Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly): 111687937
Help
Entry
111687937 CDS
T06013
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC111687937 isoform X1
KO
K20353
COPII coat assembly protein SEC16
Organism
lcq
Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
lcq04131
]
111687937
Membrane trafficking [BR:
lcq04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Forward pathways
Coat protein complex II (COP-II)
111687937
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_Sec16
Sec16
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111687937
NCBI-ProteinID:
XP_046803509
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(3769356..3791430)
Genome browser
AA seq
2606 aa
AA seq
DB search
MSWVHHKKPPPPSIINSSSPSTSSLTSYSSAPNYNNSLYNATNRNGSTPRQALQQYTTNT
TTPPANNNSLLMTSPYSTNRTNTSLKSTTAMRLNPTSPYQQLQQQQPPPPAATVQRHPPS
QPHQQQQQLHNALQTPLHAANSANSASSSMQTVFNKNNQQQNPWPAQQTGYLPSTKMMQP
TPPPPTATSAVAAQTVATANSWPLQQQQQPNVQQNFQNVNMYQQQNANTQQQWPQNPPQM
AATATYDNNYYQQTAAVNNNNMYQQQQQQPPAVAATQNPATFFQQQQPQAPATQNQPINA
VNFFDNNNQSGTADGWGDWGDWNDNSNSASTPAPAAAVEAMPIKAEPPQSQPPANQPQAN
YNNSIIADSFSNQNNNDTWNWGGNERNEQLVNNNPQTETAKLDNVTQQQNDNWNWNTNAN
DSEKLQQQQQQQQPTANEQHNDNWNWQSTNENQQHVANAAPPAAVNPSVQTATSPPPPPP
TEFSSSSTTSENHNYNINAATSNNIPNPVFVSQAKAVTLASRQYASPPSSNVAVTENTPE
TALMPPQAFQNIEEPQARPAAVVSPPLPPPKVATPPLANVPPPAGLPPANSSAGNPFKRS
GVAQHHRATGLMTTATPAANIQPPSPAVFNMAPPPPADFANPGSVSLLEPDNNELPSQEN
QEVLTPPTTNITLPNAGVQQQPITAVTLSNVAPVAQPVPPPNDERNQYLQTSHLSENAEA
EQQPEADGLLPPPGLSRLVLGEPELEASQQRMVMGTETPNADNAVTQAAAMHLDERHADG
EDTASESAVPVISSAGQGAPPTTSTLSSDRNLYLVPGESNSANNTQAQRVVTGVELAEQR
EIEMDGENLEDEQIQQQQQQQHQQQQQHLQQNQHQSIALPAEARNEPPVEGADDNVAAPP
PPSLAVTNTSHATDHQQDQHHQHHHSNNQLTKIKDANPISSPNDDDDSDERLLNDRGMNQ
STAGSSKSRAKYENERLAAAASRRRDKRSSTERYESDEYLNSEGEYSSEREERERRERDR
RRNYREGSVRSDRGINDDEDKRSRRHRTGDKRDKYYYEGEERGRGRDERERDRGTERSKA
ERRSQRQRGYEADSRYETEESTRFDSRKDVNRRSMRRGERSDQGAGDYDDYNRRGVYRSS
KRSSDNYESDRRDRRRSDKHREPRYRDDPRYDPREYEDYRKHSSRNARESDMEKEGAVSS
RSGRMHHDPRHAAMYGYPSSGYYDPYTAYYYQQMARTNPQAYAEWYKKYYGQTAAATGVT
QGMVSLPGAANNAAAHADAGSLQTAGNDGRESVHSGRSSAHNDLKDRYTHVYITQANDYH
RHYQQQQQQLHHQQHYQQQHHHHQQQMAFNQSLNSTLLDDESLNHNTSLYSGLGIGLTAA
RSNSNLSQIHGGYYSSSTAAAGVYYARSDYAESRSGALSVREPDPIAQEPQRLTPCKFIT
EHTVVNFASGILVTVKPKYTPNGSISNVVKLLKFKPNDETRKLFKVFPGPLVRGLTHKKT
VIEFCHEQIRLGPMETTIYAKQLINNNAEKYRGSYTLMWNLLILLLKQNGMVVGTDIAEL
LLKNQQQYPYQTPISTANNSLKSKSGSNSSLEVDKEEDLTKDLTAETDTKEENNVQATLE
ENKLEQEDLTAEDNSSNSVTLSEEEITEKFRNYLLYGNVNEALEWATDNNLWGHALFLAS
KLDRRSHANVMMKFANKLSLNDPLQTLYQLMSGRTPSSVTCVQDEKWGDWRPHLSMILSN
TSQKPELDRKAITTLGDSLFNRGDLYAAHFCYLMAQVGFGRYQESATQETSLQQHLPKLV
LLGSSHYKQFPEFAHNEAIVMTEIYEYACSLNDDKFSIVEFQPYKFLLATRLLDYGFHLK
SLMYLEQIAVHIARDPSKYESSFINKVYEMADRLKYYDPVLEKTIDDQQQGPDDVNGLNL
TPQQMEEQKWLQNLRQLAQQYQNDLQNSNTNALQDPQQQQQQQLTQDPNYYHNQQQIDQQ
FMEINKQFSELNLQYQQQPPAVSTTTEQQQQQQPITYYNPEQPTQMGDSIYGYQQPTTTT
TTQSLQPELPTDNAKDLQPTDNTNEIYQQSGQYLQSSVEPIQQQQQTQHTTDYSNNYYDP
TAQYNATDSGINNMETTTTAAAPAYDYWGQQSAHMPQVAEEPELNANNNNPNDMVLLKQT
HKMTSTLKANNINHASLKAPLNINNKKSPLKLKSNISTYTSSPLSSTPIKDKLKTTTTTT
TKTPLSAKKTLDLVQHKTSTAAATTRTTTTTTATATAFNKLANSTEHNNNMIINSSTTSI
SSSATPFSINNNARPTISMPKSKTYDTDEDSKQQHTAGNEGNKKQQQQAAQQQQQQQQKG
AKKEDKDSNKNQQQSNQNSGWFGGIWNKFSLKPKNQMILPDDKNPSIVWDPEKKKWVNTD
GDEDAQEALKPPPKMSDLMPQTQMPPQQQQPQQQQQQQQNQQQPQIPFMDPQQMQQQQPT
QLPQQYVPNSIPNPAPSPSPLQQQQQTPQNPSQIPTQAPGPAKTPTLQSNMFKMQRNRTL
KNAYVDVFNPSGAPVNKAAENILAPALPPAAVPQGGFFIPGAQPGAAAVSGSSGQEQQYQ
QQTQQSQQQDTPQFYNPNQFTSGTGY
NT seq
7821 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttgggttcatcataagaaaccaccaccaccatctatcattaactcatcatcaccc
tcaacatcatctttaacatcatattcatcagctcctaattataataattctctatacaat
gcaacaaatcgtaatggctctaccccacggcaggctttacaacaatatacaacaaatact
actacacctcctgcaaataataactccctgttgatgacgtcaccgtattctactaataga
acaaacactagcttgaaatcaactacagccatgcgtttaaatccaacatcaccctatcaa
cagctgcaacagcaacagcctccaccaccagcagcaacagtacaacgtcatcctccttct
caacctcatcagcaacaacaacaacttcataatgctttacaaactccattgcatgcagcc
aactcggcaaattctgccagctcctctatgcagacagtttttaataaaaacaatcaacag
caaaatccttggccagcacagcaaaccggttacttgccatcaacaaaaatgatgcagcca
acaccaccaccgccaacagcaacatcagctgttgcagcacaaactgtagcaacagcaaac
agttggccattgcaacaacaacaacaaccaaatgtacaacaaaattttcaaaatgtcaac
atgtatcagcagcagaatgccaacacacaacaacaatggccacaaaatccaccacaaatg
gcggcaacggcaacatatgataataattattatcagcaaacagcagctgttaataataac
aatatgtatcagcaacagcaacaacaaccacccgcagttgcagctactcaaaatccagca
acttttttccaacaacaacagccacaagcgccagcaactcaaaaccaacctataaatgcg
gtaaatttctttgataacaacaatcaaagtggcacagctgatggttggggtgattgggga
gattggaatgataactctaacagtgcatcaactccagcgcctgcagcagctgttgaagca
atgcctattaaagctgagcccccacaaagccaaccacctgctaatcagcctcaagctaat
tataataattctataatagccgatagttttagcaatcaaaataataatgatacttggaat
tggggtggtaatgagcgaaatgagcaacttgtaaacaataatccacaaactgagactgca
aaattggataatgtaacacagcaacagaatgataattggaattggaataccaatgctaat
gatagtgaaaaacttcaacaacaacaacaacagcagcagccaacagcaaatgagcaacat
aatgataattggaattggcagtcaacaaatgaaaatcaacaacatgtagctaatgcagct
cccccagcagcagtaaatccttctgtacaaacggctacttcaccaccgccaccaccaccc
acggaattttccagctcctcgacaacatcggaaaatcataattacaatataaatgcagca
acatccaataacattccaaatcctgtttttgtctcacaagcaaaggcggtaacactagca
tctcggcaatatgcttcacctcctagcagtaatgttgcagtaacggaaaatacccccgaa
actgctttaatgccaccacaagcttttcaaaatatagaagaacctcaggcaagaccagca
gctgttgtctcaccacctttgccaccacccaaagtggctacacctcccttggctaatgtg
ccaccaccagcaggtttgccgccagcaaacagctctgctggtaatccttttaaacgttcg
ggagtagctcaacatcatcgtgctactggtttaatgaccaccgccacacccgctgctaac
atacaaccccccagtccagctgtttttaatatggccccacctccaccagcagattttgct
aatcctggctcggtttcgctcttagaaccggataataatgagcttccttcacaagaaaat
caagaagttctaacaccacccaccacaaatataacattgccaaatgctggtgtacaacaa
caacctatcactgctgtaaccttatccaatgttgctccggttgcccagcctgtaccacca
cctaatgacgaacgtaatcaatatttgcaaaccagtcatttatcggaaaatgctgaagct
gaacaacaaccagaagccgatggtttattgccaccaccaggactgtcgcgtttagtttta
ggtgaacctgagctagaagcttcacagcaacgtatggttatgggtacagaaacccccaat
gcagataatgctgttactcaggctgccgctatgcatttggatgaacgtcatgctgatggt
gaggataccgcctcggagagtgcagtgcctgttattagttcagcaggacaaggtgctcct
cccactacctctaccctctcatctgatcgtaatttatatttggtgcctggagaaagtaat
agtgccaacaacactcaagcccaacgtgttgtaactggagtagaattagctgaacagcgt
gaaattgaaatggatggtgaaaatctagaagatgaacaaatccaacagcagcagcaacaa
caacatcaacaacagcaacaacatcttcaacaaaatcaacatcaatctattgccttacca
gcagaagcccgtaatgaaccaccagtcgaaggagctgatgataatgtagctgctcctcca
ccaccttctttggctgttactaatacaagtcatgcaactgatcatcagcaagatcaacat
catcaacatcaccattctaataatcaattaacgaaaattaaagatgcaaatcccatttca
tcacccaatgatgatgacgatagtgatgaacgtttgttaaacgatcgtggtatgaatcaa
agtactgctggttcctctaaatctcgagctaaatatgaaaatgaacgtttagcagctgct
gcctcaagacgtcgtgataaacgttcttctacggaacgttatgaaagtgatgaatattta
aattcagaaggtgagtattctagtgaacgtgaagagcgtgaacgtagagaacgtgatcgt
cgtcgcaattaccgagagggtagtgtacgcagtgatcgtggtattaacgatgatgaggat
aaacgttctagacgtcatcgtacaggagataaacgtgataaatactattatgagggagag
gaacgaggacgtggtcgtgatgagcgtgaacgtgatcgtggaaccgaacgttctaaggct
gaaagacgttctcaacgtcagcgtggctatgaggctgactcacgctatgaaactgaggaa
tcaacacgattcgatagtcgtaaagatgtcaatagacgtagcatgaggcgaggcgaacgt
agtgatcagggtgctggcgactatgatgattacaatcgtagaggtgtttatcgttcttct
aagagatcaagcgataattatgagtcagatagaagagatcgtcgacgcagcgataaacat
cgtgagccacgttatcgtgatgatccacgctacgatcctcgtgaatatgaagactatcgt
aagcatagctcacgcaatgccagggaaagtgatatggaaaaagagggtgctgtatcctca
cgttccggacgcatgcatcatgatcctagacatgcagccatgtatggttatccttctagt
ggttattatgatccctacactgcctattattatcaacaaatggcacgcactaatcctcaa
gcttatgccgaatggtataagaaatattatggacaaacagcggcggcaactggtgttaca
caggggatggttagtttacctggagctgctaataatgctgcagctcatgcagatgctggc
tctttacagacagccggtaatgatggtcgtgaatcggttcattcgggtcgtagttcagct
cataatgatttgaaagataggtatacacatgtttacataacacaagccaatgattatcat
cgtcattatcaacaacaacaacagcaacttcatcatcagcaacattatcaacaacaacat
catcatcatcagcaacaaatggccttcaatcaaagtttaaattctactcttttggatgat
gagtccttaaatcataatactagtttatatagtggcttgggtattggtcttacagcggcc
cgttcaaattctaatctttcacaaattcatggcggttattattcaagttcaacagcagca
gctggagtttattatgcacgttctgattatgcggaatcaagatctggtgccttatctgta
cgtgaaccagatcctatagcacaggagccacaacgtttgacaccctgtaaattcattact
gaacatactgtggtcaactttgcttcaggtattttggttaccgtcaaacctaagtacaca
cccaatggcagtataagtaatgtagtaaaattgctgaaattcaaacccaatgatgagaca
cgcaagttatttaaagtcttccctggtcctctggtaagaggtttaacacacaagaaaact
gtcatagaattttgtcatgaacaaatacgtttgggtcccatggaaactactatttatgcc
aaacaattgataaataataatgctgaaaaatatcgtggttcctatactttaatgtggaat
ttattgatattgctgttgaaacaaaatggaatggtggtgggcactgatattgctgaatta
ttgttgaaaaaccaacaacaatatccatatcaaacacccatttcaacagctaacaattct
ttgaaatctaaatcgggttctaactcttccttggaggtggataaggaagaagatttaact
aaagatttgactgcagaaacagacactaaggaagagaacaatgttcaagccacattagag
gaaaataagctagaacaagaagatctaacagcagaggataattcttcaaattcagttact
ttatctgaagaagaaataaccgagaaatttagaaactatttgctgtatggcaatgtcaat
gaggccttagaatgggctaccgataacaatttatggggtcatgctttatttttggcctct
aaacttgatcgtcgttctcatgccaatgttatgatgaaatttgccaataaattatcacta
aatgatccgctacaaacactttatcaactaatgagtggccgcactccttccagtgttacg
tgtgtgcaagatgaaaaatggggcgattggcgtccacatttatctatgattttatcgaat
acttcacaaaaacccgaattagatcgtaaagctattaccactttaggggattctctattc
aatcgtggtgatttatatgctgcgcatttttgttatctaatggctcaagtgggttttggt
cgctatcaggaatcagccacacaagaaacctctttacagcagcatttgcctaaattggtt
ctattgggctcttctcattataaacaattccctgaatttgcccataatgaggccattgtt
atgactgagatatatgaatatgcctgttccttaaatgatgataaattttctatagttgaa
ttccagccttataaattccttttggctacacgtttattggactatggcttccatttgaag
agtttaatgtatttggaacaaatagctgtgcatatagccagagatcccagcaaatatgaa
agcagttttattaataaggtttatgaaatggctgatcgtttgaaatactatgacccggtt
ctagagaaaaccatcgatgatcaacaacagggcccagacgatgtaaatggtttgaattta
acaccccaacaaatggaagaacaaaaatggttacaaaatctaagacaattggctcaacaa
tatcaaaatgatttgcaaaactctaatacaaatgctttacaagatccccaacagcagcaa
caacaacagctaacacaagatcctaattactatcataatcaacaacaaattgatcaacaa
tttatggaaataaataaacaatttagtgaattaaatttacaatatcaacagcaacccccg
gcggtgagcacaacaacagaacaacagcaacaacaacaaccaattacatattataatcca
gagcagcctacacaaatgggagattcaatatatggctatcagcaaccgacaacaacaaca
acaacacaatctttgcaacctgaactgcctacagataatgccaaagatttacagccaaca
gataatactaatgaaatttatcaacaatcaggacaatatctacaatcttcagtagagcca
atacaacaacaacaacaaacacaacatacaacagattattctaataattattatgatcca
acggcacaatataatgccaccgattcaggtattaataatatggaaactacaacaacagct
gctgctccagcttatgattattggggacaacagtcagctcatatgccacaagtggcagaa
gagcctgagctaaatgccaacaataacaaccctaatgatatggtgttgttaaaacagaca
cataaaatgacttcaacacttaaggccaacaatataaatcatgcttctttaaaagctccc
ttaaacataaacaacaaaaaatctccccttaaactgaaaagcaacatttccacatatacc
tcctctcctttatcctctactcctataaaggataaattaaaaacgactacaacaacaaca
acgaaaactcctttatcggctaaaaaaacattagatttagtacaacataaaacatctaca
gcagccgcaacaactagaacaaccacaacaacaacagctacagctacagcatttaataaa
ttagctaatagtacagaacacaacaataatatgatcataaatagttctacaacatcaata
tcatcatctgcaacaccattttccattaacaataatgcacgaccaacgatatcgatgccg
aaatcgaaaacttacgataccgatgaggacagtaaacagcaacatacagctggcaatgag
ggcaacaaaaaacaacaacagcaagccgcacaacagcagcagcaacaacaacagaagggt
gccaaaaaagaggataaagattctaataaaaatcaacaacaatctaatcaaaattctggt
tggtttggtggtatttggaataaattctcgttgaaacctaaaaatcaaatgattttgccg
gatgataaaaatccctctattgtttgggatccagagaaaaagaaatgggttaataccgat
ggtgatgaagatgcccaggaagctttaaagccacctccaaaaatgagtgatttaatgccg
caaacacaaatgccacctcaacaacaacaaccacaacagcagcagcagcaacagcaaaat
caacaacagcctcaaataccttttatggatcctcaacaaatgcagcagcagcaaccaaca
caattaccacaacaatatgtgcctaactcaatacccaatccagcaccatcacccagtccc
ttgcagcagcaacaacagacaccacaaaaccctagccaaattccaactcaagcaccaggt
ccagctaaaacacccacgctgcaatctaacatgtttaaaatgcaaagaaatcgaactttg
aaaaatgcctatgttgatgttttcaatccttctggtgctcccgtcaataaggctgctgaa
aatatactagctcccgctttaccacccgctgcagtgccacaaggtggctttttcataccg
ggcgctcagccaggtgctgctgccgttagtggtagtagtggtcaagagcaacagtatcag
cagcaaacacaacaaagccaacaacaagatacacctcaattctacaatcctaatcaattt
accagcggtactggttattaa
DBGET
integrated database retrieval system
