KEGG   Limnospira fusiformis: HFV01_24505
Entry
HFV01_24505       CDS       T06534                                 
Name
(GenBank) DUF4131 domain-containing protein
  KO
K02238  competence protein ComEC
Organism
lfs  Limnospira fusiformis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lfs00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:lfs02044]
    HFV01_24505
Secretion system [BR:lfs02044]
 Type II secretion system
  Competence-related DNA transformation transporter (DNA-T) core components
   HFV01_24505
SSDB
Motif
Pfam: Competence DUF4131 Lactamase_B DUF7305
Other DBs
NCBI-ProteinID: QJB28384
LinkDB
Position
5127685..5130132
AA seq 815 aa
MNQTAAIALGLAYIVGLLMASFSWGGYSLLALGVGMAIMTTIWQYKLRGRLIKPNSPTTT
NRRQRQRRQRTSDPDRLTVPRPPIPRSLWLVAGLIGFLATLYFQLQTPQPGPHDISRLIV
SGGNAENLVITVWGRVISSPRVTRSGNVQFWLQANLVNQITSNDQNSPVQVNKTVTGKLY
VTVPILQATGLQGNETVSVTGTLYAPKSPLNPGSFDFKAYLARQGGFAGMYGRHLSINTT
PRWGLSRVRQRIVRAKVQGLDVTKGTLLSAMVLGRRAVDISPEISDRFVRVGLAHTLAAS
GFHVSLLLGVVLALTARWSPKLRLVFGATILLLYVGLTGGSASVLRAALMGLAALVGVVM
KRQVRPLAVLLAVAVFLLLWNPLLIQDLGFQFSFLATLGLLVTVPPLMRSLQWLPPVIAS
CIAVPIAATVWILPLQIYVFNLVSPFSIFVNILVVPFITVITLGGMLTASVAIISPWAAA
ALATALYYPLEGLIYIVEFFNDLPGNSIAVGSLYMAQLIGLYTINILLCLLPILLPEKVG
KTDQKKKTRNHSRFYAVIAGILMAIAIITLPMAYAQFTQFRVTVLATAEKPILVVEDRDR
VLLVNAGDERTVKFTVLPFLLRQGINQIDWAILTHPQLGLTIGFPHILDTLPIHKFYDTP
ASKNAYQVSAQAIQNKIVSAQGQYLTLPVQQNLDLGETQVTLINAEVPLVEFMISDRRWL
LMGNIPKQQQSQLLQQYDLSPVDVLWWLGNDLNAQLLETLKPQVAIATTDTLSPETSQML
ENLNIQLFWTGRDGALHWTPQQGFSPSITADQTVD
NT seq 2448 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaccaaaccgctgcgatcgccctaggattagcctatattgtcggattactaatggcg
agctttagctggggaggatattctctcctcgccctaggagtcggaatggcaattatgaca
accatttggcaatataaactccgtggccgtctgattaagccaaattctccgactactaca
aaccgccgtcaaaggcaacgtagacaaaggacatctgatccagataggttgacagtcccc
cgacctcctatccctagaagcctttggctagtagctggattaataggtttcctcgctacc
ctatattttcaactacaaactccacaaccagggcctcatgacattagcagattaattgtc
agcggtggtaatgccgaaaacctggtaatcaccgtctggggaagggtgattagttctcca
cgggtcactcgttcaggaaatgtccagttttggctacaggctaaccttgttaaccagatt
accagtaatgatcagaacagcccggttcaggttaacaaaacagttacaggtaaactttat
gttaccgtacccattctacaagccacaggattacaaggcaacgaaactgtttctgtgacc
ggaactttatatgcaccaaaatcccctttaaatcctggtagctttgattttaaagcctat
ctcgccagacaaggggggtttgcgggaatgtatggtcgccacctctctattaacactacc
cctaggtggggactgtctagggtgcgacagcgaattgtcagggctaaggttcagggtttg
gatgttaccaaaggcacactattatcagccatggttttggggcggcgggctgtggatatc
tccccagaaattagcgatcgctttgtgcgagttggtttagctcatactttagccgcttct
gggtttcatgtctctttacttctgggcgtagtcctagctttgacagcccgctggtctcct
aagttgagattggtttttggtgcaactatcctattgttatatgtcggattaactgggggt
tcggcttccgtactgcgggcggctttaatggggttagctgcgttggtgggtgtcgtcatg
aaacgacaggtgcgacccttggctgtgttattagctgtagccgttttcttattgttatgg
aatcctctattgattcaagacttaggatttcaattcagctttttggcaactctggggcta
ttggtgactgtaccacctttgatgcgatcgctacaatggcttcccccagtaattgctagt
tgtatagcagttcctatcgccgccaccgtttggattcttcccctgcaaatttatgtgttt
aatttggtatcaccattcagtatttttgtcaatattttggtggtgccttttattacagtc
attaccctgggaggaatgctaactgcatcggtcgcgatcatctcgccctgggcggctgcc
gctctagccaccgctttatattaccccctagaagggttaatttatatagtcgaatttttt
aatgatttacctggcaattccatcgctgtaggcagtttatatatggcacaattaatcggt
ttatataccattaatatattgctctgtttattgccgatactcctaccggaaaaagttggt
aaaactgaccagaagaagaaaaccagaaaccatagccgattttatgccgttatcgctggt
atattaatggcgatcgccatcatcactttacccatggcttatgctcaatttacccaattt
cgagtcaccgttttagctaccgccgaaaaacctattctggtcgtggaagatcgcgatcgc
gttttgttagtaaatgccggggatgaacgcaccgttaaatttaccgttttgcccttttta
ctaaggcagggaattaatcagattgattgggctattctcactcaccctcagctaggcttg
actatcggtttcccacatattttagacactttaccaattcataaattctatgatactccc
gcttctaagaatgcttaccaagtgagcgcccaggctattcaaaataaaattgttagcgcc
caaggacaatatctaactctgccagttcagcaaaatttggatttaggagaaactcaggtt
acactgattaatgctgaggttcccctggtggaatttatgatcagcgatcgccgctggcta
ctcatgggaaatatccccaaacaacaacaatcacagttgttacaacagtatgatttatcc
cccgttgatgtcctctggtggttgggtaacgatttgaatgctcaactactagagaccctc
aaaccccaagtggcgatcgccaccactgataccctcagtccggaaacatctcaaatgctc
gaaaatcttaacattcaactattttggactgggcgagatggcgcactacattggacacca
cagcagggcttttcccctagcattaccgccgaccaaaccgttgactga

DBGET integrated database retrieval system