Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly): 111687534
Help
Entry
111687534 CDS
T06013
Name
(RefSeq) small subunit processome component 20 homolog
KO
K14772
U3 small nucleolar RNA-associated protein 20
Organism
lcq
Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
lcq03009
]
111687534
Ribosome biogenesis [BR:
lcq03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
111687534
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UTP20_N
UTP20
UTP20_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111687534
NCBI-ProteinID:
XP_023305743
LinkDB
All DBs
Position
6:6954774..6965429
Genome browser
AA seq
2785 aa
AA seq
DB search
MAEQQQKTKNSNTFRFKSFADRVNEIDLRRLALYHIGHENEELPEEENETFFHQTLKKWM
VLNLSEEYSLFSRKVIKVVTLPQLLHQKDFVVDLLLEKLACATNLSLQPLLELLYVLARD
LREEFYPYFQRVLDRLICLLNTQDAEQLEWTLVCLAYLFKALKPYLKRNIGVVFNCILPL
LDERRYEEHVTNFAVECFSFIARDVRDYGKFLEFILVTIVREQVESVQGCGRLLFEIMRG
VKGQFHSIAGDFLQFIFESLVEDKKIKTKQSQLLNDIVEHCISQILKFIQPQQMSLFWLK
LCEVSKNCLNPAKLQNLCRIFLQVVEFKECRFLAEMDVIVPCLLHLVDVAGKHVAVCYEA
LRTCTHIISCILLSGSSLVTQLDTSRLLKKSLSIKEREIYAEFVKQMTTHVQFEIFILPS
LVQHFEEFYDKPAFELLADVLLKRQPLQFNALSAQKWQPLDIKVKSAETLKKLEQNLKKF
QVNQQQMEEQLLMLLIAPHLKGLQQELLKKPLSALIQSILKDLENNAKENQLNLLCLIVT
IYVQMNFNLNAQTVNTLTPVLIQNCNNLKCLEVLNLLIFNYPQMFNGNTEIRLTLAQFLA
HHDHEKRLLAAHTLSLMFKAQEQQTPYHIFYQAELIEPTVHNYREQVLLVQKLETQAELF
KQFKEDFYKEDCVRFLLGLLYHNFKYVWEPVLKLLEDYAKQLDVGKFWLIYQEKLQSTQD
NIDNENSKNNPNLVVTQTWQSQALNDLLSLHQPSKLSQQQLFNYRNLLWQRLPQFGKLVE
LKNRELVSMFMKFVEDEYQQQLESKENSWDLSIKNENSLDIDEIEEEDNEHISTQQQTTS
FKKKTKHLNKLDSSNIKSILQTLQTQLAVFAAHQNPRALYRETELKSLYLRLLKGSNQQL
QKSALDCLFSYKSKALIPYKDLLYNMLDEKKFKDELINFKVDTVSLEHRQEFMEILLRLL
YGKMITKGSQKGLSPQQRKSIILRFLAQCSLEEIEWFLQMAFGLYGEFCQDSTDILAIPT
LVQKQFNIQQVWSPKKLQSVVNLLELIRKEFGGIMQQKFHYYMLKLLVFIGCVCNEVFSL
DSSLIHPKMPLVFRNLKHNCLQSVYNFFEHIEDFEWSEDLIKCLSEVFVYPSLEKLPVES
IHSPTVLLKLLLLWGEKPKHFKFLNQIPPHKQENIFHFIISLLLNEKSKALVRKPIMALI
ERLLVASENELEFADEGLQLVKPYIPELLQRLKMNFSTKGSKQQLDKRDLNVLSLLTKHV
TEPNTCDSLLQLLLPILIAKTQTQSSNEVVAQVITTLANLIKRLERPELYIRKIAPLFEQ
VQEVCARKQLCDLIADIARIKYKQNPSSLNTQQLKSLARIILLLNSWDKRWVEQPDYEKR
LEAFKEIKQQTVSQQGVDLDLGILVIYNCFYFLRHDKDMGLRDNASESLKLLLPHLAKKY
SGDKTQIDYLVGDVFLNLIRRVIKDSHENVRNEGIRLLGEMARECPESHEILQDLHGLGD
KLDVEVDFFENMIHLQSHRHGRALLKFNSYAASLEKPPCVRTLTQFVLPLASRYLLQEQH
ASKHTLIDAAIETVGIVCQLLPWQHYHSILRYYLMKMRLSHDYQKQCVRIVVRILDAFHY
DLSLAQKDQQTLEKLKNVIKEKAEELELDIKTSKPEEELKVKQELKQEEEDEKEEDDEDK
PKAHEEETLEQALEKQENDEEDDDEDDNEEENNNSKPIIKQEPCLNKITVLPSNASKKVL
TTITTILIPTLNRSITDKSSYDIKHKVNRKRLSMEREEEEILRVPIGLALVKLMQKLPQE
LMDTSLPGVFMKVCTFLRSPLKSVRMLTRDILKKIMLCLGSKYLPMLMDHLQNLLTRGFQ
VHVLSVTVHGVLDALRDCLQPQDIESCLHNLLEVALNDIFGEISAEKEIDKLTSHTPEAK
PSAKSFLVLHIIARNIREICLLDLLMPFKDHLAKSKSRKLTLKIQEAFAKIVNGLVENPH
ISRESLLIFIYGTMSESITDLLPGVQRRVLSEQEKEKMRRARPDCFIIQPVPRNRSGAVN
KQVKTNAQANAHILIEFGLEMLHIVLKRKKLVEVDYPPFLNPILPLLKDSLKSTHIRVTT
FALKCFATLWVEEYKLSNMEEPEYIKAVVERIFEILKNFSTFGASKQEDNFQLMKSAFKA
IVALLRKCQYYNLTEEQIDELVLYIEQDLHEGENQNMTFNLLKAMLTRKIESKAMHDIMK
RIGDMSITSHSDYVRDEARNLLTTYVMEYPLHKRVDQIVKFFTVQLCYSLSAGRLSAIEF
LCTIIKKFPLTILSKRAEFLYLSLGSRLVNDEEPECRKAVANCIEIMIGRLEKADRQQLF
DMTLLFFNAENKPSVREMAAALCSRFLMAEKQSFAPRIKLLLPILIGRMSTNSSKPGRFV
RAPHALAAEDLDKPKAKKSKKTTINLENEVQNILHNDDEQNEAALLLKQKALDHELIQMQ
YCLLKIFDYCSEELFKNDEISNLIDELAYESQRLLAHEHNWVRCNAAKIISHIISGFDLP
LIGRKLSQIVSEEDEKKRIKMDFIYLNPEYDIKSLVLDLCAQMIPGDTAQPMIDEIVKIF
LYVATMLREVPFKVKREMEVEEEVQEDNKESLTKINLNWLIKNIRFLINKEVAKAPHSTS
MRTALFTLIEALITLLSVETLELLGPSLLSALVREMSEEDQNIDAELRQLALRVGSRLRK
RMGSDVYDKLRAAAQMKLMVRRAERRKLIAQEKIHDPVRAAKRKVAVQERKKSAKKLKAS
VIRGKTADVKQKLKKRKRKAEEDLF
NT seq
8358 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggagcaacaacaaaaaactaaaaattcaaacaccttccggttcaaaagttttgca
gatcgggttaatgaaatcgatctaagacgtttggctttataccatataggccatgaaaac
gaggaactgccggaggaagaaaatgaaacatttttccatcagactttaaaaaaatggatg
gttttaaatctatccgaggaatattctttattttcccgtaaagtcatcaaggttgtgaca
ttaccgcaacttttacatcaaaaagattttgtggtggacttgctattggagaagttggct
tgtgctactaatctatcattacaacccttgctggagctgttgtatgttttggccagagat
ctaagagaagaattctatccttatttccaaagggtattggatcgtttgatatgtttgcta
aatacccaagatgctgaacaactggaatggactttagtatgtttggcttatttgtttaag
gctcttaagccttatttgaaaagaaacataggggtggtgttcaattgtattctaccttta
ttggatgagagacgttatgaggaacatgtaaccaattttgcggtagaatgtttttctttt
attgctcgagatgtgcgagattatggcaaatttttggaatttatattagtgaccatagta
cgcgaacaggtggaaagtgttcagggttgtggtcgtttgctgttcgagataatgcgcggt
gttaaaggacaattccattctatagcgggtgattttttgcagtttatttttgaatctttg
gtagaggataagaaaattaaaaccaaacaaagccaactgctaaatgatatagtggaacac
tgtattagccagatacttaagtttatacaaccccaacaaatgtctttgttttggctgaaa
ttgtgtgaagtttctaagaattgtttaaatcctgccaaattgcaaaatctttgccgtata
ttcctgcaagtggtggagtttaaagaatgtcgctttttagccgaaatggatgttattgta
ccctgtctgttacacttagtagatgtagcgggtaaacatgttgctgtttgttacgaagct
ttaagaacttgtacccacattattagctgcattttgttatcgggttcttctttggtcact
caattggataccagccgtttgctgaagaaatctttaagcattaaggaacgtgaaatttat
gctgaatttgttaaacaaatgactacacatgtgcaatttgaaatctttatcttgcctagt
ttagtgcagcattttgaggagttttatgataagccagcctttgagcttttagcggatgta
cttttaaagagacagcctttacagtttaatgctttaagtgcccaaaaatggcagccttta
gatattaaagtaaaatctgctgaaactttaaaaaaactagagcaaaacttgaaaaaattt
caagtaaatcaacaacaaatggaagagcaattattaatgttgctaatagctcctcatttg
aagggtttgcagcaggagttattaaaaaaacctttaagtgctctaatacaaagtatatta
aaagatctggagaacaatgctaaagaaaatcaactaaatttactgtgtcttatagtaacc
atatatgtacaaatgaattttaacttaaacgctcaaactgttaacactttaacgcctgtt
ttgatacaaaactgtaacaatttaaaatgtttggaagttttaaatcttttaatctttaac
tacccccaaatgtttaatggaaatactgaaatacgcttaactttagctcagtttttggca
catcatgatcatgaaaaacgtttgctagctgctcatacattatctctaatgtttaaggcc
caagaacaacaaacaccttatcatattttctatcaagcggagttgatagaacccacggta
cataactatcgggaacaggttttgctggtgcagaaattagaaacccaagctgagttattt
aaacaatttaaggaagatttctataaagaagattgtgtacgttttcttttgggtttattg
tatcataatttcaaatatgtttgggagccagttttaaaacttttagaagattatgctaaa
caattggatgtgggcaaattttggttaatttatcaggaaaaactacaatcaacacaagat
aatatagataatgaaaatagcaaaaataatccaaatttagttgttacacaaacttggcag
tctcaggccttaaatgatttattgagtttacatcagccgtcaaagttaagccaacaacag
ttgtttaactatagaaatttactatggcaaagattgcctcaatttggtaaattagtggaa
ttgaaaaatcgtgaattggttagcatgtttatgaaatttgtggaagatgaatatcagcag
caattggagagcaaagaaaactcttgggatttgtctataaaaaacgaaaactctttggat
atagacgaaatagaggaagaagataatgagcacatatcaacacagcagcagaccaccagc
tttaaaaagaaaacaaaacatcttaataaactagactcctctaacattaaatctatttta
caaactttacaaacccaactggctgtctttgcagcacatcaaaatcctcgtgctttatac
cgggaaacagaacttaaaagcctctatctacgcctactaaaaggctccaatcaacagcta
caaaagtccgctttagattgtttattttcttataaatctaaagctttaataccctataaa
gatttactttacaatatgttagatgaaaagaaattcaaagatgaactaatcaactttaaa
gtggatacagtttccctggaacatagacaagaatttatggaaattttgcttagattactc
tatggcaaaatgattactaaaggctctcaaaagggtttaagtcctcagcaaagaaaatct
ataatattaagatttttagctcaatgtagtcttgaggagatagaatggtttttacaaatg
gcctttggtttgtatggagaattttgccaagattctaccgatattctagcaatacctacc
ctagtacaaaaacaatttaatattcaacaggtatggtctcccaagaaattgcaaagtgtg
gttaatttactggagctgatacgtaaagaatttggtggcattatgcagcaaaagtttcat
tattatatgcttaaactattggtttttattggttgtgtttgcaatgaagtgttttccttg
gattcatcattaattcatcccaaaatgcctttggtttttagaaatttaaaacacaattgt
ctgcaaagtgtttataacttttttgagcatatagaagactttgaatggtctgaggatttg
attaaatgcttaagtgaggttttcgtttatccctcgctggagaagttgccagttgaaagt
atacactcgcctacggttttgctaaaactattgctgttatggggtgaaaaacctaaacat
ttcaagttcctaaatcaaattcctccccacaaacaagagaacattttccattttattata
tcattgttgttaaatgaaaaatctaaggctttagtgcgtaaacccataatggctttgata
gaacgtttgctagtggcctcggaaaatgaattagaatttgctgatgaaggcctgcagctg
gttaagccttatattcctgagctgttgcagcgtttgaaaatgaatttctctacaaaaggt
tcaaaacaacaattggataaacgtgatttgaatgttttgtcgctgttgactaaacatgtt
acagaaccgaatacctgtgacagtctcttgcaattgcttctacccatactcatagctaag
acacaaactcaaagctccaatgaagtggtggcacaagttataacaactctggcaaatcta
atcaaaagactagagcgtcctgaactatatatacgcaaaatagctcccttattcgaacag
gttcaagaggtttgtgctcgcaaacagttgtgtgatctaatagccgatatagccaggata
aaatacaaacaaaatccttcctctctaaacacacaacaattgaaatcattggcccgaatt
atattattactaaattcctgggataaacgttgggtagagcaaccggattatgaaaaacgt
ttggaggctttcaaggaaatcaaacaacaaaccgttagccaacagggtgttgatttggat
ttgggtattttggttatttacaattgtttctatttcctacggcatgacaaagatatgggt
ttgcgtgacaatgccagtgaaagtcttaagttattgctgcctcatttggctaaaaagtat
tctggtgataaaactcaaatagactatttagtgggtgatgttttccttaatctcatacgt
cgtgttattaaggattctcatgaaaatgtgcgcaatgaaggcatacgtttgctgggtgaa
atggcacgtgaatgtccggagtcgcatgaaattctacaagatcttcatggtctaggcgat
aaactggatgttgaagtagatttctttgaaaatatgatacatttgcagtcccatcgtcat
ggtagagctttactcaagtttaattcatatgctgcctctttggaaaagcctccctgcgta
agaactctaacccaatttgttttgcccctagcctctcgttatctactgcaagaacaacat
gccagtaaacacaccctaatagatgctgccatagaaacagtgggcatagtatgtcaacta
ttaccctggcagcattatcattccatactccgttattatcttatgaaaatgcgtctctcc
catgactatcaaaagcaatgtgtacgcatagtagtaagaatattagatgctttccattat
gatctatcgctggcgcaaaaagatcaacaaactttggagaagcttaagaatgttatcaaa
gaaaaggctgaagaattggagttggatattaagacttcaaagccagaggaagagctaaaa
gttaaacaggaactaaaacaggaagaagaagacgaaaaagaagaggacgatgaggataaa
cctaaagctcatgaagaagaaactttagaacaagctttagaaaaacaagaaaatgacgaa
gaagacgatgatgaagatgataatgaggaagaaaacaataacagcaaacccattattaaa
caggagccttgtttaaataaaatcacagtattaccctcaaatgcctcgaaaaaagtgtta
actaccataaccaccatattaatacccaccctaaatcgttccataacggataaatcttct
tatgatattaaacataaagtaaatcgcaaacgtctgagcatggagcgtgaagaggaggaa
atcttgagggtaccaattggtttggctttggtaaaattaatgcagaaattacctcaagag
ttaatggataccagtttgccaggtgtgtttatgaaagtctgtacatttttgcgttctccc
ctaaaatcggtgcgcatgttgacccgtgatatattaaagaaaatcatgttgtgtttgggc
tctaaatatttacccatgttaatggatcatttacaaaatttgctaacgagaggtttccaa
gtccacgtactttcggttactgtgcatggagttttggatgctttacgcgattgcctacag
cctcaagatatagaaagctgtttgcataatctcttagaagtggccttaaatgatatattc
ggcgagataagtgctgaaaaggaaatagataagttgacttcgcatacgccagaagctaaa
cctagtgctaaaagtttcctggtgttgcatataatagcacgcaatatacgtgagatctgt
ttgttggatttacttatgcctttcaaagatcatttggctaaatcaaaatcgcgtaaactt
actctaaagatacaagaagcatttgctaaaattgtcaatggtctggtggaaaatcctcat
atatcaagagaaagtttattgattttcatttatggcacgatgtctgagagtataacagat
ttattgccgggcgttcagagaagagtactgagcgaacaggaaaaagagaaaatgagaaga
gcaagacctgattgttttataatacaaccagtgccacgcaatagatcgggtgcggttaat
aaacaagtaaaaacaaatgcccaggctaatgctcatatcctaatagaatttggtttggaa
atgttgcatatagttttgaaacgtaaaaaacttgtggaggtagattatccacccttcctc
aatcccatactgccgctattgaaagactctttgaaaagtactcatataagagtaaccact
tttgctttgaaatgttttgccactttatgggtggaggaatataaattgagtaatatggag
gagccggagtatattaaggcagtggtggagagaatatttgaaattcttaagaatttctct
acctttggagcctctaaacaagaagacaatttccaattaatgaaatccgcttttaaagcc
attgttgctctgctgcgcaaatgtcaatattataatctaaccgaagagcaaatagatgaa
ttggtgctgtatatagaacaggacttacatgagggtgaaaatcaaaatatgacttttaac
ttactcaaggccatgttaacgcgtaaaattgaatcgaaagccatgcatgatataatgaaa
agaataggtgatatgtctattacctcacactcggactatgttagagatgaggcccggaat
ttgctaactacatatgttatggaatatcctttacataagcgtgtagatcaaattgttaaa
ttctttaccgtacaattgtgctactccttatccgctggtcggctctcagctatagaattt
ttatgtacaattatcaaaaagtttccgttaacaattttatccaaaagagctgagttttta
tatctttctttgggttcacgtttggttaacgatgaggaaccagagtgtcgcaaagctgtg
gctaattgcatagagattatgattggtagattagaaaaggccgatcgtcagcagttattc
gatatgactctattgtttttcaatgctgaaaataaaccctccgtaagagaaatggcagct
gccttatgttctagattcttaatggctgaaaaacaatcatttgctcctagaataaaacta
ctgctgcccattctaataggacgtatgagtacaaattcctcaaaaccgggcagatttgtt
agagcacctcatgccttagctgctgaagatttggataaaccgaaagccaaaaaatccaaa
aagaccacgataaatctagaaaatgaagtacaaaatattttacacaacgatgatgaacaa
aacgaagccgcattgctgctcaaacaaaaagccctagatcatgaactcatacaaatgcaa
tattgtttattgaaaattttcgactattgttcggaggaattatttaaaaatgatgagatt
agcaatcttatagatgaactggcctatgaatcgcaacgtcttttggcacacgaacacaat
tgggtgcgttgtaatgctgcgaaaattattagccacattattagtggctttgatctgcct
ttaattggccgcaaattgtcacaaattgttagcgaagaagatgagaagaaacgcattaaa
atggatttcatttatttgaatcctgaatatgatattaaatcattggttttggatttatgc
gcgcaaatgataccgggtgatacggctcagcctatgattgatgaaatcgttaagatattc
ctttacgtagccactatgttgagagaggtaccgtttaaggttaaacgtgagatggaagtg
gaggaggaagtgcaggaagataataaagagtctttgacaaagataaatcttaattggttg
ataaaaaatataagatttcttattaataaggaagtggctaaagctccgcatagtactagt
atgcgtactgccctcttcactctcattgaagctctcatcactttgctaagcgtcgagact
ttagaattattaggaccttcgctcctctccgctcttgtacgcgaaatgtccgaagaagat
caaaatattgatgcagaattacgtcagctggcgctacgtgttggcagtcgtctacgtaaa
cgtatgggttcagatgtttatgacaaactacgagccgcagctcaaatgaaattaatggta
cgtcgagcggaacgtagaaagcttatagctcaagagaaaattcacgatcctgtaagggct
gccaaacgtaaggtggccgtacaggaacgtaagaaatcggcaaagaaactaaaggccagt
gtaatacgtggcaaaacggctgatgttaaacaaaagctaaagaaacgaaaacgtaaagct
gaagaggatttgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system