Limnospira fusiformis: HFV01_17380
Help
Entry
HFV01_17380 CDS
T06534
Name
(GenBank) HAMP domain-containing protein
Organism
lfs
Limnospira fusiformis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HisKA
HAMP
sCache_2
sCache_3_2
dCache_1
MukF_C
14-3-3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJB27226
LinkDB
All DBs
Position
complement(3592378..3594435)
Genome browser
AA seq
685 aa
AA seq
DB search
MSKRGQSSFRRLLLSRILLLSLPVLLVGQYVTYRKARSALLETARLNLTESAVKKAAGID
EWAKSLRSSLILVAHSSVLQSGEEENFQGFLEEVVSELPFEVNCLQMTNLETNQMVASTC
DEGARVQFPQDLWSATQSQNWAVSQSEAHIINVGTAEADKGFFPQHLDDSESDSPEGSRV
LLRRQNNQLSLISIAPVYIADGEVNRLRYGLSLESYSLLRGEHTPKSLTGSTVILDEAGT
IVAHPNPQWVGLNIRDHADSQRLESLLRSALAGRTNFIHLFAFEPNGEELLAGYHAIESP
VFPKNYDSQWVILAVASLDDALYGLKDINSVLVVLILSLIIAIISAALYLSRDLARPLEK
LRDYALQVNSIESHVEVPKNLKIREVEQLAQALRTMVDRLQSRAQALAFATKEARVANQL
KDEFLRVISHELRTPLNGIINSLNLIQEGFCDDRDEEMEYLQMANDSALHLFDIVNDILD
IALIEEGQLSLFLEPTDLGVILQEAIALQTLDLQQKGLDLNLMLSPEPLEVQADRDKLKQ
VFINIINNAVKFTKAGSITISSKLERFPNWGNAIASNSGQIIKASEQVIVTIVDTGIGVI
PEKQSQLFQPFVMVDGSTTRESGGVGLGLVIARRLMEMMGGGIKLDSAGHDQGTTVTIAM
PTLQAATPPSQNQKTTRKSKKKVKS
NT seq
2058 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaaacgcggtcaatcttcatttcgccgtcttctgctatcccggattttgctgtta
agccttccggtgttgttggttggacaatatgtgacctatcgcaaagctcgttcagcttta
ctagaaacggctcgtctgaacttaactgaaagtgcagttaaaaaagctgcgggtattgat
gaatgggcgaagtccttgagatcaagtttgattttagtggctcacagttccgttttgcag
tctggagaagaggagaattttcaaggttttctcgaagaggtcgtctccgaattacctttt
gaggtcaactgtctgcaaatgactaatctggaaaccaatcagatggtagctagtacctgt
gacgagggggcgcgggttcaatttccccaggatttatggtctgctactcaatctcagaac
tgggctgtgagtcagtcggaagctcatattattaatgtgggaactgcagaggctgacaaa
ggcttttttccccaacatctcgatgatagtgagtccgatagtccagagggaagtagagtt
ttacttcgtcgccaaaataatcaactaagtttaatctctattgctccggtttatattgct
gatggagaagttaatcgactccgttatggattaagtctggagtcttattctttactcaga
ggtgaacacaccccgaaatctttaacaggttcgactgtaattttagatgaagctggaact
attgtagctcatcctaatccgcagtgggtgggattaaatattagagatcacgctgattct
cagcggctagagagtttactgcgtagtgcgttggcgggtcgtactaattttattcatttg
tttgcttttgaaccaaatggggaagaattattggcgggatatcatgctattgaaagtccg
gtttttcccaagaattatgatagtcaatgggttatcttggcggtggcgagtttagatgat
gctctctatggcttaaaggatattaattcggttttagttgtgctaattctgagtttaatt
atagcgattattagtgcagcattatatctatctagggatttggcgcgtcctttagaaaaa
ctccgagattatgctttacaagttaacagcattgaatcccatgtagaggttcccaaaaat
ctgaaaatccgggaagttgagcagttggctcaggctttgcggactatggttgatcgtttg
cagtctcgcgctcaagccttggcttttgcgactaaggaggcgcgggtggctaaccagcta
aaagatgaatttttgcgggttatatcccatgagttaagaaccccgcttaatggcattatt
aattccctgaatttgattcaggaaggattttgtgacgatcgcgatgaggaaatggaatat
ttacagatggctaatgactcggctctgcatttatttgatattgttaatgatattttagat
attgctttgattgaggaaggtcaactatctttatttttggaaccgacggacttgggggtg
attctccaagaggcgatcgctttacaaactctggatcttcagcagaaaggtttagattta
aacttaatgttatcccctgaacctctggaagtacaagcagaccgagataaacttaaacag
gtttttatcaatattattaataatgctgtcaagttcaccaaagctggtagtatcaccatt
tctagcaaacttgaacgcttcccgaattgggggaatgcgatcgcttctaattccggtcag
attatcaaagcatctgaacaggtaattgtaactattgttgatacaggaattggggtaatc
ccagagaagcaaagccaactatttcagcctttcgtgatggttgatggttccaccactagg
gagtcgggaggagtgggtttaggattagtgatcgcgcgtcgtctcatggaaatgatgggt
ggcggtattaaacttgacagcgccggacatgaccaaggtactacagttactatcgctatg
ccaactttacaagcagcaacaccaccttctcaaaatcagaagactaccagaaaatctaaa
aagaaagttaaaagttga
DBGET
integrated database retrieval system