Leclercia sp. W17: DVA44_03710
Help
Entry
DVA44_03710 CDS
T05987
Name
(GenBank) filamentous hemagglutinin N-terminal domain-containing protein
Organism
lee
Leclercia sp. W17
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
Fil_haemagg
Vps36_ESCRT-II
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXF63308
LinkDB
All DBs
Position
741347..745225
Genome browser
AA seq
1292 aa
AA seq
DB search
MISSDEKVQQRASIKLAPLTIAMILALPAVAHSADLSMKNGKIYNANGVPVVDINKANSS
GLSHNVWDNLNVDKKGLIFNNSASATSTLLGGDIQGNSNLSGGTAKVILNEVTSKNMTTI
NGMMEVAGDKAGLIIANPNGITVSGGGSINASKLTLTTGKPDIKDDELNGFSVNGGTITL
GKLDSASPTEILSRNVVINGKVSADELNVVAGNNYVNTAGEVTGKVTATGKRNGYSVDVA
KLGGMYANKINLVSTESGVGVRNLGVIVGGEKGISIDANGQLLNSNAQIKSEGIINLKTK
GSLENTTGTIASNKTISIDTNKNKITNTRAGKITTFADIYVNSGAIDNTNGKIAAGGVLA
VNTNKNTLINSGKGNNVGIEAGIVALETGTLNNSNGQIRGEYMELNSAYLNNNNGILETN
GDIIINSSDNIDNNKGLIRSASGRINMTAAKSVNNKTTKTADTNSADTLGIASETGVKIV
ANAIYNNGGQIASNGDVSLESRGMIDNDSGKVMSNAKAIVKGSSVRNDNGGISGKQGTNV
TVDGNLTNYIGVISSEEGDVALKANTVNNYGGFITAQNISIDTKGELNNSTALIVANKKL
TVNAGTNIQNRNSNNFGNNFGLYFGMPQQNGGMIGKEGVNLTANNIYNNYSRIISEKGSI
DLNSRNNFENNNAQLVSGGDAVIKVGNTFNNNYATTYSAGNLSINTTNLSINSNGNFLDN
NATGIIASDKDLILNVTNNLNNTGWISGKGNVTLNVLKGQLNNRNTIAADKSLTITASNG
IENSKDISSGGTLTLDSKRSIVNNNNSSIVGYNIVMNANNDITNRSNIVSDADMKITAKG
NLNNYLNLVSYGDVAITANSVNNNNSVIDAKGALSINSTGKIGNSRGTLRSQTGDMSLVS
NNNNIDNYYGYLISGGKIAIKGNNLNNDNGLIGSNGDINLSLKGSFDNGKGSVSSNWGDV
VLNANSIDNNNGFISGKNVSVDSKSTIYNNDALISAYKVLTVNANGNVENKNGNNFNRDH
GAYFDLVDSIGGMSGKEGLNITAQNIYNNNSNLIAEKGALTLNSRGVFDNTSAKVISGAD
NSINVAGVFYNNYATVYSEGNLDIKASKLENLSNGSMEKNNATGVIASDKNLNLTIDNSF
TNYGWISGKGDVNLNVLKGAFYNRNTLSADKAMTINTLSGVENYKDIVAGTTLTVNTEKH
ITNSNNSNMLGKDIVMNAVNNIVNHGNIVSDYSLIAKTAGDIYNYLNMLSYGVAKVTAKN
VVNSDKNAVLGGFYGLELESEKTTNTGTLVGM
NT seq
3879 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatttcttcggatgagaaagttcaacagcgagccagtattaagctggctccgttaacg
attgcaatgattttagccttacctgcagtcgcacattcagcagatttatccatgaaaaat
ggaaagatctacaacgccaacggcgttccggttgttgacattaataaggcaaacagcagc
ggtttatcacataacgtttgggacaatctgaacgttgataaaaaaggcctcattttcaac
aacagcgcttcagccaccagtacgctattaggcggtgatatccagggaaatagcaatctg
agtggtggtaccgctaaagtcattctcaacgaagttacctccaaaaacatgacgaccatc
aatggcatgatggaagttgctggcgacaaagcgggtttaatcattgctaaccctaatggc
atcaccgtgagcggtggtggcagcatcaacgccagcaaattgaccctgactaccggtaag
ccagatattaaggacgatgaactgaatggctttagcgtcaacggtggcaccattactttg
ggtaagctggatagtgcaagcccgacagaaattctttcacgcaacgttgttatcaatggc
aaagtttctgccgatgaacttaacgtggtggcagggaataactatgtaaacacggctggc
gaggtcactggcaaagtaaccgcaacgggcaagcgtaacggctatagtgttgatgtcgct
aaattaggcgggatgtatgccaataaaattaatctggtcagcacggaaagcggggtaggt
gtccgtaacctcggcgtcattgtcggcggtgagaaaggtatcagtatcgatgctaatggc
cagttgctgaacagcaacgcccagattaagtctgaaggcatcattaatttaaaaacaaag
ggctcgctggagaatacgacaggcacaatcgcgtctaacaaaacgatctcgatcgatacc
aataagaacaaaatcaccaatactcgcgcgggaaaaatcacaactttcgctgatatttat
gtgaacagtggtgccatcgataacacgaacggcaagattgctgccggcggagtgttagcc
gttaatacgaataaaaataccctgattaactccggtaaaggaaataatgtgggtattgag
gcaggtattgtcgcgttagagaccggtacgctgaataacagcaatggtcaaattcgtggt
gaatacatggagctgaattctgcatatctcaataataataatgggatattagaaactaac
ggcgacatcatcattaacagcagtgataatattgataacaacaaggggttgatccgctct
gcaagtggccggattaatatgactgctgctaagtctgtcaataataaaaccaccaaaacc
gcggatacaaacagtgccgatacattaggtattgcgtctgaaactggggttaaaattgtc
gctaatgcgatctataacaatggtggacagatcgcatctaatggcgatgtctcgttggaa
agtcgcggcatgattgacaacgattcaggcaaggtgatgtccaacgccaaagcgatagtg
aaaggcagctccgttcgcaatgacaacggtggtatcagcggcaagcagggcacaaatgtt
actgttgatggtaatctgacaaactacatcggggtcataagttctgaagagggcgatgtc
gcgctgaaggccaataccgttaataactacggtggttttattaccgcgcaaaatatctct
atcgataccaagggagagttaaacaacagtactgcacttattgttgccaataaaaagctg
acggtgaatgcgggtacaaatatacagaaccgcaatagtaacaattttggtaataatttc
ggtctctattttggcatgccacagcagaacggtggtatgatcggcaaggaaggtgtcaac
cttaccgcaaacaatatttataacaactatagtcgaattatttctgaaaaaggttcgatt
gatctgaattcaagaaataattttgaaaataacaacgcccaacttgttagtggtggcgat
gcagtcataaaagtgggtaatacgtttaataacaattatgcgactacctacagtgctggc
aaccttagcatcaacactacaaatttaagcattaatagtaacggcaatttccttgataac
aatgcaaccgggattattgcttcagataaagatctgattctgaacgttactaataatctt
aataacacaggctggatcagcggtaagggcaatgtcactcttaacgttctgaaaggtcaa
ttaaataaccgtaatacgatcgctgccgataagtctctgaccataacggcctctaatggt
attgagaactcaaaagatatctcctctggtggtacattaactctcgattctaaacgttct
attgtgaacaacaataacagtagtattgttggttataatatcgttatgaatgcgaacaat
gatatcactaaccgtagcaatattgtcagcgatgctgacatgaaaataacagctaaaggt
aatttaaataattatctcaatctggttagctacggtgacgtggcgattactgctaatagt
gtcaataacaataactcggtgatcgatgctaagggtgccttgagtattaactcaacaggc
aagattggcaactccagagggacgttacgttctcagactggagatatgtctcttgtttct
aataataataacattgataactattatggctatcttatctctggtggtaagattgcgatc
aaagggaacaatctgaacaatgataacggcctgattggaagcaacggggatatcaacctt
tcccttaaaggatcctttgacaatggtaagggatctgtcagcagtaattggggtgatgtc
gttctgaatgcgaacagcattgataataacaacggtttcatctcaggtaagaatgtttcc
gtcgattctaaatcaacgatttataacaatgatgcattaatttctgcttataaagttctt
actgttaatgctaacggtaacgttgaaaacaaaaatggcaacaactttaatcgcgatcat
ggtgcatatttcgacctggttgatagcattggcggtatgagcggtaaagaaggacttaat
attactgctcagaacatttacaacaacaatagcaacttgatcgctgagaaaggtgctctg
acgttaaactccagaggtgtcttcgataatacgtctgcgaaagtaattagcggggctgac
aacagcatcaatgtcgctggtgttttctacaataattatgcaaccgtatacagcgagggg
aatcttgatattaaggcttccaagctggaaaatttaagtaatggaagcatggagaagaat
aacgcaacaggtgttattgcttcagataaaaatttgaaccttactattgataacagcttt
actaactacggctggattagcggtaaaggtgatgtcaatcttaacgttctgaaaggagca
ttttataaccgcaatacactttctgctgacaaagctatgacaatcaatactctgagtggt
gttgagaactataaagacattgttgcaggaacgacgctgaccgtgaacaccgagaagcat
attacaaatagtaataatagtaatatgcttggtaaagatatcgtgatgaatgcagtgaat
aatatcgttaaccacgggaacatcgtaagcgattattctttaatcgcaaaaacagcaggg
gatatctataactatctcaatatgctgagctacggtgtcgctaaagtcactgcgaaaaat
gtcgttaacagcgataaaaatgcggttttaggcggtttttatggtttagaactggagtca
gaaaagacaactaacactggtacccttgtagggatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system