Candidatus Legionella polyplacis: CCU22_00835
Help
Entry
CCU22_00835 CDS
T05191
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
les
Candidatus Legionella polyplacis
Pathway
les03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
les00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
CCU22_00835 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
les03021
]
CCU22_00835 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
les03400
]
CCU22_00835 (rpoC)
Enzymes [BR:
les01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
CCU22_00835 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
les03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
CCU22_00835 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
les03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
CCU22_00835 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
Peptidase_M23
Apocytochr_F_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATW01770
LinkDB
All DBs
Position
complement(158636..162847)
Genome browser
AA seq
1403 aa
AA seq
DB search
MDNLLNFFKKQNNQGEEFDKIRISLASPDLIRSWSYGEVKKPETINYRTFKPERDGLFCA
KIFGPVKDYECLCGKYKRLKHRGVVCEKCGVELALSKVRRERMGHIELASPVAHIWFLKL
LPSRIGLLLDMTLRDIERVLYFESFVVVDSGMTSLEKGQILNDEAYLNAIDKYGDEFDAR
MGAEAIRDLLRQIDIEEEIKLLRKELPSINSETKTRKITKRLKLLEAFYESKNKPEWMVL
DVLPVLPPDLRPLVPLDGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLSAPDIIIRNERRML
QEAVDALLDNGRRGRAINGSNKRPLKSLADMIKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGP
TLRLHQCGLPKKMALELFKPFIFSKLEFRGFASTIKTAKRMVENEDPVVWDILDEVIKEH
PILLNRAPTLHRLGIQAFEPVLIEGKAIQLHPLVCTAYNADFDGDQMAVHVPLTLEAQLE
ARVLMMSTNNILSPANGEPIIVPSQDVVLGLYYLTRERILAKGEGKVFSSIQEVKNFYEA
GYIDLHAKIKVRIYCKNDNVHNYELVDTTVGRSILFDILPDGTSFSLINKTMTKKVILKV
VDICYRKFGLQKTVLFADNLMYMGFKYATRAGASIGIEDMIIPNDKVSIINQADKEVREI
ESQFRSGLVTNRERYNKVVDIWSRANEVIARSMLSEIAKEKILDSDGSILFQESFNPIFM
MADSGARGSAAQIRQLAGMRGLMAAPDGSIIETPITANFREGLSVFQYFISTHGARKGLA
DTALKTANSGYLTRRLVDVAQDVVITELDCGTKKGILMHSLIEGGDIVEPLRERVLGRVL
ASDIYIDDKKVPYISYGTLLDEILVEKLDKFGIDQIMVRSPITCETRFGLCANCYGRDLA
RGHLVNTGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHIGGAASRSTTLNSICVKNSGIVRLHNIR
TVKHKNNNLITISRSGELSIIDVFGREKERYKLPYGAILTVHDDVKVESGQVIANWDPHT
HPVISEVGGKLKFVDLIEGLTMHHQTDEITGITNIVVVDAKQRGMIGRDLKPMVKLVSDD
DKDIYLSGTGIPAQYYLPSDAIINFEDGCIVELGDVIARIPKERSKTRDITGGLPRVADL
FEARKPKDSAVMAKISGIVSFGKETKGKRRLIISVSDKEKYEELIPKWRNISVFEGEHVE
RGEILSEGPLNPHDILSLLGIGALSNYIVNEVQDVYRLQGVKINDKHIETIIRQMLRKRV
ITFVGDSKFLLGEHVEEGILLEENDRLTLDNKQIAKGVPILLGITKASLSTESFISAASF
QETTRVLTEAAVSGKTDELRGLKENVMVGRLIPAGTGYTYHKLRKKRKNKVKLFCDKENN
MITSHKVDRDSNKVFDMDDRIMS
NT seq
4212 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataatttattaaatttttttaaaaaacagaataatcaaggtgaagagtttgataaa
attcgtatttctcttgcttctcctgatttaattcgttcttggtcttatggtgaggttaag
aaacctgaaacaattaattataggacttttaaacctgaaagagatggtttattttgtgca
aaaatatttggtccagttaaagattatgaatgtttatgtggaaaatataagagattaaaa
catcgcggagtggtttgtgaaaaatgtggagttgaacttgctttatctaaggtaagaaga
gagagaatgggtcatatagagttagctagtcctgttgcccatatatggtttttaaaatta
cttccttcaagaattggattattattagatatgactttgcgtgatattgaaagagttctt
tattttgaatcgtttgttgttgttgattctggaatgacttcattggaaaaaggacaaatt
ttaaatgatgaagcatatttgaatgctatagataagtatggagatgaatttgacgctcgt
atgggtgcagaggctattcgtgatttgttacggcaaattgatatagaagaggaaattaaa
ttattacgaaaagaattgccaagtattaattctgaaacaaaaacaagaaaaataactaaa
agattaaaattacttgaagctttttatgaatctaaaaataaaccagaatggatggtttta
gatgttttacctgttttgcctccagatttaaggccattagttcctttggatggtggtcgt
tttgctacttcagatttaaatgatctttataggagagttattaatagaaataatagactt
aaaagattacttgatttaagtgctccagatataataattcgtaatgaaaggagaatgctt
caagaagcagttgatgcattattagataacggacgtcgtggtagggcaataaatggttca
aataaacgacctttaaagtctttagctgatatgatcaaaggaaaacaaggaagatttaga
caaaatttattaggaaagcgtgtagattattctggtagatcagttattgttgttggtcct
actttacgtttgcatcagtgtggacttcctaagaagatggctttggagttatttaaacca
tttatttttagtaaattagagtttcgaggatttgccagtacaattaagacagctaaaaga
atggttgagaatgaggatcctgtagtttgggatattttagatgaagtaattaaagagcat
cctatattattaaatagagctcctactttacatagattaggtattcaggcatttgaacca
gttttaatagaaggaaaagctattcaacttcatccattggtatgtacagcttataatgct
gattttgatggagatcaaatggcggttcatgtaccattaactttagaggctcaacttgag
gctagagttttaatgatgtcaacaaataatattttgtcaccagctaatggtgaacctatt
attgttcctagtcaagatgtggtgttaggattgtattatttaacaagagaacgaatttta
gcaaaaggggaaggaaaagttttttctagcatacaggaagttaaaaatttttatgaggct
ggttatattgatcttcatgcaaaaataaaagttcgtatttattgtaaaaatgataatgtt
cataattacgaattagtagatacgactgtaggaaggtctattctttttgatattttacct
gatggaacttcttttagtttaataaataaaactatgacaaaaaaagttattttgaaggta
gttgatatttgttatcgtaaatttggattgcaaaaaactgtactgtttgcggataactta
atgtatatggggtttaagtatgctactcgagctggtgcttctattggaattgaagatatg
attattcctaatgataaagtttctattattaatcaagctgataaagaagttcgtgaaatt
gaatctcagtttagatctgggcttgttactaatagagaaagatataataaagtagttgat
atttggtctagagccaatgaagttatagcaaggtctatgttatctgaaattgctaaagaa
aaaattttggattctgatggaagtattttgtttcaagaatcttttaatccaatttttatg
atggcagattctggtgctagaggttcagctgctcaaattcgtcaacttgctggaatgaga
ggattaatggctgctccggatggttctataattgaaacaccaattactgctaattttaga
gagggacttagtgtttttcaatattttatatctacacatggtgcaaggaaaggtttagca
gataccgcattaaagactgctaattctggttatttaacaagaaggttagtagatgttgct
caagatgtagttataactgaattagattgtggtacaaaaaaaggtattttaatgcattct
ttaatagaaggtggtgatatagtagagcctttacgtgaacgagtgttaggtagagtactt
gcatctgatatttatatagatgataaaaaggttccttatatttcttatggtactttatta
gatgaaattttagttgaaaaacttgataaatttggtatagatcaaattatggttagatct
cctattacttgtgaaactagattcggtctttgtgcgaattgttatggtcgtgatttagct
agaggtcatttagttaatactggagaagctgttggtattatagctgctcaatctattgga
gaacctggaacgcaattaacaatgcgtacttttcatattggtggagcggcttctagatct
actactttaaatagtatttgtgtaaaaaattctggtattgtaagacttcataatattaga
acagtcaaacataagaataataatcttattactatttctaggtcaggagagttgtctatt
atcgatgtttttggtagagaaaaggaacgttataaattaccttatggtgctatattgact
gttcatgatgatgttaaggtagaatcaggacaggttattgcaaattgggatccacatact
catccagtgatttctgaagttggtggaaaattaaagtttgttgatttaatagaaggttta
acaatgcatcatcaaactgatgaaataactggtataactaatattgtggttgtagatgct
aaacagagaggaatgataggaagagatttaaagccgatggttaagttagtttctgatgat
gataaagatatttatttatctggtactggtattccagctcagtattatcttccatctgat
gctataattaattttgaagatggatgcattgttgaattaggagatgtaattgctcgtata
cctaaagaacgttctaaaactagggatataactggtggattacctcgtgttgcagatctt
tttgaagctagaaagccaaaagattctgctgttatggctaaaatatctggaatagttagt
tttggaaaggaaacgaaaggaaagagaaggttgattatttcagtttctgataaagaaaaa
tatgaagagttaatacctaagtggagaaacatttcagtatttgaaggagaacatgttgag
agaggtgaaattctttcagaaggccccttaaatcctcatgatatattgtctctattaggt
attggtgcattgtctaattatattgttaatgaagttcaagatgtatatcgtttgcaagga
gtaaaaataaatgataaacatattgaaactattattagacaaatgctaaggaaacgtgtt
ataacttttgttggggattctaaatttttattgggggagcatgttgaagagggaattctt
ttagaagaaaatgatagattaactttagataataaacaaatagcaaaaggagtcccaatt
ttattgggaattactaaggcttctttatctactgaatcatttatttctgccgcttctttt
caagagactactcgtgttttaacggaagctgcagttagtggaaaaacggatgaattaaga
ggtttaaaagaaaatgtaatggtaggacgtttaatacctgctggtacaggatatacatat
cataaacttcgtaaaaaaagaaaaaataaagtcaaattgttttgtgataaagaaaacaac
atgattacatcacataaggttgatcgtgattcaaataaagtatttgatatggatgataga
ataatgagttaa
DBGET
integrated database retrieval system