Limibacterium fermenti: ABNK31_09705
Help
Entry
ABNK31_09705 CDS
T10860
Name
(GenBank) PspC domain-containing protein
Organism
lfg Limibacterium fermenti
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PspC
Toast-rack_PspC-Cterm
LiaI-LiaF-TM_PspC
HAAS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XGS81843
LinkDB
All DBs
Position
complement(2187455..2189431)
Genome browser
AA seq
658 aa
AA seq
DB search
MKKVININFQGQVISIEETAYELLKQYIENLKSYFLREEDGDEIVNDIENRIAELFGNRL
KLGISCITDEDVEAIITSIGRPEDFDSDYAGDSNSSERTQSHHTRNSTTPPSSAAGEQKQ
ARPLNRNANDKIIAGVCSGLAYYFKIDPVWMRVIFVLLFSVLFWVYLVLWIVLKPVALES
NYTKRLYRNPSDRWIGGVCGGIAAYFKIDSWIPRLIFAVPLLLNLVGMVSIPIFPWDRIF
DNVDFNWNINFGLVVVYCVLWVIIPQATTVKQKLEMMGEDEYIQSIRQTVSGNLANVKSR
ANEPDNASAGQAGSHAQASATSAPQGEMPPEPPKNTYHSPVPVSQRSGCLNALTVFLKII
FFAFAGIFALVILATLGALLFAGTNLLSLKSLFIDAGTENTLLWITGVLVIGIPVVAIIL
WIIRRILKAKSRPVIGIVFVVLWIAGMVTGGILAKNVAGKFSVEGSDRKSTSLTSFNGNT
LYVDMAYYGNDYYLFSSGIGPGTERHELPYRSINEDSLLFSDISLKIIDTSDTLFQVSVI
TCANSRDLKTAKQNVRNFTYPIEQTDSVLQLPEFFSVPITQGFRRQNMLVEIAVPTGKKV
EISRTLDPYMRNEPSSAIKKKYKKFSRTSGDGKSLSSDRIVYQEGTIHTETDTISKVL
NT seq
1977 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaagtcatcaatattaattttcagggacaggttatcagtattgaagaaaccgcc
tatgagttgctcaaacagtatatcgagaatcttaagagctattttcttcgcgaagaggat
ggcgacgaaatcgtgaacgatatcgagaaccgtatcgctgaacttttcgggaatcgattg
aagttagggatcagttgcattacggatgaagatgtggaagccatcattaccagtatcggc
cggccggaggatttcgattccgactatgccggcgattcgaactcttccgaaaggactcaa
tcgcaccacacccgcaattcgacaactcctccttcctctgcggcaggcgagcaaaaacaa
gcccgcccgttgaaccggaatgccaatgataagatcatcgccggcgtgtgcagtggattg
gcctattattttaaaattgatccggtttggatgcgtgtgatttttgtattattgtttagc
gtgttgttttgggtttatcttgttttatggattgtcttgaaaccggtggcgctcgagtcg
aattataccaaacgattgtatcggaatccttcggatcggtggattggcggtgtgtgtggg
ggcattgccgcttattttaaaatcgattcatggattccccgtttgatttttgcggtacct
ctgttattgaatttagtcgggatggtatcgattcctatttttccctgggacaggatattc
gataatgtcgatttcaactggaatattaatttcggattagtcgtcgtgtattgtgtgttg
tgggtaatcattcctcaggcaacaacggtgaaacaaaagctcgaaatgatgggcgaagac
gagtatattcaatcgattcggcaaacagtgagcggaaatttagcgaatgtaaagagccgt
gccaacgaaccggataatgcttctgccggacaggccgggtcgcatgcgcaagcttcggct
acgtcggcgccgcaaggtgaaatgcctcccgagccgcctaaaaatacgtatcattcgccc
gtaccggtttctcaacgatcgggttgtttaaatgcattgaccgtttttctgaagattatc
ttttttgcatttgccggaatttttgcattggtgatactggctacgctgggtgcgttgtta
tttgccggaacaaatctgttatcgttaaagtcgctgtttatcgatgccggcaccgagaac
acattgctgtggattaccggagttcttgtgatcggaatccctgttgtggcaattatttta
tggattatccggcgcatcttgaaagcgaaatcgcgcccggttatcggaatagtgtttgtg
gtgttatggattgccggaatggtgacgggtggtatattggcaaagaatgtagccgggaaa
ttcagtgtcgaaggctccgatcgaaaaagtacctctttaacttctttcaacggcaatacg
ctttatgtggatatggcgtattatggaaacgattactacttatttagctcgggtatcgga
cccggcacggagcgtcatgagctcccttaccgtagcataaacgaagattcgttgttgttc
tccgacatcagtttaaagattatcgatacttccgatacgctgtttcaggtgagcgtgatc
acctgtgccaacagtagagacttaaagacggcgaagcagaatgtccggaattttacctat
ccgatagagcagaccgattcggttttgcagctacccgaatttttctcggtgcctattaca
caaggcttccgccgtcaaaatatgctcgttgagatagctgttccgacgggtaagaaggtc
gagatcagccgtacgctggatccttacatgcgaaatgagccttcgtcggctattaagaag
aaatataagaagttctcgcgtacatccggagacggaaaatctctttcgtccgaccggatt
gtttatcaggaaggaacgatccatacggaaacagatacaatttcgaaagtgctataa
DBGET
integrated database retrieval system
