Lachnoanaerobaculum gingivalis: QJR73_03050
Help
Entry
QJR73_03050 CDS
T09491
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K22994
pectate disaccharide-lyase [EC:
4.2.2.9
]
Organism
lgg
Lachnoanaerobaculum gingivalis
Pathway
lgg00040
Pentose and glucuronate interconversions
lgg01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lgg00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00040 Pentose and glucuronate interconversions
QJR73_03050
Enzymes [BR:
lgg01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.9 pectate disaccharide-lyase
QJR73_03050
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta_helix
Pel9A-like_beta_helix
Choline_bind_1
Choline_bind_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WHE88004
LinkDB
All DBs
Position
628089..631157
Genome browser
AA seq
1022 aa
AA seq
DB search
MKRNILRCFMAYILSILLISNSLEVFASTLTNVEGISSEESERSDTLISKATDSNAKEWE
FTYFGPSTSIITNTVNDNADIDGEVILKSATYKKDGSINKKGGKFVSSDPADGISFYYTK
IDPSKENFILEADVRIDYMNPKPDGQEGFALMVRDSIGEKGDAASYESNLVSIGATQLPK
GELNSTTQVKDMLGVRAYTGIYNKIKPNPDTFKVYRLGFDKDGGKVSSGDIYRVRLEKNS
SSYVVYQLDMDGSELYKYVIPIQAKDIRANSINRYEELNDPMSVQDNFAYVGFAVARGMN
VTYSNIKFEKSDFDANDWRPQESRYIDLQAKITSPDTAAEDNYTLVFKANSNGSAKIYQD
NVLKDSVEVVNNEELNKDYDLSSGKNFSVEFTPEAGYEPEPFVKFKSYAPIILNKTVTFR
TIGKDGLIYVTNAGLDENDGSGYDSAISLESALKYAKSGQTILLKPEVYDMSGRSLVVQK
GINGSEGHTIKIQGDGGFATLDFKRTGKGFSLGGDYWELRQFNITNTADGYKGLQISGSH
NIVERLNLFNNGTTGLQISGSADDTIDKWPSYNYILNCTSMNNVDAAMEDADGFAAKITS
GVGNIFDGCIAAYNADDGWDLFAKVATGAIGNVTIKNSVAYRNGYILVKKGGNKKNFEFA
DGAVDESGNLSFEKPNLLLDAGNGNGFKMGGSNVFGAHKLDNSISYENKAKGIDSNSGPN
IKISNSTSYNNGSYNVALYTSDKTLKTDFSAKGILSFRKGTNIGEQISLQSQNSSDVMDN
TNFYWNKEENISKNTASKVLTVDENDFINLDTEVEPKRSEDGRIDMNGLLLLKPEAKDRL
SSGAGGKEFGEIISDKPDKNIDVAKEESGSALPSTDKKDDKQDNKLFDTEYTKVSDDNNQ
SPSNESKVIIPNDSKSNGNGGRSGSQKRRSSYTGGVITRIHHGIFTGWKMEILNGAIVWK
YVENGKSVTSQWAYIFNPYTGRNAWFRFDKNGVMETGWINENGINYYLSEISDGSLGEWI
KK
NT seq
3069 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaaatattttaagatgttttatggcatatattttaagcattttactgataagt
aacagcttagaagtatttgcaagtactttgacaaatgtagagggtatatcatcagaagaa
agtgaaagaagtgatactttgatttcaaaggcaacggattcaaatgcaaaagaatgggaa
tttacttactttggcccttctacatctataattacaaatactgtaaatgataatgcagat
atagatggagaagtaattttaaaatcagcaacatataaaaaagacggaagtataaataaa
aaaggtggaaagttcgtgtcttccgatcctgctgacggaataagtttctattatacaaaa
atagatccaagcaaagaaaattttattcttgaagcggatgtaagaattgattatatgaat
cccaaacctgacggacaggaaggatttgcactgatggtaagggactctataggtgaaaaa
ggagatgcggcaagttacgaatcaaatttagtatctataggtgcaacacaattgcctaag
ggagagttgaattctactacgcaagtaaaggatatgcttggagtaagggcatacacaggt
atttataataagataaagcctaatcctgatacatttaaagtttacagattaggctttgac
aaggatggagggaaagtaagtagcggagatatttacagagtcagattagagaaaaattct
tcaagttatgtagtatatcagttggatatggatggctctgaactttataagtatgtaatt
cctatacaggcaaaggatatccgtgcaaacagtataaacagatatgaagagctgaatgat
ccaatgagtgtacaggacaattttgcttatgtaggatttgctgttgcaagaggtatgaat
gtcacatattcaaatataaagtttgaaaagagtgattttgatgcaaatgattggaggccg
caagaaagcagatatatagatttacaggctaagattacaagtccggatactgcggctgaa
gataattatactttggtatttaaagctaattcaaacggatcagctaaaatttatcaggat
aatgtacttaaagatagcgtagaagtagttaataatgaggaacttaataaagattatgat
ttatcatcaggtaaaaatttcagcgttgagtttacccctgaagccggttatgagccggag
ccttttgtaaagttcaaatcctatgctcctattatattaaataaaacagtcacttttaga
accattggaaaagacgggcttatttatgttacaaatgcaggcttggatgaaaatgacggt
tcaggatatgacagtgcaataagccttgagtctgcattaaaatatgcaaagtcaggacaa
acgatattacttaagccggaagtttatgatatgtcaggtaggtcacttgttgtacaaaaa
ggaataaacggaagtgaaggacatacaattaaaatacaaggtgacggcgggttcgccaca
ttggattttaagaggacaggtaaaggatttagccttggtggagattattgggaacttaga
caatttaatattacaaatactgcagacggatataaaggactccaaatctcgggaagccac
aatatagtggaaagattgaatttatttaataacggaacaacaggattgcagatttcaggt
agtgccgatgatactatagataaatggccaagttataactacattctaaactgtacatca
atgaataatgttgatgctgcgatggaggatgcagacggatttgcagctaagataacatca
ggagtaggtaatatatttgacggttgtatagcagcgtataatgctgatgacggctgggat
ctttttgccaaggtggcaacaggtgccataggaaatgtaacaataaaaaacagcgttgct
tatagaaacggttatatattggtgaagaaaggtggtaataaaaagaactttgaatttgct
gacggagcagttgatgagagtggaaatttatcatttgaaaaacctaacttgcttttagat
gccggaaacggtaatggatttaagatgggtggttcaaatgtttttggagcacataaactg
gataattctatctcatatgaaaataaggcgaagggaattgattcaaattccggacctaat
ataaagatttccaattcaacatcatataacaacggaagctacaatgtggctttgtatacc
agcgataagacattaaaaacagatttcagtgctaaaggtatattgtcatttagaaagggg
acaaatataggagaacagatttcactacaaagccaaaattcttcagatgtaatggataat
acaaacttttattggaataaggaggaaaatatttcgaaaaacactgcatcaaaggtactt
acagtagatgaaaatgatttcattaatttggatacagaagtagagccaaagcgtagtgaa
gacggaagaattgacatgaatggccttttgctgttaaaacccgaggctaaggacagactt
tcttcaggtgccggtggaaaagagtttggagaaataatatctgataaacctgataaaaac
atagatgtagctaaagaagagtccggtagtgctttaccaagtactgataaaaaagatgac
aaacaagataataaattatttgatacggagtatacaaaagtatcagatgataataaccaa
tcaccttcaaatgaaagtaaagtaattataccaaatgactcaaagagcaatggcaatggt
ggtaggtcgggttcacagaagagaagatcatcttacacaggtggagtaattacaagaata
catcatggcatatttacaggatggaaaatggagattttaaacggtgctattgtctggaaa
tacgtggaaaacggtaagagtgtaacatctcagtgggcatatatatttaatccatataca
ggtagaaatgcatggttcagatttgataaaaatggtgttatggagacaggatggattaat
gaaaatggaataaactattacctaagtgagatttcagacggatctttgggagagtggatt
aaaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system