Lacticaseibacillus casei 12A: LCA12A_2593
Help
Entry
LCA12A_2593 CDS
T03665
Name
(GenBank) chitinase
Organism
lcx
Lacticaseibacillus casei 12A
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_3
Bact_surface_Ig-like
KxYKxGKxW_sig
DUF4625
InlK_D3
HYR
He_PIG
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
EKQ01882
LinkDB
All DBs
Position
380123..382693
Genome browser
AA seq
856 aa
AA seq
DB search
MIFDTKQHYKMYKKGKYWAFAAITLATVGLSGLINNDTTVHADTLNSEANTAKNASNGYQ
DSPQKTNEQLNQGSTESSALSKTSINPTINANTAANNSTNSGDNQLTNNAPTNKTSSNNT
IASSNSSNESTKVNATLSSVSGANVSMTSDGLGTSSSPVNGNNSVTFTFSLSTIIGKQEL
HAGDTIVLNVDSQGLNYNTVGLSGGAPYFSMTKSPSTNTITLTATEDINWTTTDPIVFSI
YGNPLDISGNNNIRTYPITSTYNDNKNNQSVVLTPSNTNLYVKTNGGGGWNVLGSGVYPS
DVWGAPFSKDYFNNYVGGTADNTGTYIYSQNAMKFTAGYFNTSSSDYTDGVLKVNSDYVI
DQKSIVISIGRIGSYTAMLNPNIVWDADGKGFTLNIGSLPRTGNNSVAVTFFVKTASIND
KPTLNSVLTALDPSGAATSVNGKAHGKYVPTSNGSFTPNITASDKTIYSTQKLSESDLLA
LATAKDQTDGDISKNITITDKGGFKLDDTNAAGTYTIAYAVTNSSGNTSTATSTITVKAD
QTSTKAKDSTLVAGPDTKWNAADNFVSATDADGTGIDFKSVNVSGSVDPTKPGDYEVTYS
YTDAGGNQVSAKATITVVSTKASIKAKDSTLVAGPDTKWNAADNFVSATDADGTGIDFKS
VNVSGSVDPTKPGKYEVTYSYTDAGGNQVSAKATITVVSSKANINGHDSTIDQGDSWTPQ
NNFDGGTDAEGNVIDFREIVVEGTVDSNVPGKYKVTYSYTDQEGNVFQKTVTINVLAKHS
NPTNPTNPTNPTNPTNPTNPTIPTDSTQTVISGNSGTRLPRTGEREGIEASLWGGLIVAI
STLLGILGIDRKRKQN
NT seq
2571 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatctttgatactaaacaacactacaaaatgtacaaaaaaggcaaatattgggctttt
gcggcaattacattagctacagttggcctttctggtcttataaacaacgatactacagtt
catgctgatactttaaatagcgaggcaaacactgccaaaaacgcatccaatggatatcaa
gactctcctcaaaaaacaaatgaacagcttaatcaggggtctaccgaaagctcggctcta
agcaagacaagcattaatccgacaattaatgctaacactgcagcaaataattctactaat
agtggtgacaaccaattaacgaataatgctccaactaataaaacctctagcaataatact
attgcttcaagcaattcttctaacgaaagcacaaaggttaatgctactttaagctcggtt
tctggagcgaatgtttcaatgacctcagacggtcttggaacaagctcctcaccagttaat
ggcaataattctgtcacatttaccttttcacttagcacgattattgggaaacaagagcta
catgctggtgatacgattgttctaaatgtagatagccagggcttaaattataataccgtt
ggcttatctggaggagctccttattttagtatgacaaagagtccttcaacaaacacaatt
actttaactgcaacggaagacataaattggaccaccactgatccaatagtgttttcaatt
tatggaaaccccttagatatttcaggaaataacaatataagaacttatccaattacgtcg
acttataatgataataaaaacaaccaaagtgttgttttgacaccatccaacacaaatctt
tacgtcaaaacgaatggcggtggaggatggaatgtcttggggtcaggcgtatatcctagc
gatgtatggggagctccttttagcaaagactatttcaataattatgttggtggtactgca
gacaatactggtacttatatatatagccagaatgcaatgaaattcacggctggctatttc
aacacttcatcttctgactatactgatggcgttcttaaagttaattcagattacgtcatt
gatcagaagtctattgttatatctattggtcggattggctcatatacggccatgcttaat
ccaaatattgtttgggatgcggatggtaaaggctttacgcttaatatcggttcactgccc
agaactggaaataacagtgttgcggtcactttttttgtgaaaaccgcaagtattaatgat
aagcctactttaaattcagttttaacagcgttggatccttctggggctgcaactagtgta
aatggtaaggctcatggaaaatatgttcccacaagcaatggatccttcacgcctaatatc
actgcaagtgataaaacgatatacagtactcaaaagttatctgaatctgatctgctagca
ttagcgacggcaaaagatcaaacagatggagatattagcaaaaatataactattacagat
aaaggtgggtttaaacttgacgatacgaatgctgcaggtacatatactatcgcgtatgca
gtgacgaatagttccggaaatacaagtacagcaacatctactatcaccgtaaaggcagat
caaactagtaccaaggcaaaggacagcactttagtggctggcccagacaccaagtggaat
gcagcggataatttcgtgagcgccactgatgccgacggcactgggattgatttcaagagt
gtaaatgtatccggaagtgttgatccaaccaagccaggcgattatgaagtgacctatagc
tacactgatgcaggtgggaaccaagtcagtgcgaaggcaacgattacggttgtttccaca
aaggcatcaattaaagcaaaggacagcactttagtggctggcccagacaccaagtggaat
gcggcggataatttcgtgagcgctactgatgccgacggcactgggattgatttcaagagt
gtaaatgtatccggaagtgttgatccaaccaagccaggcaagtatgaagtgacctatagc
tacactgatgcaggtgggaaccaagttagtgccaaggcaacgattacagttgtttcctca
aaggcaaatattaatggtcatgactccacaattgatcaaggtgattcttggacgccacaa
aacaattttgatggtggcacggatgctgaaggaaatgtaatagactttagagaaattgtg
gttgaaggtacagttgattctaatgttcctggaaaatataaagttacgtattcatatact
gatcaagaaggaaatgttttccagaagactgtaacaattaatgtattagcaaaacactcg
aatccgactaatccgactaacccgactaacccgactaacccaaccaacccaaccaatcca
actattccaactgattccacgcaaacggtaatttctggcaattcgggaacacgtttgccg
cgtacaggagaacgggaaggtattgaagccagtttatggggcggactaatcgttgctatt
agtaccttgctaggaatacttggcatagatcgaaaacgtaagcaaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
