Limosilactobacillus fermentum IFO 3956: LAF_1212 Help Entry LAF_1212          CDS       T00699                                  Name (GenBank) conserved hypothetical protein   KO K19117   CRISPR-associated protein Csd1 Organism lfe  Limosilactobacillus fermentum IFO 3956 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:lfe00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02048 Prokaryotic defense system [BR:lfe02048]     LAF_1212 Prokaryotic defense system [BR:lfe02048]  CRISPR-Cas system   Type I CRISPR-Cas system    Subtype I-C factors     LAF_1212 SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Cas_Csd1 Cas_TM1802_C Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  BAG27548 UniProt:  A0ABF7R3K3 LinkDB All DBs Position complement(1396780..1398681) Genome browser AA seq 633 aa AA seqDB search MSWMSELVDLYDRNQNKAGKVTNVKRRGKNGETVLKPVFLLPINHVSNYVEIEIKLNLDG DFVGAEVINKEKTIMPVTIESAARTSGIRPRPVDDKFQYIARDYNQLQEVLEAKREAGEH KDKPYKQDGDFDEYLQQLTDFFEFTKEHSKTVAPLLMAIQKYVANNDLIIDLIHSGQFGE LDSYEDIDEKSILANNPLCRFNVLTEGPVRWKNPECFKAWSDFYQFKLAKEGKTGFDYVA GNEHVPLGTNHPKGILPLASGAKLISSNDTQNFTFRGRFINSEEAVSIGYESSQKGHAML KWLIDKQGFSIGGRYYITWGTTGENLTTINPQDNELFNDILSLDDEIEDTNSAFASQLRN LLLKGASVNGIPKQNPVYVMQLEGTTTGRFGIVYYQALDLTTYIERITDWYTKLYLKCDD NKYIYPSLKFIADRIYGDRNDETTQKLKKDVVTDLVQSILGGRKISYSYLSKIFQKSIRP TSFDNQSAWKLTVTTAARLFKSYFSREEIEPMLNTDFKDRSYLYGRLLAIADVVEQGVLG ANGQDRSTNARRYMSAFSQRPADTWKVIYVNLQPYLTKSNYRQKAQRLFDEINEKFDVTD SQLNSPLDGKFLIGYSQQRTDWYKSSKSKSEVE NT seq 1902 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgagttggatgtcagaattagttgatttgtatgatcgtaatcaaaataaagcggggaaa gtaactaatgtaaaaagaagagggaagaatggcgaaacagtgttgaaacccgtttttcta ttaccaattaatcatgttagtaactacgtggagattgaaattaaattaaatttagacggt gattttgttggtgctgaagtgatcaacaaggaaaaaaccattatgccagtcacaattgaa tcagctgcgcgaacaagtggaattagacctagaccagttgatgataaatttcagtacatt gcccgagattataatcaacttcaggaggtgcttgaagctaaacgggaagctggtgagcat aaagataaaccgtataagcaagacggcgactttgatgagtatttacaacaattaacagat ttttttgaatttactaaagagcattcaaaaacggttgcaccactccttatggcaattcaa aaatatgtggcgaataatgatttaatcattgatttaattcatagtggtcaatttggagaa ttggattcatatgaggatatcgacgaaaaaagtattttagctaataacccactctgtaga tttaatgttctcactgaaggacctgtacggtggaaaaatccagaatgctttaaagcgtgg tcagatttttatcaatttaaattggctaaggaggggaaaactggatttgattatgtagcc ggtaatgagcatgtccccttaggtacaaaccatcctaaagggattttaccattggcaagc ggtgctaaacttatttcttcaaatgatacccaaaactttacatttagaggtcggtttatt aattccgaagaggccgtttcaattggttatgagtcatcacagaaagggcatgctatgcta aagtggttgattgataagcagggattttcaattggtggccgttattacattacgtggggg acaaccggagaaaacttaactacaattaatcctcaagacaatgaattatttaatgacata ctatctttagatgatgaaatagaggatactaatagtgcatttgcaagccagttgcgtaat cttttacttaagggagctagtgtaaatggaattccaaaacaaaatccggtttacgtaatg cagttagaagggacgacgacgggacgatttggaattgtatattaccaagcacttgatcta acaacctatattgagcgaattactgattggtatacgaaattatatcttaaatgtgatgat aataaatatatttatccaagtctaaaattcatagcagatagaatttatggcgatcgtaat gacgaaactactcagaaattgaaaaaagatgtagttaccgatctagttcaatcaatattg ggtggaagaaagatttcttacagttacctgagtaagatcttccaaaaatcgattcgccct actagttttgataatcagtcagcttggaaattaacggttacaaccgctgcaagactattc aaaagttatttttctagagaggaaattgaaccaatgttaaatacggattttaaggatcgg agctatttgtatggtcggcttcttgcaattgctgatgtggttgaacaaggggttcttgga gctaatggtcaagatcgttcgacaaatgcacgacgctatatgtcagcctttagtcaacga ccggccgatacctggaaagtaatttatgttaacctacagccatatcttactaaaagcaac tatcggcaaaaggcacaaaggctatttgatgaaatcaatgaaaaatttgacgtcacagat tctcagttaaattcaccgcttgatgggaagtttttaattggatatagccaacaacgaact gactggtataaatcaagcaaaagtaagagcgaagtcgaataa

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