Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly): 111686678
Help
Entry
111686678 CDS
T06013
Name
(RefSeq) putative neural-cadherin 2 isoform X1
KO
K27892
neural-cadherin
Organism
lcq
Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04515 Cell adhesion molecules [BR:
lcq04515
]
111686678
Cell adhesion molecules [BR:
lcq04515
]
Cadherins
Cadherin related
111686678
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin
Laminin_G_2
Laminin_G_1
Ig_Shg
CADH_Y-type_LIR
EGF
hEGF
Fibulin_C
Cadherin_CELSR2_9th
EGF_Teneurin
EGF_2
cEGF
PKD_2
EGF_DL_JAG
Chordopox_A13L
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111686678
NCBI-ProteinID:
XP_046802606
LinkDB
All DBs
Position
2:29306396..29664625
Genome browser
AA seq
1742 aa
AA seq
DB search
MDSTAFNIQMHIWKFLLIVTKFVRIGIADKNDSPPYFDKFLYETEIDENADLQTTVLTVN
AKNHNESSSIRYSITGGNIGNAFGVHNNTGAIFVASPLDYETRPRYELRLEASRSRKTNY
TTVIINVRDVNDNPPTFDRQTYRTQITEEDDRNFPKRILQVTATDGDVDRPINIVYFLTG
QGIDPDNTANSKFDINRTTGDIFVLKPLDRDQPNGRPQWRFTVFAQDEGGEGLVGYADIQ
VNLKDINDNTPQFPQGVYYGNVTENGTSGLAVMTMSAVDYDDPNEGTHAKLIYSIEKNVI
EEETGAPIFEIEPDTGVIKTAVCCLDRERTPDYSIQVVAMDGGGLKGTGTASIRVKDLND
MPPMFTKDEWFTEVDETNGTYIPETPILTVTVQDEDETNSFQYKVVPNSGLGSDKFAMVR
NTDGTGSLKIIQPLDYEDPMQSSGFRFRIQVNDMGNNDSDKYHLAYSWVVVKLRDINDNS
PHFERERIELSVYEDTKVGTILEQFKATDADQGGKSKVSYKLVRASNRKRQFAISDKGAI
SIQRSLDRETNERHQLEILAVDDGVVPRTATAVLTVIVKDVNDNAPVFKEDYRPVLPENV
SPRKFIEVAAKDADDRARGNGGPFTFRMDPMASDVIRSSFKLEYDRRADNGNGAAIISSL
RPFDREQQKSYLIPIEIKDNGSPAMTGTSTLTVIIGDVNDNKMLPGSKEVLVYNYQGQSH
DTPIGRVYVHDLDDWDVVDKKYYWEQQEHQRFKLDTDTGIVNMKAGTRRGRYNLRFKVYD
REQGQVDVPSNMTVIVRDITQEAVQQAGSMRLQGISDEEFVRTWDFMQHKQMRSKLERFR
DKLAELLYTERDMVDVFSVQTKSEGYTDVHFSARPANQQPYFKAVRLNGVVLMQREEIER
ELGLNITMVGIDECLQEPGKCEGSCTNRVEINRLPYTVNVNKTALVGVRLDITAECYCKA
RNYSKEDSCRTLNCFNGGRCVETRNGPRCVACPIGYNGPRCQQNTRSFKGNGWSWYPPLQ
LCEESHLSLEFITKEADGLILYNGPIVPPKADELVVTDFIAIELEQGYPRLLIDFGSGTL
ELRIKTKKTLDDGVWHRLDIFWNSENIRMVVDFCRSADVYEMEDGSTPEFDDNTCQAQGT
IPPFNEALNLNTPLQLGGLYRQHFDQSLFHWQYAFTSKGFDGCIRNVVHNSEHYDLAFPA
LARNSYPGCPQTDEVCLKTDHTARCWEQGNCVASLVQAKCHCQPGWMGPMCNIPTIPTTF
KPQSYVKFALSFEPDRFSTQLQLRFRTREMQGEIFRVSDQHHREYAILELQQGHLQFRFN
LNSLRPEEHNVALTSITVNDGQWHVVKVSRYGSAALIELDGGEGRRYNETFNYHGHQWLT
IDKQEGVYAGGKAEYTGVKTFEVLGDFQRSCLDDIRLDGKHLPLPPSMNGTQWGQATMAR
NLERNCPSNRPCSNIICPDPFDCVDLWNEYECTCSEGRVMSADTKGCVDRNECLDMPCLN
GATCINLEPRLRYRCICPEGYWGENCELVQEGQRLKLSMGALGAIFVCLIIILILALIFV
LYNRKRKTTNKKRNGPEKDVRETVISYDDEGGGEDDMTAFDITPLQIPIGQGGNMPPDIA
ACKVPIIYPVVTLMPGQELNVGFLMEERKKRCDKDINAPPFDDLRNFTYEGSGSIAESLS
SLASGTDDENQDFNFLETWGPRFNALAALYLQDKTKTKTTTTTTAAVTTATADVVANENG
VL
NT seq
5229 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggactcaacagcttttaatattcaaatgcatatttggaaatttctattaattgttaca
aaatttgtacgtattggtattgccgataaaaacgattcaccgccttattttgataaattt
ttatacgagactgaaattgatgaaaatgccgatttacagacaacagtactcacagttaat
gccaaaaatcacaatgagtcctcgagtattcgatactcgatcacaggcggtaacataggc
aatgcttttggtgtacataataatactggagctatattcgtagcatcacccttagattat
gaaactagaccaaggtatgaattacgcttggaagcttcacgtagtcgtaagacaaattac
accaccgttataataaatgtacgggatgttaatgataatccaccgacatttgatcgtcaa
acatatcgtacacaaattacagaagaagatgatcgtaattttcctaaacgtatattacag
gttactgccaccgatggcgatgtagatagacccataaatattgtatattttctcaccggt
cagggtatagatcctgacaatacagctaatagtaaatttgatataaatcgtacaacgggt
gatatttttgttttaaagccccttgatcgcgatcaaccgaatggccgaccacaatggcgc
tttacagtatttgcccaagatgagggcggtgaaggtctagtcggctatgccgacatacaa
gttaatctcaaagatatcaacgacaatacaccacaatttcctcagggcgtttattatggt
aacgtaacggaaaatggcacctccggtttagcagtgatgaccatgtcagccgtagactat
gatgatcccaacgagggtacacatgccaaacttatatattcgatagagaaaaatgtcatc
gaagaagagacgggagcaccaatattcgaaatcgaacccgatacgggtgttatcaagaca
gcagtctgttgtctggatcgtgagcggacgcccgactactccatacaagtggtagccatg
gatggtggtggacttaagggtactggtacggcttctataagagtaaaagatttaaacgat
atgccacccatgtttaccaaggacgaatggttcacggaggtggatgaaacaaatggcact
tatataccagaaacacctatactaacggtgacagtgcaggatgaggatgaaacaaattca
tttcaatataaagtagtgcccaatagtggtttgggttcggataaatttgcaatggtacgt
aatactgatggtactggttccttgaaaatcatacagccgttggactatgaagatcccatg
cagagcagtggttttcgttttcgcatacaggtcaacgatatgggcaataatgatagtgat
aaatatcatttggcctattcatgggtggtggttaagctgcgtgacatcaatgataactca
ccgcatttcgagagggaacgcatcgaattgtcggtgtatgaagatacaaaagttggcacg
atattggaacagttcaaagctaccgatgccgatcagggtggcaagagtaaggttagctat
aaactggtaagagccagtaatcgtaaacgtcaatttgctattagcgataagggagcgata
agcatacaaagatctttagatcgtgagaccaacgaacgacatcaactggaaattttggcg
gtagatgatggtgtagtaccgcgcacagcgactgcggtacttacggtcatcgttaaagat
gtcaatgataatgctcccgtatttaaggaggattatcgtcccgttttacctgaaaatgtt
agcccgcgtaaatttatagaagtggcagctaaagatgctgacgatagagcgcgagggaac
ggaggacccttcacatttcgtatggatcctatggccagcgatgtgataagatcgagtttt
aagctggaatatgatagaagagctgataatggtaatggcgctgcgattatttcttctttg
cgacccttcgaccgtgaacaacaaaaatcctacctcatacccatcgaaatcaaagacaat
ggttcaccagccatgactggcacttcaacattaacagtaattataggcgatgttaatgat
aataaaatgctgccaggcagcaaggaagtgctggtctataattatcagggccagtcacat
gacacccccattgggcgggtgtatgtccacgatctagatgattgggacgtggtggacaaa
aagtactattgggaacaacaggaacatcaacgtttcaaattggacaccgatacgggtatt
gtaaacatgaaagctggcacccgtagaggtcgctacaatctgcgctttaaagtttatgat
cgtgagcagggccaagttgatgtgccatcgaatatgacggtcatagttcgagatataacc
caggaagctgtacagcaggctggttctatgcgcctacaaggtattagtgatgaagaattt
gtgcggacttgggatttcatgcagcacaagcaaatgcgttccaaactggaaagatttcgc
gataaactggctgaattactttacaccgagcgtgatatggttgatgtgtttagtgtccaa
actaaaagtgaaggttatacagatgttcacttttctgcccgccctgccaaccaacagcct
tactttaaggccgtcagattgaatggtgtagtgctaatgcaacgtgaagaaatagagcgg
gagctgggtctgaacatcacaatggtaggcatagatgagtgtctgcaagagccgggtaaa
tgtgagggctcttgcaccaatcgtgtagaaattaatagacttccttatacagtcaatgtt
aacaaaactgccttggtaggcgtaagactagacataaccgccgaatgttattgcaaggcc
cgcaattacagcaaagaagactcctgccgcacactgaactgttttaatggtggccgctgt
gtggagacgcgtaacggtccacgttgtgtcgcctgtcctataggctataatggtcctaga
tgtcaacaaaatacccgcagttttaaaggaaatggctggtcctggtatccgcctcttcag
ctatgcgaagagtcacatttgtctttggagtttataaccaaagaagccgatggcttgatt
ttatacaatggtcccatagtacctcccaaagctgacgagctggtagtcaccgactttata
gccattgaactggaacagggttatcctcgtttacttatagactttggctcgggcacttta
gaattgagaattaaaactaaaaagactttagacgatggtgtatggcataggctggacata
ttttggaattccgaaaacatacgcatggtagtggacttttgtcgttcggcagatgtctat
gaaatggaggatggctctactcctgaatttgatgataacacttgtcaagctcaaggcact
ataccaccttttaatgaggctctcaacttaaatacacccctccaattgggtggtctttat
agacagcatttcgatcagtcgctcttccactggcaatatgcctttacctctaaaggattt
gatggctgcataagaaacgttgtgcacaattcggagcattatgatttagcatttcccgcc
ttggcccgcaatagctatcccggctgtcctcaaactgatgaggtttgcttgaaaaccgat
cacactgccagatgttgggaacaaggtaactgtgtggccagtttagtgcaggcaaaatgc
cattgtcagcccggctggatgggacccatgtgtaacatacccaccatacctacaacgttc
aaaccccaaagttatgtcaaatttgccttatcctttgaacccgatcgtttctccacccaa
cttcagctacgttttcgtacgagggaaatgcaaggtgaaatctttcgtgtctccgatcaa
catcatcgtgagtacgccatattggaacttcagcagggacatctacaattcagatttaat
ttgaactcattaaggccagaagaacacaatgtcgccctcacctccatcaccgtcaatgat
ggtcaatggcacgtggtaaaagttagccgttatggttcagctgctcttatcgaactcgat
ggcggtgagggtagacgttataatgaaacatttaattatcatggccatcagtggctgacg
attgacaaacaggagggtgtgtatgccggtggcaaggccgagtatacaggcgttaagact
tttgaagttttgggagattttcaacgttcctgtctagatgatatcagattggatggcaaa
catttgcctttgccgccctccatgaatggcacacaatggggacaggcaacaatggctaga
aatttagaacgtaattgtccttcaaatcgtccatgttcgaacataatatgtccagatcca
tttgattgtgttgatttgtggaatgaatatgaatgcacctgcagtgaaggtcgtgtcatg
tctgccgatacaaagggatgtgtagatcgtaatgagtgtctggatatgccatgtcttaat
ggtgccacttgtataaatctagagccacgtttacgttatcgttgcatatgtcccgaaggt
tattggggtgaaaattgtgaattggtgcaggagggtcaaagactaaagttgagcatgggt
gcattgggtgccatctttgtgtgtcttattattattttaattttagctcttatctttgtt
ctgtacaatcgtaaacgtaaaacaacaaataaaaaacgtaatggcccagaaaaagatgta
cgtgaaactgtgattagttacgatgacgaaggtggtggtgaggatgatatgacagcattt
gatattacacctctacagatacccataggacagggtggcaatatgccacctgacatagct
gcctgtaaagtgccaataatatatcctgttgttaccttaatgcccggccaagaattaaat
gtgggctttttaatggaagaacgtaaaaaacgctgcgataaagatataaacgcgccaccc
tttgatgatttaagaaatttcacttatgaaggtagtgggagtatagctgaatcattaagt
tcattggcatcaggcactgatgatgagaatcaagactttaattttttggaaacgtggggt
ccacgttttaatgccttggcagcattatatctacaagacaaaacgaaaacaaaaacaaca
actacaactacggcagcagtaacaacagcaacagctgacgttgtagctaatgaaaatggt
gtattataa
DBGET
integrated database retrieval system