Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly): 111687026
Help
Entry
111687026 CDS
T06013
Name
(RefSeq) cohesin subunit SA-1 isoform X1
KO
K06671
cohesin complex subunit SA-1/2
Organism
lcq
Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
lcq03036
]
111687026
Chromosome and associated proteins [BR:
lcq03036
]
Eukaryotic type
Sister chromatid cohesion proteins
Cohesin complex
111687026
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HEAT_SCC3-SA
STAG
SCD
PI3K_P85_iSH2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111687026
NCBI-ProteinID:
XP_023305202
LinkDB
All DBs
Position
5:45725446..45731473
Genome browser
AA seq
1128 aa
AA seq
DB search
MMARRGGKRIRMDDPPPDYEEQGENLNDSISDGDSPTKRMTRLRARGGVRDKPPIIDEDE
DDFFAPVVRKRKAQAPRKPPGEGTGRREKIDRPRKEHIDKEQERIDMERDVTTDENSLYF
IVRHSKSPIASIVDDWIEQYKINRDTALIALLQFFINASGCKGKIPEDTEHPMDHTAVIR
KMTEEFDEESGEYPLIIPGQQWKKFKMNFCDFVQTLVKQCQYSIIYDQFLMDNVISLLTG
LSDSQVRAFRHTATLAAMKLMTALVDVALLVSNNFENAAKQYEAERLKSRDRRASDRLES
LMAKRAELEENMDEIKNMLTYMFKSVFVHRYRDTLPDIRAICMSEIGVWMENYPQNFLDD
SYLKYIGWTLHDKVGEVRLRCLQALLPLYDKEELKGKLELFTSKFKDRIVAMTLDKEFEV
AVHAVKLVISILKIHPDILADKDCEIVYELVYSSHRGVAQAAADFLNVRLFHLTADMEET
KTKRGKLRLPNTPLIRDLVQFMIESELHEHGAYLVDSFMDNNTMVKDWECMTDLLLEEPG
PNEEVLDNKQESTLIEIMVSSVKQAATGEAPVGRASNRKISLSAKELKAIQDEKVRLTEH
FIVTLPSLLEKYQADSEKLTNLLSIPQYFELDIYTTNRQEANLQSLLEKMSYIMSVHTDR
DVLETCAKTLEYLCREGSATYTRCDVARSNIIDNAVNKYKDSIEDWRNLIAGEELPNEDE
IYNVISSLKVVSILYSSHNLNPWNLFDSLFQDVDECQSKENPGRNLPNEALTYCIEACYF
SISWGLYYIENQCETSQIPEAVAELRKNLDKYMFACYELTRDGPTDQIQEAAYQSICDLL
ITFSDQLSRNENVNVRSLEYKSTLDEQLVLNNFVQHYVFSLKHEDLQDEIRIMELHKKRN
FLASYCKLVVYNIIPTKSAAGMFKYYVKCYNEYGDIIKATLGKAREINKVNFALTLLLSL
IAVFKDLQSQSENELVSKNSHEFSELKELAKRFALTFGFDAIKNREPIIALHRAGILFAV
GDVPEDPVAAPKRLLFLEVLNEFNHKLLKQDKKVILNFLDRRISPGMPSSKPEEYQPLTL
YRNSLVHGETDQAPVSSKRAYVRKRRDHDDDEEDEDFEEEHNDPDYRG
NT seq
3387 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatggctagacgtggagggaaacgtataagaatggatgatccgcctcctgattacgag
gagcaaggggaaaatctaaatgactctatatctgatggtgatagtcccactaaacgtatg
acacgcttgagagctcgtggtggtgtacgcgataagcctcccattatcgatgaagacgaa
gatgatttctttgcacctgtggtgcgtaaacgtaaagctcaagctccacgcaaaccaccc
ggagagggtaccggtcgtcgtgagaaaattgatcgaccacgcaaggaacatatcgataaa
gaacaagaacgtattgatatggaacgagatgttacaacagatgagaatagtttgtacttt
atagtaagacattccaaatcacccattgccagtatagtagacgattggatagaacaatat
aaaataaatagggatacagctttgatagctttattgcaatttttcattaatgctagtggt
tgtaagggtaaaatacccgaagataccgaacatcctatggatcatacagctgttattcgt
aaaatgacagaagaatttgatgaggaaagcggtgaatatcctttgattataccgggtcaa
caatggaaaaaattcaaaatgaatttttgtgattttgtacagactttagtaaaacaatgt
caatattctataatctatgatcagtttctaatggataatgttatttcactattgaccggt
ttgtctgattctcaagtaagagcctttaggcacactgctacattggcagccatgaaactt
atgaccgctttagtggatgtggctttattggtttcaaataattttgaaaatgccgccaag
caatatgaagcagaacgtcttaagtcccgtgatcgtcgtgcttcagatcgtttagagtca
ttaatggctaaacgtgccgagctagaggagaacatggatgaaattaagaacatgttaacc
tatatgtttaaatcggtgtttgtgcatcgttatcgtgatactttacccgatattcgagct
atttgtatgtctgaaattggtgtttggatggagaattatcctcaaaactttttagatgat
tcatatcttaaatatatcggttggactttacacgacaaagtcggtgaggttcgtttacgt
tgtcttcaagctttattgcctttatatgacaaggaagagcttaaaggtaaattggaattg
tttacttcgaaatttaaagatcgtattgtggccatgactttggataaggaatttgaagtg
gctgtacatgcggttaaattggttataagtattttgaaaatccatcccgatatattggcc
gataaagactgtgaaatcgtttatgaattagtctattcctcacatcgtggtgttgcccag
gctgctgccgatttccttaatgtacgtctattccatttaacggccgatatggaagagact
aaaactaaaagaggcaaattacgtttacccaatacacccctcatacgtgatttagtacaa
tttatgattgaatctgaattacatgaacacggtgcctatttggtagactcctttatggat
aataacaccatggtcaaagattgggaatgtatgacagatttgctgctagaggaaccggga
cccaatgaagaagtcttagacaataaacaagaatctactttaatagaaattatggttagt
agtgttaaacaggcggcaacgggagaagctccagttgggcgagccagtaatcgtaaaata
tccttaagtgctaaagaactaaaagctatacaagatgaaaaagtacgtttaacagaacat
tttatagttactttgccatctttattggagaaatatcaagcggatagtgagaaattaaca
aatttactttccataccacaatattttgaattggatatttatacaacaaatcgtcaggaa
gctaatctacaaagtttgctagagaaaatgagctatataatgtcggtgcatacagatcgt
gatgttctcgagacttgtgccaaaacattggaatacttgtgtcgtgaaggtagtgccact
tacacacgttgcgatgttgctcgctcgaatatcattgataatgctgtaaataaatataaa
gattccattgaagattggcgtaatttaattgctggcgaagaattacccaatgaagatgaa
atttataatgttatcagttctttaaaagtggtttctatattatattcttctcataattta
aatccttggaatctttttgattcgttgtttcaagatgtggatgagtgtcagtctaaagaa
aatcccgggcgtaatttacccaatgaggctttaacctattgcatagaggcctgttatttc
tctataagttggggtttgtattacatagagaatcaatgtgaaacctcacaaatacccgaa
gcagtggcggagttaagaaagaatcttgataaatatatgtttgcctgttatgaactgaca
cgtgatggtcccacagatcaaatacaagaagcggcctatcaatctatttgtgatttatta
ataaccttttccgatcaattgtcacgtaatgaaaatgttaatgttcgtagtttggaatac
aaatccactttagatgaacaattagttttgaataatttcgttcagcattatgtgttttcg
ttgaaacatgaagatcttcaagatgaaattcgtattatggaattgcataagaaacgtaac
tttttggcctcctactgtaagctggttgtctacaatatcatacccactaaaagtgctgcg
ggcatgtttaaatattatgtaaaatgctacaatgaatatggtgacattattaaggccact
ttgggcaaggctcgtgaaatcaataaagttaattttgccttaactttacttttgagttta
atagctgttttcaaggatttacaaagtcaatcggaaaatgaattggtctcaaagaattct
catgaatttagtgaactcaaagaattagctaaacgttttgctttaacttttggctttgat
gcgattaaaaatcgtgaacctattattgctttacatcgtgctggtattctctttgctgtg
ggtgatgttcctgaagatccagttgccgctcctaaacgtttactttttctagaagttctt
aatgaattcaatcataaacttttgaaacaggataaaaaggttattttgaactttttggat
cgtcgcatatcaccgggtatgccttcgagtaagccggaggaatatcaaccgttgacattg
tatcgtaatagtttagttcatggagagactgatcaggcaccagtgagttcgaagagggcg
tatgtacgcaagaggcgggatcatgatgatgacgaagaggacgaggactttgaggaggaa
cataatgatcctgattatcgtggttaa
DBGET
integrated database retrieval system