggcttaaagggctaccaaggtgatcaa
ggtctgatgggtttggccggcgcagatggtccaaagggtgaacgcggtatgatcggtgcc
cctggtttgactggtttacaaggtattcgtggtcctaagggttacactggtgaaccagct
ccaccaccaccacgcgccaagagtcgtggcttcatctttacccgtcattcacaatccgtc
tatgtgccaaaatgtccagccaacacccagaaactctgggaaggttattcgctcgccggt
aatatcggtaacagtagaactgttggccaagatttaggaagagctggttcctgtttgatg
cgtttcagcatgatgccctacatgatttgtgacattaacaacgtctgcaattacggacaa
accaacgatgacagcttatggctcggtacagccgaacctatgaatgtcgctatgacaccc
ctacagcccagtgaaattcaaaaatacatctcacgttgcgttgtatgcgagacctcaact
cgtgttatagctatgcacagtcaaagtatgagtatacccgaatgtcccggaggttgggaa
gaaatgtggaccggttacagttactatatgacaaccactgataacactggaggctttggc
caaaatctggtttctcccggttcctgtttggaagaattccgtgctcaacccgttatcgaa
tgtcatggtcagggacgttgcaattattatgatcctgtattctcattctggttggcggta
attgaagaacaagaaatgtggtcaatgcccagacaacaaactttgaaaaaggatcaaact
agcaaaatcagcagatgtactgtttgtcgtcgccgtaatgattcttatattacacgtcaa
gccaccttagactcatcggctcgtgaattcagacgtggccgtgagcgtgttgttcccgcc
cctcaggctgccccagcaccaccaccatcattacgtcgtacaagcacctacaacagcaga
cgacctgctcccggcaattatggctatgggcgcgtcaatcgctaccggtatcccagatca
gataccactgccccctag
DBGET
integrated database retrieval system
