Lactobacillus crispatus: LCRIS_01431
Help
Entry
LCRIS_01431 CDS
T01222
Symbol
licR
Name
(GenBank) PTS system, IIA component
KO
K03491
probable licABCH operon transcriptional regulator
Organism
lcr
Lactobacillus crispatus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
lcr03000
]
LCRIS_01431 (licR)
Transcription factors [BR:
lcr03000
]
Prokaryotic type
Other transcription factors
BglG family
LCRIS_01431 (licR)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PRD
PTS_EIIA_2
HTH_11
Mga
HTH_Mga
HTH_36
MarR_2
DnaD_N
Fe_dep_repress
Sigma70_r4_2
EAP30
HTH_23
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBL50878
UniProt:
D5GYL9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1446002..1447897)
Genome browser
AA seq
631 aa
AA seq
DB search
MLATILKKLQFSSDYLSANYLAKELHVSKRTVQNRIHLLKKEGKKNGFRIQNNYGKGYYL
KILDAKKFSDFYQSLNSDFEVNSEKALIINELELLIQRGTKYLTADELAENLDLSKTLVF
SKMFNLEKYLNTYGLKLERKSHYGLRIKGSELNILQIIKDSYERGDKFHSIIDTKIKNTN
YVDALLKKNLNSQQSRISYYEYVSTRNLLICFIYYKLTFIDHYSDDKDLTHTSIKPVNNL
LLPLSKYFAININQNDVNSLGKLNRLFAEKKSVPNVKKNDLKRDLSQFIKQIDLSENTKF
LEDTDFIDRLTNHLLSLFQRINKNINYKNPLLIEISVKYPLVFDITLRFYSFLKEKYGYE
ISNDELGFIALYFLNYMEKQKEQKLTKYKKIAIICTSGGILAEMTRKRILEIFQDAEIKT
FAYYERKAIEKFNPNLLLTMVPINSNFEVPTIFIGELLSDKDLKDIKEKLFLDDQKKNNS
SEAIFNKRYLNLIKSDLIFKFKPVAYESLLKKMGQELIDKKYAKEDVIKNILIRESLMNT
IYQNGIAIPHPIKTDAIKSSISVGIVEPDLITPSGKVTLIFLICLSQTDRELYSSISNDL
YYLMKEPEKIRSIVQVGTCEKIINVLEEIEV
NT seq
1896 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctagcaacaattctaaaaaaattacaattttcctctgattatttaagtgccaattat
ttggctaaggaattgcatgtttctaaacgaacggttcaaaatagaattcatttgttgaag
aaagaaggaaaaaagaacggatttcggatacaaaacaactatggtaaagggtattatcta
aaaattttagatgcaaaaaaattttcagatttttatcaatcattaaattcagattttgaa
gtaaatagtgaaaaagctttgattatcaatgaactagaattattgattcaaagaggtact
aaatacttaactgcagatgaattggctgagaatcttgatttaagtaaaacactagtcttt
tcaaaaatgtttaacttagagaaatatttaaatacatatggtttaaagcttgaacgcaaa
agtcattatggcttaagaattaagggctcagaattaaatattttacagataatcaaagat
tcatatgaacgaggtgataagtttcattcaattattgacacaaagattaaaaatacaaat
tatgttgatgcactgttaaaaaagaatttaaacagtcaacaaagtcggattagttattat
gaatatgtttcaacgcgtaatcttttaatttgttttatttactacaaattaacttttatt
gatcactattcagatgataaggatttaactcatacttcaattaaaccagtgaataatttg
ttgcttccattatctaaatactttgcaatcaacatcaatcagaatgatgttaattcttta
ggtaaactgaatcgattatttgcagaaaaaaagtctgttcccaatgtaaaaaagaatgat
ttaaaaagagatttaagtcaatttattaaacagatagatttatctgagaatacaaaattt
ttagaagatactgattttattgatcgattaactaatcatctgctatctctttttcaaagg
attaataaaaatattaattataagaatccattgctaatagaaattagcgtcaaatacccg
ttagtttttgatattactttacgtttttattctttcttaaaggaaaaatacggttatgag
atttctaatgatgagttaggatttatagcactttactttttgaattatatggaaaaacaa
aaagagcaaaaactaacgaaatataaaaaaattgccattatttgtactagtggtggaatt
ttagcagaaatgactagaaagagaatattagaaatattccaggatgctgaaattaaaact
tttgcttattacgaaagaaaagcaattgagaagtttaatcctaatcttcttttgactatg
gtaccaattaattcaaattttgaagttcccacaatttttattggtgaattgttatcagat
aaagatttaaaagatattaaagaaaaattgtttttggatgatcaaaaaaagaataattca
tcagaagcaatttttaataagagatatcttaatttaataaaatccgatttaatttttaag
tttaaaccagttgcttatgaatcattacttaagaaaatgggacaagaattaattgataaa
aaatatgctaaagaagatgtaattaagaatattttgattcgagaaagtcttatgaatact
atttatcaaaatggtattgctattcctcatcctattaaaactgatgcgataaagagttca
atttctgtaggtatagttgaacctgatttaataactccatcaggtaaagtaactttgatt
ttcttaatttgtttgtctcaaacagatagagagttatattcaagcatttcaaatgatctt
tattatctaatgaaagagcctgaaaaaattaggtcaattgtccaagttggaacatgtgaa
aagataattaatgtattagaagaaatcgaggtataa
DBGET
integrated database retrieval system
