Lactobacillus crispatus: LCRIS_01290
Help
Entry
LCRIS_01290 CDS
T01222
Symbol
mdlB
Name
(GenBank) ABC transporter, ATP-binding/permease protein
KO
K18890
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
lcr
Lactobacillus crispatus
Pathway
lcr02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcr00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
LCRIS_01290 (mdlB)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lcr02000
]
LCRIS_01290 (mdlB)
Transporters [BR:
lcr02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
LCRIS_01290 (mdlB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_29
AAA_23
RsgA_GTPase
AAA_16
MMR_HSR1
DUF87
FtsK_SpoIIIE
Stevor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBL50737
UniProt:
D5GY78
LinkDB
All DBs
Position
complement(1296403..1298202)
Genome browser
AA seq
599 aa
AA seq
DB search
MNNNEEQHESVWSKAIPFKEQVDIFKRLMGFVKQFKFEMIVALVGAFIVSVINILLPRGL
QYFLDHFLLHQSTTVQVILFAGFLYALGSILKAIIQFTYQYFFALGSEKTLESVRKALYR
KLHKLGMRYFDQTPAGSIVSRVTNDTMTLSNFLTVLSTFVIGAFSVITALVAMFTTNIVA
GWLILLFIPILLLVVWLYSQKSSRLYRNYRERLSRINANLNESIEGVSVIQEFNQEKRMT
NNFEGENGGLMNTRFNMIRVNSLLLSPLTSLLYSLALAISLMYFGFPLRETFVPAGVVYA
FSQYISQLFNPISTVMDQMTFFQDGIVAGKRIFRILDDTQYEPQQDAQKGLTITKGKIEF
KHVSFSYDGKHEILHDISFVVNPGETLGIVGHTGSGKSSIINVMMRFYEFGQGEILIDDV
NIRKYPKEELRKKLGLVLQEPFMFYGDISSNIRLYNNQITDNQIKDAAMAVQADRFIERM
PGKYHAKVIEGGEEFSQGQRQLISFARTLVTDPKILVLDEATANVDTETETLIQQGLKRL
RKGRTTLAIAHRLSTIADADQIIVLDKGCIIERGTHDQLLAQKGYYYSLYTLQNNENKN
NT seq
1800 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataataacgaagaacagcatgaatctgtttggtctaaggcgataccatttaaagag
caagttgatatttttaagcgtttaatgggctttgttaagcaatttaaatttgaaatgatt
gttgctttagttggtgcatttatcgttagtgtaattaatattcttttgccacgtggcttg
caatatttcttagatcactttctattacatcaaagcacaacagtgcaggtgattttgttt
gcaggttttctttatgctttaggttcaattttaaaggcaataattcagtttacttaccaa
tatttctttgctttaggatcagaaaaaacgctagagagtgtcagaaaggcattgtaccgc
aaactgcataagctagggatgcgctattttgatcaaactcctgcgggctcaattgtttct
agagttactaatgatacgatgactttgagtaattttttgacggtgctatcaacttttgtg
attggtgctttttcggtgattactgcgttagtagcgatgtttactactaatatagttgct
gggtggttgattttactctttattccgattttattattagttgtttggctttattcgcaa
aaaagctcacgtctttatcgtaattatcgtgagcgtcttagtcgaattaacgctaactta
aatgaatcaattgaaggagtatcggttatccaagaatttaatcaagaaaaacggatgact
aataattttgaaggcgaaaatggtggtttaatgaatacgcgcttcaacatgatccgagta
aattcattgttattatcgccattgacatcgctgctttattcgttagctttagccatttca
ttaatgtactttggttttccattacgtgaaacttttgttccagctggtgtagtctatgcc
ttttcacaatacatttcgcaactttttaatcctatttcaactgtgatggatcaaatgacc
tttttccaagatgggattgttgcaggaaagcggatttttcggattcttgatgatacccaa
tatgaaccacagcaggatgctcaaaaaggattgacgattactaaaggaaaaattgagttt
aaacatgtaagcttttcttatgatggcaagcatgaaattttacatgatatttctttcgta
gttaatccaggtgaaactttaggaattgttggtcatactgggtcagggaagagctcgatt
attaacgtgatgatgcgtttttacgaattcggtcaaggtgaaatcttgattgatgacgtt
aatattcgtaaatatcctaaagaagaattaagaaaaaaacttggcttggtattgcaagaa
ccgtttatgttttatggagatatttcatctaacattcgtttgtataataatcaaattact
gataatcagattaaagacgccgctatggcagtccaagccgatcgctttattgaaagaatg
ccgggtaagtatcatgctaaagtgattgaaggcggagaagaatttagtcagggacaaaga
cagttaatttcttttgctcgaactttagtcacagatcctaagattttggttttagatgag
gcaacagcaaatgttgataccgagactgaaactttgattcagcaaggactaaagcggctg
agaaagggtcgaacgacattagctattgctcaccgtctttctacgattgccgatgcggat
caaattattgttttagacaagggatgcataattgaacggggtacgcatgatcaattgctt
gcacaaaagggctattactatagtttgtataccttgcaaaataatgaaaataaaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system