Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly): 111685712
Help
Entry
111685712 CDS
T06013
Name
(RefSeq) protein Smaug isoform X1
KO
K27396
protein Smaug
Organism
lcq
Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
lcq03019
]
111685712
Messenger RNA biogenesis [BR:
lcq03019
]
Eukaryotic type
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Other 3'-5' decay factors
111685712
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PHAT
SAM_1
SAM_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111685712
NCBI-ProteinID:
XP_046807040
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(52060081..52081953)
Genome browser
AA seq
1353 aa
AA seq
DB search
MKYTTNTIENQTNTTNANNNINLVTSSSTSSSSSSSASSTSSCLSTASTTNGGGVNNNNN
NTTNTTGNALFCEQVNTVTNLFEKWNDCERTVVMYALLKRLRYPSLKFLQYSIDNTLTQN
MGSTSNLSTVVVDMNANNPSYLQNLLNAYKTFHLGDLVDTLSSSSSDKDSMPCYGSDFQI
THCDERKLYSKKEDILHEVLNMLPLLKPGNDEAKMIYLSLIPLAVKDTIRQIVPTELVQQ
IFSYMLIHPAVSSDDRRNLNVWLRHLEDHLQNFNNCPPLNMSGGSGGMPATHTNYMQNQN
SLVGGLLLDNPTMTTSGSSVTSSSSSAMSISSTASNVSVSSSSFGNLTQNCNASTISNNS
MMGSRNNDWQTIQPPSRQQQQQQQQTQLTKSALGSDWSSLVVKPNTVINNTSVNVVNAGT
NNSGGVVGGMVVGTTIADQLCDNLNGITLNDLASSQNSLGINIVGANIVDSLATVDNNSS
SLVNGVAAAAASATAAAVTSVATTPNIFGPQTNPIINIINNNNNCSGQLNGIDDHDTSFS
KNGTEILDFDPNTNNMQNCDSCSNSSSSNVGQMQSHQQMGYASILMSNCADHLDINRWTL
DSKFAALKTRRSNSLTTQTISSSASSSNSSVITVNDNCSNSTENLAQFANKPRSFSLSIE
HHRGSLTNSGSDTRLDDFKPNYIKFQTRNVGMSSIGLWLKSLRLHKYIELFKNMTYEDML
QITEEYLQSLGVTKGASHKLALCIEKLKERSSHLSKMEQELINGQLKLQAAVEELANIVL
TPMKPIELVNSNCGEDNVALMFLKVVDLVCTIAQKDPYAVVDDDNISVILWILDRSIHNE
AFVNHVNQLKDLKFKLSKLKMSLTPKIHHTKNGSNGNLNKPSFQFSRWNGKSRKCDQKNG
SNDRINHRKNSNDMLNFSLSCLQQQHHHNQQMQQQQQQQQQQQQQQINEYDKYHNNNNNN
NNNNNNNNQYKNSAYQNYQQQQQQIKQQQQLQQQQQQLQPQMLQQNTHFPALPQQQQQQQ
NQQQQHRRSLNNLIVVSGGPQQPQKMMFKPGQGILSNTNMTNDDLSIDVMKSNQQQQQQQ
SRKASLTSLNNSNNSSNSLNASNLETLQQQQQSPAANASSMPKKTMAAVVMVSNDLMHTT
ATPTTVAATSAGSTTANVANLAPPPPPPQILINNNNTTQNTNTNHNNMLQHHHHQQQQQQ
HHALQQQQQQLKLLAAAAAAVGNSCSLNVGSLNTNNSNSNNLTGIAIAGGNSSNNIVCNN
ICSTNNNNCSNSHHHTCVNNCCSNCNSHQLQINLKLPPLNENYQQQHHHHHSPPTISDVL
KTSLNHNTDPLNDITSLEQLETLCLQMTEQAIN
NT seq
4062 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatatacaacaaatacaattgaaaaccaaaccaatactacaaatgccaataacaac
attaatttagtgacctcatcatcaacatcctcatcttcgtcatcgtcagcatcttccacc
tcatcatgcctgtccacagcatcaacgaccaatggtggtggtgttaacaacaacaataac
aacaccacaaataccaccgggaatgcattattctgtgaacaggttaatacggtaacaaat
ctcttcgagaaatggaatgattgtgaacgtaccgttgttatgtatgctttacttaaacgt
ttacgttatccaagcctaaaatttcttcaatattccattgataatactttgacacagaat
atgggttcaacatccaatctaagcaccgttgttgtagatatgaatgccaacaatccatcg
tatttgcaaaatctcttaaatgcctataagacatttcatttgggcgatttagtcgatact
ctctcatcatcgtcctctgacaaagattcaatgccttgctatggatctgattttcaaata
acacattgcgatgaacgcaaattgtatagtaagaaagaggatattttacatgaggtattg
aatatgttacctctactcaagccgggaaatgatgaagctaaaatgatttatctatcgttg
ataccattggccgttaaggatacgatacgacaaattgtacccactgagttggtgcaacag
atattttcgtatatgcttatacatccagcggtgtcgagtgatgatcgcagaaaccttaac
gtttggctgcgccatttagaggatcatcttcaaaactttaacaactgtccaccgctcaat
atgagtggtggtagcggcggtatgccagcaacacacacaaactatatgcaaaatcaaaat
agtcttgtgggtggactcttgctagataatccaacaatgacaacatcaggttcatcagta
acatcctcatcatcgtctgcaatgtcaatatcttcgacagcctccaatgtttcggtatcc
tcatcatcatttggcaacttgacacagaattgtaatgcatctacaatttctaacaactca
atgatgggatcacgcaataatgattggcaaactatacagccgccaagtagacaacagcaa
caacaacagcagcaaacacaattgactaaatctgctttaggttcggattggtcttcgctt
gtggttaaacccaatacagtgattaataatacaagtgttaatgttgttaatgccggaact
aataatagtggtggtgttgttggtggcatggtagttggtacaactattgccgatcaactc
tgtgataatttgaatggtattacactgaatgatttagcctctagtcaaaatagtttaggt
atcaacattgttggcgccaacattgtagattcgctggctacggtcgacaataacagttct
tcgcttgtcaatggtgtggcagcagcagctgcctctgctacagccgctgccgttacatct
gtagctacaacaccaaatatttttggaccacaaacaaatccaattattaacataattaat
aataacaacaattgtagtggtcagctaaatggtatcgatgatcatgacacttcattctca
aagaatggtacagaaatcttagattttgatccaaatacaaataatatgcagaactgcgat
agttgcagtaacagtagcagcagtaatgtaggacaaatgcagtcacaccaacaaatgggc
tatgcctctatattgatgagcaattgtgccgatcacttggatataaatcgctggactttg
gatagtaaatttgctgctttaaagacccgacgttctaatagtcttaccactcaaacgatt
tcctcctcggcttcttcctccaattcgtcggttattaccgtcaacgacaactgttccaat
tcaaccgaaaatttagcacaatttgccaataaaccacgtagtttttcactttccattgaa
catcatcgcggttcgttaacaaatagcggttctgatacccgtctagatgacttcaaacca
aattatataaaattccaaacacgcaatgttggcatgtccagcattggtttatggttgaaa
tcgctacgtcttcataaatacatcgaactctttaagaatatgacctatgaagatatgttg
caaatcaccgaggaatatttgcaaagtttaggtgttaccaaaggtgcttcccataagttg
gcattgtgcattgaaaagttaaaggaacgttcgtcgcatttgtctaaaatggagcaggaa
ttaatcaatggtcagcttaagctgcaggcagctgttgaagagttggctaatattgttttg
actcccatgaaaccgattgaattggtcaatagcaattgtggtgaggataatgtggcttta
atgtttttgaaggtcgtcgatttggtctgcacaattgctcaaaaggatccctatgctgtg
gttgatgatgataatattagtgttattttgtggattttagatcgatccatacataacgag
gcatttgttaatcatgtcaatcaattgaaggatttaaaattcaaactatccaaattgaaa
atgtcattaactccgaaaattcatcataccaaaaatggtagtaatggaaatttaaataaa
ccaagttttcaattttccaggtggaatggcaaatcacgcaaatgtgatcaaaagaatggc
agtaatgatcgtataaatcatcgtaagaattcaaatgatatgctgaatttctctctaagt
tgtttgcaacagcagcatcatcataatcagcaaatgcagcaacaacaacagcagcagcaa
caacaacaacaacaacagattaatgaatatgataaatatcataataataacaataataac
aacaataataataacaacaataatcaatataaaaattcagcatatcaaaattatcaacaa
caacagcaacaaattaaacagcaacaacaactgcagcagcaacaacaacaattacaaccc
caaatgttgcaacaaaatacacatttcccagctttgccacaacagcagcaacaacaacaa
aatcagcaacaacaacatagacgttctcttaacaatttaattgttgtctctggtggtccc
caacagcctcagaaaatgatgtttaaaccaggtcaaggtattttatctaatacaaacatg
actaatgatgatttaagcattgatgtgatgaagtcaaaccaacagcagcaacaacaacaa
tctcgtaaagccagtttaacatctttgaacaatagcaacaacagcagtaacagtttaaat
gccagcaatttggaaacattgcaacaacagcagcaatcacctgctgctaatgcatcttca
atgccaaagaaaaccatggctgctgtcgtaatggttagtaatgatctcatgcatacaaca
gcaacaccaacaacagtagcagctacatcagctggctcaacaactgctaatgttgctaat
cttgctccacctcctccaccaccccaaattcttataaacaataataatacaacacaaaac
actaacactaatcataataacatgttgcaacaccaccatcaccaacaacagcagcagcag
catcatgctctacaacaacagcaacagcaattaaaacttttagcagcagctgctgctgct
gttggcaattcttgtagtcttaatgttggtagtcttaatactaacaattctaattctaat
aatctaactggcattgctattgctggtggtaatagtagtaataatattgtttgcaacaac
atttgtagtacgaacaataataattgtagcaatagtcatcaccatacttgtgttaataat
tgctgcagcaattgcaacagtcatcaattacaaattaatttaaaattacctcctcttaat
gaaaactatcaacagcagcatcatcaccatcattctcctcccacaatttcagatgttttg
aaaacatctctaaatcataatacagatccgttaaatgacataacaagtttagaacaattg
gaaactttgtgtcttcaaatgacagaacaggctataaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
