Limnospira fusiformis: HFV01_17910
Help
Entry
HFV01_17910 CDS
T06534
Name
(GenBank) COG1615 family transporter
KO
K09118
uncharacterized protein
Organism
lfs
Limnospira fusiformis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lfs00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
HFV01_17910
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UPF0182
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJB27311
LinkDB
All DBs
Position
3701658..3704786
Genome browser
AA seq
1042 aa
AA seq
DB search
MAGAETSTHGQYHQKRSPDTRSTPDAKMVKGRKSNLLNAMISKNWVLKALLFLFGAWLIF
DMITWVIAEYLWFDEVGYLSVFRRRLLTQVGLWVLGVGLSAAFLFFNLAIADKFRYQSAI
KSYHRFEDALFSPPPPSRPPALNLPWLSFLVIGPTMFMVVMTLHYGYEFITDFNISLEQD
LVVPLLPRRFDFAVIWEMMTQQPIQWWQIAISVVMTMVVIIKPQLSLSAIAVFFSLGFGW
VLSSHWINVLGFFYPTDFQITEGLFNKDISFYIFIISAIDLVEFWLFGLFLLALISCSLI
YLLSGDSFNQGKFPGFSRFQQRHLHGLAGVFMLCMALRYWLNRYELLYSERGVVFGAGYT
DANVAEPAYYLMFFISILFALFLFWQAFFSVEVIKPYVEFCLKKMGLRRPRSQPKRYAKL
FADSYSLRAILSVYILMGFSANVALPEMVQRVIVQPNELERELPYIERNIQFTQQGFHLD
NIDIQTFDPDAQLTLADLESNSLTIDNIRLWDQRPLLQTNRQLQQIRPYYEFLDAAIDRY
TLLKPEEEQTPDNRTQKQQVIIAGRELDYQLVPEKAQTWINEHLVYTHGYGFTLSPVNKV
AEGGLPKYFIKNIGPAPRFNPDTTLEVDPRVEDSIPIGKPRIYYGQLTNTNVMTGTRVLE
FDFPSGDENVYNTYSGDGGIPINSLWRRLLFAKYLKNWQMIFTRNFLPETKVLFRRQIQQ
RVKAIAPFLRYDKNPYLVAADSSLGQDVVPENAQEGKYLYWILDAYTTSSRYPYSDPEDG
EFNYIRNSVKVVIDAYNGSIKFYYLSEPRDPLLITLRNIFPDLFEPIENMPKSLYEHIRY
PQDLFTVQSERLLTYHMQDARVFYNREDVWRIPTEIYGGQTQRVAPYYLIMKLPTEAMAE
FILLQPFTPASRLNLIAWLAARSDSPQYGKLLLYQFPKQRLVFGPEQVEALINQEPRISE
QISLWNRQGSRVLQGNLLVIPIEQSLLYVEPIYLEATDNSLPTLVRVIVAYENRIVMRPT
LDESLQAVFDADPIEPAIIVPN
NT seq
3129 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctggggccgaaacttctacccatggtcaataccatcaaaagcgatcgcctgacacg
cgatcgactccagacgctaaaatggtcaaagggcgtaaatctaacctactcaatgccatg
atatccaaaaactgggtcctaaaagcgcttctgtttctgttcggcgcatggttgatattt
gatatgatcacctgggtgatcgccgaatacctatggtttgatgaagttggctatttatcc
gtattcaggcgacgactgctaacccaagtaggattatgggtcctaggggtgggtttgagt
gcagcctttctgttcttcaatttggctattgctgacaaatttcgctatcaatccgccatt
aaatcttaccaccgatttgaggatgccctattttcaccgcctccccctagccgaccccca
gccttaaatttgccatggctatcttttctggtaattgggccaactatgttcatggtggtg
atgacactccactatggctatgagtttattacagatttcaacatcagcctagagcaggat
ttggttgttcccttgctaccccgtcggtttgattttgccgtcatttgggaaatgatgact
cagcaacctatccaatggtggcaaattgccattagtgtggttatgactatggtagttatc
attaaaccacagctttctctaagtgcgatcgctgtattttttagcctcggttttggttgg
gttctctctagtcactggattaatgtactgggatttttctaccccaccgattttcagatt
acagaaggtctctttaacaaagatattagtttttatatttttatcatctccgccattgac
ttggtagaattttggctattcggtttatttctcttggctttaatttcctgctccctgatt
tatctactttccggtgatagctttaatcaaggcaaatttcccggattttctcgttttcag
cagcgccacttacatgggttggctggtgtgttcatgctatgtatggctctgcgatattgg
ttaaatcgatatgagttattatattccgagcgaggggtcgtatttggggctggctatact
gatgccaatgtggctgaacccgcctattacttgatgtttttcattagtatattattcgcg
ctgttcttgttctggcaggctttcttttccgtagaagtaattaaaccttatgtcgagttt
tgcttaaaaaaaatgggtttgcgtcgtccgcgatcgcaaccaaaacgctatgccaaatta
ttcgcggatagctattctttgagggcgattttatctgtatatattttgatgggattttcg
gctaatgtggcgttgccagaaatggtgcaaagggtcatagtccagcctaacgaattagag
cgagaattgccatatattgaacgcaatattcaatttacccaacagggttttcatcttgat
aatattgatattcaaacctttgacccagacgctcaactaaccctcgctgacctagaaagc
aattctctcaccattgataatattcggctgtgggaccagcgacccctattacaaactaat
cgtcaactccagcaaattcgaccttattatgaatttcttgatgctgctattgaccgctat
actttgctgaaaccagaagaggaacaaacaccagataatcgtactcaaaaacaacaggtg
attattgcaggacgggaattagactatcagttagttcccgaaaaagcgcaaacttggatt
aatgaacaccttgtctatacccacggttatggatttaccctatctccagttaacaaagta
gcggaaggaggactacctaaatattttatcaaaaatatcggccctgcgcctcggtttaac
ccagatactaccctagaagtcgatcctcgcgttgaagatagtatccctatcggaaagcct
cgcatttattacggtcaactcactaataccaatgtgatgactggtactagagttttggaa
tttgactttccctccggtgatgaaaatgtctataatacctatagcggtgatgggggtatt
ccgattaattccctatggcggcggttactttttgctaagtatttaaaaaactggcaaatg
atttttacccggaattttttgccggaaactaaagtgctatttcgtcgtcaaattcaacag
cgagttaaagcgatcgctccctttttacggtatgataaaaatccctatttggtagccgca
gatagcagtttagggcaagatgtggttcccgaaaatgcacaggagggtaaatatctctat
tggattttagatgcttacaccaccagcagtcgctacccctattctgacccggaagatggc
gaatttaactatattcgcaactcagttaaagtcgtaattgatgcctataatggctccatt
aaattctactatctcagtgaacccagagacccgcttttaatcactttacgcaatattttc
cccgatttatttgaacctatcgaaaatatgcccaaatctttgtatgagcatattcgatac
ccccaagatttatttacagtccaatcagaacgcctattaacttaccacatgcaggatgct
agggtgttctataaccgggaagatgtctggcgcattcccaccgaaatttatggcggtcaa
actcaacgggtcgcgccttattatttgattatgaaactacccaccgaagccatggcggag
tttattctattgcagccatttactcccgccagtcgcctcaatttaattgcttggttagcg
gcgcgatcggactccccccaatatggtaaactattattatatcagtttcctaagcagcga
ttagtatttggacccgaacaggtggaggcactaatcaaccaagaaccccgaatatctgag
caaatctcactgtggaatcgtcaaggttcacgggtacttcagggtaatttattagtaatt
cccattgaacagtctttgttgtatgtagaaccaatttatctcgaggcgactgataacagt
ttacctactctagtcagggttattgtggcttatgaaaaccgcattgtcatgcgtcctact
ttagatgaatctctgcaagctgtctttgatgctgaccccatcgaacccgccattatagtt
cccaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
