Companilactobacillus farciminis: LF20184_02110
Help
Entry
LF20184_02110 CDS
T06098
Name
(GenBank) transposase
KO
K07496
putative transposase
Organism
lfm
Companilactobacillus farciminis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lfm00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99976 Replication and repair
LF20184_02110
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cas12f1-like_TNB
OrfB_IS605
HTH_OrfB_IS605
Stk19
zf-H2C2_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATO47531
LinkDB
All DBs
Position
447743..448849
Genome browser
AA seq
368 aa
AA seq
DB search
MKVVLNQLCDYRRYCWNKALETWNDMYDLHTIDSSIPIPNVYSVRNELVFNKMDWQFNLS
SRTLQLTIVDLGIAWKNYFDKSLPDWGKPKFKSKKMSRQGFKTDRAKIVDGKLRLDKPLG
VKQWFDIHISKHVNLNGQLKTVSVYKENGKYWASFPLEVCIKHKLMTGKSTAVDVNVGHF
NYTNGLINTLPKGLIKLYERIKIYQKCLARKRVINGGNATKSNNYIVMRDKLQRDYRKAA
NIQHDIIQKFTSNLVAQYDKIVIEDLNIKSMQMSHVASKGLQRALFGYFRKVLSYKCEWY
GKEVILASQIYPSTQRCSKCGYVKRGNEKLGLQGNLKHHTNHSDYVCYSCGARIDRDKNA
VANLLDLI
NT seq
1107 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaggtggttttaaatcaactttgtgattatcgtcgttattgttggaataaggcgcta
gaaacatggaacgatatgtatgatttgcataccattgactccagcattcctattccaaat
gtatattctgtccgaaatgaattagtatttaataaaatggattggcagtttaatttgtcg
tcaagaactttacaactaacaattgtggatttgggtattgcgtggaaaaattattttgat
aaatctctacctgattgggggaaaccaaaatttaaatcaaagaaaatgtcccgtcagggt
tttaagactgatcgtgcaaaaattgttgatggaaagcttcgtttagataaacctctggga
gtaaagcagtggttcgatattcatattagtaaacatgtgaatttaaatggacaacttaag
actgttagtgtttataaagaaaatggaaaatattgggctagctttccgttagaagtatgt
ataaaacataaacttatgacaggaaaaagtaccgctgtggatgttaatgttggacacttt
aattatacaaatgggttaattaatacattaccaaaaggtttaattaaattgtatgagcgt
ataaaaatttatcaaaaatgtttagctcgaaaaagagtgattaatggtggaaatgctaca
aagagtaataattacattgtaatgagagacaagttacaacgtgattatcgtaaagctgct
aatattcaacatgatattattcaaaaatttacatctaatttagtcgctcaatatgacaaa
attgttattgaagatttaaatattaagtctatgcaaatgagccatgttgcttcgaagggc
ctacaaagagcattgtttgggtattttcgtaaagttttatcatataagtgtgaatggtat
ggtaaagaagttattttagctagtcaaatatatccatcgacacaacgatgctctaagtgc
ggttatgttaaaagaggaaatgaaaagcttggattacaggggaatttaaagcatcatact
aatcattctgactatgtttgttattcctgtggtgcaagaattgatagagataaaaatgcg
gtggcaaatttattagatttgatttaa
DBGET
integrated database retrieval system