Companilactobacillus farciminis: LF20184_01600
Help
Entry
LF20184_01600 CDS
T06098
Name
(GenBank) acyl-CoA synthetase
Organism
lfm
Companilactobacillus farciminis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AMP-binding
AMP-binding_C
AMP-binding_C_3
DUF7426
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATO45528
LinkDB
All DBs
Position
339888..341405
Genome browser
AA seq
505 aa
AA seq
DB search
MSEITNQLNKQLRNNMNQEMIKDEKRNRWYQGFELADDIRMLREEFLDLHIGFGDVVLVC
LPNTAAYPLITQALWEVGAVMHPVAATTPEKELQQELKEHDYVASIVGQTLVDAALDDRV
AIVSALHLQTYSLLHIIRDRSLMGHDAKIPDEDDLALIMNTSGTTGKPKRVGLTHRILLN
GVKHDIESHKMTSEDTSLLVMPMFHINAQAVVILATRLSGGKLVIAEKFSASKFWNQVRE
NNVTWVSVVPTIVNILLINQKANENYSDDIRLRFVRCSSFALPLDKLTTFQTRFHTRILE
GYGMTETASQCTINPFDAPKVGSAGKPFETDLGIMIDDQITKRPQQIGEIVVRGDHVISD
YLDPHPESFKNGWFLTGDLGYLDEDGYLFVKGRKKDIINHGGEKVAPAQVENVLSQLNFV
KEVSVIGTPDTLYGEAVTAVVISDGEQDEELERQKIMAHAKATLANYEQPTRIFFVNDYP
RNATGKVIRLKLRQQVMSTLVRSAG
NT seq
1518 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagaaataacgaatcaattaaacaaacagttaaggaataatatgaatcaagaaatg
atcaaggatgaaaagagaaatcgttggtatcaaggatttgaacttgctgatgatattcgt
atgttacgcgaagaattcttagatctacatatcggatttggtgacgtagttttggtttgt
ttacctaacacggcggcctatcctttgataacacaggcactttgggaagttggtgccgtc
atgcatccagttgctgccacgactccagaaaaagaattgcagcaagaactaaaagaacac
gattatgtagcttctatcgttggtcagacactagttgatgcagctttagatgaccgtgtg
gcaattgtttcagcactacacttacaaacttattctttgttacacatcattcgtgatcgc
agtttaatgggccacgatgctaaaattcctgatgaagatgatttagcgttgattatgaat
acttctggaactactggaaagcccaaacgtgttggtttgactcacagaatcttgttgaat
ggtgtcaaacatgatattgaaagccataagatgacatccgaggatactagtttgctagtt
atgccgatgtttcacattaacgctcaagcagttgtgattttagcgactagattgtctggt
ggtaagttggtgattgccgaaaaattcagtgcttcgaagttttggaatcaagttagagaa
aataatgttacttgggtatcagtcgtgccaactatcgtcaatatcttgttgatcaatcaa
aaagctaatgaaaattatagtgatgatattcgattgcgctttgtcagatgttcatccttt
gctttgccactcgataaactgacgacttttcaaactcgattccacacgagaatcttggaa
ggctacgggatgactgaaactgctagtcaatgtacgattaatcctttcgatgcaccaaaa
gttggttcagctgggaaaccttttgaaactgatttgggaattatgattgatgaccaaatt
actaagcgacctcaacaaattggtgaaatcgttgttcgcggtgaccatgttattagtgat
tatctagatccacatccagaatctttcaaaaatggatggtttttaactggcgatttagga
tatttggacgaagatggctacttgtttgttaaaggacgcaaaaaagacatcatcaaccac
ggtggcgaaaaagtagctcccgcacaagttgaaaatgtcttgagccaattgaattttgtc
aaagaggtttccgtcattggtacgccagatacgctttatggagaagcagtaacggcagtc
gttatcagtgatggtgaacaagatgaagaattagaacgtcaaaaaatcatggctcatgcc
aaagcgactttagctaattatgagcaaccaacgagaatttttttcgtcaatgactatcct
cgtaatgccacgggtaaagtcattcgcttgaaattacgtcaacaagttatgtcaacttta
gttaggagtgctggatga
DBGET
integrated database retrieval system