Loigolactobacillus coryniformis subsp. torquens: LC20004_05610
Help
Entry
LC20004_05610 CDS
T05341
Name
(GenBank) phage tail tape measure protein
Organism
lcy
Loigolactobacillus coryniformis subsp. torquens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PhageMin_Tail
MotCF
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATO43413
UniProt:
A0A2D1KMQ6
LinkDB
All DBs
Position
1138010..1142623
Genome browser
AA seq
1537 aa
AA seq
DB search
MSQSLGHLASTVSLNIDPFKSSATALKAQIKSTAAALKAQEAAIKGAGNSVNGMKSAYGS
MQQQMKNYNAQLERQKATYDKLKNTTAETEAEQQKLTARQANAANQYNKTSANIETLRAR
MATMKQQIVLQEDGWTQAGDKMVAFGSKTTQVSQKLSTFGSGMTTKVTAPIVLGLAAAAK
SAVDFNSQISAMGPLLTNGGKITATVRQELDQMGASSKQWSMQFGVSTGKINEGMTEMVK
RGYSAQQTMGAMPAVLNAAKASGDDFNDVMHVSTSVLEQFGLKTNSTNGMLKNTSRVTDS
LTYVANATAAGFQDMGEAMTYVGPSAHAAGISLEETAAAIGIMSNRGIEGSVAGTSLRGA
LTRLLKPSKQNVAGFKELGVNVADFKKGTLTLPQIIDKIKTNTKGWTDEQRASAVAMAFG
TEAQAGMNALISAGGDELRKYTKGAKDSAGTTKEIADQLNDTQAAKVARFKESIHVLGIE
VGEKLLPALTPLINKATDMVQSFSKMDSSTQQSIIKWAIFAAAIGPVAGTLGKVGSLIGG
TSTVMGSLAKGIGRMSSAAKLGSTGLDVLKAGFSNSAYEATTFAGAASTVGVKAEGMAGG
LAAAETGSTGLLAAIGPVGVAIGATALAAGVGVAAWELWGKKAYESSQRTERWGTDVGAA
ADKSLTKMQNFSTQTKVYMNAANSGTQENTEQIKKAFDSMASSIEQSSKRELAAVQQTER
SLGDGYNTSALEKKATYYQQSIQLAQHAQSVVDNIEKGQSESKRKRTTADNQMILNAQND
LIEAQIKGLNLSSKKQKIVADQFAEDFKDKSVSQLNSMNQAYATAASKTKEYKGALDAVR
EANKGLSDSQKNSNWAKFVKDNVSTLGPVYDNYLAQVKKINSSSDDQATKQTKLQSAYGD
LALAVQSLGIPFDTFLKVVKKSDSATKDTADGIVSTSTKMSSAVHDAANNWNDLVFDPKT
GKMKTNTAEIIGQAKAGSDTWNDINLLVKEGKMDVKGMEEVSKATLATNSWNKLTPKNQL
LVAKVTGNDKVIDALGKFKLWNELTPEQKAAVAQAKGQDEVFAAIGGIDRWNASTPEQQN
AIIKTAGKENVEQAVLTLQNWNSMTPEQKQATVQTLGGEAVSKTILSMDSWNQMSVEQKN
ATVQSLGHPELLQMIGGIGAFNALNPKTQQAVAQAIGNGSVTDLTSKMNIWSGLTPSQKW
AIANTQGSDKVWSAIQTFGGWEKLTPGQKTAVAKQIGRGDVQGAIDTVNKWRGTSPGGTK
NASGADHASGQMNNAKRSVDSFRGTSPGGTKNANGSDHTSGQFGTATGAVNRFRGTSPGS
TKNANAADHASGPANAASSAVGAFANKRDHTVTLTSIFKSIYKKITQSAKGTRDFAGGAI
MVNDQAGPVFRELVRFPNGDSFVPVGRNVVFNAPKHTQVVPAAKTNHLLGGIPQFANGTA
GHDQAVRTLLDAKPMIQAQQQSVTNNRIVQVSNFNGLEEKLQQLDKLTDIVGYLAKILAK
NPNLYLDGKQVGESVEPTVSKNQMQNNILTERGVFSG
NT seq
4614 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctcaaagtttaggccacttggcgtcaaccgttagcctgaatattgatccatttaag
tcgtctgcgaccgcacttaaggcgcaaattaaatcgactgcagcagcgctaaaggcacaa
gaagcggccataaaaggagcgggcaatagcgttaatggcatgaagtcagcctatggatca
atgcagcaacagatgaagaattataatgcccagttggagcgccaaaaagccacttacgat
aaattaaagaatacgactgctgaaaccgaagcggaacagcaaaagctcacggcgcgccaa
gccaatgcagctaaccagtacaataaaacttccgctaacattgaaactttacgcgcgcgt
atggcaacgatgaagcaacagattgtgctgcaggaagacggttggacccaagcaggcgat
aaaatggttgcttttggttcaaaaacaacccaagtcagtcaaaaattaagcacttttggt
tcagggatgacgaccaaagtaaccgcgccgattgtgcttggcttggccgctgctgctaaa
tctgcagtggattttaattcacagatcagcgctatgggtcccttgctaactaatggcggc
aaaataaccgctaccgttagacaagaattagatcaaatgggcgcatcatcaaagcagtgg
tccatgcaatttggtgtttccaccggcaagatcaatgaaggtatgactgaaatggttaag
cgtggttattcggcccaacaaaccatgggcgcaatgcccgctgttttaaatgcagctaag
gcttccggtgatgactttaatgatgttatgcatgtttcgacctcagttcttgaacaattc
ggtttaaaaaccaattcaaccaatgggatgctgaaaaatactagtcgcgttaccgacagc
ttgacctatgttgccaacgcaaccgcggctggatttcaggatatgggcgaggctatgact
tatgttggaccgtccgctcatgctgctggaatcagtttagaagaaactgctgccgcgatt
ggcatcatgagtaatagaggcattgagggttcagtcgccggtacttcattacgtggcgca
ctaacgcggttactcaagccgtcaaagcaaaacgttgctggctttaaagaattaggtgtt
aatgtagcggatttcaaaaaaggcacactaacgttaccgcagatcattgataaaatcaaa
accaatacaaaaggttggaccgatgagcagcgagcttctgctgtggcaatggcctttggc
actgaggcgcaagccggaatgaatgcactgatttctgccggtggtgatgagctacgtaag
tataccaaaggagcaaaagattcagccggaaccactaaagaaattgctgatcagttaaat
gacacgcaagccgctaaggtagccagatttaaagaatcgatccatgttcttggaattgaa
gtaggtgaaaaattattgcctgctttaacaccattaattaacaaagcaacagacatggtg
caatcattttctaaaatggattcgtccacacaacagtcgattattaagtgggctattttc
gctgccgcaattggaccagttgcgggaaccctaggtaaagttgggtcattaattggtggt
actagtacggtcatgggttcattagctaaaggtattggccgaatgagtagcgcagccaag
cttggcagtaccgggctagatgttttgaaggctggattttccaattcggcctatgaggcg
actacatttgccggcgccgccagtacggttggcgttaaggcagagggcatggccggcgga
ttagctgctgcagagaccggaagtactggtttactcgcagcaattggccctgttggcgtt
gcgattggcgccaccgcacttgctgctggagttggtgttgcggcatgggagctatggggt
aaaaaagcttatgaatctagtcaaaggacagaacgctggggcacggatgttggcgccgct
gcggataagtccttgactaagatgcagaattttagtacccaaaccaaagtttatatgaat
gctgctaattctgggactcaagaaaatactgaacagattaaaaaagcttttgattcaatg
gctagcagtattgaacaaagcagcaaacgcgaattggctgcagttcaacaaactgaacgg
agcttaggtgacggttataatacatctgccttagaaaagaaagctacttattatcaacag
agtattcagttggctcaacatgcgcagagcgttgttgacaatatcgaaaaaggtcagagt
gagtcaaaacgtaaacgaacaaccgctgacaaccagatgattcttaatgcccagaatgac
ttgatcgaagcacaaattaaagggctcaatttaagttctaaaaaacagaaaattgtcgcg
gatcaatttgccgaggattttaaagataaatcggtttcacaattaaattcgatgaatcag
gcctatgcaactgctgccagcaaaactaaagaatataagggtgcgctggatgctgttaga
gaagcgaacaagggattgtctgattcacaaaagaacagcaactgggccaaattcgttaag
gacaatgtctcaaccttggggccagtttacgataactacttagcccaggttaaaaaaatc
aacagttcttctgatgatcaagcaaccaagcagactaagctacaatccgcgtacggggac
ttagctttagctgtacagtcgctaggtattccattcgatacttttcttaaagtcgtaaaa
aaatctgattctgcaacgaaagatactgctgatggtatcgtatcaacatcaacgaaaatg
tccagtgcggttcatgatgcggccaacaattggaatgatttagttttcgatccaaaaacc
ggcaaaatgaaaactaataccgcggaaataatcggtcaggctaaagcaggttccgatacg
tggaatgacatcaatctcctggttaaagagggcaagatggatgtcaagggcatggaagaa
gtatcgaaggcgacgttagcaactaattcttggaataaattgacccctaagaatcagttg
ttggtcgctaaagttaccggtaatgataaagttattgatgcactcggaaaatttaaactt
tggaatgagctaacgccagaacaaaaagcggcggtcgctcaagcaaaagggcaggatgaa
gtctttgccgctattggtggcattgatcggtggaatgcctccacaccagaacaacaaaat
gcgatcattaaaactgctggcaaagaaaatgtcgagcaagcagtactcactttgcagaac
tggaattctatgacacctgagcagaaacaagccacagtccaaacgcttggcggtgaggcg
gtcagtaaaaccatcctatccatggacagttggaaccaaatgtctgttgagcaaaaaaat
gcaacggtgcagtctttaggccacccagagttattacaaatgatcggtgggattggcgcc
tttaatgccttgaaccctaaaacacaacaggcagttgctcaagcgattggtaacggtagc
gtcactgatttgactagtaagatgaacatctggagcgggttaacaccgtcccaaaaatgg
gcgattgctaatacacaaggttctgataaggtttggagcgctatccagactttcggtggt
tgggaaaaactaacacctggtcaaaagacggctgttgcgaaacaaattggtcgtggcgat
gtacaaggtgcaatcgataccgttaataaatggcgcggcacctcaccgggaggaactaaa
aatgctagcggtgcggatcatgctagtgggcagatgaataatgctaaaagaagtgttgat
tcatttcgtggtacttcacccggtggcaccaaaaatgctaacgggagtgaccatacttcg
gggcaatttggtaccgcaaccggagcggtaaatcgattccgcggtacttcaccgggatca
actaaaaatgcaaatgcagcagatcacgcgtctggaccagccaatgctgcaagtagtgca
gttggggcttttgcaaacaaaagagaccatactgtaacgctgacaagtatattcaaatca
atttataaaaaaataacccagagcgcaaaaggtaccagagattttgctggtggcgcaata
atggtcaatgatcaagctgggcctgtttttcgtgaattagttaggtttcctaatggtgat
tcgtttgttccggtagggcgaaatgttgtatttaatgcgcctaagcatacgcaagtcgtt
cctgcagcaaagacaaaccacttacttggtggaattccgcagtttgctaatggtacagca
gggcatgatcaagctgttagaacattgcttgatgccaagccgatgattcaggcacaacag
caaagcgtgaccaacaacaggattgtgcaagtttctaatttcaacggcctagaggaaaag
ctacagcaattagataagttgaccgatatcgttggctatttagcgaagatattggccaag
aatcctaatctttatttagacggtaaacaagttggcgaaagcgttgagccgacggtatct
aaaaatcaaatgcaaaataatattctgacggaaaggggcgtatttagtggctaa
DBGET
integrated database retrieval system