KEGG   Candidatus Legionella polyplacis: CCU22_00835
Entry
CCU22_00835       CDS       T05191                                 
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
  KO
K03046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
les  Candidatus Legionella polyplacis
Pathway
les03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:les00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    CCU22_00835 (rpoC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:les03021]
    CCU22_00835 (rpoC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:les03400]
    CCU22_00835 (rpoC)
Enzymes [BR:les01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     CCU22_00835 (rpoC)
Transcription machinery [BR:les03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     CCU22_00835 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:les03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      CCU22_00835 (rpoC)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 Peptidase_M23 Apocytochr_F_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: ATW01770
LinkDB
Position
complement(158636..162847)
AA seq 1403 aa
MDNLLNFFKKQNNQGEEFDKIRISLASPDLIRSWSYGEVKKPETINYRTFKPERDGLFCA
KIFGPVKDYECLCGKYKRLKHRGVVCEKCGVELALSKVRRERMGHIELASPVAHIWFLKL
LPSRIGLLLDMTLRDIERVLYFESFVVVDSGMTSLEKGQILNDEAYLNAIDKYGDEFDAR
MGAEAIRDLLRQIDIEEEIKLLRKELPSINSETKTRKITKRLKLLEAFYESKNKPEWMVL
DVLPVLPPDLRPLVPLDGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLSAPDIIIRNERRML
QEAVDALLDNGRRGRAINGSNKRPLKSLADMIKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGP
TLRLHQCGLPKKMALELFKPFIFSKLEFRGFASTIKTAKRMVENEDPVVWDILDEVIKEH
PILLNRAPTLHRLGIQAFEPVLIEGKAIQLHPLVCTAYNADFDGDQMAVHVPLTLEAQLE
ARVLMMSTNNILSPANGEPIIVPSQDVVLGLYYLTRERILAKGEGKVFSSIQEVKNFYEA
GYIDLHAKIKVRIYCKNDNVHNYELVDTTVGRSILFDILPDGTSFSLINKTMTKKVILKV
VDICYRKFGLQKTVLFADNLMYMGFKYATRAGASIGIEDMIIPNDKVSIINQADKEVREI
ESQFRSGLVTNRERYNKVVDIWSRANEVIARSMLSEIAKEKILDSDGSILFQESFNPIFM
MADSGARGSAAQIRQLAGMRGLMAAPDGSIIETPITANFREGLSVFQYFISTHGARKGLA
DTALKTANSGYLTRRLVDVAQDVVITELDCGTKKGILMHSLIEGGDIVEPLRERVLGRVL
ASDIYIDDKKVPYISYGTLLDEILVEKLDKFGIDQIMVRSPITCETRFGLCANCYGRDLA
RGHLVNTGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHIGGAASRSTTLNSICVKNSGIVRLHNIR
TVKHKNNNLITISRSGELSIIDVFGREKERYKLPYGAILTVHDDVKVESGQVIANWDPHT
HPVISEVGGKLKFVDLIEGLTMHHQTDEITGITNIVVVDAKQRGMIGRDLKPMVKLVSDD
DKDIYLSGTGIPAQYYLPSDAIINFEDGCIVELGDVIARIPKERSKTRDITGGLPRVADL
FEARKPKDSAVMAKISGIVSFGKETKGKRRLIISVSDKEKYEELIPKWRNISVFEGEHVE
RGEILSEGPLNPHDILSLLGIGALSNYIVNEVQDVYRLQGVKINDKHIETIIRQMLRKRV
ITFVGDSKFLLGEHVEEGILLEENDRLTLDNKQIAKGVPILLGITKASLSTESFISAASF
QETTRVLTEAAVSGKTDELRGLKENVMVGRLIPAGTGYTYHKLRKKRKNKVKLFCDKENN
MITSHKVDRDSNKVFDMDDRIMS
NT seq 4212 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggataatttattaaatttttttaaaaaacagaataatcaaggtgaagagtttgataaa
attcgtatttctcttgcttctcctgatttaattcgttcttggtcttatggtgaggttaag
aaacctgaaacaattaattataggacttttaaacctgaaagagatggtttattttgtgca
aaaatatttggtccagttaaagattatgaatgtttatgtggaaaatataagagattaaaa
catcgcggagtggtttgtgaaaaatgtggagttgaacttgctttatctaaggtaagaaga
gagagaatgggtcatatagagttagctagtcctgttgcccatatatggtttttaaaatta
cttccttcaagaattggattattattagatatgactttgcgtgatattgaaagagttctt
tattttgaatcgtttgttgttgttgattctggaatgacttcattggaaaaaggacaaatt
ttaaatgatgaagcatatttgaatgctatagataagtatggagatgaatttgacgctcgt
atgggtgcagaggctattcgtgatttgttacggcaaattgatatagaagaggaaattaaa
ttattacgaaaagaattgccaagtattaattctgaaacaaaaacaagaaaaataactaaa
agattaaaattacttgaagctttttatgaatctaaaaataaaccagaatggatggtttta
gatgttttacctgttttgcctccagatttaaggccattagttcctttggatggtggtcgt
tttgctacttcagatttaaatgatctttataggagagttattaatagaaataatagactt
aaaagattacttgatttaagtgctccagatataataattcgtaatgaaaggagaatgctt
caagaagcagttgatgcattattagataacggacgtcgtggtagggcaataaatggttca
aataaacgacctttaaagtctttagctgatatgatcaaaggaaaacaaggaagatttaga
caaaatttattaggaaagcgtgtagattattctggtagatcagttattgttgttggtcct
actttacgtttgcatcagtgtggacttcctaagaagatggctttggagttatttaaacca
tttatttttagtaaattagagtttcgaggatttgccagtacaattaagacagctaaaaga
atggttgagaatgaggatcctgtagtttgggatattttagatgaagtaattaaagagcat
cctatattattaaatagagctcctactttacatagattaggtattcaggcatttgaacca
gttttaatagaaggaaaagctattcaacttcatccattggtatgtacagcttataatgct
gattttgatggagatcaaatggcggttcatgtaccattaactttagaggctcaacttgag
gctagagttttaatgatgtcaacaaataatattttgtcaccagctaatggtgaacctatt
attgttcctagtcaagatgtggtgttaggattgtattatttaacaagagaacgaatttta
gcaaaaggggaaggaaaagttttttctagcatacaggaagttaaaaatttttatgaggct
ggttatattgatcttcatgcaaaaataaaagttcgtatttattgtaaaaatgataatgtt
cataattacgaattagtagatacgactgtaggaaggtctattctttttgatattttacct
gatggaacttcttttagtttaataaataaaactatgacaaaaaaagttattttgaaggta
gttgatatttgttatcgtaaatttggattgcaaaaaactgtactgtttgcggataactta
atgtatatggggtttaagtatgctactcgagctggtgcttctattggaattgaagatatg
attattcctaatgataaagtttctattattaatcaagctgataaagaagttcgtgaaatt
gaatctcagtttagatctgggcttgttactaatagagaaagatataataaagtagttgat
atttggtctagagccaatgaagttatagcaaggtctatgttatctgaaattgctaaagaa
aaaattttggattctgatggaagtattttgtttcaagaatcttttaatccaatttttatg
atggcagattctggtgctagaggttcagctgctcaaattcgtcaacttgctggaatgaga
ggattaatggctgctccggatggttctataattgaaacaccaattactgctaattttaga
gagggacttagtgtttttcaatattttatatctacacatggtgcaaggaaaggtttagca
gataccgcattaaagactgctaattctggttatttaacaagaaggttagtagatgttgct
caagatgtagttataactgaattagattgtggtacaaaaaaaggtattttaatgcattct
ttaatagaaggtggtgatatagtagagcctttacgtgaacgagtgttaggtagagtactt
gcatctgatatttatatagatgataaaaaggttccttatatttcttatggtactttatta
gatgaaattttagttgaaaaacttgataaatttggtatagatcaaattatggttagatct
cctattacttgtgaaactagattcggtctttgtgcgaattgttatggtcgtgatttagct
agaggtcatttagttaatactggagaagctgttggtattatagctgctcaatctattgga
gaacctggaacgcaattaacaatgcgtacttttcatattggtggagcggcttctagatct
actactttaaatagtatttgtgtaaaaaattctggtattgtaagacttcataatattaga
acagtcaaacataagaataataatcttattactatttctaggtcaggagagttgtctatt
atcgatgtttttggtagagaaaaggaacgttataaattaccttatggtgctatattgact
gttcatgatgatgttaaggtagaatcaggacaggttattgcaaattgggatccacatact
catccagtgatttctgaagttggtggaaaattaaagtttgttgatttaatagaaggttta
acaatgcatcatcaaactgatgaaataactggtataactaatattgtggttgtagatgct
aaacagagaggaatgataggaagagatttaaagccgatggttaagttagtttctgatgat
gataaagatatttatttatctggtactggtattccagctcagtattatcttccatctgat
gctataattaattttgaagatggatgcattgttgaattaggagatgtaattgctcgtata
cctaaagaacgttctaaaactagggatataactggtggattacctcgtgttgcagatctt
tttgaagctagaaagccaaaagattctgctgttatggctaaaatatctggaatagttagt
tttggaaaggaaacgaaaggaaagagaaggttgattatttcagtttctgataaagaaaaa
tatgaagagttaatacctaagtggagaaacatttcagtatttgaaggagaacatgttgag
agaggtgaaattctttcagaaggccccttaaatcctcatgatatattgtctctattaggt
attggtgcattgtctaattatattgttaatgaagttcaagatgtatatcgtttgcaagga
gtaaaaataaatgataaacatattgaaactattattagacaaatgctaaggaaacgtgtt
ataacttttgttggggattctaaatttttattgggggagcatgttgaagagggaattctt
ttagaagaaaatgatagattaactttagataataaacaaatagcaaaaggagtcccaatt
ttattgggaattactaaggcttctttatctactgaatcatttatttctgccgcttctttt
caagagactactcgtgttttaacggaagctgcagttagtggaaaaacggatgaattaaga
ggtttaaaagaaaatgtaatggtaggacgtttaatacctgctggtacaggatatacatat
cataaacttcgtaaaaaaagaaaaaataaagtcaaattgttttgtgataaagaaaacaac
atgattacatcacataaggttgatcgtgattcaaataaagtatttgatatggatgataga
ataatgagttaa

DBGET integrated database retrieval system