Companilactobacillus crustorum: BI355_1923
Help
Entry
BI355_1923 CDS
T04712
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K19505
sigma-54 dependent transcriptional regulator, gfr operon transcriptional activator
Organism
lct
Companilactobacillus crustorum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lct00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
lct03000
]
BI355_1923
Transcription factors [BR:
lct03000
]
Prokaryotic type
Helix-turn-helix
Other families
BI355_1923
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma54_activat
AAA
PRD
AAA_5
EIIA-man
Sigma54_activ_2
Mg_chelatase
RuvB_N
AAA_22
AAA_14
AAA_2
PTS_IIB
AAA_16
NACHT
ResIII
AAA_7
HTH_Crp_2
HTH_7
RNA_helicase
HTH_IclR
MC5
HTH_5
nSTAND3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APU72222
LinkDB
All DBs
Position
complement(1961448..1964207)
Genome browser
AA seq
919 aa
AA seq
DB search
MSEIKLEAYLDKISKKAMDERNFNILETGTIADNLQLSRSTVSRYLNDGYKEGAFSKIKT
HPIKYISIRVLRKYFKSPRLDYDSVKNLMNEKKKMSTSNRDIFNAVIGSDGSLVNQIEEI
KTATLYPGKGLPIMLMGPSGSGKTYLAYKIYEYCVQKEIISKQSKFQSLNCAQYFNNPEL
LSSLLFGYTKGAFTGADQDTAGLIENANGGILFLDEVHRLTQSGQEKLFSFMDTGQYSPV
GNDSIKRKASVRLIFATTEKLDSTFLPTFVRRIPVIINIPSFGSRPQSEKVQLIDYFFMN
ESRVLNRRIKVSTQLINALASADMEGNIGKLRNIIKYSSGNAYAKFEDSSEIKVNLSNIP
INYYQSLIQYEKFENEPNEYVKYDFNSDALPRHTNQTIRIIKKLYESTIEIIWDFFNGEL
DKKQFLNHFNKNVDMLFDSILFKTNYKNLNDSEYEFLIYQIKSVFDFMEDSYGYPKDGNQ
IIAIATLLRSKNLQSVLKENKIWNLHKFEIIHELKNNFRRSYQIATRILALLSNKMERDI
LKEDILMVTLYVAKSKSNNSLQEIHSIVVAHGYSTASSLANVANRMLKDNIFQSIDMPID
TTTKDIETKLIDYINTVNIENGLILLIDMGSLNQIGNSLNEKLNVPILMIDHVSTPLVLN
VGNLILQHKGMNEIRNDVYLNNKINSQILLPRKKQKKAIITCCHSGMGSAVQIQEIIKNS
LKKFDVNIEILPYDFGKLSKNKRNELPFELYDVIAIVGTANPKISGIPYLSLDGLLSGNH
IDQLIKILNETKSMDYSELKDALLMNFTIKRMISSVTILDPNSLIKITDTTVSKMEKLLN
TKFQTNKRILLIIHESGMIERLIRKQNLDVQEDIEQFRLKHKKLFGLVYQAIHPLESQYN
IEVSVEEVRLIVEIILGDD
NT seq
2760 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagaaataaagttagaagcatatcttgataagatttctaaaaaggcaatggatgaa
agaaattttaatatattagaaacaggaactattgcagacaatttacagttatcacgtagc
accgttagtcggtatctgaatgatgggtacaaagagggagcgttttctaaaataaaaact
catcctatcaaatatatttctattagagttttgagaaaatattttaaatcaccaagacta
gattatgacagcgtgaaaaacttaatgaatgaaaagaaaaagatgtcaacaagcaatcgg
gatatatttaatgcggttatcggttcagatgggagcttagtaaatcagatcgaagagatt
aaaactgcaactctgtatccagggaaaggcttgcctataatgctaatgggaccgagtggc
tccggtaaaacttatttggcttataaaatttatgaatactgcgttcaaaaagaaataatt
tctaaacaatcaaagtttcaatctttaaattgtgcgcagtattttaataatcctgaatta
ttatctagcttgttgtttggatatactaaaggggccttcacaggtgcagatcaggatact
gctggtttaatagaaaacgccaatggaggaattttatttttagatgaagtgcatcgttta
acacaaagtgggcaagaaaaactcttttcattcatggatactggtcaatattctcccgtg
gggaacgatagtattaaacgaaaagcgtcggtacgattgatttttgctacaactgaaaaa
ttagattcaacttttttacctacgtttgtaaggcgtattccagtaattattaatattcca
agtttcggttccagaccgcaaagcgaaaaagttcagttaatagattatttctttatgaac
gaaagcagggtattaaatagacgaataaaggtttcgacacaattaataaatgcattagca
tcagctgatatggaaggaaatataggcaaattaagaaatattattaaatattctagtggc
aatgcctatgcaaaatttgaagattcatctgaaattaaagttaatttatcaaatatacct
ataaattattatcaaagtttaattcaatatgaaaaatttgaaaatgaacctaatgaatat
gttaaatatgattttaatagtgatgcacttccacgtcatactaatcaaacaattagaatt
attaaaaaactttatgagagtactatagaaataatatgggatttctttaatggagaactt
gataaaaagcagtttttgaatcattttaataaaaatgttgatatgctttttgatagcatc
ctttttaaaactaattataaaaatctaaatgactcagaatatgaatttctaatttatcaa
ataaaatctgtttttgattttatggaagatagttacggctatcctaaagatggaaatcag
attattgcaattgctactttgttaaggtctaaaaacttgcagtcagtactgaaagaaaac
aagatttggaatttacacaaattcgaaattattcatgaattaaaaaacaattttcgcaga
tcatatcagatagcaacacgaatacttgctttgctatcaaacaaaatggaacgagatatt
ttaaaagaagatattttaatggtcacactatatgttgctaaaagtaaaagtaataattca
ttgcaagaaatccatagtattgtagttgctcatggatattcaacagcaagtagtctggcc
aatgttgctaatcgaatgttgaaggataatatatttcaatccatagatatgccaattgat
acaacaaccaaggacattgagacaaaattaattgattatattaatacggtaaatattgaa
aatggattaatcctattgattgatatgggatcattaaatcaaattggtaacagtttaaat
gaaaaattaaatgtaccaattttaatgattgaccatgtttccacaccattagttttgaat
gtaggaaatctaattcttcaacataaaggcatgaatgaaattagaaatgatgtatattta
aacaataaaattaatagccaaattttattgccacgtaaaaaacaaaagaaagccattatt
acttgttgccattcagggatgggcagtgctgttcaaatacaagaaattattaaaaatagc
ttaaaaaagttcgatgttaatattgaaatattgccctacgattttggtaaattatcaaaa
aataagcgtaatgaattaccgttcgaattgtatgatgttatagctatagttggaactgct
aatcctaaaataagtggaattccatatctttcgttagatggtttactatcaggaaaccat
atagatcaacttattaagatattgaatgaaactaaatctatggattattcagaattgaaa
gatgccttattaatgaattttacaattaaaagaatgatttctagcgtaactattctagat
cctaatagtttaattaaaataactgatacaactgtttcaaaaatggagaaattattgaat
actaaatttcaaaccaataaacggattctattaattattcatgaatctggtatgattgag
cgattaattcgtaaacaaaatttagatgttcaagaagatattgaacagtttagattaaaa
cataagaagttatttggattagtttatcaggcgatacatccactggagagtcaatataat
attgaagtaagtgttgaagaagttagattaattgttgagattattttgggtgatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
